MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012579	CTAATG	2	12	2108	2119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227811432
2	NC_012579	TTTCAT	2	12	4539	4550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227811436
3	NC_012579	TCAATT	2	12	4559	4570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811436
4	NC_012579	CTCTTT	2	12	9597	9608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811440
5	NC_012579	CGTCTG	2	12	10880	10891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811440
6	NC_012579	ACAAAA	2	12	15264	15275	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	227811445
7	NC_012579	TTTCTT	2	12	16025	16036	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811446
8	NC_012579	TTTTAA	2	12	16974	16985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811446
9	NC_012579	TTAATT	2	12	17144	17155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811446
10	NC_012579	ATGAAT	2	12	18813	18824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227811446
11	NC_012579	ACGCCA	2	12	20022	20033	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227811447
12	NC_012579	AGTGAT	2	12	25822	25833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811451
13	NC_012579	GTCTAC	2	12	32830	32841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811459
14	NC_012579	TTTTGA	2	12	36571	36582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227811468
15	NC_012579	ATGTAA	2	12	41358	41369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227811473
16	NC_012579	TTCATA	2	12	45586	45597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811476
17	NC_012579	TTTTTC	2	12	50661	50672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811483
18	NC_012579	ATTCTA	2	12	50897	50908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811484
19	NC_012579	TTATTT	2	12	52461	52472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227811487
20	NC_012579	CCGAAT	2	12	55620	55631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227811487
21	NC_012579	GTTCCT	2	12	58945	58956	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227811490
22	NC_012579	TGAATT	2	12	64747	64758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227811495
23	NC_012579	ATTGAT	2	12	65721	65732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227811496
24	NC_012579	ACAGCA	2	12	68012	68023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227811499
25	NC_012579	TTTGGT	2	12	68189	68200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811499
26	NC_012579	TTTTGA	2	12	69566	69577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227811500
27	NC_012579	ATCCAG	2	12	70348	70359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227811500
28	NC_012579	TATAAA	2	12	70374	70385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811500
29	NC_012579	TAAAGG	2	12	70880	70891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	227811500
30	NC_012579	AAAAAG	2	12	71816	71827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227811501
31	NC_012579	ACGTGT	2	12	73215	73226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227811503
32	NC_012579	CAGTTG	2	12	73400	73411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227811503
33	NC_012579	GTTATT	2	12	77610	77621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227811508
34	NC_012579	ACAGAT	2	12	79266	79277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227811512
35	NC_012579	ATTTGT	2	12	79949	79960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227811512
36	NC_012579	AGAAAT	2	12	80609	80620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227811513
37	NC_012579	CAGAAG	2	12	81046	81057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227811513
38	NC_012579	GATTGT	2	12	82166	82177	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811514
39	NC_012579	AATGAA	2	12	83913	83924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	227811516
40	NC_012579	AATAAA	2	12	87694	87705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	227811520
41	NC_012579	TCAAAT	2	12	87766	87777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227811520
42	NC_012579	CAAAAG	2	12	90016	90027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227811525
43	NC_012579	AGCCAG	2	12	91057	91068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811525
44	NC_012579	AAGAGA	2	12	93493	93504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811526
45	NC_012579	AAGAGG	2	12	98179	98190	50 %	0 %	50 %	0 %	227811530
46	NC_012579	TATCAA	2	12	105222	105233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227811539
47	NC_012579	ATTTTT	2	12	110649	110660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227811543
48	NC_012579	ATCATT	2	12	111697	111708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811545
49	NC_012579	AAGTGC	2	12	111780	111791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227811546
50	NC_012579	ATAAAT	2	12	118909	118920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811555
51	NC_012579	ATTTTT	2	12	119358	119369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227811556
52	NC_012579	TAACTT	2	12	121030	121041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811558
53	NC_012579	GAAAAA	2	12	123093	123104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227811562
54	NC_012579	TTTTTG	2	12	126389	126400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	227811565
55	NC_012579	TTCCTT	2	12	129311	129322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811569
56	NC_012579	AAATTA	2	12	130845	130856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811571
57	NC_012579	TCTACT	2	12	134660	134671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811575
58	NC_012579	TACAAC	2	12	138694	138705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227811578
59	NC_012579	GTTAGA	2	12	138853	138864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811578
60	NC_012579	GAATCA	2	12	144213	144224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227811585
61	NC_012579	TTCTAA	2	12	144482	144493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811585
62	NC_012579	CTTTTT	2	12	150894	150905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811590
63	NC_012579	TCTCTT	2	12	151968	151979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811590
64	NC_012579	ATGCCC	2	12	156528	156539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	227811599
65	NC_012579	AAAAGA	2	12	158669	158680	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227811603
66	NC_012579	TGTTAG	2	12	165730	165741	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811615
67	NC_012579	AAGAAA	2	12	168322	168333	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	227811617
68	NC_012579	TTCCGG	2	12	170441	170452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811618
69	NC_012579	TAATTT	2	12	170733	170744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811618
70	NC_012579	TTTATG	2	12	181050	181061	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	227811633

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.