MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Laribacter hongkongensis HLHK9

Total Repeats: 50256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012559	GTT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012559	CGC	2	6	198	203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
3	NC_012559	CAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938935
4	NC_012559	GTA	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938935
5	NC_012559	GCA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938935
6	NC_012559	TTG	2	6	439	444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226938935
7	NC_012559	CAC	2	6	507	512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938935
8	NC_012559	GCC	2	6	601	606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
9	NC_012559	GCC	2	6	738	743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
10	NC_012559	TGA	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938935
11	NC_012559	TCG	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938935
12	NC_012559	TGC	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938935
13	NC_012559	GCC	2	6	1005	1010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
14	NC_012559	CGC	2	6	1013	1018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
15	NC_012559	TGG	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938935
16	NC_012559	CCG	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
17	NC_012559	GTC	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938935
18	NC_012559	TCT	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938935
19	NC_012559	GAT	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938935
20	NC_012559	GCG	2	6	1419	1424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938935
21	NC_012559	CGA	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938935
22	NC_012559	CCA	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938935
23	NC_012559	GCC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938935
24	NC_012559	CCA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938936
25	NC_012559	CCA	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938936
26	NC_012559	GCG	2	6	2135	2140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938936
27	NC_012559	CCA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938936
28	NC_012559	TCG	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938936
29	NC_012559	TCC	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226938936
30	NC_012559	GCG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938936
31	NC_012559	TTC	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938936
32	NC_012559	GCA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938936
33	NC_012559	CTT	2	6	2956	2961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938936
34	NC_012559	TCG	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938936
35	NC_012559	CGT	2	6	3075	3080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938936
36	NC_012559	GTA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938936
37	NC_012559	TCG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938936
38	NC_012559	TTC	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938936
39	NC_012559	CAA	2	6	3406	3411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938937
40	NC_012559	CAG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938937
41	NC_012559	GCC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938937
42	NC_012559	TGA	3	9	3667	3675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938937
43	NC_012559	CGC	2	6	3733	3738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
44	NC_012559	GCC	2	6	3743	3748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
45	NC_012559	GCC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
46	NC_012559	TGC	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938938
47	NC_012559	GCA	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938938
48	NC_012559	CAC	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938938
49	NC_012559	GCG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938938
50	NC_012559	TCA	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938938
51	NC_012559	CGG	2	6	4040	4045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938938
52	NC_012559	TCG	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938938
53	NC_012559	GCC	2	6	4257	4262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
54	NC_012559	CCG	2	6	4291	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
55	NC_012559	GCC	2	6	4325	4330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938938
56	NC_012559	CAT	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938939
57	NC_012559	GGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938939
58	NC_012559	TGG	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938939
59	NC_012559	TGA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938939
60	NC_012559	TCA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938939
61	NC_012559	CAT	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938939
62	NC_012559	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
63	NC_012559	CTG	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
64	NC_012559	CCT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226938939
65	NC_012559	TGC	2	6	4989	4994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
66	NC_012559	CGA	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938939
67	NC_012559	GCC	2	6	5036	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
68	NC_012559	AGA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226938939
69	NC_012559	CGA	2	6	5188	5193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938939
70	NC_012559	GCC	2	6	5198	5203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
71	NC_012559	GAA	3	9	5216	5224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226938939
72	NC_012559	CGC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
73	NC_012559	CTG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
74	NC_012559	TGG	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938939
75	NC_012559	CTG	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
76	NC_012559	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938939
77	NC_012559	CTG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
78	NC_012559	CGA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938939
79	NC_012559	CCG	2	6	5632	5637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
80	NC_012559	CTG	2	6	5717	5722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938939
81	NC_012559	GAA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226938939
82	NC_012559	GCA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938939
83	NC_012559	GCC	2	6	5768	5773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938939
84	NC_012559	GAC	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012559	AAC	2	6	5924	5929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012559	CTG	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012559	CCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_012559	AAC	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012559	GCA	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012559	CAA	2	6	6447	6452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938940
91	NC_012559	GCC	2	6	6562	6567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938940
92	NC_012559	CGA	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938940
93	NC_012559	TGC	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938940
94	NC_012559	TGG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938940
95	NC_012559	CTG	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938940
96	NC_012559	GCC	2	6	6780	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938940
97	NC_012559	TGC	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012559	AGG	2	6	7102	7107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012559	CAG	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012559	ACA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012559	ACC	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012559	GAC	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012559	CGC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938941
104	NC_012559	CTT	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938941
105	NC_012559	GCC	2	6	7447	7452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938941
106	NC_012559	GCC	2	6	7475	7480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938941
107	NC_012559	GCC	2	6	7540	7545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938941
108	NC_012559	TCA	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938941
109	NC_012559	CAA	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938941
110	NC_012559	CCT	2	6	7870	7875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226938941
111	NC_012559	ATC	2	6	7899	7904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938941
112	NC_012559	CAT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938941
113	NC_012559	CAA	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938941
114	NC_012559	GGC	3	9	8052	8060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938942
