MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azotobacter vinelandii DJ chromosome

Total Repeats: 3476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012560	TCCGC	2	10	350	359	0 %	20 %	20 %	60 %	226942171
2	NC_012560	AGTTC	2	10	4788	4797	20 %	40 %	20 %	20 %	226942174
3	NC_012560	GGTCA	2	10	7372	7381	20 %	20 %	40 %	20 %	226942176
4	NC_012560	GCCAG	2	10	9738	9747	20 %	0 %	40 %	40 %	226942178
5	NC_012560	TGGCG	2	10	10512	10521	0 %	20 %	60 %	20 %	226942180
6	NC_012560	CCCAG	2	10	13046	13055	20 %	0 %	20 %	60 %	226942181
7	NC_012560	CGCCC	2	10	14782	14791	0 %	0 %	20 %	80 %	226942183
8	NC_012560	CTGGC	2	10	17787	17796	0 %	20 %	40 %	40 %	226942185
9	NC_012560	GCGCC	3	15	19389	19403	0 %	0 %	40 %	60 %	226942186
10	NC_012560	GGCGC	2	10	21731	21740	0 %	0 %	60 %	40 %	226942189
11	NC_012560	CTGGC	2	10	21774	21783	0 %	20 %	40 %	40 %	226942189
12	NC_012560	GCCGC	2	10	22524	22533	0 %	0 %	40 %	60 %	226942189
13	NC_012560	CGGGG	2	10	22767	22776	0 %	0 %	80 %	20 %	226942190
14	NC_012560	ATCGA	2	10	24696	24705	40 %	20 %	20 %	20 %	226942192
15	NC_012560	CGGCC	3	15	27897	27911	0 %	0 %	40 %	60 %	226942195
16	NC_012560	GCCGC	2	10	29664	29673	0 %	0 %	40 %	60 %	226942196
17	NC_012560	TGACA	2	10	35803	35812	40 %	20 %	20 %	20 %	226942204
18	NC_012560	TCGGC	2	10	38808	38817	0 %	20 %	40 %	40 %	226942207
19	NC_012560	GCGCG	2	10	40105	40114	0 %	0 %	60 %	40 %	226942208
20	NC_012560	GAAAA	2	10	43157	43166	80 %	0 %	20 %	0 %	226942211
21	NC_012560	GCCCG	2	10	47011	47020	0 %	0 %	40 %	60 %	226942215
22	NC_012560	GCCTG	2	10	47932	47941	0 %	20 %	40 %	40 %	226942217
23	NC_012560	GCGAT	2	10	53410	53419	20 %	20 %	40 %	20 %	226942221
24	NC_012560	GCCGC	2	10	53779	53788	0 %	0 %	40 %	60 %	226942222
25	NC_012560	ACAGC	2	10	53844	53853	40 %	0 %	20 %	40 %	226942222
26	NC_012560	TCGGC	2	10	56490	56499	0 %	20 %	40 %	40 %	226942223
27	NC_012560	GTACG	2	10	57299	57308	20 %	20 %	40 %	20 %	226942224
28	NC_012560	GGCAA	2	10	58343	58352	40 %	0 %	40 %	20 %	226942226
29	NC_012560	CGCGC	2	10	61256	61265	0 %	0 %	40 %	60 %	226942228
30	NC_012560	GCCGC	2	10	61531	61540	0 %	0 %	40 %	60 %	226942229
31	NC_012560	GGCCG	2	10	62200	62209	0 %	0 %	60 %	40 %	226942229
32	NC_012560	CAGGC	2	10	62585	62594	20 %	0 %	40 %	40 %	226942229
33	NC_012560	GCGAG	2	10	66188	66197	20 %	0 %	60 %	20 %	226942232
34	NC_012560	GCCCT	2	10	69181	69190	0 %	20 %	20 %	60 %	226942234
35	NC_012560	CCTCG	2	10	71060	71069	0 %	20 %	20 %	60 %	226942238
36	NC_012560	CGGAG	2	10	71257	71266	20 %	0 %	60 %	20 %	226942238
37	NC_012560	TCGCC	2	10	72356	72365	0 %	20 %	20 %	60 %	226942239
38	NC_012560	CTTCT	2	10	74029	74038	0 %	60 %	0 %	40 %	226942241
39	NC_012560	TCGGG	2	10	76892	76901	0 %	20 %	60 %	20 %	226942244
