MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 4341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012529	TGC	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358015
2	NC_012529	CTT	2	6	352	357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358015
3	NC_012529	CTC	2	6	437	442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358015
4	NC_012529	GAT	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358015
5	NC_012529	AGG	2	6	630	635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358015
6	NC_012529	CTG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358015
7	NC_012529	CCG	2	6	832	837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358015
8	NC_012529	ATG	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358015
9	NC_012529	AAT	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226358015
10	NC_012529	CCA	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358015
11	NC_012529	CTC	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358016
12	NC_012529	CAG	2	6	1330	1335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358016
13	NC_012529	AAG	2	6	1358	1363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358016
14	NC_012529	TGC	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358016
15	NC_012529	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358016
16	NC_012529	CAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358016
17	NC_012529	GCT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358016
18	NC_012529	TGA	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358016
19	NC_012529	CTG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358016
20	NC_012529	AGG	2	6	1748	1753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358016
21	NC_012529	CCA	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358016
22	NC_012529	GCT	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358016
23	NC_012529	TAG	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358016
24	NC_012529	TCA	2	6	3801	3806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358017
25	NC_012529	TCC	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358017
26	NC_012529	CGG	2	6	3907	3912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358017
27	NC_012529	CAT	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358017
28	NC_012529	GAC	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358017
29	NC_012529	TGA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358017
30	NC_012529	TAC	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358017
31	NC_012529	ACC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358017
32	NC_012529	ACC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358017
33	NC_012529	GCA	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358017
34	NC_012529	CTG	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
35	NC_012529	GCT	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
36	NC_012529	GCA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358017
37	NC_012529	ATG	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358017
38	NC_012529	TCA	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358017
39	NC_012529	CCG	2	6	4660	4665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358017
40	NC_012529	GGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358017
41	NC_012529	CGG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358017
42	NC_012529	GCT	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
43	NC_012529	CTG	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
44	NC_012529	CTG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
45	NC_012529	TCG	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358017
46	NC_012529	CGA	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358017
47	NC_012529	GGA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358018
48	NC_012529	CGC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358018
49	NC_012529	GCG	2	6	5629	5634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358018
50	NC_012529	CAG	2	6	5639	5644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358018
51	NC_012529	CGC	2	6	5772	5777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358018
52	NC_012529	GTC	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358019
53	NC_012529	AAC	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358019
54	NC_012529	CCG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358019
55	NC_012529	TGA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358019
56	NC_012529	CAC	2	6	6343	6348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358019
57	NC_012529	GAA	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358019
58	NC_012529	ACG	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358019
59	NC_012529	CAG	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358019
60	NC_012529	AGC	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358020
61	NC_012529	CAG	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358020
62	NC_012529	CGG	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358020
63	NC_012529	GGC	2	6	7034	7039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358020
64	NC_012529	AGC	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358020
65	NC_012529	GCG	2	6	7206	7211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358020
66	NC_012529	CCA	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358020
67	NC_012529	CCA	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358020
68	NC_012529	CAG	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358020
69	NC_012529	AGC	2	6	7320	7325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358020
70	NC_012529	TGA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358020
71	NC_012529	CGG	2	6	7352	7357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358020
72	NC_012529	GCC	2	6	7545	7550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358020
73	NC_012529	CTC	2	6	7574	7579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358021
74	NC_012529	CGA	2	6	7598	7603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358021
75	NC_012529	TTC	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358021
76	NC_012529	GCC	2	6	7875	7880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358021
77	NC_012529	GGC	2	6	7899	7904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358021
78	NC_012529	GAT	2	6	7977	7982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358021
79	NC_012529	CAG	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358021
80	NC_012529	GAA	2	6	8133	8138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358021
81	NC_012529	GTC	2	6	8142	8147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358021
82	NC_012529	AGC	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358021
83	NC_012529	CAC	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358021
84	NC_012529	CGG	2	6	8233	8238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358021
85	NC_012529	CGG	2	6	8363	8368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358021
86	NC_012529	GCC	3	9	8485	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358022
87	NC_012529	GTC	2	6	8569	8574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358022
88	NC_012529	GTG	2	6	8794	8799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358022
89	NC_012529	CGT	2	6	8877	8882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358022
90	NC_012529	GCA	2	6	9021	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358022
91	NC_012529	CTG	2	6	9139	9144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358022
92	NC_012529	TCC	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358022
93	NC_012529	CAG	2	6	9322	9327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358022
94	NC_012529	GGC	2	6	9349	9354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358022
95	NC_012529	GCT	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358023
96	NC_012529	GAA	3	9	9512	9520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358023
97	NC_012529	GGC	2	6	9538	9543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358023
98	NC_012529	TCG	2	6	9597	9602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358023
99	NC_012529	CAT	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358023
100	NC_012529	GAT	2	6	9683	9688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358023
101	NC_012529	CAG	2	6	9701	9706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358023
102	NC_012529	GCA	2	6	9709	9714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358023
103	NC_012529	TCA	2	6	9784	9789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358023
104	NC_012529	ATG	3	9	9855	9863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358023
105	NC_012529	ACC	2	6	9972	9977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358023
106	NC_012529	GCA	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358023
107	NC_012529	TTG	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226358023
108	NC_012529	CGT	2	6	10036	10041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358023
109	NC_012529	TCG	2	6	10077	10082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358023
110	NC_012529	GAT	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358023
111	NC_012529	TGG	2	6	10192	10197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358023
