MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012579	TTTCC	2	10	1899	1908	0 %	60 %	0 %	40 %	227811431
2	NC_012579	TAAAA	2	10	2058	2067	80 %	20 %	0 %	0 %	227811432
3	NC_012579	CGGAA	2	10	2707	2716	40 %	0 %	40 %	20 %	227811433
4	NC_012579	AAGAA	2	10	3111	3120	80 %	0 %	20 %	0 %	227811434
5	NC_012579	CATAC	2	10	3129	3138	40 %	20 %	0 %	40 %	227811434
6	NC_012579	TTTAA	2	10	4418	4427	40 %	60 %	0 %	0 %	227811436
7	NC_012579	GCATT	2	10	6576	6585	20 %	40 %	20 %	20 %	227811438
8	NC_012579	TCTTT	2	10	7625	7634	0 %	80 %	0 %	20 %	227811439
9	NC_012579	TCCAT	2	10	7945	7954	20 %	40 %	0 %	40 %	227811439
10	NC_012579	TCTTT	2	10	8337	8346	0 %	80 %	0 %	20 %	227811439
11	NC_012579	CATTC	2	10	10067	10076	20 %	40 %	0 %	40 %	227811440
12	NC_012579	CTTTT	2	10	11334	11343	0 %	80 %	0 %	20 %	227811440
13	NC_012579	AGCAA	2	10	11796	11805	60 %	0 %	20 %	20 %	227811440
14	NC_012579	TAAAA	2	10	11913	11922	80 %	20 %	0 %	0 %	227811440
15	NC_012579	TTCGG	2	10	13644	13653	0 %	40 %	40 %	20 %	227811444
16	NC_012579	TTTAA	2	10	16150	16159	40 %	60 %	0 %	0 %	227811446
17	NC_012579	TTCTG	2	10	16599	16608	0 %	60 %	20 %	20 %	227811446
18	NC_012579	AATTA	2	10	18465	18474	60 %	40 %	0 %	0 %	227811446
19	NC_012579	CTCTG	2	10	18892	18901	0 %	40 %	20 %	40 %	227811446
20	NC_012579	CTCTT	2	10	20586	20595	0 %	60 %	0 %	40 %	227811447
21	NC_012579	AAATA	2	10	24246	24255	80 %	20 %	0 %	0 %	227811450
22	NC_012579	ACACT	2	10	27134	27143	40 %	20 %	0 %	40 %	227811454
23	NC_012579	ATTGC	2	10	27201	27210	20 %	40 %	20 %	20 %	227811454
24	NC_012579	TCCAA	2	10	28136	28145	40 %	20 %	0 %	40 %	227811454
25	NC_012579	GAAAA	2	10	28297	28306	80 %	0 %	20 %	0 %	227811454
26	NC_012579	TTGTT	2	10	32215	32224	0 %	80 %	20 %	0 %	227811459
27	NC_012579	TATCC	2	10	32989	32998	20 %	40 %	0 %	40 %	227811459
28	NC_012579	CCTTC	2	10	34157	34166	0 %	40 %	0 %	60 %	227811461
29	NC_012579	ATTTA	2	10	34765	34774	40 %	60 %	0 %	0 %	227811462
30	NC_012579	TTTCC	2	10	36611	36620	0 %	60 %	0 %	40 %	227811468
31	NC_012579	AATTA	2	10	37376	37385	60 %	40 %	0 %	0 %	227811469
32	NC_012579	AAATT	2	10	38916	38925	60 %	40 %	0 %	0 %	227811471
33	NC_012579	AGTAA	2	10	39229	39238	60 %	20 %	20 %	0 %	227811471
34	NC_012579	CTTGG	2	10	40965	40974	0 %	40 %	40 %	20 %	227811473
35	NC_012579	TTTTC	2	10	44678	44687	0 %	80 %	0 %	20 %	227811476
36	NC_012579	GTTTT	2	10	44876	44885	0 %	80 %	20 %	0 %	227811476
37	NC_012579	TTCAT	2	10	45918	45927	20 %	60 %	0 %	20 %	227811477
38	NC_012579	AGTCC	2	10	46140	46149	20 %	20 %	20 %	40 %	227811477
39	NC_012579	AAAGA	2	10	47218	47227	80 %	0 %	20 %	0 %	227811479
40	NC_012579	GTGAT	2	10	47786	47795	20 %	40 %	40 %	0 %	227811479
41	NC_012579	ATTTT	2	10	50159	50168	20 %	80 %	0 %	0 %	227811482
42	NC_012579	TCATC	2	10	53461	53470	20 %	40 %	0 %	40 %	227811487