40	NC_012560	TGGAA	2	10	77565	77574	40 %	20 %	40 %	0 %	226942245
41	NC_012560	GCCGA	2	10	82605	82614	20 %	0 %	40 %	40 %	226942250
42	NC_012560	CCGAG	2	10	82804	82813	20 %	0 %	40 %	40 %	226942250
43	NC_012560	CGGCC	2	10	85096	85105	0 %	0 %	40 %	60 %	226942252
44	NC_012560	GCCGG	2	10	88931	88940	0 %	0 %	60 %	40 %	226942257
45	NC_012560	CCGAT	2	10	90563	90572	20 %	20 %	20 %	40 %	226942258
46	NC_012560	TGGCC	2	10	90588	90597	0 %	20 %	40 %	40 %	226942258
47	NC_012560	TCCGA	2	10	92289	92298	20 %	20 %	20 %	40 %	226942259
48	NC_012560	CGGCG	2	10	93445	93454	0 %	0 %	60 %	40 %	226942260
49	NC_012560	GCCGG	2	10	99289	99298	0 %	0 %	60 %	40 %	226942266
50	NC_012560	GGCCG	2	10	103023	103032	0 %	0 %	60 %	40 %	226942270
51	NC_012560	TCGAG	2	10	104468	104477	20 %	20 %	40 %	20 %	226942272
52	NC_012560	GGGCA	2	10	104518	104527	20 %	0 %	60 %	20 %	226942272
53	NC_012560	GCCGA	2	10	106315	106324	20 %	0 %	40 %	40 %	226942274
54	NC_012560	GGCGC	2	10	112813	112822	0 %	0 %	60 %	40 %	226942280
55	NC_012560	CCGGG	2	10	113254	113263	0 %	0 %	60 %	40 %	226942280
56	NC_012560	GGGCA	2	10	115287	115296	20 %	0 %	60 %	20 %	226942281
57	NC_012560	CGGCG	2	10	117474	117483	0 %	0 %	60 %	40 %	226942284
58	NC_012560	TGGTC	2	10	120506	120515	0 %	40 %	40 %	20 %	226942287
59	NC_012560	GGCCG	2	10	121071	121080	0 %	0 %	60 %	40 %	226942288
60	NC_012560	GCCAC	2	10	122237	122246	20 %	0 %	20 %	60 %	226942289
61	NC_012560	CGCAG	2	10	124469	124478	20 %	0 %	40 %	40 %	226942293
62	NC_012560	TCAGC	2	10	126250	126259	20 %	20 %	20 %	40 %	226942295
63	NC_012560	GGCCC	2	10	126883	126892	0 %	0 %	40 %	60 %	226942295
64	NC_012560	GCCGC	2	10	127604	127613	0 %	0 %	40 %	60 %	226942296
65	NC_012560	CCAGG	2	10	127946	127955	20 %	0 %	40 %	40 %	226942296
66	NC_012560	CAGCC	2	10	130547	130556	20 %	0 %	20 %	60 %	226942300
67	NC_012560	CGAGC	2	10	136261	136270	20 %	0 %	40 %	40 %	226942304
68	NC_012560	TGCGT	2	10	138497	138506	0 %	40 %	40 %	20 %	226942306
69	NC_012560	CTGGA	2	10	140300	140309	20 %	20 %	40 %	20 %	226942307
70	NC_012560	GCGCC	2	10	142486	142495	0 %	0 %	40 %	60 %	226942311
71	NC_012560	GTGCT	2	10	145243	145252	0 %	40 %	40 %	20 %	226942313
72	NC_012560	CCCGA	2	10	146113	146122	20 %	0 %	20 %	60 %	226942314
73	NC_012560	ATCGC	2	10	147914	147923	20 %	20 %	20 %	40 %	226942318
74	NC_012560	GCGCT	2	10	148164	148173	0 %	20 %	40 %	40 %	226942319
75	NC_012560	GCCGG	2	10	149692	149701	0 %	0 %	60 %	40 %	226942321
76	NC_012560	TCTGC	2	10	149771	149780	0 %	40 %	20 %	40 %	226942322
77	NC_012560	CTGGC	2	10	151425	151434	0 %	20 %	40 %	40 %	226942324
78	NC_012560	CTGCG	2	10	152188	152197	0 %	20 %	40 %	40 %	226942325
79	NC_012560	TGCGC	2	10	153535	153544	0 %	20 %	40 %	40 %	226942327
