MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 6652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	AATC	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	227116372
2	NC_012582	TGGC	2	8	1387	1394	0 %	25 %	50 %	25 %	227116372
3	NC_012582	AGAT	2	8	1641	1648	50 %	25 %	25 %	0 %	227116372
4	NC_012582	CAAC	2	8	2317	2324	50 %	0 %	0 %	50 %	227116373
5	NC_012582	GGCA	2	8	2787	2794	25 %	0 %	50 %	25 %	227116373
6	NC_012582	GGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	75 %	0 %	227116373
7	NC_012582	GCAA	2	8	3488	3495	50 %	0 %	25 %	25 %	227116373
8	NC_012582	AAAG	2	8	4853	4860	75 %	0 %	25 %	0 %	227116374
9	NC_012582	CAAA	2	8	4944	4951	75 %	0 %	0 %	25 %	227116374
10	NC_012582	TCCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	227116374
11	NC_012582	TCAT	2	8	8128	8135	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
12	NC_012582	TCTT	2	8	8296	8303	0 %	75 %	0 %	25 %	227116375
13	NC_012582	CTAT	2	8	8335	8342	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
14	NC_012582	TTGA	2	8	8480	8487	25 %	50 %	25 %	0 %	227116375
15	NC_012582	TGCT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	25 %	25 %	227116375
16	NC_012582	CTGA	2	8	9318	9325	25 %	25 %	25 %	25 %	227116376
17	NC_012582	ATGA	2	8	9417	9424	50 %	25 %	25 %	0 %	227116376
18	NC_012582	TCTA	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	227116377
19	NC_012582	GGTG	2	8	10882	10889	0 %	25 %	75 %	0 %	227116379
20	NC_012582	GATG	2	8	11179	11186	25 %	25 %	50 %	0 %	227116379
21	NC_012582	GAAT	2	8	11233	11240	50 %	25 %	25 %	0 %	227116379
22	NC_012582	ATGA	2	8	12129	12136	50 %	25 %	25 %	0 %	227116380
23	NC_012582	TTTG	2	8	12466	12473	0 %	75 %	25 %	0 %	227116381
24	NC_012582	TGAT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	25 %	0 %	227116382
25	NC_012582	CTTG	2	8	13269	13276	0 %	50 %	25 %	25 %	227116382
26	NC_012582	TCGC	2	8	13291	13298	0 %	25 %	25 %	50 %	227116382
27	NC_012582	GTCT	2	8	13994	14001	0 %	50 %	25 %	25 %	227116382
28	NC_012582	AAGA	2	8	14031	14038	75 %	0 %	25 %	0 %	227116382
29	NC_012582	ATGT	2	8	14474	14481	25 %	50 %	25 %	0 %	227116382
30	NC_012582	TCAT	2	8	14902	14909	25 %	50 %	0 %	25 %	227116383
31	NC_012582	AGCA	2	8	14958	14965	50 %	0 %	25 %	25 %	227116383
32	NC_012582	TTCG	2	8	15168	15175	0 %	50 %	25 %	25 %	227116383
33	NC_012582	TGGT	2	8	15307	15314	0 %	50 %	50 %	0 %	227116383
34	NC_012582	GACG	3	12	15335	15346	25 %	0 %	50 %	25 %	227116383
35	NC_012582	TTGT	2	8	15388	15395	0 %	75 %	25 %	0 %	227116383
36	NC_012582	AAGA	2	8	15489	15496	75 %	0 %	25 %	0 %	227116383
37	NC_012582	TTTG	2	8	15503	15510	0 %	75 %	25 %	0 %	227116383
38	NC_012582	ACTA	2	8	16470	16477	50 %	25 %	0 %	25 %	227116384
39	NC_012582	GTCT	2	8	17690	17697	0 %	50 %	25 %	25 %	227116384
40	NC_012582	TGAA	2	8	18672	18679	50 %	25 %	25 %	0 %	227116385
41	NC_012582	ATGG	2	8	18760	18767	25 %	25 %	50 %	0 %	227116385
42	NC_012582	CACT	2	8	19900	19907	25 %	25 %	0 %	50 %	227116386
43	NC_012582	ATTT	2	8	20050	20057	25 %	75 %	0 %	0 %	227116386
44	NC_012582	CAAC	2	8	20455	20462	50 %	0 %	0 %	50 %	227116386
45	NC_012582	CAAA	2	8	20764	20771	75 %	0 %	0 %	25 %	227116386