112	NC_012529	CAT	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358023
113	NC_012529	CTT	2	6	10324	10329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358023
114	NC_012529	CTC	2	6	10334	10339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358023
115	NC_012529	GTA	2	6	10454	10459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358023
116	NC_012529	GCG	2	6	10460	10465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358023
117	NC_012529	GGC	2	6	10472	10477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358023
118	NC_012529	CGG	2	6	10543	10548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358023
119	NC_012529	AGG	2	6	10669	10674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358023
120	NC_012529	CTT	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358023
121	NC_012529	TCC	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358023
122	NC_012529	CTG	2	6	10859	10864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358023
123	NC_012529	GCT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358024
124	NC_012529	CGT	2	6	11071	11076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358024
125	NC_012529	GCG	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358024
126	NC_012529	GGC	2	6	11236	11241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358024
127	NC_012529	CGC	2	6	11445	11450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358024
128	NC_012529	GCA	2	6	11668	11673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358024
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250	NC_012529	TCC	2	6	20151	20156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358033
251	NC_012529	CCG	2	6	20188	20193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358033
252	NC_012529	ACC	2	6	20250	20255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
253	NC_012529	TCA	2	6	20272	20277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358033
254	NC_012529	GGC	2	6	20329	20334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358033
255	NC_012529	GCA	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
256	NC_012529	CCA	2	6	20344	20349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
257	NC_012529	TCT	2	6	20356	20361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358033
258	NC_012529	CGG	2	6	20377	20382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358033
259	NC_012529	AGC	4	12	20394	20405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
260	NC_012529	CCA	2	6	20416	20421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
261	NC_012529	GCT	2	6	20446	20451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
262	NC_012529	GCT	2	6	20512	20517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
263	NC_012529	CTG	2	6	20528	20533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
264	NC_012529	GCA	2	6	20563	20568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
265	NC_012529	TGC	2	6	20569	20574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
266	NC_012529	CAC	2	6	20576	20581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
267	NC_012529	GCC	2	6	20603	20608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358033
268	NC_012529	CAT	2	6	20609	20614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358033
269	NC_012529	CAG	2	6	20624	20629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
270	NC_012529	GCA	2	6	20641	20646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
271	NC_012529	CAG	2	6	20765	20770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
272	NC_012529	CGT	2	6	20848	20853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
273	NC_012529	CAG	2	6	20900	20905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
274	NC_012529	GCA	2	6	20956	20961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
275	NC_012529	CCA	2	6	20992	20997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
276	NC_012529	GCA	2	6	21025	21030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
277	NC_012529	CAG	2	6	21041	21046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
278	NC_012529	ACC	2	6	21054	21059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
279	NC_012529	CTG	2	6	21074	21079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
280	NC_012529	CAG	2	6	21083	21088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
281	NC_012529	GCA	2	6	21094	21099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
282	NC_012529	CGC	2	6	21148	21153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358033
283	NC_012529	CCG	2	6	21171	21176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358033
284	NC_012529	CCA	2	6	21343	21348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358033
285	NC_012529	CGA	2	6	21389	21394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
286	NC_012529	CAG	2	6	21395	21400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
287	NC_012529	CAG	2	6	21434	21439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
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289	NC_012529	GCC	2	6	21521	21526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358033
290	NC_012529	TGC	2	6	21640	21645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358033
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292	NC_012529	CAG	2	6	21665	21670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
293	NC_012529	GGT	2	6	21713	21718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358033
294	NC_012529	CAG	2	6	21779	21784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
295	NC_012529	CAG	2	6	21827	21832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358033
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300	NC_012529	CGG	2	6	21906	21911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358033
301	NC_012529	TCC	2	6	21944	21949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358034
302	NC_012529	CAG	2	6	21979	21984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358034
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318	NC_012529	CAG	3	9	22771	22779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358034
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324	NC_012529	CGT	2	6	23315	23320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358035
325	NC_012529	CAG	2	6	23447	23452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358035
326	NC_012529	ACG	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358035
327	NC_012529	ACG	2	6	23494	23499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358035
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330	NC_012529	GAC	2	6	23778	23783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358035
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343	NC_012529	CAG	2	6	24854	24859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358036
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354	NC_012529	CTG	2	6	25462	25467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004722
355	NC_012529	TGA	2	6	25481	25486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	355004722
356	NC_012529	AGT	2	6	25546	25551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	355004722
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358	NC_012529	CAT	3	9	25584	25592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	355004722
359	NC_012529	GCA	2	6	25596	25601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004722
360	NC_012529	CAG	2	6	25636	25641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004722
361	NC_012529	CGG	2	6	25772	25777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358038
362	NC_012529	CGA	2	6	25974	25979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358038
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365	NC_012529	GAG	2	6	26077	26082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358038
366	NC_012529	CCA	2	6	26128	26133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358038
367	NC_012529	CGC	2	6	26144	26149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358038
368	NC_012529	CGC	2	6	26208	26213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358038
369	NC_012529	AGG	2	6	26221	26226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358038
370	NC_012529	GGA	2	6	26294	26299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358038
371	NC_012529	CCA	2	6	26313	26318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358038
372	NC_012529	GAT	2	6	26323	26328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358038
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374	NC_012529	CAA	2	6	26424	26429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358038
375	NC_012529	GCA	2	6	26435	26440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358038
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496	NC_012529	CTG	2	6	34067	34072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358044
497	NC_012529	CCG	2	6	34282	34287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358044
498	NC_012529	CAG	2	6	34307	34312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358044
499	NC_012529	GCC	2	6	34322	34327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358044
500	NC_012529	GTG	2	6	34332	34337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358044

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