80	NC_012560	GGGCG	2	10	156275	156284	0 %	0 %	80 %	20 %	226942329
81	NC_012560	TGAGC	2	10	158499	158508	20 %	20 %	40 %	20 %	226942332
82	NC_012560	CCTCG	2	10	158744	158753	0 %	20 %	20 %	60 %	226942333
83	NC_012560	CGAGG	2	10	165370	165379	20 %	0 %	60 %	20 %	226942340
84	NC_012560	GAGCC	2	10	167052	167061	20 %	0 %	40 %	40 %	226942342
85	NC_012560	CCAGG	2	10	168970	168979	20 %	0 %	40 %	40 %	226942343
86	NC_012560	GCGCT	2	10	170391	170400	0 %	20 %	40 %	40 %	226942345
87	NC_012560	GGCGG	2	10	172094	172103	0 %	0 %	80 %	20 %	226942345
88	NC_012560	CGCTG	2	10	173762	173771	0 %	20 %	40 %	40 %	226942348
89	NC_012560	AGCGA	2	10	183745	183754	40 %	0 %	40 %	20 %	226942351
90	NC_012560	GGCGA	2	10	185078	185087	20 %	0 %	60 %	20 %	226942352
91	NC_012560	TGGTT	2	10	185697	185706	0 %	60 %	40 %	0 %	226942352
92	NC_012560	GGGCC	2	10	190170	190179	0 %	0 %	60 %	40 %	226942357
93	NC_012560	GCATC	2	10	190919	190928	20 %	20 %	20 %	40 %	226942358
94	NC_012560	GCCTG	2	10	191475	191484	0 %	20 %	40 %	40 %	226942359
95	NC_012560	TCGTT	2	10	191663	191672	0 %	60 %	20 %	20 %	226942360
96	NC_012560	CGTCG	2	10	191761	191770	0 %	20 %	40 %	40 %	226942360
97	NC_012560	GTGCC	2	10	192591	192600	0 %	20 %	40 %	40 %	226942361
98	NC_012560	TGCTG	2	10	193042	193051	0 %	40 %	40 %	20 %	226942361
99	NC_012560	GCTCG	2	10	193883	193892	0 %	20 %	40 %	40 %	226942362
100	NC_012560	CGGCG	2	10	195720	195729	0 %	0 %	60 %	40 %	226942364
101	NC_012560	TGGCC	2	10	196274	196283	0 %	20 %	40 %	40 %	226942365
102	NC_012560	GGCCA	2	10	196959	196968	20 %	0 %	40 %	40 %	226942365
103	NC_012560	CGGCG	2	10	198936	198945	0 %	0 %	60 %	40 %	226942367
104	NC_012560	GGCGC	2	10	200120	200129	0 %	0 %	60 %	40 %	226942368
105	NC_012560	CCGCG	2	10	201443	201452	0 %	0 %	40 %	60 %	226942369
106	NC_012560	CGCTG	2	10	201803	201812	0 %	20 %	40 %	40 %	226942369
107	NC_012560	GCGCG	2	10	203532	203541	0 %	0 %	60 %	40 %	226942370
108	NC_012560	GGGCC	2	10	204050	204059	0 %	0 %	60 %	40 %	226942370
109	NC_012560	CGGCG	2	10	205000	205009	0 %	0 %	60 %	40 %	226942374
110	NC_012560	TTTCG	2	10	208352	208361	0 %	60 %	20 %	20 %	226942377
111	NC_012560	GCGGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	60 %	20 %	226942384
112	NC_012560	GCATG	2	10	212611	212620	20 %	20 %	40 %	20 %	226942384
113	NC_012560	GGCGG	2	10	213334	213343	0 %	0 %	80 %	20 %	226942385
114	NC_012560	GCCCG	2	10	216668	216677	0 %	0 %	40 %	60 %	226942387
115	NC_012560	GCCTG	2	10	217293	217302	0 %	20 %	40 %	40 %	226942387
116	NC_012560	CCGGC	2	10	220147	220156	0 %	0 %	40 %	60 %	226942390
117	NC_012560	CATGG	2	10	220216	220225	20 %	20 %	40 %	20 %	226942390
118	NC_012560	TGCTG	2	10	221124	221133	0 %	40 %	40 %	20 %	226942392
