MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012529	TGGAA	2	10	173	182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012529	CGGGG	2	10	5482	5491	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012529	AGTGA	2	10	14190	14199	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012529	GTCCG	2	10	28601	28610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012529	TCTGG	2	10	42032	42041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012529	CTGAC	2	10	44481	44490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012529	GGTGT	2	10	70963	70972	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012529	TTCTA	2	10	80153	80162	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012529	CAGCA	2	10	93891	93900	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012529	CAAAA	2	10	102277	102286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012529	CACGA	2	10	102658	102667	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012529	CTGAA	2	10	109019	109028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012529	CAACA	2	10	109291	109300	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012529	CTCGA	2	10	121315	121324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012529	GGTCA	2	10	154392	154401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012529	GACAG	2	10	158649	158658	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012529	CTGCC	2	10	165544	165553	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_012529	TGGCT	2	10	188665	188674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012529	GCTGC	2	10	188815	188824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012529	GGTCA	2	10	199174	199183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012529	CCACC	2	10	201765	201774	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
22	NC_012529	TCCCG	2	10	201878	201887	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_012529	AATGG	2	10	211448	211457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012529	CAGGA	2	10	213992	214001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012529	GCAGA	2	10	242477	242486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012529	ACCGT	2	10	242510	242519	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012529	TCCGT	2	10	249211	249220	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_012529	CAACC	2	10	280200	280209	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_012529	CACAC	2	10	288229	288238	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_012529	GACAA	2	10	293010	293019	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012529	TGAAC	2	10	296405	296414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012529	GGAGA	2	10	310627	310636	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.