MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 11218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
2	NC_012580	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811636
3	NC_012580	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
4	NC_012580	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
5	NC_012580	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
6	NC_012580	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
7	NC_012580	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
8	NC_012580	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
9	NC_012580	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
10	NC_012580	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811636
11	NC_012580	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811636
12	NC_012580	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
13	NC_012580	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
14	NC_012580	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
15	NC_012580	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
16	NC_012580	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811636
17	NC_012580	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811636
18	NC_012580	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
19	NC_012580	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
20	NC_012580	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
21	NC_012580	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
22	NC_012580	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
23	NC_012580	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
24	NC_012580	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
25	NC_012580	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811637
26	NC_012580	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
27	NC_012580	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
28	NC_012580	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
29	NC_012580	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
30	NC_012580	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811638
31	NC_012580	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
32	NC_012580	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811638
33	NC_012580	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
34	NC_012580	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811638
35	NC_012580	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645757
36	NC_012580	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
37	NC_012580	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811640
38	NC_012580	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811640
39	NC_012580	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
40	NC_012580	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
41	NC_012580	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
42	NC_012580	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811640
43	NC_012580	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811640
44	NC_012580	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811640
45	NC_012580	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811640
46	NC_012580	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
47	NC_012580	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
48	NC_012580	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645758
49	NC_012580	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
50	NC_012580	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
51	NC_012580	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
52	NC_012580	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
53	NC_012580	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645758
54	NC_012580	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
55	NC_012580	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
56	NC_012580	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
57	NC_012580	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
58	NC_012580	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811642
59	NC_012580	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
60	NC_012580	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
61	NC_012580	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
62	NC_012580	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811642
63	NC_012580	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
64	NC_012580	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
65	NC_012580	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
66	NC_012580	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
67	NC_012580	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811642
68	NC_012580	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
69	NC_012580	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
70	NC_012580	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
71	NC_012580	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
72	NC_012580	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
73	NC_012580	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
74	NC_012580	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645759
75	NC_012580	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
76	NC_012580	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
77	NC_012580	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645759
78	NC_012580	TGA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645759
79	NC_012580	TAG	2	6	8988	8993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
80	NC_012580	CTT	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
81	NC_012580	TGG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
82	NC_012580	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
83	NC_012580	GTG	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
84	NC_012580	AGC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
85	NC_012580	TGC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
86	NC_012580	ATC	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
87	NC_012580	CAG	2	6	9476	9481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
88	NC_012580	CAG	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
89	NC_012580	GCA	2	6	9952	9957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
90	NC_012580	TGC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
91	NC_012580	AGT	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
92	NC_012580	TGC	2	6	10134	10139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
93	NC_012580	CGA	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
94	NC_012580	TGG	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
95	NC_012580	CGC	2	6	10373	10378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811644
96	NC_012580	CAT	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
97	NC_012580	GCG	2	6	10474	10479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
98	NC_012580	CGC	2	6	10493	10498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811644
99	NC_012580	CAG	2	6	10562	10567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
100	NC_012580	TGA	2	6	10605	10610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
101	NC_012580	GGC	3	9	10637	10645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
102	NC_012580	CAT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
103	NC_012580	GCT	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
104	NC_012580	TCG	2	6	10887	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
105	NC_012580	CTT	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
106	NC_012580	TGC	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
107	NC_012580	GTC	2	6	11106	11111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
108	NC_012580	ACC	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
109	NC_012580	TCA	2	6	11274	11279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
110	NC_012580	GGT	2	6	11287	11292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
111	NC_012580	CAC	2	6	11303	11308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
112	NC_012580	TTA	2	6	11430	11435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811644
113	NC_012580	GCA	2	6	11443	11448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
114	NC_012580	ATC	2	6	11483	11488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
115	NC_012580	ACC	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
116	NC_012580	TGG	2	6	11539	11544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
117	NC_012580	CGG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
118	NC_012580	TGC	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
119	NC_012580	TCT	2	6	11680	11685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
120	NC_012580	GTT	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811645
121	NC_012580	ACG	2	6	12404	12409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811645
122	NC_012580	CAA	2	6	12505	12510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811645
123	NC_012580	GAA	2	6	12587	12592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
124	NC_012580	CAT	2	6	12603	12608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811645
125	NC_012580	GGT	2	6	12617	12622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811645
126	NC_012580	GCC	2	6	12635	12640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811645
127	NC_012580	GCG	2	6	12659	12664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811645
128	NC_012580	GAA	2	6	12728	12733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
129	NC_012580	AAG	2	6	12744	12749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
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375	NC_012580	GCA	2	6	33089	33094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811658
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378	NC_012580	GGT	2	6	33505	33510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811658
379	NC_012580	TTG	2	6	33522	33527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811658
380	NC_012580	GCT	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811658
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387	NC_012580	CTG	2	6	34355	34360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811658
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497	NC_012580	GAA	2	6	44798	44803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811666
498	NC_012580	TCA	2	6	44862	44867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811666
499	NC_012580	AAC	2	6	44897	44902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811666
500	NC_012580	TGC	2	6	45010	45015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811666

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