MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 1

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012527	GTACA	2	10	529	538	40 %	20 %	20 %	20 %	226357405
2	NC_012527	CCCGA	2	10	635	644	20 %	0 %	20 %	60 %	226357405
3	NC_012527	TTGTT	2	10	2249	2258	0 %	80 %	20 %	0 %	226357407
4	NC_012527	AGGTG	2	10	4127	4136	20 %	20 %	60 %	0 %	226357409
5	NC_012527	GCAAG	2	10	4405	4414	40 %	0 %	40 %	20 %	226357409
6	NC_012527	GCACA	2	10	6012	6021	40 %	0 %	20 %	40 %	226357411
7	NC_012527	GCCAC	2	10	10133	10142	20 %	0 %	20 %	60 %	226357414
8	NC_012527	ACTTC	2	10	10385	10394	20 %	40 %	0 %	40 %	226357414
9	NC_012527	TGCCC	2	10	12574	12583	0 %	20 %	20 %	60 %	226357416
10	NC_012527	AGGTG	2	10	13209	13218	20 %	20 %	60 %	0 %	226357417
11	NC_012527	AGCAC	2	10	21556	21565	40 %	0 %	20 %	40 %	226357418
12	NC_012527	GTGCT	2	10	22353	22362	0 %	40 %	40 %	20 %	226357418
13	NC_012527	AGAAA	2	10	23253	23262	80 %	0 %	20 %	0 %	226357419
14	NC_012527	CTGGG	2	10	24429	24438	0 %	20 %	60 %	20 %	226357420
15	NC_012527	ACCTC	2	10	25138	25147	20 %	20 %	0 %	60 %	226357421
16	NC_012527	GACCA	2	10	26379	26388	40 %	0 %	20 %	40 %	226357422
17	NC_012527	GGCAG	2	10	27849	27858	20 %	0 %	60 %	20 %	226357424
18	NC_012527	GGCTG	2	10	29388	29397	0 %	20 %	60 %	20 %	226357425
19	NC_012527	GCGTG	2	10	29875	29884	0 %	20 %	60 %	20 %	226357425
20	NC_012527	CAGCT	2	10	30891	30900	20 %	20 %	20 %	40 %	226357426
21	NC_012527	GGCCG	2	10	30910	30919	0 %	0 %	60 %	40 %	226357426
22	NC_012527	ATTTC	2	10	32150	32159	20 %	60 %	0 %	20 %	226357427
23	NC_012527	CCCAC	2	10	32788	32797	20 %	0 %	0 %	80 %	226357427
24	NC_012527	TGAGC	2	10	34900	34909	20 %	20 %	40 %	20 %	226357428
25	NC_012527	CAGCC	2	10	35173	35182	20 %	0 %	20 %	60 %	226357428
26	NC_012527	GTGAG	2	10	37018	37027	20 %	20 %	60 %	0 %	226357429
27	NC_012527	TCGAG	2	10	37153	37162	20 %	20 %	40 %	20 %	226357429
28	NC_012527	CCCTC	2	10	38319	38328	0 %	20 %	0 %	80 %	226357430
29	NC_012527	GCGAC	2	10	39113	39122	20 %	0 %	40 %	40 %	226357431
30	NC_012527	GCTCC	2	10	40132	40141	0 %	20 %	20 %	60 %	226357431
31	NC_012527	GAGCA	2	10	43353	43362	40 %	0 %	40 %	20 %	226357433
32	NC_012527	CGGCG	2	10	43936	43945	0 %	0 %	60 %	40 %	226357434
33	NC_012527	TGCGG	2	10	46862	46871	0 %	20 %	60 %	20 %	226357435
34	NC_012527	CCAGC	2	10	47612	47621	20 %	0 %	20 %	60 %	226357435
35	NC_012527	CGGCG	2	10	48286	48295	0 %	0 %	60 %	40 %	226357435
36	NC_012527	AGGGG	2	10	48971	48980	20 %	0 %	80 %	0 %	226357435
37	NC_012527	TTTCA	2	10	48987	48996	20 %	60 %	0 %	20 %	226357435
