MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 2159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	TAGCAG	2	12	548	559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226947223
2	NC_012563	AAAAAT	2	12	1487	1498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947223
3	NC_012563	GATAAT	2	12	2306	2317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947224
4	NC_012563	AAGTTA	2	12	2988	2999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947225
5	NC_012563	CAAATA	2	12	3231	3242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947226
6	NC_012563	ATAAAG	2	12	3327	3338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947226
7	NC_012563	ATAAAA	2	12	3461	3472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947226
8	NC_012563	GAAGTA	2	12	4959	4970	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947228
9	NC_012563	TTGATA	2	12	6010	6021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947228
10	NC_012563	GATTAG	2	12	6656	6667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947229
11	NC_012563	TTTAAA	2	12	7521	7532	50 %	50 %	0 %	0 %	226947229
12	NC_012563	CAAGCT	2	12	7747	7758	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226947229
13	NC_012563	ATAGAT	2	12	17920	17931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947233
14	NC_012563	ACAAAT	2	12	18829	18840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947233
15	NC_012563	AATAAA	2	12	19802	19813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947234
16	NC_012563	GCAAAA	2	12	23658	23669	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226947237
17	NC_012563	ATATAG	2	12	26830	26841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947239
18	NC_012563	AGAAGC	2	12	27248	27259	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226947239
19	NC_012563	AGATGA	2	12	34405	34416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947245
20	NC_012563	CTATAG	2	12	34586	34597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226947246
21	NC_012563	AGAAAA	2	12	36409	36420	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947249
22	NC_012563	ATGTTT	2	12	41463	41474	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226947255
23	NC_012563	AATATG	2	12	63333	63344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947268
24	NC_012563	ATTTAA	2	12	79034	79045	50 %	50 %	0 %	0 %	226947276
25	NC_012563	ATTATA	2	12	82151	82162	50 %	50 %	0 %	0 %	226947279
26	NC_012563	AATATG	2	12	82171	82182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947279
27	NC_012563	AATTAT	2	12	84193	84204	50 %	50 %	0 %	0 %	226947282
28	NC_012563	GAAAAA	2	12	84734	84745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947283
29	NC_012563	TGTAGA	2	12	85569	85580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947284
30	NC_012563	AAAATA	2	12	87186	87197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947287
31	NC_012563	GTTTTA	2	12	87419	87430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226947287
32	NC_012563	AGAAAA	2	12	87454	87465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947287
33	NC_012563	GTAAGA	2	12	88817	88828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947288
34	NC_012563	ATAAAT	2	12	102470	102481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947301
35	NC_012563	AGTTAA	2	12	104334	104345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947303
36	NC_012563	TAAATA	2	12	106425	106436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947305
37	NC_012563	AATATA	2	12	109635	109646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947308
38	NC_012563	AGGACA	2	12	110383	110394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226947309
39	NC_012563	GTAGAT	2	12	110651	110662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947309
40	NC_012563	TACTGA	2	12	113308	113319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226947312
41	NC_012563	AATAAA	2	12	116488	116499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947316
42	NC_012563	GATATA	2	12	116576	116587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947316
43	NC_012563	TTAAAT	2	12	121587	121598	50 %	50 %	0 %	0 %	226947321
44	NC_012563	TCAAAA	2	12	124103	124114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947322
45	NC_012563	TTTGCT	2	12	125129	125140	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226947322
46	NC_012563	GAAAAA	2	12	127264	127275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947324
47	NC_012563	AGGAAA	2	12	127526	127537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947324
48	NC_012563	AAATGA	2	12	128067	128078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947324
49	NC_012563	AATGTA	2	12	128336	128347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947324
50	NC_012563	GATATG	2	12	128569	128580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947324
51	NC_012563	TGGATA	2	12	131387	131398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947325
52	NC_012563	CATGAA	2	12	132560	132571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226947326
53	NC_012563	ATAAAT	2	12	132674	132685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947326
54	NC_012563	ATAAGA	2	12	138272	138283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947330
55	NC_012563	ATATAA	2	12	140956	140967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947334
56	NC_012563	ATTTTT	2	12	143876	143887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226947336
57	NC_012563	GTAAGT	2	12	144110	144121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947336
58	NC_012563	TTGAAA	2	12	144308	144319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947337
59	NC_012563	AAAGAA	2	12	148851	148862	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947342
60	NC_012563	AATATA	2	12	149930	149941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947343
61	NC_012563	ATTAGT	2	12	152795	152806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947344
62	NC_012563	TTAAAG	2	12	157695	157706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947349
63	NC_012563	ATTTTT	2	12	158246	158257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226947350
64	NC_012563	TACCTA	2	12	158782	158793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947350
65	NC_012563	GTAGAA	2	12	161769	161780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947352
66	NC_012563	AAAAGA	2	12	162328	162339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947353
