MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 4680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	TAAAT	2	10	3760	3769	60 %	40 %	0 %	0 %	226947226
2	NC_012563	TAAAA	2	10	4240	4249	80 %	20 %	0 %	0 %	226947226
3	NC_012563	ACTTT	2	10	6084	6093	20 %	60 %	0 %	20 %	226947228
4	NC_012563	AAGAT	2	10	6472	6481	60 %	20 %	20 %	0 %	226947228
5	NC_012563	TAAAA	2	10	7125	7134	80 %	20 %	0 %	0 %	226947229
6	NC_012563	GGTAA	2	10	9697	9706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012563	TCGTG	2	10	10488	10497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012563	TAAGT	2	10	12231	12240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012563	AAAAT	2	10	14082	14091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012563	AAATT	2	10	14819	14828	60 %	40 %	0 %	0 %	226947230
11	NC_012563	AATAA	2	10	15557	15566	80 %	20 %	0 %	0 %	226947231
12	NC_012563	ATATA	2	10	15935	15944	60 %	40 %	0 %	0 %	226947232
13	NC_012563	TTTTA	2	10	16497	16506	20 %	80 %	0 %	0 %	226947232
14	NC_012563	AATAA	2	10	16846	16855	80 %	20 %	0 %	0 %	226947233
15	NC_012563	TTATT	2	10	17289	17298	20 %	80 %	0 %	0 %	226947233
16	NC_012563	TATAA	2	10	17935	17944	60 %	40 %	0 %	0 %	226947233
17	NC_012563	CAAAG	2	10	18724	18733	60 %	0 %	20 %	20 %	226947233
18	NC_012563	TAATG	2	10	18909	18918	40 %	40 %	20 %	0 %	226947233
19	NC_012563	TAAAA	2	10	19457	19466	80 %	20 %	0 %	0 %	226947233
20	NC_012563	GAAAT	2	10	19746	19755	60 %	20 %	20 %	0 %	226947234
21	NC_012563	ATATT	2	10	20185	20194	40 %	60 %	0 %	0 %	226947234
22	NC_012563	TAATA	2	10	20245	20254	60 %	40 %	0 %	0 %	226947234
23	NC_012563	AATTT	2	10	21793	21802	40 %	60 %	0 %	0 %	226947235
24	NC_012563	ATTAT	2	10	22470	22479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012563	ACCCA	2	10	22865	22874	40 %	0 %	0 %	60 %	226947237
26	NC_012563	TTTAA	2	10	23854	23863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012563	ATTAA	2	10	23874	23883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012563	TATTT	2	10	23946	23955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012563	TAATT	2	10	26871	26880	40 %	60 %	0 %	0 %	226947239
30	NC_012563	ATTTT	2	10	27700	27709	20 %	80 %	0 %	0 %	226947240
31	NC_012563	TAAAT	2	10	28038	28047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012563	ATATA	2	10	28325	28334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012563	AATAA	2	10	28892	28901	80 %	20 %	0 %	0 %	226947241
34	NC_012563	AATAA	2	10	29906	29915	80 %	20 %	0 %	0 %	226947241
35	NC_012563	AAAAT	2	10	31515	31524	80 %	20 %	0 %	0 %	226947243
36	NC_012563	AATAC	2	10	31607	31616	60 %	20 %	0 %	20 %	226947243
37	NC_012563	ATATT	2	10	31946	31955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012563	AATAA	2	10	32004	32013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012563	GATTT	2	10	33023	33032	20 %	60 %	20 %	0 %	226947244
40	NC_012563	ATAAA	2	10	35461	35470	80 %	20 %	0 %	0 %	226947247
41	NC_012563	TAATA	2	10	35556	35565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012563	GAATA	2	10	35643	35652	60 %	20 %	20 %	0 %	226947248
43	NC_012563	TTATT	2	10	35659	35668	20 %	80 %	0 %	0 %	226947248
44	NC_012563	ATAAA	2	10	36038	36047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012563	GATTT	2	10	36393	36402	20 %	60 %	20 %	0 %	226947249
46	NC_012563	AAAAG	2	10	36652	36661	80 %	0 %	20 %	0 %	226947249
47	NC_012563	TTGTA	2	10	36917	36926	20 %	60 %	20 %	0 %	226947250
