MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 65939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012563	GTT	2	6	91	96	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012563	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012563	AAT	2	6	271	276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
5	NC_012563	ACT	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
6	NC_012563	GAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
7	NC_012563	ATA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
8	NC_012563	ATG	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
9	NC_012563	CTA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
10	NC_012563	GCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947223
11	NC_012563	TGG	2	6	597	602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226947223
12	NC_012563	AGT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
13	NC_012563	TCT	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947223
14	NC_012563	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
15	NC_012563	TGA	2	6	786	791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
16	NC_012563	AAT	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
17	NC_012563	AGA	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
18	NC_012563	TAA	2	6	1103	1108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
19	NC_012563	TAG	2	6	1112	1117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947223
20	NC_012563	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
21	NC_012563	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
22	NC_012563	ATT	2	6	1219	1224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
23	NC_012563	AAG	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
24	NC_012563	TAT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947223
25	NC_012563	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
26	NC_012563	AGA	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
27	NC_012563	GAA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947223
28	NC_012563	TAC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947223
29	NC_012563	TAA	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947223
30	NC_012563	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012563	TTG	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012563	ATT	2	6	1611	1616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012563	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012563	CAA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012563	CTA	6	18	1677	1694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012563	TAT	2	6	1698	1703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012563	TAA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012563	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012563	TAT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
40	NC_012563	TTA	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
41	NC_012563	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
42	NC_012563	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
43	NC_012563	ATA	2	6	1985	1990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
44	NC_012563	AGA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
45	NC_012563	ATA	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
46	NC_012563	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
47	NC_012563	TAG	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
48	NC_012563	AAG	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
49	NC_012563	GTT	2	6	2300	2305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947224
50	NC_012563	AGA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
51	NC_012563	AAT	2	6	2443	2448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
52	NC_012563	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
53	NC_012563	TTA	2	6	2472	2477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
54	NC_012563	GAA	2	6	2498	2503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
55	NC_012563	ATA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
56	NC_012563	AAG	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
57	NC_012563	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
58	NC_012563	TAA	2	6	2625	2630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
59	NC_012563	GAA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947224
60	NC_012563	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947224
61	NC_012563	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947224
62	NC_012563	AAT	2	6	2852	2857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947224
63	NC_012563	ATA	2	6	2906	2911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
64	NC_012563	CAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947225
65	NC_012563	GAC	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947225
66	NC_012563	TAA	2	6	3058	3063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947225
67	NC_012563	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947225
68	NC_012563	ATT	2	6	3087	3092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012563	AAT	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012563	TAT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012563	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
72	NC_012563	ATG	2	6	3204	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
73	NC_012563	TAA	2	6	3253	3258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
74	NC_012563	ATA	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
75	NC_012563	TGT	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947226
76	NC_012563	AGA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
77	NC_012563	AAT	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
78	NC_012563	TAT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
79	NC_012563	ATA	2	6	3624	3629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
80	NC_012563	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
81	NC_012563	ATT	2	6	3770	3775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
82	NC_012563	AAG	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
83	NC_012563	AGA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
84	NC_012563	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947226
85	NC_012563	GAT	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
86	NC_012563	ACA	2	6	4000	4005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947226
87	NC_012563	CAT	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947226
88	NC_012563	ATA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
89	NC_012563	ATA	2	6	4058	4063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
90	NC_012563	GAT	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947226
91	NC_012563	TAA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
92	NC_012563	AGA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947226
93	NC_012563	TAA	2	6	4231	4236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947226
94	NC_012563	TTC	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947227
95	NC_012563	GTA	3	9	4303	4311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947227
96	NC_012563	TTG	2	6	4406	4411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947227
97	NC_012563	AGG	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012563	ATG	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
99	NC_012563	TCA	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947228
100	NC_012563	ATA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
101	NC_012563	CTG	2	6	4834	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226947228
102	NC_012563	TAA	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
103	NC_012563	TGG	3	9	4880	4888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226947228
104	NC_012563	TGG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226947228
105	NC_012563	TGT	2	6	4931	4936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226947228
106	NC_012563	AGA	2	6	4971	4976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
107	NC_012563	TGA	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
108	NC_012563	CAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947228
109	NC_012563	TGA	2	6	5294	5299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
110	NC_012563	CAG	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947228
111	NC_012563	TAG	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
112	NC_012563	ATA	2	6	5673	5678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
113	NC_012563	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
114	NC_012563	TTC	2	6	5795	5800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226947228
115	NC_012563	CAT	2	6	5809	5814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947228
116	NC_012563	GAA	2	6	5869	5874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
117	NC_012563	ATA	2	6	6031	6036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
118	NC_012563	AAT	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947228
119	NC_012563	ACC	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226947228
120	NC_012563	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226947228
121	NC_012563	ATT	2	6	6227	6232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947228
122	NC_012563	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226947228
123	NC_012563	ACT	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947228
124	NC_012563	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947228
125	NC_012563	AAG	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947228
126	NC_012563	AGT	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947228
127	NC_012563	GAA	2	6	6546	6551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947229
128	NC_012563	AGA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947229
129	NC_012563	ATA	2	6	6637	6642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947229
130	NC_012563	ATC	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226947229
131	NC_012563	CAG	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947229
132	NC_012563	TAG	2	6	6800	6805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226947229
133	NC_012563	AGC	3	9	6843	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226947229
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266	NC_012563	TTA	2	6	16185	16190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947232
267	NC_012563	ATA	2	6	16341	16346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947232
268	NC_012563	AAG	2	6	16381	16386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947232
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270	NC_012563	AGA	2	6	16565	16570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947232
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272	NC_012563	ATT	2	6	16812	16817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947233
273	NC_012563	ATA	2	6	16819	16824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947233
274	NC_012563	TAT	2	6	16863	16868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226947233
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296	NC_012563	TAA	2	6	18249	18254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226947233
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316	NC_012563	ATA	2	6	19470	19475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_012563	ATA	2	6	19560	19565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_012563	GAA	2	6	23713	23718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226947237
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