MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 1819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012583	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012583	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012583	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	227119190
4	NC_012583	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	227119190
5	NC_012583	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	227119190
6	NC_012583	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	227119190
7	NC_012583	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	227119191
8	NC_012583	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012583	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012583	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	227119194
11	NC_012583	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	227119195
12	NC_012583	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	227119195
13	NC_012583	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	227119195
14	NC_012583	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	227119196
15	NC_012583	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	227119196
16	NC_012583	CT	3	6	6982	6987	0 %	50 %	0 %	50 %	227119196
17	NC_012583	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	227119196
18	NC_012583	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	227119196
19	NC_012583	GC	3	6	7542	7547	0 %	0 %	50 %	50 %	227119196
20	NC_012583	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	227119196
21	NC_012583	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	227119196
22	NC_012583	AG	3	6	8515	8520	50 %	0 %	50 %	0 %	227119197
23	NC_012583	TC	3	6	8772	8777	0 %	50 %	0 %	50 %	227119197
24	NC_012583	GC	3	6	9595	9600	0 %	0 %	50 %	50 %	227119198
25	NC_012583	GC	3	6	9955	9960	0 %	0 %	50 %	50 %	227119198
26	NC_012583	GC	3	6	10691	10696	0 %	0 %	50 %	50 %	227119198
27	NC_012583	TC	3	6	11702	11707	0 %	50 %	0 %	50 %	227119198
28	NC_012583	GT	3	6	12540	12545	0 %	50 %	50 %	0 %	227119199
29	NC_012583	CG	3	6	12808	12813	0 %	0 %	50 %	50 %	227119199
30	NC_012583	TG	4	8	13554	13561	0 %	50 %	50 %	0 %	227119199
31	NC_012583	GC	3	6	14497	14502	0 %	0 %	50 %	50 %	227119199
32	NC_012583	GA	3	6	14802	14807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012583	GC	3	6	15069	15074	0 %	0 %	50 %	50 %	227119200
34	NC_012583	CG	3	6	15738	15743	0 %	0 %	50 %	50 %	227119200
35	NC_012583	GC	3	6	16926	16931	0 %	0 %	50 %	50 %	227119200
36	NC_012583	AC	3	6	17078	17083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012583	CT	3	6	18766	18771	0 %	50 %	0 %	50 %	227119201
38	NC_012583	GT	3	6	19148	19153	0 %	50 %	50 %	0 %	227119201
39	NC_012583	TA	3	6	19404	19409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012583	TC	3	6	19536	19541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012583	CT	3	6	20033	20038	0 %	50 %	0 %	50 %	227119202
42	NC_012583	TC	3	6	20804	20809	0 %	50 %	0 %	50 %	227119203
43	NC_012583	TG	3	6	20883	20888	0 %	50 %	50 %	0 %	227119203
44	NC_012583	GC	3	6	21512	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	227119203
45	NC_012583	TG	4	8	22475	22482	0 %	50 %	50 %	0 %	227119203
46	NC_012583	GT	3	6	22485	22490	0 %	50 %	50 %	0 %	227119203