48	NC_012563	ATAGA	2	10	38315	38324	60 %	20 %	20 %	0 %	226947252
49	NC_012563	GCAAT	2	10	38972	38981	40 %	20 %	20 %	20 %	226947252
50	NC_012563	AAAGA	2	10	38989	38998	80 %	0 %	20 %	0 %	226947252
51	NC_012563	AGTAT	2	10	39998	40007	40 %	40 %	20 %	0 %	226947254
52	NC_012563	TTAAT	2	10	41035	41044	40 %	60 %	0 %	0 %	226947255
53	NC_012563	ATTGT	2	10	42218	42227	20 %	60 %	20 %	0 %	226947256
54	NC_012563	ATAGA	2	10	42323	42332	60 %	20 %	20 %	0 %	226947256
55	NC_012563	GGTAA	2	10	43110	43119	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012563	TCGTG	2	10	43901	43910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012563	TAAGT	2	10	45639	45648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012563	AATAA	2	10	48092	48101	80 %	20 %	0 %	0 %	226947259
59	NC_012563	GAATA	2	10	48443	48452	60 %	20 %	20 %	0 %	226947259
60	NC_012563	TCGTG	2	10	50457	50466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012563	TAAGT	2	10	52195	52204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012563	TTATA	2	10	54544	54553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012563	GGTAA	2	10	57530	57539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012563	TCGTG	2	10	58321	58330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012563	TAAGT	2	10	60064	60073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012563	CAAAA	2	10	62204	62213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012563	TGATT	2	10	62251	62260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012563	TAAAT	2	10	62495	62504	60 %	40 %	0 %	0 %	226947266
69	NC_012563	AAGAA	2	10	62994	63003	80 %	0 %	20 %	0 %	226947267
70	NC_012563	TTATA	2	10	63645	63654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012563	TCGTG	2	10	65331	65340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012563	TAAGT	2	10	67069	67078	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012563	AAAAT	2	10	68920	68929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012563	GAAGA	2	10	69427	69436	60 %	0 %	40 %	0 %	226947272
75	NC_012563	AAATA	2	10	70045	70054	80 %	20 %	0 %	0 %	226947272
76	NC_012563	ATTAT	2	10	70168	70177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012563	GGTAA	2	10	70820	70829	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012563	TCGTG	2	10	71611	71620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012563	TAAGT	2	10	73285	73294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012563	TATAT	2	10	76202	76211	40 %	60 %	0 %	0 %	226947273
81	NC_012563	TTGAA	2	10	76473	76482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012563	CAATC	2	10	76624	76633	40 %	20 %	0 %	40 %	226947274
83	NC_012563	TTATT	2	10	78904	78913	20 %	80 %	0 %	0 %	226947276
84	NC_012563	ATTTT	2	10	78921	78930	20 %	80 %	0 %	0 %	226947276
85	NC_012563	ATTTT	2	10	79274	79283	20 %	80 %	0 %	0 %	226947276
86	NC_012563	TAATT	2	10	79295	79304	40 %	60 %	0 %	0 %	226947276
87	NC_012563	TTTCC	2	10	79989	79998	0 %	60 %	0 %	40 %	226947277
88	NC_012563	ATTTT	2	10	80004	80013	20 %	80 %	0 %	0 %	226947277
89	NC_012563	GAATA	2	10	80563	80572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012563	TATAA	2	10	82141	82150	60 %	40 %	0 %	0 %	226947279
91	NC_012563	TAAAT	2	10	83991	84000	60 %	40 %	0 %	0 %	226947282
92	NC_012563	TAAAT	2	10	84784	84793	60 %	40 %	0 %	0 %	226947283
93	NC_012563	TAGAA	2	10	84913	84922	60 %	20 %	20 %	0 %	226947283
94	NC_012563	GATAG	2	10	86521	86530	40 %	20 %	40 %	0 %	226947286