38	NC_012527	ACCTG	2	10	49980	49989	20 %	20 %	20 %	40 %	226357436
39	NC_012527	GACTC	2	10	50915	50924	20 %	20 %	20 %	40 %	226357437
40	NC_012527	GGTCA	2	10	51233	51242	20 %	20 %	40 %	20 %	226357437
41	NC_012527	GACGG	2	10	51905	51914	20 %	0 %	60 %	20 %	226357438
42	NC_012527	TGGAG	2	10	52179	52188	20 %	20 %	60 %	0 %	226357438
43	NC_012527	ACCGC	2	10	57785	57794	20 %	0 %	20 %	60 %	226357441
44	NC_012527	CACGG	2	10	59351	59360	20 %	0 %	40 %	40 %	226357442
45	NC_012527	CGAGC	2	10	59699	59708	20 %	0 %	40 %	40 %	226357442
46	NC_012527	CGCTG	2	10	61643	61652	0 %	20 %	40 %	40 %	226357445
47	NC_012527	CAGTG	2	10	63600	63609	20 %	20 %	40 %	20 %	226357447
48	NC_012527	CGGTG	2	10	70340	70349	0 %	20 %	60 %	20 %	226357454
49	NC_012527	GCAGC	2	10	71183	71192	20 %	0 %	40 %	40 %	226357454
50	NC_012527	TGGCC	2	10	72158	72167	0 %	20 %	40 %	40 %	226357454
51	NC_012527	CCTCG	2	10	72677	72686	0 %	20 %	20 %	60 %	226357454
52	NC_012527	CTGCT	2	10	74782	74791	0 %	40 %	20 %	40 %	226357458
53	NC_012527	TCCCG	2	10	80756	80765	0 %	20 %	20 %	60 %	226357461
54	NC_012527	TGGCG	2	10	86265	86274	0 %	20 %	60 %	20 %	226357467
55	NC_012527	GTCAC	2	10	88253	88262	20 %	20 %	20 %	40 %	226357470
56	NC_012527	GACAG	2	10	91693	91702	40 %	0 %	40 %	20 %	226357471
57	NC_012527	GCGCC	2	10	92081	92090	0 %	0 %	40 %	60 %	226357471
58	NC_012527	AAGTG	2	10	95212	95221	40 %	20 %	40 %	0 %	226357472
59	NC_012527	GCGCT	2	10	96086	96095	0 %	20 %	40 %	40 %	226357472
60	NC_012527	GCCCA	2	10	99956	99965	20 %	0 %	20 %	60 %	226357474
61	NC_012527	GCGTG	2	10	102611	102620	0 %	20 %	60 %	20 %	226357476
62	NC_012527	CTGAT	2	10	105701	105710	20 %	40 %	20 %	20 %	226357479
63	NC_012527	GATCA	2	10	105733	105742	40 %	20 %	20 %	20 %	226357479
64	NC_012527	CCGTG	2	10	106263	106272	0 %	20 %	40 %	40 %	226357479
65	NC_012527	CGCAG	2	10	106531	106540	20 %	0 %	40 %	40 %	226357480
66	NC_012527	CACCG	2	10	107114	107123	20 %	0 %	20 %	60 %	226357480
67	NC_012527	GAACG	2	10	110931	110940	40 %	0 %	40 %	20 %	226357484
68	NC_012527	CCATG	2	10	114031	114040	20 %	20 %	20 %	40 %	226357486
69	NC_012527	GTGAG	2	10	114858	114867	20 %	20 %	60 %	0 %	226357487
70	NC_012527	TGAGC	2	10	116285	116294	20 %	20 %	40 %	20 %	226357488
71	NC_012527	GTGCC	2	10	118962	118971	0 %	20 %	40 %	40 %	226357490
72	NC_012527	GAGGT	2	10	119393	119402	20 %	20 %	60 %	0 %	226357490
73	NC_012527	GCCGT	2	10	120150	120159	0 %	20 %	40 %	40 %	226357491
74	NC_012527	TGCCG	2	10	123511	123520	0 %	20 %	40 %	40 %	226357492
