MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX02

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012577	ACTCTG	2	12	3291	3302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811314
2	NC_012577	TCATCT	2	12	5785	5796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811315
3	NC_012577	GTTACC	2	12	6239	6250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811317
4	NC_012577	AATTCA	2	12	13883	13894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227811322
5	NC_012577	GAACAT	2	12	14294	14305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227811323
6	NC_012577	TTTCTT	2	12	16845	16856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811328
7	NC_012577	CCTGTT	2	12	17580	17591	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227811329
8	NC_012577	TCTTTG	2	12	19626	19637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227811333
9	NC_012577	CATTTT	2	12	25489	25500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227811342
10	NC_012577	TAAATT	2	12	26820	26831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012577	CATTCT	2	12	28005	28016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811345
12	NC_012577	TTTGCA	2	12	28735	28746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227811346
13	NC_012577	TGTGTA	2	12	29421	29432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811347
14	NC_012577	TTTTTC	2	12	32655	32666	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012577	CTTGAC	2	12	33913	33924	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811352
16	NC_012577	CAATAT	2	12	40081	40092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227811362
17	NC_012577	GAATTA	2	12	41995	42006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	227811364
18	NC_012577	TATAAT	2	12	44968	44979	50 %	50 %	0 %	0 %	227811369
19	NC_012577	TACCAA	2	12	45774	45785	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227811371
20	NC_012577	TAAAAT	2	12	46836	46847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012577	ATGAAT	2	12	46929	46940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012577	ACTTTC	2	12	47573	47584	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811374
23	NC_012577	TTGTTT	2	12	48496	48507	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	227811374
24	NC_012577	TCCCTT	2	12	48611	48622	0 %	50 %	0 %	50 %	227811374
25	NC_012577	TTTTAT	2	12	48623	48634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227811374
26	NC_012577	GATTTG	2	12	48764	48775	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227811374
27	NC_012577	TATACA	2	12	48836	48847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012577	CATTCT	2	12	51291	51302	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811377
29	NC_012577	TCTTTA	2	12	51992	52003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227811377
30	NC_012577	TTTTCT	2	12	52336	52347	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811378
31	NC_012577	TCGTCA	2	12	53354	53365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811378
32	NC_012577	TGCTTC	2	12	54889	54900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227811380
33	NC_012577	ATTCAT	2	12	58094	58105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811385
34	NC_012577	ACTTTG	2	12	60560	60571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227811387
35	NC_012577	TTATAA	2	12	62418	62429	50 %	50 %	0 %	0 %	227811391
36	NC_012577	CAAATA	2	12	63812	63823	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	227811393
37	NC_012577	AATATG	2	12	64614	64625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012577	TATAAA	2	12	68574	68585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012577	TTTTAA	2	12	68715	68726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012577	ATTTTT	2	12	72145	72156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	227811401
41	NC_012577	ATTGTA	2	12	73550	73561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227811403
42	NC_012577	TGTTTC	2	12	73655	73666	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227811403
43	NC_012577	TTAAAT	2	12	77586	77597	50 %	50 %	0 %	0 %	227811408
44	NC_012577	TCCAAA	2	12	83220	83231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227811413
45	NC_012577	TTCCTA	2	12	84289	84300	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811415
46	NC_012577	TACTTT	2	12	85159	85170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227811416
47	NC_012577	TCATAA	2	12	87769	87780	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227811418
48	NC_012577	TATTTA	2	12	88161	88172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012577	CATATC	2	12	89166	89177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811420
50	NC_012577	CATCTT	2	12	89880	89891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	227811421
51	NC_012577	TCTCTT	2	12	90587	90598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811421
52	NC_012577	TTTAAT	2	12	90997	91008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811421
53	NC_012577	TTTCTT	2	12	92531	92542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	227811424
54	NC_012577	GTTTTC	2	12	92980	92991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227811424
55	NC_012577	TGCTTC	2	12	93590	93601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	227811424

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.