46	NC_012582	TTGC	2	8	22160	22167	0 %	50 %	25 %	25 %	227116387
47	NC_012582	ATTA	2	8	22213	22220	50 %	50 %	0 %	0 %	227116387
48	NC_012582	CTAA	2	8	22667	22674	50 %	25 %	0 %	25 %	227116389
49	NC_012582	CCAG	2	8	23472	23479	25 %	0 %	25 %	50 %	227116389
50	NC_012582	TTGC	2	8	23493	23500	0 %	50 %	25 %	25 %	227116389
51	NC_012582	CTTT	2	8	23537	23544	0 %	75 %	0 %	25 %	227116389
52	NC_012582	GGTC	2	8	23988	23995	0 %	25 %	50 %	25 %	227116390
53	NC_012582	CTAC	2	8	24097	24104	25 %	25 %	0 %	50 %	227116390
54	NC_012582	GCCT	2	8	24135	24142	0 %	25 %	25 %	50 %	227116390
55	NC_012582	AGGC	2	8	24300	24307	25 %	0 %	50 %	25 %	227116390
56	NC_012582	CATT	2	8	24814	24821	25 %	50 %	0 %	25 %	227116391
57	NC_012582	GCAC	2	8	24966	24973	25 %	0 %	25 %	50 %	227116391
58	NC_012582	ATAC	2	8	25529	25536	50 %	25 %	0 %	25 %	227116392
59	NC_012582	GTTA	2	8	25568	25575	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
60	NC_012582	GTTT	2	8	25609	25616	0 %	75 %	25 %	0 %	227116392
61	NC_012582	AATG	2	8	25785	25792	50 %	25 %	25 %	0 %	227116392
62	NC_012582	TGAT	2	8	26038	26045	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
63	NC_012582	ATTG	2	8	26080	26087	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
64	NC_012582	TGTC	2	8	26112	26119	0 %	50 %	25 %	25 %	227116392
65	NC_012582	CATC	2	8	26528	26535	25 %	25 %	0 %	50 %	227116392
66	NC_012582	TATT	2	8	26662	26669	25 %	75 %	0 %	0 %	227116392
67	NC_012582	GTTG	2	8	27833	27840	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
68	NC_012582	AGGT	2	8	28336	28343	25 %	25 %	50 %	0 %	227116393
69	NC_012582	AGAT	2	8	28532	28539	50 %	25 %	25 %	0 %	227116393
70	NC_012582	AGCC	2	8	29442	29449	25 %	0 %	25 %	50 %	227116393
71	NC_012582	TCAT	2	8	29964	29971	25 %	50 %	0 %	25 %	227116394
72	NC_012582	TGTT	2	8	30069	30076	0 %	75 %	25 %	0 %	227116394
73	NC_012582	CAGT	2	8	30084	30091	25 %	25 %	25 %	25 %	227116394
74	NC_012582	AAAT	2	8	30123	30130	75 %	25 %	0 %	0 %	227116394
75	NC_012582	TCCT	2	8	30261	30268	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
76	NC_012582	CTTT	2	8	30709	30716	0 %	75 %	0 %	25 %	227116394
77	NC_012582	AGGT	2	8	30774	30781	25 %	25 %	50 %	0 %	227116394
78	NC_012582	CAAC	2	8	30955	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
79	NC_012582	TGTT	2	8	31732	31739	0 %	75 %	25 %	0 %	227116395
80	NC_012582	CCTT	2	8	33595	33602	0 %	50 %	0 %	50 %	227116397
81	NC_012582	TGAT	2	8	34442	34449	25 %	50 %	25 %	0 %	227116398
82	NC_012582	AAAC	2	8	34450	34457	75 %	0 %	0 %	25 %	227116398
83	NC_012582	CAAT	2	8	34485	34492	50 %	25 %	0 %	25 %	227116398
84	NC_012582	GGTG	2	8	35088	35095	0 %	25 %	75 %	0 %	227116398
85	NC_012582	TCAT	2	8	35423	35430	25 %	50 %	0 %	25 %	227116398
86	NC_012582	CCAA	2	8	35889	35896	50 %	0 %	0 %	50 %	227116399
87	NC_012582	GCAC	2	8	35900	35907	25 %	0 %	25 %	50 %	227116399
88	NC_012582	GAGC	2	8	36937	36944	25 %	0 %	50 %	25 %	227116400
89	NC_012582	AATG	2	8	37681	37688	50 %	25 %	25 %	0 %	227116400
90	NC_012582	CTGA	2	8	38706	38713	25 %	25 %	25 %	25 %	227116402
91	NC_012582	ACCC	2	8	39081	39088	25 %	0 %	0 %	75 %	227116402
92	NC_012582	TCGG	2	8	39421	39428	0 %	25 %	50 %	25 %	227116402