75	NC_012527	GAATC	2	10	125551	125560	40 %	20 %	20 %	20 %	226357494
76	NC_012527	GGTGC	2	10	125820	125829	0 %	20 %	60 %	20 %	226357494
77	NC_012527	GCAAC	2	10	128036	128045	40 %	0 %	20 %	40 %	226357495
78	NC_012527	GGGCC	2	10	131694	131703	0 %	0 %	60 %	40 %	226357498
79	NC_012527	TGGCG	2	10	132381	132390	0 %	20 %	60 %	20 %	226357498
80	NC_012527	GACAC	2	10	133339	133348	40 %	0 %	20 %	40 %	226357499
81	NC_012527	ACGAC	2	10	142443	142452	40 %	0 %	20 %	40 %	226357506
82	NC_012527	CGCAC	2	10	142462	142471	20 %	0 %	20 %	60 %	226357506
83	NC_012527	CTGAT	2	10	146540	146549	20 %	40 %	20 %	20 %	226357510
84	NC_012527	CTGGT	2	10	146694	146703	0 %	40 %	40 %	20 %	226357510
85	NC_012527	ACTGG	2	10	151121	151130	20 %	20 %	40 %	20 %	226357516
86	NC_012527	GCCGC	2	10	152506	152515	0 %	0 %	40 %	60 %	226357519
87	NC_012527	GCACG	2	10	155499	155508	20 %	0 %	40 %	40 %	226357520
88	NC_012527	CACCT	2	10	156257	156266	20 %	20 %	0 %	60 %	226357521
89	NC_012527	CAGAA	2	10	157253	157262	60 %	0 %	20 %	20 %	226357521
90	NC_012527	TGACC	2	10	159491	159500	20 %	20 %	20 %	40 %	226357522
91	NC_012527	CACAC	2	10	169761	169770	40 %	0 %	0 %	60 %	226357528
92	NC_012527	TGGCG	2	10	170756	170765	0 %	20 %	60 %	20 %	226357529
93	NC_012527	GCAGC	2	10	173188	173197	20 %	0 %	40 %	40 %	226357532
94	NC_012527	GCGGT	2	10	176180	176189	0 %	20 %	60 %	20 %	226357535
95	NC_012527	GCTCG	2	10	177820	177829	0 %	20 %	40 %	40 %	226357537
96	NC_012527	CCCAT	2	10	178057	178066	20 %	20 %	0 %	60 %	226357537
97	NC_012527	CCGGA	2	10	179659	179668	20 %	0 %	40 %	40 %	226357538
98	NC_012527	CCGGC	2	10	185983	185992	0 %	0 %	40 %	60 %	226357543
99	NC_012527	TGGGC	2	10	189937	189946	0 %	20 %	60 %	20 %	226357550
100	NC_012527	GCCGC	2	10	191881	191890	0 %	0 %	40 %	60 %	226357551
101	NC_012527	CGGCG	2	10	192016	192025	0 %	0 %	60 %	40 %	226357551
102	NC_012527	TGCGC	2	10	192323	192332	0 %	20 %	40 %	40 %	226357551
103	NC_012527	CGGAC	2	10	194847	194856	20 %	0 %	40 %	40 %	226357552
104	NC_012527	GGCTG	2	10	195039	195048	0 %	20 %	60 %	20 %	226357552
105	NC_012527	GGACT	2	10	195064	195073	20 %	20 %	40 %	20 %	226357552
106	NC_012527	TGCCG	2	10	195863	195872	0 %	20 %	40 %	40 %	226357553
107	NC_012527	CGCGG	2	10	196119	196128	0 %	0 %	60 %	40 %	226357553
108	NC_012527	CCGCG	2	10	196302	196311	0 %	0 %	40 %	60 %	226357553
109	NC_012527	GCTGC	2	10	197698	197707	0 %	20 %	40 %	40 %	226357554
110	NC_012527	AGCGC	2	10	198042	198051	20 %	0 %	40 %	40 %	226357554
