MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 11783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119189
2	NC_012583	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119189
3	NC_012583	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119190
4	NC_012583	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119190
5	NC_012583	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
6	NC_012583	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
7	NC_012583	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
8	NC_012583	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119190
9	NC_012583	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
10	NC_012583	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
11	NC_012583	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
12	NC_012583	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119190
13	NC_012583	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119190
14	NC_012583	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119190
15	NC_012583	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
16	NC_012583	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
17	NC_012583	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
18	NC_012583	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119190
19	NC_012583	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119190
20	NC_012583	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
21	NC_012583	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119190
22	NC_012583	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119190
23	NC_012583	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119190
24	NC_012583	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119190
25	NC_012583	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119190
26	NC_012583	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119191
27	NC_012583	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119191
28	NC_012583	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119191
29	NC_012583	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119191
30	NC_012583	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119191
31	NC_012583	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119191
32	NC_012583	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119192
33	NC_012583	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119192
34	NC_012583	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119192
35	NC_012583	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119192
36	NC_012583	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119192
37	NC_012583	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119193
38	NC_012583	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119194
39	NC_012583	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119194
40	NC_012583	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119194
41	NC_012583	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119194
42	NC_012583	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119194
43	NC_012583	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119194
44	NC_012583	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119194
45	NC_012583	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119194
46	NC_012583	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119194
47	NC_012583	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119194
48	NC_012583	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119195
49	NC_012583	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119195
50	NC_012583	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119195
51	NC_012583	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119195
52	NC_012583	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119195
53	NC_012583	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119195
54	NC_012583	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119195
55	NC_012583	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119195
56	NC_012583	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119196
57	NC_012583	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
58	NC_012583	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119196
59	NC_012583	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
60	NC_012583	TGC	2	6	7071	7076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
61	NC_012583	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119196
62	NC_012583	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
63	NC_012583	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119196
64	NC_012583	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119196
65	NC_012583	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119196
66	NC_012583	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
67	NC_012583	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
68	NC_012583	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119196
69	NC_012583	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119196
70	NC_012583	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119196
71	NC_012583	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
72	NC_012583	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
73	NC_012583	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119196
74	NC_012583	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119196
75	NC_012583	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
76	NC_012583	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
77	NC_012583	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119196
78	NC_012583	CAT	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119197
79	NC_012583	CAA	2	6	8585	8590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119197
80	NC_012583	CAA	2	6	8593	8598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119197
81	NC_012583	GCC	2	6	8613	8618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119197
82	NC_012583	TGC	2	6	8629	8634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119197
83	NC_012583	ACC	2	6	8855	8860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119197
84	NC_012583	TGA	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119197
85	NC_012583	TAG	2	6	8988	8993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119198
86	NC_012583	CTT	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
87	NC_012583	TGG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
88	NC_012583	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
89	NC_012583	GTG	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
90	NC_012583	AGC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
91	NC_012583	CAG	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
92	NC_012583	TGC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
93	NC_012583	ATC	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
94	NC_012583	GTT	2	6	9689	9694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119198
95	NC_012583	AGC	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
96	NC_012583	GCA	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
97	NC_012583	TGC	2	6	10002	10007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
98	NC_012583	TGC	2	6	10086	10091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
99	NC_012583	CTG	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
100	NC_012583	CAT	2	6	10154	10159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
101	NC_012583	GGT	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
102	NC_012583	TGG	2	6	10351	10356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
