MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX02

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012577	TTTCT	2	10	421	430	0 %	80 %	0 %	20 %	227811310
2	NC_012577	CTTTT	2	10	970	979	0 %	80 %	0 %	20 %	227811310
3	NC_012577	TCATT	2	10	1027	1036	20 %	60 %	0 %	20 %	227811310
4	NC_012577	ACTTT	2	10	1837	1846	20 %	60 %	0 %	20 %	227811312
5	NC_012577	GAATC	2	10	4054	4063	40 %	20 %	20 %	20 %	227811314
6	NC_012577	ATCTT	2	10	6643	6652	20 %	60 %	0 %	20 %	227811319
7	NC_012577	GCTTC	2	10	6950	6959	0 %	40 %	20 %	40 %	227811319
8	NC_012577	CGCTT	2	10	7192	7201	0 %	40 %	20 %	40 %	227811319
9	NC_012577	TTCAC	2	10	7313	7322	20 %	40 %	0 %	40 %	227811319
10	NC_012577	TTTTC	2	10	7859	7868	0 %	80 %	0 %	20 %	227811319
11	NC_012577	TTCAT	2	10	9577	9586	20 %	60 %	0 %	20 %	227811320
12	NC_012577	TTTCT	2	10	9706	9715	0 %	80 %	0 %	20 %	227811320
13	NC_012577	TTCTT	2	10	12077	12086	0 %	80 %	0 %	20 %	227811321
14	NC_012577	ATTCA	2	10	13579	13588	40 %	40 %	0 %	20 %	227811322
15	NC_012577	TTTCA	2	10	16302	16311	20 %	60 %	0 %	20 %	227811328
16	NC_012577	AGAAA	2	10	16726	16735	80 %	0 %	20 %	0 %	227811328
17	NC_012577	TCTTG	2	10	18099	18108	0 %	60 %	20 %	20 %	227811329
18	NC_012577	CAAAT	2	10	21079	21088	60 %	20 %	0 %	20 %	227811334
19	NC_012577	CAAAA	2	10	23656	23665	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012577	AAAAT	2	10	24375	24384	80 %	20 %	0 %	0 %	227811337
21	NC_012577	AATTT	2	10	24694	24703	40 %	60 %	0 %	0 %	227811340
22	NC_012577	GATGT	2	10	24819	24828	20 %	40 %	40 %	0 %	227811340
23	NC_012577	CATTT	2	10	25199	25208	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012577	CATTA	2	10	25214	25223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012577	TGCTT	2	10	26510	26519	0 %	60 %	20 %	20 %	227811343
26	NC_012577	CTTCT	2	10	26634	26643	0 %	60 %	0 %	40 %	227811343
27	NC_012577	TTTTC	2	10	28160	28169	0 %	80 %	0 %	20 %	227811345
28	NC_012577	TAACT	2	10	28848	28857	40 %	40 %	0 %	20 %	227811346
29	NC_012577	CAACA	2	10	29720	29729	60 %	0 %	0 %	40 %	227811348
30	NC_012577	AACCA	2	10	30467	30476	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_012577	ACTTT	2	10	31939	31948	20 %	60 %	0 %	20 %	227811349
32	NC_012577	CTTAT	2	10	33044	33053	20 %	60 %	0 %	20 %	227811351
33	NC_012577	GGGAT	2	10	33847	33856	20 %	20 %	60 %	0 %	227811352
34	NC_012577	AAACA	2	10	34028	34037	80 %	0 %	0 %	20 %	227811352
35	NC_012577	GAAAA	2	10	34936	34945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012577	GGAAA	2	10	35827	35836	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012577	AAATC	2	10	37153	37162	60 %	20 %	0 %	20 %	227811357
38	NC_012577	TTTCC	2	10	37829	37838	0 %	60 %	0 %	40 %	227811358
39	NC_012577	TTTTG	2	10	39927	39936	0 %	80 %	20 %	0 %	227811362
40	NC_012577	ATAAG	2	10	40272	40281	60 %	20 %	20 %	0 %	227811363
41	NC_012577	CGGTT	2	10	40953	40962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012577	AATAA	2	10	41019	41028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012577	GCAAA	2	10	41759	41768	60 %	0 %	20 %	20 %	227811364
44	NC_012577	TTCTT	2	10	42877	42886	0 %	80 %	0 %	20 %	227811366
45	NC_012577	CTTCT	2	10	43729	43738	0 %	60 %	0 %	40 %	227811367
