MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 1232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	GGTAA	2	10	9697	9706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012563	TCGTG	2	10	10488	10497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012563	TAAGT	2	10	12231	12240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012563	AAAAT	2	10	14082	14091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012563	ATTAT	2	10	22470	22479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012563	TTTAA	2	10	23854	23863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012563	ATTAA	2	10	23874	23883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012563	TATTT	2	10	23946	23955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012563	TAAAT	2	10	28038	28047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012563	ATATA	2	10	28325	28334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012563	ATATT	2	10	31946	31955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012563	AATAA	2	10	32004	32013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012563	TAATA	2	10	35556	35565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012563	ATAAA	2	10	36038	36047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012563	GGTAA	2	10	43110	43119	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012563	TCGTG	2	10	43901	43910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012563	TAAGT	2	10	45639	45648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012563	TCGTG	2	10	50457	50466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012563	TAAGT	2	10	52195	52204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012563	TTATA	2	10	54544	54553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012563	GGTAA	2	10	57530	57539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012563	TCGTG	2	10	58321	58330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012563	TAAGT	2	10	60064	60073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012563	CAAAA	2	10	62204	62213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012563	TGATT	2	10	62251	62260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012563	TTATA	2	10	63645	63654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012563	TCGTG	2	10	65331	65340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012563	TAAGT	2	10	67069	67078	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012563	AAAAT	2	10	68920	68929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012563	ATTAT	2	10	70168	70177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012563	GGTAA	2	10	70820	70829	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012563	TCGTG	2	10	71611	71620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012563	TAAGT	2	10	73285	73294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012563	TTGAA	2	10	76473	76482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012563	GAATA	2	10	80563	80572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012563	AAATT	2	10	87619	87628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012563	ATTTA	2	10	89265	89274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012563	TACAA	2	10	89523	89532	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012563	TTTAA	2	10	89931	89940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012563	AAGTT	2	10	90825	90834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012563	TAAAT	2	10	92287	92296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012563	TATAA	2	10	93382	93391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012563	ATTTT	2	10	94452	94461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012563	TAATA	2	10	94924	94933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012563	GTTAT	2	10	113796	113805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012563	GAAAT	2	10	114496	114505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012563	TAAAA	2	10	116650	116659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012563	ATTTT	2	10	135405	135414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012563	TTTAA	2	10	136897	136906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012563	ACTTA	2	10	148441	148450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012563	ATAAA	2	10	159624	159633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012563	TAATA	2	10	167757	167766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012563	ATATA	2	10	170275	170284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012563	ATTTA	2	10	176345	176354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012563	AAATA	2	10	179446	179455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012563	ATAAA	2	10	179459	179468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012563	ATTAT	2	10	179482	179491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012563	TAATT	2	10	181281	181290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012563	TATTT	2	10	190406	190415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012563	AAAAT	2	10	194339	194348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012563	TAAAG	2	10	194934	194943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012563	ATATG	2	10	195016	195025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012563	TATTT	2	10	205634	205643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012563	TAATT	2	10	207248	207257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012563	TTTAT	2	10	210628	210637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012563	GATTT	2	10	218118	218127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012563	TAAAA	2	10	221680	221689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012563	TAAAA	2	10	221771	221780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012563	AAATT	2	10	224605	224614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012563	ATTAT	2	10	227103	227112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012563	ATTTA	2	10	227545	227554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012563	TAATT	2	10	231653	231662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012563	TTTTG	2	10	235982	235991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012563	ATTAT	2	10	236058	236067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012563	ATTAT	2	10	238372	238381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012563	TAAAT	2	10	243031	243040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012563	TTTAT	2	10	249028	249037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012563	TAATT	2	10	262105	262114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012563	GGTTT	2	10	263256	263265	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012563	AATTT	2	10	271389	271398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012563	TATAT	2	10	275028	275037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012563	GAAAT	2	10	275739	275748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012563	TTTTA	2	10	276364	276373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012563	ATGGA	2	10	276431	276440	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012563	ATAGT	2	10	276460	276469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012563	GAAAA	2	10	278328	278337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012563	TATAA	2	10	278435	278444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012563	CAATT	2	10	282969	282978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012563	AATTA	2	10	283221	283230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012563	AACTA	2	10	293215	293224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012563	AAAAT	2	10	293328	293337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012563	TATAA	2	10	294266	294275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012563	ACTTT	2	10	298366	298375	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012563	AATTA	2	10	299624	299633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012563	TAGAT	2	10	304262	304271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012563	CAAAA	2	10	310552	310561	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012563	AATAA	2	10	315444	315453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012563	TAACT	2	10	322795	322804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012563	AAAAT	2	10	323079	323088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012563	ATATA	2	10	325347	325356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012563	AAAGG	2	10	329393	329402	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012563	ATGTA	2	10	338853	338862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012563	ATATA	2	10	338917	338926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012563	ATTAG	2	10	340969	340978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012563	TTTAG	2	10	347555	347564	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012563	ATAAA	2	10	347611	347620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012563	ATATA	2	10	347630	347639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012563	GAATG	2	10	350331	350340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012563	TCTTT	2	10	353693	353702	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012563	ATTAT	2	10	363164	363173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012563	TATTT	2	10	406972	406981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012563	ATTAT	2	10	407021	407030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012563	ACTAT	2	10	408981	408990	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012563	TTTTA	2	10	413368	413377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012563	TTTTA	2	10	414531	414540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012563	TCAAT	2	10	414670	414679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012563	ATATA	2	10	414759	414768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012563	AATAA	2	10	416826	416835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012563	ATTTA	2	10	418599	418608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012563	AATTA	2	10	418645	418654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012563	AAACA	2	10	423396	423405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012563	AATTT	2	10	429457	429466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012563	AAATA	2	10	434324	434333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012563	ATATA	2	10	437405	437414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012563	ATTAA	2	10	437752	437761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012563	TTAAT	2	10	444640	444649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012563	AAAAT	2	10	447520	447529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012563	TTTAG	2	10	447550	447559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012563	TAAAA	2	10	450393	450402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012563	TATAA	2	10	461440	461449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012563	ATTTT	2	10	463759	463768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012563	TAAAA	2	10	463862	463871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012563	AAAAT	2	10	471761	471770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012563	AATTA	2	10	473114	473123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012563	GAATA	2	10	477872	477881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012563	TATAT	2	10	480535	480544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012563	AAAAT	2	10	480687	480696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012563	AATAA	2	10	493296	493305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012563	AAATA	2	10	493468	493477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012563	AATTT	2	10	500361	500370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012563	TATAA	2	10	500455	500464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012563	AATTA	2	10	506676	506685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012563	TATAA	2	10	508974	508983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012563	TACTC	2	10	509497	509506	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_012563	ATTAA	2	10	518948	518957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012563	TTAAT	2	10	522688	522697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012563	TATAA	2	10	524118	524127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012563	TAATT	2	10	524162	524171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012563	GGTAA	2	10	528398	528407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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