103	NC_012583	GCT	2	6	10389	10394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
104	NC_012583	GCA	2	6	10453	10458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
105	NC_012583	TGA	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119198
106	NC_012583	GGC	3	9	10652	10660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119198
107	NC_012583	CAT	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
108	NC_012583	TCG	2	6	10902	10907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
109	NC_012583	CTT	2	6	10921	10926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
110	NC_012583	TGC	2	6	11004	11009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
111	NC_012583	GTC	2	6	11121	11126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
112	NC_012583	ACC	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
113	NC_012583	TCA	2	6	11289	11294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
114	NC_012583	GGT	2	6	11302	11307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
115	NC_012583	CAC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
116	NC_012583	TTA	2	6	11445	11450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119198
117	NC_012583	GCA	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119198
118	NC_012583	ATC	2	6	11498	11503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119198
119	NC_012583	ACC	2	6	11512	11517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119198
120	NC_012583	TGG	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119198
121	NC_012583	CGG	2	6	11572	11577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119198
122	NC_012583	TGC	2	6	11613	11618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119198
123	NC_012583	TCT	2	6	11695	11700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119198
124	NC_012583	AAG	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
125	NC_012583	ACA	2	6	12353	12358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119199
126	NC_012583	ACG	2	6	12419	12424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119199
127	NC_012583	CAA	2	6	12520	12525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119199
128	NC_012583	GAA	2	6	12602	12607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
129	NC_012583	CAT	2	6	12618	12623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
130	NC_012583	GGT	2	6	12632	12637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119199
131	NC_012583	GCC	2	6	12650	12655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119199
132	NC_012583	GCG	2	6	12674	12679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119199
133	NC_012583	GAA	2	6	12743	12748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
134	NC_012583	AAG	2	6	12759	12764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
135	NC_012583	GTC	2	6	12857	12862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119199
136	NC_012583	CGT	3	9	12881	12889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119199
137	NC_012583	ACT	2	6	13029	13034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
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141	NC_012583	GCG	2	6	13310	13315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119199
142	NC_012583	CTG	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119199
143	NC_012583	CTG	2	6	13406	13411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119199
144	NC_012583	ATC	2	6	13427	13432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
145	NC_012583	ACC	2	6	13443	13448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119199
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149	NC_012583	GCG	2	6	13589	13594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119199
150	NC_012583	TTG	2	6	13635	13640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119199
151	NC_012583	AGA	2	6	13737	13742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119199
152	NC_012583	GCG	2	6	13805	13810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119199
153	NC_012583	CAA	2	6	13843	13848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119199
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157	NC_012583	TTC	2	6	14033	14038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119199
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159	NC_012583	ATC	2	6	14078	14083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
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161	NC_012583	ATC	2	6	14186	14191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119199
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245	NC_012583	TGA	2	6	21596	21601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119203
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249	NC_012583	CGG	2	6	22109	22114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119203
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251	NC_012583	GCA	2	6	22135	22140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119203
252	NC_012583	CGG	2	6	22229	22234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119203
253	NC_012583	TTA	2	6	22240	22245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119203
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255	NC_012583	CGG	2	6	22298	22303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119203
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374	NC_012583	CTT	2	6	32189	32194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119211
375	NC_012583	TTG	2	6	32232	32237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119211
376	NC_012583	AGT	2	6	32242	32247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119211
377	NC_012583	GAG	2	6	32282	32287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119211
378	NC_012583	CAC	2	6	32349	32354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119211
379	NC_012583	GAT	3	9	32364	32372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119211
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382	NC_012583	CGC	2	6	33055	33060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119212
383	NC_012583	GCA	2	6	33095	33100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119212
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386	NC_012583	GGT	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
387	NC_012583	TTG	2	6	33528	33533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119212
388	NC_012583	GCT	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119212
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403	NC_012583	GTG	2	6	35180	35185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119212
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407	NC_012583	GTT	2	6	35565	35570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119212
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494	NC_012583	CAC	2	6	44294	44299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119220
495	NC_012583	AGT	2	6	44329	44334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119220
496	NC_012583	TCA	2	6	44339	44344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119220
497	NC_012583	GCA	2	6	44374	44379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119220
498	NC_012583	TGC	2	6	44403	44408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119220
499	NC_012583	GCA	2	6	44509	44514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119220
500	NC_012583	GTA	2	6	44595	44600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119220

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