MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 7346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	TTGA	2	8	269	276	25 %	50 %	25 %	0 %	227080238
2	NC_012578	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	227080238
3	NC_012578	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	227080240
4	NC_012578	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	227080240
5	NC_012578	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	227080240
6	NC_012578	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	227080240
7	NC_012578	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	227080240
8	NC_012578	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012578	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	227080241
10	NC_012578	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
11	NC_012578	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
12	NC_012578	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
13	NC_012578	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	227080241
14	NC_012578	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	227080241
15	NC_012578	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	227080241
16	NC_012578	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	227080241
17	NC_012578	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	227080242
18	NC_012578	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	227080243
19	NC_012578	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	227080243
20	NC_012578	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	227080243
21	NC_012578	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012578	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	227080245
23	NC_012578	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	227080245
24	NC_012578	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	227080246
25	NC_012578	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	227080246
26	NC_012578	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012578	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	227080247
28	NC_012578	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	227080247
29	NC_012578	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	227080249
30	NC_012578	GTAC	2	8	7682	7689	25 %	25 %	25 %	25 %	227080249
31	NC_012578	CAAC	2	8	8191	8198	50 %	0 %	0 %	50 %	227080249
32	NC_012578	CTTT	2	8	8376	8383	0 %	75 %	0 %	25 %	227080249
33	NC_012578	CGTG	2	8	8407	8414	0 %	25 %	50 %	25 %	227080249
34	NC_012578	GATT	2	8	8476	8483	25 %	50 %	25 %	0 %	227080249
35	NC_012578	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	227080249
36	NC_012578	ACCA	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	227080249
37	NC_012578	GCAG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	227080250
38	NC_012578	CTCA	2	8	9260	9267	25 %	25 %	0 %	50 %	227080250
39	NC_012578	CCAA	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	227080250
40	NC_012578	CGGA	2	8	10161	10168	25 %	0 %	50 %	25 %	227080251
41	NC_012578	AGCA	2	8	10477	10484	50 %	0 %	25 %	25 %	227080251
42	NC_012578	TCAA	2	8	10592	10599	50 %	25 %	0 %	25 %	227080251
43	NC_012578	GTCA	2	8	11309	11316	25 %	25 %	25 %	25 %	227080252
44	NC_012578	CCGA	2	8	11337	11344	25 %	0 %	25 %	50 %	227080252
45	NC_012578	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	227080252
46	NC_012578	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	227080252
47	NC_012578	TTGA	2	8	12666	12673	25 %	50 %	25 %	0 %	227080252
48	NC_012578	GATG	2	8	12785	12792	25 %	25 %	50 %	0 %	227080252
49	NC_012578	TACT	2	8	13128	13135	25 %	50 %	0 %	25 %	227080252
50	NC_012578	TTGA	2	8	13203	13210	25 %	50 %	25 %	0 %	227080252
51	NC_012578	GTCT	2	8	13303	13310	0 %	50 %	25 %	25 %	227080252
52	NC_012578	CATT	2	8	13774	13781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012578	CTCG	2	8	14066	14073	0 %	25 %	25 %	50 %	227080253
54	NC_012578	CCAA	2	8	14329	14336	50 %	0 %	0 %	50 %	227080253
55	NC_012578	TTAA	2	8	14490	14497	50 %	50 %	0 %	0 %	227080254
56	NC_012578	CAAT	2	8	15452	15459	50 %	25 %	0 %	25 %	227080256
57	NC_012578	AGCG	2	8	16299	16306	25 %	0 %	50 %	25 %	227080256
58	NC_012578	GTTC	2	8	16709	16716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012578	GCCA	2	8	17013	17020	25 %	0 %	25 %	50 %	227080257
60	NC_012578	AGCC	2	8	17819	17826	25 %	0 %	25 %	50 %	227080257
61	NC_012578	CGGT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	50 %	25 %	227080257
62	NC_012578	GTGC	2	8	18385	18392	0 %	25 %	50 %	25 %	227080257
63	NC_012578	TGCT	2	8	18624	18631	0 %	50 %	25 %	25 %	227080257
64	NC_012578	TTGG	2	8	18673	18680	0 %	50 %	50 %	0 %	227080257
65	NC_012578	AAGT	2	8	19200	19207	50 %	25 %	25 %	0 %	227080258
66	NC_012578	AAGT	2	8	19425	19432	50 %	25 %	25 %	0 %	227080258
67	NC_012578	ACAA	2	8	20205	20212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012578	TTGT	2	8	20235	20242	0 %	75 %	25 %	0 %	227080259
69	NC_012578	TGGA	2	8	20548	20555	25 %	25 %	50 %	0 %	227080259