47	NC_012583	CT	3	6	23797	23802	0 %	50 %	0 %	50 %	227119205
48	NC_012583	GT	3	6	23836	23841	0 %	50 %	50 %	0 %	227119205
49	NC_012583	TC	3	6	24933	24938	0 %	50 %	0 %	50 %	227119205
50	NC_012583	AG	3	6	25104	25109	50 %	0 %	50 %	0 %	227119205
51	NC_012583	GC	3	6	25484	25489	0 %	0 %	50 %	50 %	227119205
52	NC_012583	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	227119205
53	NC_012583	CG	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	227119205
54	NC_012583	GA	4	8	26741	26748	50 %	0 %	50 %	0 %	227119206
55	NC_012583	GC	3	6	27610	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	227119207
56	NC_012583	TG	3	6	27693	27698	0 %	50 %	50 %	0 %	227119207
57	NC_012583	GT	3	6	28144	28149	0 %	50 %	50 %	0 %	227119208
58	NC_012583	GC	3	6	28525	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	227119208
59	NC_012583	GT	3	6	28607	28612	0 %	50 %	50 %	0 %	227119208
60	NC_012583	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	227119209
61	NC_012583	AG	3	6	29906	29911	50 %	0 %	50 %	0 %	227119209
62	NC_012583	TC	3	6	32938	32943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012583	AG	3	6	33020	33025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012583	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	227119212
65	NC_012583	GC	3	6	34063	34068	0 %	0 %	50 %	50 %	227119212
66	NC_012583	AG	3	6	35629	35634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012583	TC	4	8	35849	35856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012583	CA	3	6	35953	35958	50 %	0 %	0 %	50 %	227119213
69	NC_012583	AG	3	6	36134	36139	50 %	0 %	50 %	0 %	227119213
70	NC_012583	GT	3	6	36774	36779	0 %	50 %	50 %	0 %	227119214
71	NC_012583	CT	3	6	37939	37944	0 %	50 %	0 %	50 %	227119215
72	NC_012583	CT	3	6	38329	38334	0 %	50 %	0 %	50 %	227119215
73	NC_012583	TG	3	6	39416	39421	0 %	50 %	50 %	0 %	227119216
74	NC_012583	TG	3	6	39710	39715	0 %	50 %	50 %	0 %	227119216
75	NC_012583	TG	3	6	41936	41941	0 %	50 %	50 %	0 %	227119217
76	NC_012583	TG	3	6	42238	42243	0 %	50 %	50 %	0 %	227119218
77	NC_012583	TA	3	6	43146	43151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012583	GC	3	6	44092	44097	0 %	0 %	50 %	50 %	227119220
79	NC_012583	GT	3	6	44365	44370	0 %	50 %	50 %	0 %	227119220
80	NC_012583	CA	3	6	44480	44485	50 %	0 %	0 %	50 %	227119220
81	NC_012583	GT	3	6	45079	45084	0 %	50 %	50 %	0 %	227119220
82	NC_012583	CG	4	8	46003	46010	0 %	0 %	50 %	50 %	227119221
83	NC_012583	CT	3	6	47155	47160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012583	AG	3	6	47479	47484	50 %	0 %	50 %	0 %	227119224
85	NC_012583	AT	3	6	48508	48513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012583	GA	3	6	48731	48736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012583	TG	3	6	48909	48914	0 %	50 %	50 %	0 %	227119225
88	NC_012583	CT	3	6	49167	49172	0 %	50 %	0 %	50 %	227119225
89	NC_012583	CA	3	6	49355	49360	50 %	0 %	0 %	50 %	227119225
90	NC_012583	GA	3	6	50426	50431	50 %	0 %	50 %	0 %	227119226
91	NC_012583	GA	3	6	50452	50457	50 %	0 %	50 %	0 %	227119226
92	NC_012583	CG	3	6	50541	50546	0 %	0 %	50 %	50 %	227119226
93	NC_012583	GT	3	6	51129	51134	0 %	50 %	50 %	0 %	227119227
94	NC_012583	TG	3	6	51520	51525	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