119	NC_012560	CGCTT	2	10	221890	221899	0 %	40 %	20 %	40 %	226942393
120	NC_012560	TTCGC	2	10	222867	222876	0 %	40 %	20 %	40 %	226942394
121	NC_012560	TCCCG	2	10	223249	223258	0 %	20 %	20 %	60 %	226942395
122	NC_012560	CCGAG	2	10	225376	225385	20 %	0 %	40 %	40 %	226942399
123	NC_012560	GCGCG	2	10	225908	225917	0 %	0 %	60 %	40 %	226942400
124	NC_012560	GCCGT	2	10	226288	226297	0 %	20 %	40 %	40 %	226942400
125	NC_012560	GCTCG	2	10	228330	228339	0 %	20 %	40 %	40 %	226942401
126	NC_012560	GCGCG	2	10	229247	229256	0 %	0 %	60 %	40 %	226942402
127	NC_012560	CGCAG	2	10	229496	229505	20 %	0 %	40 %	40 %	226942402
128	NC_012560	TGGCC	2	10	230526	230535	0 %	20 %	40 %	40 %	226942403
129	NC_012560	CGGCG	2	10	232482	232491	0 %	0 %	60 %	40 %	226942406
130	NC_012560	CGCGG	2	10	232743	232752	0 %	0 %	60 %	40 %	226942406
131	NC_012560	CGGCC	2	10	233791	233800	0 %	0 %	40 %	60 %	226942407
132	NC_012560	CCCAG	2	10	235061	235070	20 %	0 %	20 %	60 %	226942409
133	NC_012560	CAGGG	2	10	235302	235311	20 %	0 %	60 %	20 %	226942409
134	NC_012560	GGCCG	2	10	235992	236001	0 %	0 %	60 %	40 %	226942410
135	NC_012560	GGGCA	2	10	236013	236022	20 %	0 %	60 %	20 %	226942410
136	NC_012560	GCCGG	2	10	238405	238414	0 %	0 %	60 %	40 %	226942411
137	NC_012560	CTGGG	2	10	238700	238709	0 %	20 %	60 %	20 %	226942411
138	NC_012560	GCCGG	2	10	242755	242764	0 %	0 %	60 %	40 %	226942414
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248	NC_012560	GCTCT	2	10	419395	419404	0 %	40 %	20 %	40 %	226942601
249	NC_012560	CGCGC	2	10	420294	420303	0 %	0 %	40 %	60 %	226942601
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251	NC_012560	CGGCG	2	10	421504	421513	0 %	0 %	60 %	40 %	226942602
252	NC_012560	CGGCA	2	10	423270	423279	20 %	0 %	40 %	40 %	226942604
253	NC_012560	GCACC	2	10	424338	424347	20 %	0 %	20 %	60 %	226942606
254	NC_012560	CATCG	2	10	426233	426242	20 %	20 %	20 %	40 %	226942607
255	NC_012560	GCCGT	2	10	430310	430319	0 %	20 %	40 %	40 %	226942611
256	NC_012560	TCGAC	2	10	432837	432846	20 %	20 %	20 %	40 %	226942613
257	NC_012560	GCCTT	2	10	438451	438460	0 %	40 %	20 %	40 %	226942621
258	NC_012560	GGGGC	2	10	439665	439674	0 %	0 %	80 %	20 %	226942621
259	NC_012560	GCGCC	2	10	442213	442222	0 %	0 %	40 %	60 %	226942623
260	NC_012560	CGGCG	2	10	444384	444393	0 %	0 %	60 %	40 %	226942627
261	NC_012560	GTCCA	2	10	448135	448144	20 %	20 %	20 %	40 %	226942631
262	NC_012560	TGCGC	2	10	449077	449086	0 %	20 %	40 %	40 %	226942632
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264	NC_012560	GATCG	2	10	450813	450822	20 %	20 %	40 %	20 %	226942634
265	NC_012560	GTTGG	2	10	454556	454565	0 %	40 %	60 %	0 %	226942640
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