MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 4323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	227116371
2	NC_012582	GC	3	6	1109	1114	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
3	NC_012582	GC	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
4	NC_012582	CT	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	227116373
5	NC_012582	CG	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	227116374
6	NC_012582	GA	3	6	3970	3975	50 %	0 %	50 %	0 %	227116374
7	NC_012582	CA	3	6	4679	4684	50 %	0 %	0 %	50 %	227116374
8	NC_012582	CT	3	6	5066	5071	0 %	50 %	0 %	50 %	227116374
9	NC_012582	AT	3	6	9563	9568	50 %	50 %	0 %	0 %	227116376
10	NC_012582	TG	3	6	10481	10486	0 %	50 %	50 %	0 %	227116378
11	NC_012582	GA	3	6	10998	11003	50 %	0 %	50 %	0 %	227116379
12	NC_012582	TC	3	6	11476	11481	0 %	50 %	0 %	50 %	227116379
13	NC_012582	AT	3	6	14201	14206	50 %	50 %	0 %	0 %	227116382
14	NC_012582	AC	3	6	14345	14350	50 %	0 %	0 %	50 %	227116382
15	NC_012582	GA	3	6	15454	15459	50 %	0 %	50 %	0 %	227116383
16	NC_012582	TG	4	8	15713	15720	0 %	50 %	50 %	0 %	227116383
17	NC_012582	CA	3	6	16944	16949	50 %	0 %	0 %	50 %	227116384
18	NC_012582	TC	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
19	NC_012582	CT	3	6	19195	19200	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
20	NC_012582	AG	3	6	21141	21146	50 %	0 %	50 %	0 %	227116386
21	NC_012582	AG	3	6	22349	22354	50 %	0 %	50 %	0 %	227116388
22	NC_012582	TC	3	6	23005	23010	0 %	50 %	0 %	50 %	227116389
23	NC_012582	CT	3	6	23012	23017	0 %	50 %	0 %	50 %	227116389
24	NC_012582	AG	3	6	23123	23128	50 %	0 %	50 %	0 %	227116389
25	NC_012582	CA	3	6	23513	23518	50 %	0 %	0 %	50 %	227116389
26	NC_012582	CT	3	6	24938	24943	0 %	50 %	0 %	50 %	227116391
27	NC_012582	CA	3	6	25475	25480	50 %	0 %	0 %	50 %	227116392
28	NC_012582	AT	3	6	25715	25720	50 %	50 %	0 %	0 %	227116392
29	NC_012582	TC	3	6	26721	26726	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
30	NC_012582	CT	3	6	27224	27229	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
31	NC_012582	TC	3	6	28404	28409	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
32	NC_012582	CT	3	6	28572	28577	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
33	NC_012582	AT	3	6	28750	28755	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
34	NC_012582	AG	3	6	28789	28794	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
35	NC_012582	AG	3	6	29249	29254	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
36	NC_012582	TA	3	6	29626	29631	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
37	NC_012582	CT	3	6	29654	29659	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
38	NC_012582	TG	3	6	29843	29848	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
39	NC_012582	AT	3	6	29979	29984	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
40	NC_012582	CT	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
41	NC_012582	AT	3	6	30929	30934	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
42	NC_012582	AC	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
43	NC_012582	TA	3	6	31220	31225	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
