MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012579	AAAGA	2	10	49	58	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012579	ATTAT	2	10	785	794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012579	ATGAT	2	10	2459	2468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012579	ATTTA	2	10	11958	11967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012579	TGTTA	2	10	14008	14017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012579	CACAA	2	10	14181	14190	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012579	CTACT	2	10	24335	24344	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012579	TATAA	2	10	26987	26996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012579	TTTTC	2	10	31355	31364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012579	TTATT	2	10	46597	46606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012579	TATGA	2	10	48436	48445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012579	CTAAG	2	10	51003	51012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012579	TTAAC	2	10	51189	51198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012579	TGATT	2	10	56194	56203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012579	AAAAT	2	10	59726	59735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012579	GTATA	2	10	61023	61032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012579	CTATG	2	10	63831	63840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012579	ATATA	2	10	69217	69226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012579	TTTCA	2	10	71982	71991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012579	ACATG	2	10	72013	72022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012579	AAATC	2	10	72592	72601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012579	TAACA	2	10	83572	83581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012579	TTGTG	2	10	83661	83670	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012579	GATTT	2	10	87614	87623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012579	AGTAA	2	10	103277	103286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012579	TTTAA	2	10	104542	104551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012579	ATTTT	2	10	104592	104601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012579	ACAGT	2	10	105128	105137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012579	GAATA	2	10	106201	106210	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012579	TTGGT	2	10	110944	110953	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012579	AATAA	2	10	111091	111100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012579	ATTCA	2	10	111128	111137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012579	TATAA	2	10	115468	115477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012579	TCATT	2	10	115482	115491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012579	TAATA	2	10	115886	115895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012579	ATTTA	2	10	116368	116377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012579	ATTGG	2	10	121991	122000	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012579	TAAAA	2	10	122858	122867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012579	TAAAA	2	10	125998	126007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012579	CTTTC	2	10	126905	126914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012579	AATTC	2	10	130456	130465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012579	TATTT	2	10	130466	130475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012579	TTAAA	2	10	131223	131232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012579	ATTAA	2	10	131750	131759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012579	ATCTT	2	10	142366	142375	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012579	AAATT	2	10	143567	143576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012579	TATAT	2	10	144021	144030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012579	AATAT	2	10	144054	144063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012579	AATTT	2	10	144065	144074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012579	TAAGG	2	10	146737	146746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012579	TAATT	2	10	147100	147109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012579	TACTT	2	10	147774	147783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012579	TCTTT	2	10	147979	147988	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012579	TTCAA	2	10	148961	148970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012579	AGTAA	2	10	152246	152255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012579	AGTAG	2	10	154596	154605	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012579	ATTCT	2	10	159383	159392	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012579	TAAAT	2	10	163611	163620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012579	TTTAG	2	10	166876	166885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012579	GTTTA	2	10	168241	168250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012579	TATAA	2	10	174359	174368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012579	AAACA	2	10	174373	174382	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012579	AAATA	2	10	174466	174475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012579	TTATT	2	10	174499	174508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012579	CCTAT	2	10	180812	180821	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_012579	TCACC	2	10	181668	181677	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.