111	NC_012527	CTGGT	2	10	198245	198254	0 %	40 %	40 %	20 %	226357554
112	NC_012527	GCAGT	2	10	198489	198498	20 %	20 %	40 %	20 %	226357554
113	NC_012527	CAGAA	2	10	200508	200517	60 %	0 %	20 %	20 %	226357556
114	NC_012527	CACGA	2	10	202205	202214	40 %	0 %	20 %	40 %	226357559
115	NC_012527	CGTGG	2	10	204821	204830	0 %	20 %	60 %	20 %	226357562
116	NC_012527	CACAC	2	10	205617	205626	40 %	0 %	0 %	60 %	226357563
117	NC_012527	ACCCC	2	10	206074	206083	20 %	0 %	0 %	80 %	226357563
118	NC_012527	GCTGG	2	10	210339	210348	0 %	20 %	60 %	20 %	226357568
119	NC_012527	GGTAG	2	10	211960	211969	20 %	20 %	60 %	0 %	226357570
120	NC_012527	AGACC	2	10	212637	212646	40 %	0 %	20 %	40 %	226357570
121	NC_012527	ACCAG	2	10	212711	212720	40 %	0 %	20 %	40 %	226357570
122	NC_012527	GATCG	2	10	212779	212788	20 %	20 %	40 %	20 %	226357570
123	NC_012527	CCACA	2	10	212829	212838	40 %	0 %	0 %	60 %	226357570
124	NC_012527	TGTCC	2	10	213602	213611	0 %	40 %	20 %	40 %	226357571
125	NC_012527	AAGTC	2	10	214732	214741	40 %	20 %	20 %	20 %	226357572
126	NC_012527	GACCA	2	10	216607	216616	40 %	0 %	20 %	40 %	226357573
127	NC_012527	GCAGT	2	10	220204	220213	20 %	20 %	40 %	20 %	226357577
128	NC_012527	CGATG	2	10	221666	221675	20 %	20 %	40 %	20 %	226357578
129	NC_012527	GGGCA	2	10	221757	221766	20 %	0 %	60 %	20 %	226357578
130	NC_012527	ACAGC	2	10	225180	225189	40 %	0 %	20 %	40 %	226357581
131	NC_012527	CAGGC	2	10	226682	226691	20 %	0 %	40 %	40 %	226357582
132	NC_012527	CAGCC	2	10	228406	228415	20 %	0 %	20 %	60 %	226357585
133	NC_012527	TGGCT	2	10	228574	228583	0 %	40 %	40 %	20 %	226357585
134	NC_012527	CCCGG	2	10	230512	230521	0 %	0 %	40 %	60 %	226357586
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166	NC_012527	CGTGG	2	10	279871	279880	0 %	20 %	60 %	20 %	226357627
167	NC_012527	TGCCC	2	10	280856	280865	0 %	20 %	20 %	60 %	226357629
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175	NC_012527	GAGCG	2	10	288410	288419	20 %	0 %	60 %	20 %	226357636
176	NC_012527	TGCCG	2	10	288664	288673	0 %	20 %	40 %	40 %	226357637
177	NC_012527	GGACT	2	10	299511	299520	20 %	20 %	40 %	20 %	226357647
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187	NC_012527	TCGGC	2	10	315942	315951	0 %	20 %	40 %	40 %	226357658
188	NC_012527	GCACC	2	10	318877	318886	20 %	0 %	20 %	60 %	226357662
189	NC_012527	CTGCT	2	10	321192	321201	0 %	40 %	20 %	40 %	226357664
190	NC_012527	CGGTC	2	10	322769	322778	0 %	20 %	40 %	40 %	226357664
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.