44	NC_012582	CG	3	6	31861	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	227116395
45	NC_012582	TA	3	6	32197	32202	50 %	50 %	0 %	0 %	227116395
46	NC_012582	AG	3	6	32282	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	227116395
47	NC_012582	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	227116395
48	NC_012582	TC	3	6	33166	33171	0 %	50 %	0 %	50 %	227116396
49	NC_012582	TC	3	6	33176	33181	0 %	50 %	0 %	50 %	227116396
50	NC_012582	AG	3	6	34275	34280	50 %	0 %	50 %	0 %	227116398
51	NC_012582	CT	3	6	34831	34836	0 %	50 %	0 %	50 %	227116398
52	NC_012582	GC	3	6	34944	34949	0 %	0 %	50 %	50 %	227116398
53	NC_012582	GC	5	10	35314	35323	0 %	0 %	50 %	50 %	227116398
54	NC_012582	TG	3	6	35957	35962	0 %	50 %	50 %	0 %	227116399
55	NC_012582	CG	3	6	36150	36155	0 %	0 %	50 %	50 %	227116399
56	NC_012582	CG	3	6	38001	38006	0 %	0 %	50 %	50 %	227116401
57	NC_012582	AG	3	6	38037	38042	50 %	0 %	50 %	0 %	227116401
58	NC_012582	CG	3	6	38873	38878	0 %	0 %	50 %	50 %	227116402
59	NC_012582	GA	4	8	39158	39165	50 %	0 %	50 %	0 %	227116402
60	NC_012582	GC	3	6	39405	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	227116402
61	NC_012582	AG	3	6	41240	41245	50 %	0 %	50 %	0 %	227116405
62	NC_012582	CA	3	6	41285	41290	50 %	0 %	0 %	50 %	227116405
63	NC_012582	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	227116406
64	NC_012582	CA	3	6	43394	43399	50 %	0 %	0 %	50 %	227116409
65	NC_012582	TC	3	6	43941	43946	0 %	50 %	0 %	50 %	227116410
66	NC_012582	GT	3	6	45189	45194	0 %	50 %	50 %	0 %	227116411
67	NC_012582	TG	3	6	46771	46776	0 %	50 %	50 %	0 %	227116413
68	NC_012582	CA	3	6	47097	47102	50 %	0 %	0 %	50 %	227116414
69	NC_012582	TG	3	6	47667	47672	0 %	50 %	50 %	0 %	227116414
70	NC_012582	TC	3	6	48422	48427	0 %	50 %	0 %	50 %	227116416
71	NC_012582	CT	3	6	49208	49213	0 %	50 %	0 %	50 %	227116416
72	NC_012582	GC	3	6	49943	49948	0 %	0 %	50 %	50 %	227116417
73	NC_012582	AG	3	6	49993	49998	50 %	0 %	50 %	0 %	227116417
74	NC_012582	GC	3	6	50081	50086	0 %	0 %	50 %	50 %	227116417
75	NC_012582	AC	3	6	50671	50676	50 %	0 %	0 %	50 %	227116418
76	NC_012582	GC	3	6	52173	52178	0 %	0 %	50 %	50 %	227116418
77	NC_012582	GA	3	6	52749	52754	50 %	0 %	50 %	0 %	227116418
78	NC_012582	GA	3	6	52989	52994	50 %	0 %	50 %	0 %	227116419
79	NC_012582	GC	3	6	53217	53222	0 %	0 %	50 %	50 %	227116419
80	NC_012582	GC	3	6	53707	53712	0 %	0 %	50 %	50 %	227116420
81	NC_012582	GA	3	6	55106	55111	50 %	0 %	50 %	0 %	227116421
82	NC_012582	GT	3	6	55687	55692	0 %	50 %	50 %	0 %	227116422
83	NC_012582	GC	4	8	55893	55900	0 %	0 %	50 %	50 %	227116422
84	NC_012582	GA	3	6	56048	56053	50 %	0 %	50 %	0 %	227116422
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86	NC_012582	GT	3	6	56508	56513	0 %	50 %	50 %	0 %	227116423
87	NC_012582	CG	3	6	56561	56566	0 %	0 %	50 %	50 %	227116423
88	NC_012582	GC	3	6	57054	57059	0 %	0 %	50 %	50 %	227116423
89	NC_012582	CG	3	6	60189	60194	0 %	0 %	50 %	50 %	227116426
90	NC_012582	CG	3	6	61057	61062	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
91	NC_012582	GC	3	6	61148	61153	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