70	NC_012578	TTGC	2	8	20712	20719	0 %	50 %	25 %	25 %	227080259
71	NC_012578	TTGT	2	8	21280	21287	0 %	75 %	25 %	0 %	227080261
72	NC_012578	TGAC	2	8	21863	21870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012578	TTTC	2	8	21997	22004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012578	CGAT	2	8	22410	22417	25 %	25 %	25 %	25 %	227080263
75	NC_012578	GCTG	2	8	22648	22655	0 %	25 %	50 %	25 %	227080263
76	NC_012578	ACCA	2	8	22677	22684	50 %	0 %	0 %	50 %	227080263
77	NC_012578	AATC	2	8	22813	22820	50 %	25 %	0 %	25 %	227080263
78	NC_012578	GTGA	2	8	22964	22971	25 %	25 %	50 %	0 %	227080263
79	NC_012578	ATGG	2	8	23062	23069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012578	CTAT	2	8	23102	23109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012578	AGGC	2	8	24145	24152	25 %	0 %	50 %	25 %	227080264
82	NC_012578	ACCG	2	8	24240	24247	25 %	0 %	25 %	50 %	227080264
83	NC_012578	CTGG	2	8	24632	24639	0 %	25 %	50 %	25 %	227080264
84	NC_012578	AGGT	2	8	25138	25145	25 %	25 %	50 %	0 %	227080265
85	NC_012578	TGCG	2	8	25389	25396	0 %	25 %	50 %	25 %	227080265
86	NC_012578	GTTT	2	8	25528	25535	0 %	75 %	25 %	0 %	227080265
87	NC_012578	CCGC	2	8	25642	25649	0 %	0 %	25 %	75 %	227080265
88	NC_012578	CGAT	2	8	25726	25733	25 %	25 %	25 %	25 %	227080265
89	NC_012578	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	227080266
90	NC_012578	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	227080266
91	NC_012578	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	227080267
92	NC_012578	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	227080268
93	NC_012578	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	227080268
94	NC_012578	TATC	2	8	29658	29665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012578	GTCT	2	8	29705	29712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012578	TCAT	2	8	30082	30089	25 %	50 %	0 %	25 %	227080269
97	NC_012578	TGCC	2	8	30436	30443	0 %	25 %	25 %	50 %	227080269
98	NC_012578	TGCG	2	8	33596	33603	0 %	25 %	50 %	25 %	227080272
99	NC_012578	TGGG	2	8	33685	33692	0 %	25 %	75 %	0 %	227080272
100	NC_012578	TTTG	2	8	34471	34478	0 %	75 %	25 %	0 %	227080273
101	NC_012578	CAAT	2	8	34902	34909	50 %	25 %	0 %	25 %	227080273
102	NC_012578	CCAA	2	8	35221	35228	50 %	0 %	0 %	50 %	227080273
103	NC_012578	CAAG	2	8	35509	35516	50 %	0 %	25 %	25 %	227080273
104	NC_012578	TCAA	2	8	35857	35864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012578	ACTT	2	8	36083	36090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012578	TAAG	2	8	36327	36334	50 %	25 %	25 %	0 %	227080274
107	NC_012578	TTTC	2	8	36572	36579	0 %	75 %	0 %	25 %	227080275
108	NC_012578	ATTT	2	8	36902	36909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012578	TGAG	2	8	36924	36931	25 %	25 %	50 %	0 %	227080276
110	NC_012578	GCCA	2	8	37192	37199	25 %	0 %	25 %	50 %	227080276
111	NC_012578	TGAG	2	8	37844	37851	25 %	25 %	50 %	0 %	227080277
112	NC_012578	TATT	2	8	38104	38111	25 %	75 %	0 %	0 %	227080277
113	NC_012578	GGTT	2	8	38170	38177	0 %	50 %	50 %	0 %	227080277
114	NC_012578	TCGC	2	8	38195	38202	0 %	25 %	25 %	50 %	227080277
115	NC_012578	GGTG	2	8	38326	38333	0 %	25 %	75 %	0 %	227080277
116	NC_012578	ACTG	2	8	38744	38751	25 %	25 %	25 %	25 %	227080278
117	NC_012578	TGGT	2	8	38759	38766	0 %	50 %	50 %	0 %	227080278
118	NC_012578	GCCA	2	8	39324	39331	25 %	0 %	25 %	50 %	227080279
119	NC_012578	CAAC	2	8	39684	39691	50 %	0 %	0 %	50 %	227080279
120	NC_012578	ACGT	2	8	40344	40351	25 %	25 %	25 %	25 %	227080279
121	NC_012578	GTGA	2	8	40853	40860	25 %	25 %	50 %	0 %	227080280
122	NC_012578	ATCA	2	8	40901	40908	50 %	25 %	0 %	25 %	227080280
123	NC_012578	ACTC	2	8	41263	41270	25 %	25 %	0 %	50 %	227080280
124	NC_012578	ACCA	2	8	41432	41439	50 %	0 %	0 %	50 %	227080280
125	NC_012578	TGGC	2	8	41775	41782	0 %	25 %	50 %	25 %	227080280
126	NC_012578	AGCG	2	8	41888	41895	25 %	0 %	50 %	25 %	227080280
127	NC_012578	TTTG	2	8	41947	41954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012578	GCGT	2	8	42107	42114	0 %	25 %	50 %	25 %	227080281
129	NC_012578	CAAT	2	8	42454	42461	50 %	25 %	0 %	25 %	227080281
130	NC_012578	AGTG	2	8	43216	43223	25 %	25 %	50 %	0 %	227080281
131	NC_012578	CCAT	2	8	43309	43316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012578	TCGC	2	8	43793	43800	0 %	25 %	25 %	50 %	227080282
133	NC_012578	CATC	2	8	43851	43858	25 %	25 %	0 %	50 %	227080282
134	NC_012578	ATTT	2	8	44296	44303	25 %	75 %	0 %	0 %	227080283
135	NC_012578	GGAC	2	8	44525	44532	25 %	0 %	50 %	25 %	227080283
136	NC_012578	CAAG	2	8	45411	45418	50 %	0 %	25 %	25 %	227080284
137	NC_012578	GGTG	2	8	45528	45535	0 %	25 %	75 %	0 %	227080284
138	NC_012578	CAGC	2	8	45667	45674	25 %	0 %	25 %	50 %	227080284
139	NC_012578	TGCA	2	8	45980	45987	25 %	25 %	25 %	25 %	227080284
140	NC_012578	GCAG	2	8	45996	46003	25 %	0 %	50 %	25 %	227080284
141	NC_012578	TCGC	2	8	46462	46469	0 %	25 %	25 %	50 %	227080285
142	NC_012578	CTCA	2	8	46781	46788	25 %	25 %	0 %	50 %	227080285
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