67	NC_012563	ATAAAT	2	12	162569	162580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947353
68	NC_012563	ATAGAA	2	12	162988	162999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947354
69	NC_012563	AGATTT	2	12	163580	163591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947355
70	NC_012563	AAAGAA	2	12	163767	163778	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947355
71	NC_012563	AGACAT	2	12	164748	164759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226947355
72	NC_012563	ATGAAT	2	12	165517	165528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947356
73	NC_012563	GTGGTA	2	12	169747	169758	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	226947361
74	NC_012563	ATATAA	2	12	170953	170964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947362
75	NC_012563	AGGTAT	2	12	174607	174618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947367
76	NC_012563	TGTAGG	2	12	174736	174747	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	226947367
77	NC_012563	AGTTAT	2	12	177486	177497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947371
78	NC_012563	TACAAC	2	12	178579	178590	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	226947372
79	NC_012563	AAAAAT	2	12	180121	180132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947373
80	NC_012563	ATGGTA	2	12	184130	184141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947379
81	NC_012563	AACATA	2	12	184198	184209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226947379
82	NC_012563	AATTAA	2	12	186580	186591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947381
83	NC_012563	TAATTT	2	12	187296	187307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947382
84	NC_012563	AATAAA	2	12	188274	188285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947383
85	NC_012563	ATAAAA	2	12	188347	188358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226947383
86	NC_012563	TAAAGT	2	12	191180	191191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947385
87	NC_012563	AATGGT	2	12	195375	195386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947390
88	NC_012563	TTAAAA	2	12	196736	196747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947391
89	NC_012563	TAAATA	2	12	197496	197507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947391
90	NC_012563	AAAGAT	2	12	198113	198124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947391
91	NC_012563	TGTAAT	2	12	202873	202884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947395
92	NC_012563	AAAGAA	2	12	203804	203815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947395
93	NC_012563	GTAGAA	2	12	204041	204052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947395
94	NC_012563	GAAATA	2	12	205148	205159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947396
95	NC_012563	AATTAA	2	12	206172	206183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947397
96	NC_012563	GAAAAA	2	12	208008	208019	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947398
97	NC_012563	TAATAC	2	12	210809	210820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226947400
98	NC_012563	GGGTAA	2	12	212123	212134	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	226947400
99	NC_012563	ATATAG	2	12	212613	212624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947401
100	NC_012563	TAAGAT	2	12	213145	213156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947402
101	NC_012563	CAGATA	2	12	214221	214232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226947404
102	NC_012563	GATAAA	2	12	215201	215212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947404
103	NC_012563	TAAAAG	2	12	215619	215630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947404
104	NC_012563	CTATAT	2	12	216772	216783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226947405
105	NC_012563	TATAAA	2	12	217781	217792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947406
106	NC_012563	TTTATA	2	12	224124	224135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947412
107	NC_012563	ATAGAT	2	12	225213	225224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947413
108	NC_012563	TCATAA	2	12	226697	226708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226947414
109	NC_012563	TTTATA	2	12	228670	228681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947417
110	NC_012563	AAATGA	2	12	228777	228788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947417
111	NC_012563	CTTATT	2	12	233677	233688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226947423
112	NC_012563	ATTTAG	2	12	241009	241020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226947428
113	NC_012563	TATGTT	2	12	247168	247179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226947434
114	NC_012563	AGATAA	2	12	248368	248379	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947435
115	NC_012563	TCAATA	2	12	249638	249649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226947436
116	NC_012563	ATTTTT	2	12	252006	252017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226947438
117	NC_012563	CTGTAG	2	12	252192	252203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226947438
118	NC_012563	GAAAAA	2	12	253398	253409	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226947440
119	NC_012563	AGGAAT	2	12	254919	254930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226947441
120	NC_012563	ATATTA	2	12	255163	255174	50 %	50 %	0 %	0 %	226947441
121	NC_012563	TTAGCA	2	12	258162	258173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226947443
122	NC_012563	TATGAA	2	12	259404	259415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226947445
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237	NC_012563	TTTAAA	2	12	496579	496590	50 %	50 %	0 %	0 %	226947620
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346	NC_012563	GCTAAA	2	12	706040	706051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226947802
347	NC_012563	TAGAAA	2	12	707814	707825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947803
348	NC_012563	ATAAAG	2	12	709470	709481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226947804
349	NC_012563	CTTCAG	2	12	710415	710426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226947804
350	NC_012563	ATCTTG	2	12	711907	711918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226947805
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352	NC_012563	TTGCTC	2	12	714280	714291	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	226947807
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