92	NC_012582	GC	3	6	61565	61570	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
93	NC_012582	CG	3	6	61623	61628	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
94	NC_012582	CA	3	6	61769	61774	50 %	0 %	0 %	50 %	227116428
95	NC_012582	GT	3	6	62420	62425	0 %	50 %	50 %	0 %	227116429
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97	NC_012582	GA	3	6	63590	63595	50 %	0 %	50 %	0 %	227116430
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100	NC_012582	GC	3	6	66810	66815	0 %	0 %	50 %	50 %	227116433
101	NC_012582	AG	3	6	66942	66947	50 %	0 %	50 %	0 %	227116433
102	NC_012582	GA	3	6	68060	68065	50 %	0 %	50 %	0 %	227116435
103	NC_012582	CT	3	6	68119	68124	0 %	50 %	0 %	50 %	227116435
104	NC_012582	CG	3	6	68737	68742	0 %	0 %	50 %	50 %	227116436
105	NC_012582	GC	3	6	69884	69889	0 %	0 %	50 %	50 %	227116437
106	NC_012582	GA	3	6	71505	71510	50 %	0 %	50 %	0 %	227116440
107	NC_012582	GC	3	6	72224	72229	0 %	0 %	50 %	50 %	227116440
108	NC_012582	GC	3	6	73160	73165	0 %	0 %	50 %	50 %	227116440
109	NC_012582	TA	3	6	76861	76866	50 %	50 %	0 %	0 %	227116446
110	NC_012582	AG	3	6	76959	76964	50 %	0 %	50 %	0 %	227116446
111	NC_012582	GC	3	6	78503	78508	0 %	0 %	50 %	50 %	227116449
112	NC_012582	CT	3	6	80168	80173	0 %	50 %	0 %	50 %	227116450
113	NC_012582	CT	3	6	81881	81886	0 %	50 %	0 %	50 %	227116453
114	NC_012582	GA	3	6	82296	82301	50 %	0 %	50 %	0 %	227116453
115	NC_012582	GC	4	8	82323	82330	0 %	0 %	50 %	50 %	227116454
116	NC_012582	GT	3	6	82484	82489	0 %	50 %	50 %	0 %	227116454
117	NC_012582	CT	3	6	82656	82661	0 %	50 %	0 %	50 %	227116454
118	NC_012582	GA	3	6	83312	83317	50 %	0 %	50 %	0 %	227116455
119	NC_012582	CA	3	6	84080	84085	50 %	0 %	0 %	50 %	227116455
120	NC_012582	TG	3	6	84119	84124	0 %	50 %	50 %	0 %	227116455
121	NC_012582	GC	3	6	84930	84935	0 %	0 %	50 %	50 %	227116455
122	NC_012582	GC	3	6	86443	86448	0 %	0 %	50 %	50 %	227116456
123	NC_012582	GT	3	6	87100	87105	0 %	50 %	50 %	0 %	227116457
124	NC_012582	CG	3	6	87442	87447	0 %	0 %	50 %	50 %	227116457
125	NC_012582	TG	3	6	87587	87592	0 %	50 %	50 %	0 %	227116458
126	NC_012582	CT	3	6	88285	88290	0 %	50 %	0 %	50 %	227116458
127	NC_012582	GT	3	6	88725	88730	0 %	50 %	50 %	0 %	227116458
128	NC_012582	AC	3	6	88814	88819	50 %	0 %	0 %	50 %	227116458
129	NC_012582	GC	3	6	88906	88911	0 %	0 %	50 %	50 %	227116458
130	NC_012582	TA	3	6	90813	90818	50 %	50 %	0 %	0 %	227116460
131	NC_012582	CG	3	6	92381	92386	0 %	0 %	50 %	50 %	227116463
132	NC_012582	CA	3	6	92427	92432	50 %	0 %	0 %	50 %	227116463
133	NC_012582	CA	3	6	92454	92459	50 %	0 %	0 %	50 %	227116463
134	NC_012582	AC	3	6	92733	92738	50 %	0 %	0 %	50 %	227116463
135	NC_012582	GT	3	6	93137	93142	0 %	50 %	50 %	0 %	227116463
136	NC_012582	GC	3	6	93722	93727	0 %	0 %	50 %	50 %	227116464
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138	NC_012582	GC	3	6	95220	95225	0 %	0 %	50 %	50 %	227116466
139	NC_012582	GC	3	6	96185	96190	0 %	0 %	50 %	50 %	227116466
140	NC_012582	CG	3	6	96675	96680	0 %	0 %	50 %	50 %	227116467
141	NC_012582	GC	3	6	98103	98108	0 %	0 %	50 %	50 %	227116468
142	NC_012582	GT	3	6	100312	100317	0 %	50 %	50 %	0 %	227116472
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