MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	AGCGGT	2	12	8329	8340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012580	TTCATA	2	12	48303	48314	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012580	AATTCA	2	12	83129	83140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012580	AATAAA	2	12	86553	86564	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012580	AAGTGA	2	12	195228	195239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012580	TGTTGA	2	12	196426	196437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012580	TTATTT	2	12	201945	201956	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012580	GAAGGA	2	12	243897	243908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012580	GATGGA	2	12	258626	258637	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012580	GTTTGG	2	12	339549	339560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012580	GTTTGG	2	12	364407	364418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012580	GTTTGG	2	12	387993	388004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012580	TCAAAA	2	12	402958	402969	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012580	TTTTCA	2	12	419119	419130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012580	TAGTGA	2	12	428747	428758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012580	TAGTGG	2	12	457913	457924	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012580	TGGTTA	2	12	558435	558446	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012580	GATCAA	2	12	566852	566863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012580	TCTTTT	2	12	568556	568567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012580	AAACTC	2	12	570223	570234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012580	AAATAA	2	12	604420	604431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012580	CAAATA	2	12	604694	604705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012580	CAACCC	2	12	651682	651693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012580	GACACT	2	12	661741	661752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012580	AAAACC	2	12	678560	678571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012580	AGGAAT	2	12	693633	693644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012580	CTAAGC	2	12	757780	757791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012580	CAATAA	2	12	785742	785753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012580	AAATTA	2	12	806416	806427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012580	TTATTG	2	12	819014	819025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012580	AATCAC	2	12	914687	914698	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012580	TAGAAA	2	12	960559	960570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012580	AAAATT	2	12	989947	989958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012580	AAAATG	2	12	1002163	1002174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012580	TCCGCT	2	12	1013592	1013603	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.