95	NC_012583	GT	3	6	51706	51711	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
96	NC_012583	TC	3	6	51794	51799	0 %	50 %	0 %	50 %	227119228
97	NC_012583	TG	3	6	52190	52195	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
98	NC_012583	GT	3	6	54848	54853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012583	AG	3	6	55254	55259	50 %	0 %	50 %	0 %	227119230
100	NC_012583	AC	3	6	56013	56018	50 %	0 %	0 %	50 %	227119230
101	NC_012583	GA	4	8	56102	56109	50 %	0 %	50 %	0 %	227119231
102	NC_012583	AC	4	8	56584	56591	50 %	0 %	0 %	50 %	227119232
103	NC_012583	CA	3	6	57281	57286	50 %	0 %	0 %	50 %	227119232
104	NC_012583	AG	3	6	57399	57404	50 %	0 %	50 %	0 %	227119232
105	NC_012583	GC	3	6	57958	57963	0 %	0 %	50 %	50 %	227119232
106	NC_012583	GC	3	6	58033	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	227119232
107	NC_012583	CA	3	6	58415	58420	50 %	0 %	0 %	50 %	227119233
108	NC_012583	GA	3	6	58535	58540	50 %	0 %	50 %	0 %	227119233
109	NC_012583	GC	3	6	58591	58596	0 %	0 %	50 %	50 %	227119233
110	NC_012583	TG	3	6	60634	60639	0 %	50 %	50 %	0 %	227119234
111	NC_012583	TG	3	6	62003	62008	0 %	50 %	50 %	0 %	227119235
112	NC_012583	GA	3	6	62129	62134	50 %	0 %	50 %	0 %	227119236
113	NC_012583	CT	3	6	62149	62154	0 %	50 %	0 %	50 %	227119236
114	NC_012583	AG	3	6	62591	62596	50 %	0 %	50 %	0 %	227119237
115	NC_012583	TG	3	6	62638	62643	0 %	50 %	50 %	0 %	227119237
116	NC_012583	CG	3	6	62949	62954	0 %	0 %	50 %	50 %	227119237
117	NC_012583	GT	3	6	64041	64046	0 %	50 %	50 %	0 %	227119238
118	NC_012583	GC	3	6	64551	64556	0 %	0 %	50 %	50 %	227119239
119	NC_012583	GC	3	6	64716	64721	0 %	0 %	50 %	50 %	227119239
120	NC_012583	TG	3	6	64846	64851	0 %	50 %	50 %	0 %	227119239
121	NC_012583	GC	3	6	64997	65002	0 %	0 %	50 %	50 %	227119239
122	NC_012583	GT	3	6	66235	66240	0 %	50 %	50 %	0 %	227119240
123	NC_012583	GC	4	8	66351	66358	0 %	0 %	50 %	50 %	227119240
124	NC_012583	GA	3	6	66459	66464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012583	TG	3	6	67981	67986	0 %	50 %	50 %	0 %	227119242
126	NC_012583	GC	3	6	69201	69206	0 %	0 %	50 %	50 %	227119244
127	NC_012583	AC	3	6	69724	69729	50 %	0 %	0 %	50 %	227119244
128	NC_012583	TC	3	6	69915	69920	0 %	50 %	0 %	50 %	227119244
129	NC_012583	GC	3	6	70384	70389	0 %	0 %	50 %	50 %	227119244
130	NC_012583	CA	3	6	71793	71798	50 %	0 %	0 %	50 %	227119245
131	NC_012583	AG	3	6	72703	72708	50 %	0 %	50 %	0 %	227119245
132	NC_012583	TC	3	6	73922	73927	0 %	50 %	0 %	50 %	227119246
133	NC_012583	TC	3	6	75241	75246	0 %	50 %	0 %	50 %	227119246
134	NC_012583	TC	3	6	75278	75283	0 %	50 %	0 %	50 %	227119246
135	NC_012583	GC	3	6	75427	75432	0 %	0 %	50 %	50 %	227119247
136	NC_012583	GC	3	6	75603	75608	0 %	0 %	50 %	50 %	227119247
137	NC_012583	CA	3	6	76892	76897	50 %	0 %	0 %	50 %	227119248
138	NC_012583	GA	3	6	77676	77681	50 %	0 %	50 %	0 %	227119249
139	NC_012583	CG	3	6	77818	77823	0 %	0 %	50 %	50 %	227119249
140	NC_012583	CG	3	6	77877	77882	0 %	0 %	50 %	50 %	227119249
141	NC_012583	CT	3	6	78046	78051	0 %	50 %	0 %	50 %	227119249
142	NC_012583	TG	3	6	78113	78118	0 %	50 %	50 %	0 %	227119249
143	NC_012583	CT	3	6	78280	78285	0 %	50 %	0 %	50 %	227119249
144	NC_012583	CG	3	6	80922	80927	0 %	0 %	50 %	50 %	227119252
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