MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 33116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080238
2	NC_012578	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080238
3	NC_012578	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080239
4	NC_012578	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
5	NC_012578	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080239
6	NC_012578	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
7	NC_012578	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080239
8	NC_012578	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
9	NC_012578	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080240
10	NC_012578	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
11	NC_012578	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
12	NC_012578	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080240
13	NC_012578	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080240
14	NC_012578	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
15	NC_012578	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
16	NC_012578	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
17	NC_012578	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
18	NC_012578	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
19	NC_012578	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080240
20	NC_012578	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
21	NC_012578	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
22	NC_012578	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080240
23	NC_012578	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080240
24	NC_012578	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
25	NC_012578	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
26	NC_012578	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080241
27	NC_012578	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
28	NC_012578	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
29	NC_012578	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
30	NC_012578	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
31	NC_012578	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
32	NC_012578	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
33	NC_012578	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
34	NC_012578	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
35	NC_012578	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
36	NC_012578	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
37	NC_012578	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
38	NC_012578	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
39	NC_012578	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
40	NC_012578	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
41	NC_012578	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
42	NC_012578	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
43	NC_012578	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
44	NC_012578	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
45	NC_012578	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
46	NC_012578	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
47	NC_012578	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
48	NC_012578	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
49	NC_012578	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
50	NC_012578	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
51	NC_012578	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
52	NC_012578	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
53	NC_012578	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
54	NC_012578	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080241
55	NC_012578	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
56	NC_012578	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
57	NC_012578	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080242
58	NC_012578	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080243
59	NC_012578	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080243
60	NC_012578	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080243
61	NC_012578	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080243
62	NC_012578	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080244
63	NC_012578	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080244
64	NC_012578	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080244
65	NC_012578	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080245
66	NC_012578	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080245
67	NC_012578	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080245
68	NC_012578	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
69	NC_012578	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080245
70	NC_012578	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
71	NC_012578	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
72	NC_012578	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
73	NC_012578	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080245
74	NC_012578	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
75	NC_012578	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080246
76	NC_012578	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080246
77	NC_012578	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080246
78	NC_012578	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
79	NC_012578	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
80	NC_012578	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
81	NC_012578	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
82	NC_012578	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080247
83	NC_012578	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080247
84	NC_012578	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080247
85	NC_012578	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080248
86	NC_012578	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080248
87	NC_012578	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
88	NC_012578	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080249
89	NC_012578	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080249
90	NC_012578	TGG	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080249
91	NC_012578	CGG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080249
92	NC_012578	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
93	NC_012578	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080249
94	NC_012578	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
95	NC_012578	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080249
96	NC_012578	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080249
97	NC_012578	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080249
98	NC_012578	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
99	NC_012578	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080249
100	NC_012578	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080249
101	NC_012578	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080249
102	NC_012578	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080249
103	NC_012578	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080249
104	NC_012578	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080249
105	NC_012578	TTG	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080249
106	NC_012578	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080249
107	NC_012578	CAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080249
108	NC_012578	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080249
109	NC_012578	CTG	2	6	8180	8185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
110	NC_012578	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080249
111	NC_012578	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080249
112	NC_012578	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080249
113	NC_012578	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080249
114	NC_012578	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080249
115	NC_012578	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080249
116	NC_012578	ATA	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080249
117	NC_012578	AGA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080249
118	NC_012578	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080249
119	NC_012578	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080249
120	NC_012578	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080249
121	NC_012578	GCA	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080250
122	NC_012578	GGT	2	6	8936	8941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080250
123	NC_012578	TTG	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080250
124	NC_012578	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080250
125	NC_012578	CTA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080250
126	NC_012578	CAC	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080250
127	NC_012578	TGC	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080250
128	NC_012578	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080250
129	NC_012578	AAG	3	9	9768	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080250
130	NC_012578	TGG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080250
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254	NC_012578	AAT	2	6	19810	19815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080258
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