43	NC_012579	TACGA	2	10	53690	53699	40 %	20 %	20 %	20 %	227811487
44	NC_012579	AGTAA	2	10	53931	53940	60 %	20 %	20 %	0 %	227811487
45	NC_012579	CTTCT	2	10	56494	56503	0 %	60 %	0 %	40 %	227811489
46	NC_012579	CTCTT	2	10	58458	58467	0 %	60 %	0 %	40 %	227811490
47	NC_012579	TTGAT	2	10	58545	58554	20 %	60 %	20 %	0 %	227811490
48	NC_012579	AACAA	2	10	60686	60695	80 %	0 %	0 %	20 %	227811492
49	NC_012579	TGAAT	2	10	61499	61508	40 %	40 %	20 %	0 %	227811493
50	NC_012579	AGTAA	2	10	65048	65057	60 %	20 %	20 %	0 %	227811495
51	NC_012579	GTGAT	2	10	65464	65473	20 %	40 %	40 %	0 %	227811496
52	NC_012579	AAAAG	2	10	66796	66805	80 %	0 %	20 %	0 %	227811496
53	NC_012579	TAAAT	2	10	69079	69088	60 %	40 %	0 %	0 %	227811499
54	NC_012579	TAGAT	2	10	70670	70679	40 %	40 %	20 %	0 %	227811500
55	NC_012579	GAAAA	2	10	70848	70857	80 %	0 %	20 %	0 %	227811500
56	NC_012579	AAAAG	2	10	70991	71000	80 %	0 %	20 %	0 %	227811500
57	NC_012579	AAGAA	2	10	73789	73798	80 %	0 %	20 %	0 %	227811504
58	NC_012579	AAAGA	2	10	74628	74637	80 %	0 %	20 %	0 %	227811505
59	NC_012579	GAAAG	2	10	75206	75215	60 %	0 %	40 %	0 %	227811505
60	NC_012579	TAGTA	2	10	75897	75906	40 %	40 %	20 %	0 %	227811506
61	NC_012579	AAAGA	2	10	77179	77188	80 %	0 %	20 %	0 %	227811507
62	NC_012579	ATTGC	2	10	77429	77438	20 %	40 %	20 %	20 %	227811507
63	NC_012579	AAATG	2	10	77966	77975	60 %	20 %	20 %	0 %	227811510
64	NC_012579	TCAAA	2	10	79896	79905	60 %	20 %	0 %	20 %	227811512
65	NC_012579	TAATT	2	10	86920	86929	40 %	60 %	0 %	0 %	227811518
66	NC_012579	AATGG	2	10	87210	87219	40 %	20 %	40 %	0 %	227811519
67	NC_012579	TATAA	2	10	87857	87866	60 %	40 %	0 %	0 %	227811521
68	NC_012579	ATTTA	2	10	89324	89333	40 %	60 %	0 %	0 %	227811524
69	NC_012579	GAAAA	2	10	89712	89721	80 %	0 %	20 %	0 %	227811525
70	NC_012579	TTTAA	2	10	91587	91596	40 %	60 %	0 %	0 %	227811525
71	NC_012579	AAAGA	2	10	92796	92805	80 %	0 %	20 %	0 %	227811526
72	NC_012579	GTTTT	2	10	98992	99001	0 %	80 %	20 %	0 %	227811531
73	NC_012579	TAAAG	2	10	102744	102753	60 %	20 %	20 %	0 %	227811536
74	NC_012579	GTACT	2	10	105145	105154	20 %	40 %	20 %	20 %	227811539
75	NC_012579	TATTT	2	10	107193	107202	20 %	80 %	0 %	0 %	227811541
76	NC_012579	TGAAT	2	10	107832	107841	40 %	40 %	20 %	0 %	227811541
77	NC_012579	AAAAG	2	10	109515	109524	80 %	0 %	20 %	0 %	227811542
78	NC_012579	GTGAT	2	10	109804	109813	20 %	40 %	40 %	0 %	227811542
79	NC_012579	ATTAT	2	10	111326	111335	40 %	60 %	0 %	0 %	227811544
80	NC_012579	AAAAT	3	15	111537	111551	80 %	20 %	0 %	0 %	227811545
81	NC_012579	CCTTG	2	10	119087	119096	0 %	40 %	20 %	40 %	227811555
82	NC_012579	ATGAA	2	10	120497	120506	60 %	20 %	20 %	0 %	227811557
83	NC_012579	GAAAA	2	10	123360	123369	80 %	0 %	20 %	0 %	227811562
