MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Laribacter hongkongensis HLHK9

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012559	GAAAAA	2	12	10541	10552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012559	TGTTCT	2	12	12777	12788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012559	CCGTTT	2	12	63529	63540	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012559	TGCGGG	2	12	69528	69539	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012559	CACCGC	2	12	69596	69607	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012559	CCGTTT	2	12	74116	74127	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012559	CACAGA	7	42	74243	74284	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012559	GCTCCC	2	12	74323	74334	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012559	TGCTGT	2	12	75886	75897	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012559	GGTTGT	2	12	96865	96876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012559	CTTGGG	2	12	97001	97012	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012559	TGCGGG	2	12	97317	97328	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012559	CCGGAC	2	12	103127	103138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012559	TGGCGC	2	12	103288	103299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012559	AACGTA	2	12	199272	199283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012559	TGGCGG	2	12	277751	277762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012559	GGGCTG	2	12	305093	305104	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012559	CGATTT	2	12	342954	342965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012559	TCCTGC	2	12	362627	362638	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012559	TGCAGG	2	12	387529	387540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012559	GCAGGG	2	12	397316	397327	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012559	TTCATC	2	12	425757	425768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012559	TCGACC	2	12	476570	476581	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012559	ACCGTT	2	12	542827	542838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012559	GCAGGT	2	12	612205	612216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012559	TTTTAC	2	12	617703	617714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012559	GGCAAG	2	12	661760	661771	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012559	GTACTG	2	12	674879	674890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012559	CCGGCA	2	12	686822	686833	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012559	CTTGAA	2	12	718174	718185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012559	GGAAAA	2	12	720854	720865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012559	GTTGTC	2	12	740597	740608	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012559	CTATGT	2	12	743882	743893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012559	CCCGGC	2	12	758731	758742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012559	CTTTTT	2	12	774792	774803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012559	TATGAA	2	12	791194	791205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012559	GGCGCC	2	12	820345	820356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012559	GCTTCG	2	12	832521	832532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012559	CCACAC	2	12	868673	868684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012559	AAACGG	2	12	872352	872363	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012559	GCGGAA	2	12	875639	875650	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012559	TGAACC	2	12	891066	891077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012559	GCCGGA	2	12	897036	897047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012559	TGCTGT	3	18	922662	922679	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012559	GGCCGG	2	12	943187	943198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012559	AAAAGG	2	12	987108	987119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012559	CCAGCA	2	12	1011497	1011508	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012559	CGAAAA	2	12	1013579	1013590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012559	GAGCTG	2	12	1097538	1097549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012559	AGGCGG	2	12	1109899	1109910	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012559	GGGCCG	2	12	1119368	1119379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012559	GTGGGG	2	12	1120853	1120864	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012559	ACGGTG	2	12	1122147	1122158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012559	GCCGGA	2	12	1122166	1122177	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012559	CGGGAA	2	12	1204478	1204489	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012559	GATAGC	2	12	1242288	1242299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012559	CAGGTT	2	12	1242750	1242761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012559	CCTGAA	2	12	1308275	1308286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012559	CTAGGC	2	12	1310156	1310167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012559	TTTAAA	2	12	1312895	1312906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012559	GCCGGC	2	12	1377733	1377744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012559	GCTGGA	2	12	1489387	1489398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012559	GCATTA	2	12	1506713	1506724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012559	CAAACG	2	12	1545569	1545580	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012559	TCATGC	2	12	1570886	1570897	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012559	CGCTGT	2	12	1571029	1571040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012559	ATCAAT	2	12	1593726	1593737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012559	CCATCA	2	12	1601297	1601308	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012559	TACCAC	2	12	1601460	1601471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012559	CCAACG	2	12	1605715	1605726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012559	ATATGG	2	12	1669467	1669478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012559	CGTTAC	2	12	1691818	1691829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012559	CAGCGA	2	12	1849133	1849144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012559	GGTTCC	2	12	1850381	1850392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012559	CCCCGG	2	12	1884572	1884583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012559	CCGGGA	2	12	1891294	1891305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012559	AATGTT	2	12	1898655	1898666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012559	ACTGAA	2	12	1901165	1901176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012559	CCTTGT	2	12	1903364	1903375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012559	CCGATG	2	12	1942651	1942662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012559	CAGCCA	2	12	1955478	1955489	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012559	TATGAG	2	12	1955571	1955582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012559	GATAAA	2	12	2020901	2020912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012559	ACGGCC	2	12	2064515	2064526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012559	GTTCGG	2	12	2070616	2070627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012559	CCTGCC	2	12	2071552	2071563	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012559	GGAACC	2	12	2113437	2113448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012559	GCCCCG	2	12	2117774	2117785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012559	ATACGG	2	12	2127714	2127725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012559	CGCCCG	2	12	2150730	2150741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012559	ACCAGC	2	12	2163007	2163018	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012559	ACGAAA	2	12	2192821	2192832	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012559	CATGAC	2	12	2265088	2265099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012559	TGCAAA	2	12	2336850	2336861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012559	AAGGCG	2	12	2350751	2350762	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012559	CAAGCG	2	12	2352949	2352960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012559	TTTCAT	2	12	2372667	2372678	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012559	GCCAGG	2	12	2374376	2374387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012559	CCGGCT	2	12	2385148	2385159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012559	GCAAAG	2	12	2417815	2417826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012559	GTAAGG	2	12	2425053	2425064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012559	ACGCAG	2	12	2453545	2453556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012559	CCTGCA	2	12	2461159	2461170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012559	GCAGAT	2	12	2488933	2488944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012559	CCACAC	2	12	2491381	2491392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012559	CCCACC	2	12	2523227	2523238	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_012559	CTTGAC	2	12	2558545	2558556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012559	TACCCC	2	12	2559021	2559032	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012559	GCTGCC	2	12	2623370	2623381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012559	GATGAC	2	12	2666215	2666226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012559	AGATTA	2	12	2692448	2692459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012559	GGAAGG	2	12	2701620	2701631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012559	TGCCTT	2	12	2711647	2711658	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012559	ACAAAA	2	12	2718368	2718379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012559	GCCGGC	2	12	2724719	2724730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012559	CGTTTT	2	12	2739733	2739744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012559	TGCAAC	2	12	2817328	2817339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012559	ACCGGC	2	12	2854442	2854453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012559	CATCCA	2	12	2862904	2862915	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012559	ACGGGG	2	12	2879440	2879451	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012559	TTTTTG	2	12	2881271	2881282	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012559	TTCTGG	2	12	2890990	2891001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012559	AGGAAC	2	12	2907657	2907668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012559	GCGCGA	2	12	2939872	2939883	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012559	CCAGCA	2	12	2942861	2942872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012559	CGGACG	2	12	2961351	2961362	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012559	CTCTGT	2	12	2963939	2963950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012559	AACGTC	2	12	3013793	3013804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012559	CCGGCC	2	12	3022499	3022510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012559	GCAAAG	2	12	3164092	3164103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.