115	NC_012559	ACA	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938942
116	NC_012559	GGT	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938942
117	NC_012559	GGC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938942
118	NC_012559	GTG	2	6	8383	8388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938942
119	NC_012559	CAC	2	6	8403	8408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938942
120	NC_012559	CGC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938942
121	NC_012559	GCC	2	6	8642	8647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938942
122	NC_012559	TGT	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226938942
123	NC_012559	CGG	2	6	8799	8804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938942
124	NC_012559	TGC	3	9	8809	8817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938942
125	NC_012559	GAT	2	6	8827	8832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938942
126	NC_012559	GGC	2	6	8842	8847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938942
127	NC_012559	CAC	2	6	8879	8884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938942
128	NC_012559	GAC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012559	AGT	2	6	9054	9059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938943
130	NC_012559	ACG	2	6	9091	9096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938943
131	NC_012559	CCA	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938943
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258	NC_012559	CGC	2	6	17904	17909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938953
259	NC_012559	CGA	2	6	17950	17955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938953
260	NC_012559	CCG	2	6	17956	17961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938953
261	NC_012559	GAT	2	6	17992	17997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938953
262	NC_012559	GCA	2	6	18034	18039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938953
263	NC_012559	GGC	2	6	18040	18045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938953
264	NC_012559	GAA	2	6	18098	18103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226938953
265	NC_012559	GTC	2	6	18145	18150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938953
266	NC_012559	CCA	2	6	18162	18167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938953
267	NC_012559	CAT	2	6	18211	18216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938953
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269	NC_012559	CTG	2	6	18254	18259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938953
270	NC_012559	CTG	2	6	18278	18283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938953
271	NC_012559	ACA	2	6	18351	18356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938953
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273	NC_012559	GCC	2	6	18458	18463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938953
274	NC_012559	GCA	3	9	18490	18498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938953
275	NC_012559	ACG	2	6	18516	18521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938953
276	NC_012559	TGA	2	6	18525	18530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938953
277	NC_012559	GGT	2	6	18604	18609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938953
278	NC_012559	CGG	3	9	18610	18618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938953
279	NC_012559	GGC	2	6	18638	18643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938953
280	NC_012559	CAT	2	6	18652	18657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938953
281	NC_012559	CAG	2	6	18755	18760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938953
282	NC_012559	GGC	2	6	18781	18786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938953
283	NC_012559	TCG	2	6	18801	18806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938953
284	NC_012559	TGG	2	6	18813	18818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938953
285	NC_012559	GGC	2	6	18863	18868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938953
286	NC_012559	CCT	2	6	18903	18908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226938953
287	NC_012559	CTT	2	6	18949	18954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938953
288	NC_012559	TGC	2	6	19057	19062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938953
289	NC_012559	CAG	2	6	19091	19096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_012559	CTG	2	6	19149	19154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_012559	CAT	2	6	19170	19175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226938954
292	NC_012559	GCC	2	6	19188	19193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938954
293	NC_012559	CGG	2	6	19298	19303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938954
294	NC_012559	CAG	2	6	19314	19319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938954
295	NC_012559	GGC	2	6	19344	19349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938954
296	NC_012559	CAG	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938954
297	NC_012559	CGG	2	6	19514	19519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938954
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299	NC_012559	GAC	2	6	19778	19783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938955
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303	NC_012559	GGC	2	6	19966	19971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226938955
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312	NC_012559	CGC	2	6	20601	20606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938955
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324	NC_012559	TGC	2	6	21520	21525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938958
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327	NC_012559	GTC	2	6	21671	21676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938958
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329	NC_012559	CTG	3	9	21717	21725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938958
330	NC_012559	GCC	2	6	21762	21767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226938958
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332	NC_012559	GGT	2	6	21794	21799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938958
333	NC_012559	TGG	2	6	21811	21816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938958
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349	NC_012559	GTG	2	6	22439	22444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938959
350	NC_012559	TGA	2	6	22480	22485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938959
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352	NC_012559	TGG	2	6	22506	22511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938959
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354	NC_012559	CAA	2	6	22546	22551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938959
355	NC_012559	GAT	2	6	22568	22573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938959
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357	NC_012559	TGC	2	6	22641	22646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938959
358	NC_012559	GAA	2	6	22736	22741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
359	NC_012559	CAA	2	6	22837	22842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938960
360	NC_012559	ACA	2	6	22848	22853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938960
361	NC_012559	GTG	4	12	22904	22915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938960
362	NC_012559	ACA	2	6	23106	23111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226938960
363	NC_012559	GGT	2	6	23234	23239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226938960
364	NC_012559	CAG	3	9	23240	23248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938960
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366	NC_012559	ATG	2	6	23384	23389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938960
367	NC_012559	GAG	2	6	23465	23470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226938960
368	NC_012559	GAA	2	6	23480	23485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226938960
369	NC_012559	TTC	2	6	23486	23491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226938960
370	NC_012559	GCA	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938960
371	NC_012559	GCA	2	6	23586	23591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_012559	GCA	2	6	23732	23737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226938961
373	NC_012559	TGT	2	6	23740	23745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226938961
374	NC_012559	TCG	2	6	23831	23836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226938961
375	NC_012559	ATG	2	6	23882	23887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226938961
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378	NC_012559	ACC	2	6	24026	24031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938961
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380	NC_012559	CAC	2	6	24169	24174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226938961
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