MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785S

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012552	AAT	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
2	NC_012552	TTG	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
3	NC_012552	ATT	3	9	251	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226526992
4	NC_012552	TGT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
5	NC_012552	AGA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
6	NC_012552	TGA	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526992
7	NC_012552	TCA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226526992
8	NC_012552	TTG	2	6	781	786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
9	NC_012552	GTT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526992
10	NC_012552	TCG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226526992
11	NC_012552	TGA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526992
12	NC_012552	CTT	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226526992
13	NC_012552	AAG	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
14	NC_012552	AGA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526992
15	NC_012552	ATT	2	6	1267	1272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226526992
16	NC_012552	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226526992
17	NC_012552	TAA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
18	NC_012552	ATA	2	6	1502	1507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226526992
19	NC_012552	CAT	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226526992
20	NC_012552	GTA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012552	GCT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012552	GCG	2	6	1699	1704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012552	TAT	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012552	TTG	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012552	TAG	2	6	1907	1912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012552	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
27	NC_012552	ATG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526991
28	NC_012552	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
29	NC_012552	AGA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
30	NC_012552	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226526991
31	NC_012552	CAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226526991
32	NC_012552	AGA	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226526991
33	NC_012552	TTG	2	6	2835	2840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226526991
34	NC_012552	TAC	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012552	GGT	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012552	GAA	2	6	3302	3307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012552	TTC	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012552	GGA	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012552	TTG	2	6	3368	3373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012552	GGT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.