95	NC_012563	ATGGA	2	10	86726	86735	40 %	20 %	40 %	0 %	226947286
96	NC_012563	AGGAT	2	10	87222	87231	40 %	20 %	40 %	0 %	226947287
97	NC_012563	AATGG	2	10	87469	87478	40 %	20 %	40 %	0 %	226947287
98	NC_012563	AAATT	2	10	87619	87628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012563	AAAGA	2	10	88175	88184	80 %	0 %	20 %	0 %	226947288
100	NC_012563	ATTTA	2	10	89265	89274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012563	TACAA	2	10	89523	89532	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012563	TTTAA	2	10	89931	89940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012563	AAGTT	2	10	90825	90834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012563	TAAAT	2	10	92287	92296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012563	TATAA	2	10	93382	93391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012563	ATTTT	2	10	94452	94461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012563	ATTTA	2	10	94654	94663	40 %	60 %	0 %	0 %	226947294
108	NC_012563	TAATA	2	10	94924	94933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012563	TAATA	2	10	96109	96118	60 %	40 %	0 %	0 %	226947296
110	NC_012563	ATATT	2	10	98293	98302	40 %	60 %	0 %	0 %	226947298
111	NC_012563	AGAAA	2	10	100793	100802	80 %	0 %	20 %	0 %	226947300
112	NC_012563	AAAAC	2	10	100838	100847	80 %	0 %	0 %	20 %	226947300
113	NC_012563	AAATT	2	10	101808	101817	60 %	40 %	0 %	0 %	226947301
114	NC_012563	AAATG	2	10	102076	102085	60 %	20 %	20 %	0 %	226947301
115	NC_012563	GAAGT	2	10	103089	103098	40 %	20 %	40 %	0 %	226947302
116	NC_012563	GAAAA	2	10	104654	104663	80 %	0 %	20 %	0 %	226947303
117	NC_012563	ACATT	2	10	107719	107728	40 %	40 %	0 %	20 %	226947306
118	NC_012563	AAAAT	2	10	110208	110217	80 %	20 %	0 %	0 %	226947309
119	NC_012563	ATAAA	2	10	110298	110307	80 %	20 %	0 %	0 %	226947309
120	NC_012563	ATTTA	2	10	111185	111194	40 %	60 %	0 %	0 %	226947310
121	NC_012563	GTTAT	2	10	113796	113805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012563	GAAAT	2	10	114496	114505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012563	ATTTT	2	10	115537	115546	20 %	80 %	0 %	0 %	226947315
124	NC_012563	ATACA	2	10	116054	116063	60 %	20 %	0 %	20 %	226947316
125	NC_012563	AATAT	2	10	116358	116367	60 %	40 %	0 %	0 %	226947316
126	NC_012563	TAAAA	2	10	116650	116659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012563	AAGAA	2	10	117623	117632	80 %	0 %	20 %	0 %	226947317
128	NC_012563	TAATA	2	10	117911	117920	60 %	40 %	0 %	0 %	226947317
129	NC_012563	AGAGA	2	10	117945	117954	60 %	0 %	40 %	0 %	226947317
130	NC_012563	TAAAT	2	10	118535	118544	60 %	40 %	0 %	0 %	226947317
131	NC_012563	AATTC	2	10	120869	120878	40 %	40 %	0 %	20 %	226947320
132	NC_012563	GTAAC	2	10	123024	123033	40 %	20 %	20 %	20 %	226947322
133	NC_012563	AAAAG	2	10	123754	123763	80 %	0 %	20 %	0 %	226947322
134	NC_012563	TTAAA	2	10	123816	123825	60 %	40 %	0 %	0 %	226947322
135	NC_012563	GCTTA	2	10	124731	124740	20 %	40 %	20 %	20 %	226947322
136	NC_012563	AGAAA	2	10	124982	124991	80 %	0 %	20 %	0 %	226947322
137	NC_012563	TATAA	2	10	125867	125876	60 %	40 %	0 %	0 %	226947323
138	NC_012563	GAAAG	2	10	127939	127948	60 %	0 %	40 %	0 %	226947324
139	NC_012563	ATAAA	2	10	128306	128315	80 %	20 %	0 %	0 %	226947324
140	NC_012563	ATTAT	2	10	128436	128445	40 %	60 %	0 %	0 %	226947324
141	NC_012563	TAATT	2	10	128838	128847	40 %	60 %	0 %	0 %	226947324
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