46	NC_012577	GAAAA	2	10	44594	44603	80 %	0 %	20 %	0 %	227811368
47	NC_012577	TTAAA	2	10	46379	46388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012577	TGAAT	2	10	46463	46472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012577	ATCTT	2	10	48036	48045	20 %	60 %	0 %	20 %	227811374
50	NC_012577	ATTTC	2	10	48570	48579	20 %	60 %	0 %	20 %	227811374
51	NC_012577	TTTTA	2	10	49052	49061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012577	TAAAA	2	10	50196	50205	80 %	20 %	0 %	0 %	227811375
53	NC_012577	TTTTA	2	10	52213	52222	20 %	80 %	0 %	0 %	227811377
54	NC_012577	ATTTT	2	10	54830	54839	20 %	80 %	0 %	0 %	227811380
55	NC_012577	CCTTT	2	10	55878	55887	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_012577	CTAAT	2	10	56223	56232	40 %	40 %	0 %	20 %	227811381
57	NC_012577	TAAAT	2	10	56659	56668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012577	ATTAA	6	30	56814	56843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012577	GTTTT	2	10	57385	57394	0 %	80 %	20 %	0 %	227811384
60	NC_012577	TTTCA	2	10	57993	58002	20 %	60 %	0 %	20 %	227811385
61	NC_012577	AAATT	2	10	59546	59555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012577	TAAAA	2	10	62832	62841	80 %	20 %	0 %	0 %	227811391
63	NC_012577	TATTT	2	10	63776	63785	20 %	80 %	0 %	0 %	227811393
64	NC_012577	AATAA	2	10	64241	64250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012577	GAATT	2	10	66720	66729	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012577	AAATA	2	10	66763	66772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012577	TAAAG	2	10	67483	67492	60 %	20 %	20 %	0 %	227811395
68	NC_012577	GAAAT	2	10	67943	67952	60 %	20 %	20 %	0 %	227811395
69	NC_012577	TAATA	2	10	69099	69108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012577	AAATC	2	10	70797	70806	60 %	20 %	0 %	20 %	227811400
71	NC_012577	CTTCA	2	10	71446	71455	20 %	40 %	0 %	40 %	227811401
72	NC_012577	TTTCT	2	10	73001	73010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012577	AACAA	2	10	76222	76231	80 %	0 %	0 %	20 %	227811406
74	NC_012577	TAATA	2	10	76442	76451	60 %	40 %	0 %	0 %	227811406
75	NC_012577	TTAAT	2	10	76870	76879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012577	ACAAT	2	10	77883	77892	60 %	20 %	0 %	20 %	227811408
77	NC_012577	CAAAA	2	10	81147	81156	80 %	0 %	0 %	20 %	227811411
78	NC_012577	CATTT	2	10	83485	83494	20 %	60 %	0 %	20 %	227811414
79	NC_012577	GTTAA	2	10	83854	83863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012577	TTAAA	2	10	83943	83952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012577	TAATG	2	10	85205	85214	40 %	40 %	20 %	0 %	227811416
82	NC_012577	TTTTA	2	10	86911	86920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012577	ATGCA	2	10	87672	87681	40 %	20 %	20 %	20 %	227811418
84	NC_012577	CATTC	2	10	88447	88456	20 %	40 %	0 %	40 %	227811419
85	NC_012577	AAATA	2	10	88486	88495	80 %	20 %	0 %	0 %	227811419
86	NC_012577	TTCCG	2	10	89539	89548	0 %	40 %	20 %	40 %	227811420
87	NC_012577	TAAAA	2	10	89774	89783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012577	ACTCA	2	10	92912	92921	40 %	20 %	0 %	40 %	227811424

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.