84	NC_012579	TACAA	2	10	124288	124297	60 %	20 %	0 %	20 %	227811562
85	NC_012579	AAAGG	2	10	125186	125195	60 %	0 %	40 %	0 %	227811562
86	NC_012579	CTTTT	2	10	126993	127002	0 %	80 %	0 %	20 %	227811567
87	NC_012579	ATGTA	2	10	128757	128766	40 %	40 %	20 %	0 %	227811569
88	NC_012579	ATTTA	2	10	130237	130246	40 %	60 %	0 %	0 %	227811570
89	NC_012579	AATTC	2	10	133494	133503	40 %	40 %	0 %	20 %	227811575
90	NC_012579	TTAAT	2	10	134682	134691	40 %	60 %	0 %	0 %	227811575
91	NC_012579	TATTT	2	10	136096	136105	20 %	80 %	0 %	0 %	227811575
92	NC_012579	CAATT	2	10	136774	136783	40 %	40 %	0 %	20 %	227811576
93	NC_012579	CAAAA	2	10	136954	136963	80 %	0 %	0 %	20 %	227811576
94	NC_012579	AAATT	2	10	138098	138107	60 %	40 %	0 %	0 %	227811577
95	NC_012579	ATTAT	2	10	140194	140203	40 %	60 %	0 %	0 %	227811579
96	NC_012579	TAAAA	2	10	143157	143166	80 %	20 %	0 %	0 %	227811583
97	NC_012579	ACAAA	2	10	143687	143696	80 %	0 %	0 %	20 %	227811584
98	NC_012579	GGATT	2	10	144567	144576	20 %	40 %	40 %	0 %	227811585
99	NC_012579	CGAAT	2	10	145784	145793	40 %	20 %	20 %	20 %	227811585
100	NC_012579	GATAT	2	10	146158	146167	40 %	40 %	20 %	0 %	227811585
101	NC_012579	ATAAA	2	10	148118	148127	80 %	20 %	0 %	0 %	227811587
102	NC_012579	ATTCC	2	10	150301	150310	20 %	40 %	0 %	40 %	227811590
103	NC_012579	CAATG	2	10	152985	152994	40 %	20 %	20 %	20 %	227811591
104	NC_012579	GAAGC	2	10	160769	160778	40 %	0 %	40 %	20 %	227811607
105	NC_012579	AGGGA	2	10	161251	161260	40 %	0 %	60 %	0 %	227811607
106	NC_012579	TTAAA	2	10	161556	161565	60 %	40 %	0 %	0 %	227811607
107	NC_012579	TTGGA	2	10	161857	161866	20 %	40 %	40 %	0 %	227811608
108	NC_012579	GTAAT	2	10	168703	168712	40 %	40 %	20 %	0 %	227811617
109	NC_012579	ATTAT	2	10	170191	170200	40 %	60 %	0 %	0 %	227811618
110	NC_012579	AATTA	2	10	170931	170940	60 %	40 %	0 %	0 %	227811618
111	NC_012579	TAATA	2	10	171220	171229	60 %	40 %	0 %	0 %	227811619
112	NC_012579	AAATT	2	10	171496	171505	60 %	40 %	0 %	0 %	227811619
113	NC_012579	CAAAG	2	10	173093	173102	60 %	0 %	20 %	20 %	227811622
114	NC_012579	TAATT	2	10	173153	173162	40 %	60 %	0 %	0 %	227811622
115	NC_012579	AAAGA	2	10	173247	173256	80 %	0 %	20 %	0 %	227811622
116	NC_012579	TTACA	2	10	174705	174714	40 %	40 %	0 %	20 %	227811625
117	NC_012579	TTTTC	2	10	175597	175606	0 %	80 %	0 %	20 %	227811627
118	NC_012579	TTACT	2	10	175747	175756	20 %	60 %	0 %	20 %	227811628
119	NC_012579	ACTCT	2	10	177321	177330	20 %	40 %	0 %	40 %	227811631
120	NC_012579	AATCG	2	10	177405	177414	40 %	20 %	20 %	20 %	227811631
121	NC_012579	TCATT	2	10	178009	178018	20 %	60 %	0 %	20 %	227811631
122	NC_012579	AATTT	2	10	180360	180369	40 %	60 %	0 %	0 %	227811632
123	NC_012579	TCTTT	2	10	181232	181241	0 %	80 %	0 %	20 %	227811633

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.