93	NC_012582	GCCA	2	8	39888	39895	25 %	0 %	25 %	50 %	227116403
94	NC_012582	GAAA	2	8	40012	40019	75 %	0 %	25 %	0 %	227116403
95	NC_012582	CATG	2	8	40602	40609	25 %	25 %	25 %	25 %	227116404
96	NC_012582	GCTT	2	8	41333	41340	0 %	50 %	25 %	25 %	227116405
97	NC_012582	AAGC	2	8	42998	43005	50 %	0 %	25 %	25 %	227116408
98	NC_012582	CATT	2	8	43105	43112	25 %	50 %	0 %	25 %	227116408
99	NC_012582	GGTC	2	8	43890	43897	0 %	25 %	50 %	25 %	227116410
100	NC_012582	TCAA	2	8	44055	44062	50 %	25 %	0 %	25 %	227116411
101	NC_012582	GGTA	2	8	45109	45116	25 %	25 %	50 %	0 %	227116411
102	NC_012582	ATTC	2	8	45321	45328	25 %	50 %	0 %	25 %	227116412
103	NC_012582	GATT	2	8	45501	45508	25 %	50 %	25 %	0 %	227116412
104	NC_012582	CAAG	2	8	45724	45731	50 %	0 %	25 %	25 %	227116412
105	NC_012582	CTGA	2	8	46247	46254	25 %	25 %	25 %	25 %	227116413
106	NC_012582	TGAC	2	8	46296	46303	25 %	25 %	25 %	25 %	227116413
107	NC_012582	ATGA	2	8	47759	47766	50 %	25 %	25 %	0 %	227116414
108	NC_012582	TTTG	2	8	48080	48087	0 %	75 %	25 %	0 %	227116415
109	NC_012582	TCGC	2	8	48222	48229	0 %	25 %	25 %	50 %	227116416
110	NC_012582	TGAA	2	8	48439	48446	50 %	25 %	25 %	0 %	227116416
111	NC_012582	ATCA	2	8	48567	48574	50 %	25 %	0 %	25 %	227116416
112	NC_012582	TGAA	2	8	49222	49229	50 %	25 %	25 %	0 %	227116416
113	NC_012582	GCTG	2	8	49869	49876	0 %	25 %	50 %	25 %	227116417
114	NC_012582	CGCT	2	8	49963	49970	0 %	25 %	25 %	50 %	227116417
115	NC_012582	CGCT	2	8	50021	50028	0 %	25 %	25 %	50 %	227116417
116	NC_012582	CGGG	2	8	50735	50742	0 %	0 %	75 %	25 %	227116418
117	NC_012582	CTCA	2	8	50788	50795	25 %	25 %	0 %	50 %	227116418
118	NC_012582	CTGA	2	8	51211	51218	25 %	25 %	25 %	25 %	227116418
119	NC_012582	TCGG	2	8	51860	51867	0 %	25 %	50 %	25 %	227116418
120	NC_012582	CATG	2	8	51903	51910	25 %	25 %	25 %	25 %	227116418
121	NC_012582	GTTT	2	8	52391	52398	0 %	75 %	25 %	0 %	227116418
122	NC_012582	CGCT	2	8	53020	53027	0 %	25 %	25 %	50 %	227116419
123	NC_012582	TCGC	2	8	53385	53392	0 %	25 %	25 %	50 %	227116419
124	NC_012582	GCCA	2	8	53517	53524	25 %	0 %	25 %	50 %	227116419
125	NC_012582	CGCA	2	8	53815	53822	25 %	0 %	25 %	50 %	227116420
126	NC_012582	GAGC	2	8	55147	55154	25 %	0 %	50 %	25 %	227116421
127	NC_012582	ATGG	2	8	55839	55846	25 %	25 %	50 %	0 %	227116422
128	NC_012582	CCAA	2	8	56376	56383	50 %	0 %	0 %	50 %	227116423
129	NC_012582	AATC	2	8	56728	56735	50 %	25 %	0 %	25 %	227116423
130	NC_012582	GCCA	2	8	56981	56988	25 %	0 %	25 %	50 %	227116423
131	NC_012582	GATA	2	8	57612	57619	50 %	25 %	25 %	0 %	227116424
132	NC_012582	CTGG	2	8	57795	57802	0 %	25 %	50 %	25 %	227116425
133	NC_012582	CAAG	2	8	57888	57895	50 %	0 %	25 %	25 %	227116425
134	NC_012582	GATT	2	8	57921	57928	25 %	50 %	25 %	0 %	227116425
135	NC_012582	CATT	2	8	59894	59901	25 %	50 %	0 %	25 %	227116426
136	NC_012582	TTCA	2	8	60106	60113	25 %	50 %	0 %	25 %	227116426
137	NC_012582	CGAT	2	8	60258	60265	25 %	25 %	25 %	25 %	227116426
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139	NC_012582	GCTG	2	8	61796	61803	0 %	25 %	50 %	25 %	227116428
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