MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	CCGGC	2	10	6011	6020	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_012523	TCGAC	2	10	12070	12079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012523	CAGCG	2	10	37526	37535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012523	TGTGG	2	10	37744	37753	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012523	GAGCG	2	10	37778	37787	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012523	TCCGC	2	10	37965	37974	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_012523	CGACT	2	10	38035	38044	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012523	TCGGA	2	10	46030	46039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012523	CGGCT	2	10	48452	48461	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012523	AGCCG	2	10	48483	48492	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_012523	TTCCG	2	10	50299	50308	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012523	ATCGA	2	10	63252	63261	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012523	TCCCG	2	10	67590	67599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_012523	GCGGG	2	10	69522	69531	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012523	CGGGC	2	10	69542	69551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012523	CCGCC	2	10	69552	69561	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_012523	TCCCC	2	10	69942	69951	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_012523	CGGCG	2	10	70055	70064	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012523	ACCTC	2	10	71091	71100	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_012523	CCCCA	2	10	76079	76088	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_012523	ATGAA	3	15	76120	76134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012523	AGGGC	2	10	78408	78417	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012523	ATGCC	2	10	80020	80029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012523	CGGGA	2	10	96908	96917	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012523	AACCC	2	10	97327	97336	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_012523	CGAAG	2	10	110733	110742	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.