MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	CTTC	2	8	1769	1776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012523	TGCT	2	8	3488	3495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012523	GCCG	2	8	3518	3525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012523	CAGC	2	8	3549	3556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012523	TCGG	2	8	4941	4948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012523	GAGT	2	8	8693	8700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012523	CCTG	2	8	8722	8729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012523	CAAC	2	8	10741	10748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012523	TGAA	2	8	11803	11810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012523	ATGA	2	8	12479	12486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012523	CTGG	2	8	12741	12748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012523	CCTG	2	8	12749	12756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012523	GTCA	2	8	12783	12790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012523	GCGG	2	8	12942	12949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012523	AAGG	2	8	18750	18757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012523	ACCA	2	8	33300	33307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012523	CGGC	2	8	37842	37849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012523	ACCC	2	8	38006	38013	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_012523	AGCG	2	8	39354	39361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012523	GCAC	2	8	40130	40137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012523	CCCT	2	8	40191	40198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_012523	GGCT	2	8	47043	47050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012523	CCAG	2	8	48717	48724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012523	CGCC	2	8	60537	60544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_012523	ATCG	2	8	61481	61488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012523	TCCG	2	8	63494	63501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012523	GATG	2	8	64455	64462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012523	CTGA	2	8	66583	66590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012523	CCGG	2	8	67407	67414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012523	CTGC	2	8	67704	67711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012523	GGGT	2	8	67734	67741	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012523	AGGT	2	8	68410	68417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012523	ACGG	2	8	69263	69270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012523	CCTC	2	8	69284	69291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_012523	CCCG	2	8	69336	69343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_012523	CCGA	2	8	69375	69382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012523	CGGG	2	8	69461	69468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012523	CCCG	2	8	69916	69923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_012523	CTGA	2	8	70036	70043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012523	GTGA	2	8	70212	70219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012523	TCGC	2	8	73385	73392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012523	ACCC	2	8	73514	73521	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_012523	CTGG	2	8	74401	74408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012523	GGGC	2	8	79929	79936	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012523	GCTG	2	8	84106	84113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012523	ATCA	2	8	90758	90765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012523	TCTA	2	8	92555	92562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012523	TCCA	2	8	92601	92608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012523	TTGG	2	8	97081	97088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012523	AAAC	2	8	98082	98089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012523	GGCC	2	8	98132	98139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012523	CCGT	2	8	98317	98324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012523	ATCG	2	8	98360	98367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012523	GCCA	2	8	100817	100824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012523	TCCG	2	8	100871	100878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012523	TGAC	2	8	100957	100964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012523	GTCA	2	8	101009	101016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012523	GGAC	2	8	110573	110580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012523	TCGA	2	8	110627	110634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.