MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	GT	4	8	131	138	0 %	50 %	50 %	0 %	226334773
2	NC_012523	GA	3	6	230	235	50 %	0 %	50 %	0 %	226334773
3	NC_012523	TC	3	6	448	453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012523	CT	3	6	1208	1213	0 %	50 %	0 %	50 %	226334774
5	NC_012523	GT	3	6	1265	1270	0 %	50 %	50 %	0 %	226334774
6	NC_012523	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
7	NC_012523	GC	3	6	1716	1721	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
8	NC_012523	GC	3	6	2007	2012	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
9	NC_012523	CG	3	6	2173	2178	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
10	NC_012523	TC	3	6	3451	3456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012523	CG	3	6	4646	4651	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
12	NC_012523	GC	3	6	4776	4781	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
13	NC_012523	TC	3	6	5811	5816	0 %	50 %	0 %	50 %	226334778
14	NC_012523	GC	3	6	6074	6079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012523	CA	3	6	6349	6354	50 %	0 %	0 %	50 %	226334779
16	NC_012523	GC	3	6	7277	7282	0 %	0 %	50 %	50 %	226334779
17	NC_012523	AC	3	6	8071	8076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012523	GT	3	6	8206	8211	0 %	50 %	50 %	0 %	226334780
19	NC_012523	CG	3	6	8961	8966	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
20	NC_012523	GC	3	6	8967	8972	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
21	NC_012523	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
22	NC_012523	GT	4	8	9829	9836	0 %	50 %	50 %	0 %	226334781
23	NC_012523	CG	3	6	10038	10043	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
24	NC_012523	TG	3	6	10593	10598	0 %	50 %	50 %	0 %	226334781
25	NC_012523	TG	3	6	10821	10826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012523	TC	3	6	11223	11228	0 %	50 %	0 %	50 %	226334782
27	NC_012523	CG	3	6	11859	11864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012523	GA	3	6	12892	12897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012523	GC	3	6	14658	14663	0 %	0 %	50 %	50 %	226334784
30	NC_012523	TC	3	6	14965	14970	0 %	50 %	0 %	50 %	226334784
31	NC_012523	AC	3	6	15967	15972	50 %	0 %	0 %	50 %	226334785
32	NC_012523	CG	3	6	16062	16067	0 %	0 %	50 %	50 %	226334785
33	NC_012523	CG	3	6	16457	16462	0 %	0 %	50 %	50 %	226334785
34	NC_012523	AC	3	6	16772	16777	50 %	0 %	0 %	50 %	226334786
35	NC_012523	CG	3	6	16954	16959	0 %	0 %	50 %	50 %	226334786
36	NC_012523	GC	3	6	17397	17402	0 %	0 %	50 %	50 %	226334786
37	NC_012523	CG	3	6	17644	17649	0 %	0 %	50 %	50 %	226334787
38	NC_012523	GC	3	6	22531	22536	0 %	0 %	50 %	50 %	226334794
39	NC_012523	GC	3	6	24535	24540	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
40	NC_012523	CG	3	6	24929	24934	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
41	NC_012523	GC	3	6	24949	24954	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
42	NC_012523	CG	3	6	25155	25160	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
43	NC_012523	GC	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	226334797
44	NC_012523	GC	3	6	27309	27314	0 %	0 %	50 %	50 %	226334798
45	NC_012523	GA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	50 %	0 %	226334798
46	NC_012523	CT	3	6	30088	30093	0 %	50 %	0 %	50 %	226334800
47	NC_012523	CG	3	6	30571	30576	0 %	0 %	50 %	50 %	226334800
48	NC_012523	AC	3	6	32009	32014	50 %	0 %	0 %	50 %	226334802
49	NC_012523	CG	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	226334802
50	NC_012523	GC	3	6	32565	32570	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
51	NC_012523	CG	3	6	32622	32627	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
52	NC_012523	GC	3	6	33137	33142	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
53	NC_012523	GA	3	6	34600	34605	50 %	0 %	50 %	0 %	226334804
54	NC_012523	CG	4	8	34832	34839	0 %	0 %	50 %	50 %	226334804
55	NC_012523	CG	4	8	35599	35606	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
56	NC_012523	CG	3	6	35664	35669	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
57	NC_012523	CG	3	6	35708	35713	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
58	NC_012523	CG	3	6	35898	35903	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
59	NC_012523	AC	3	6	35956	35961	50 %	0 %	0 %	50 %	226334805
60	NC_012523	CG	3	6	36386	36391	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
61	NC_012523	GT	3	6	37026	37031	0 %	50 %	50 %	0 %	226334805
62	NC_012523	CG	3	6	37881	37886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012523	CA	3	6	37986	37991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012523	CA	3	6	38204	38209	50 %	0 %	0 %	50 %	226334807
65	NC_012523	CG	4	8	38238	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	226334807
66	NC_012523	GC	3	6	38290	38295	0 %	0 %	50 %	50 %	226334807
67	NC_012523	GC	3	6	38685	38690	0 %	0 %	50 %	50 %	226334808
68	NC_012523	CG	4	8	38810	38817	0 %	0 %	50 %	50 %	226334808
69	NC_012523	CA	3	6	38939	38944	50 %	0 %	0 %	50 %	226334808
70	NC_012523	GC	3	6	40230	40235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012523	GC	4	8	41085	41092	0 %	0 %	50 %	50 %	226334810
72	NC_012523	CG	5	10	41383	41392	0 %	0 %	50 %	50 %	226334810
73	NC_012523	TC	4	8	41870	41877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012523	CG	3	6	42843	42848	0 %	0 %	50 %	50 %	226334811
75	NC_012523	GT	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	226334812
76	NC_012523	CG	4	8	43816	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
77	NC_012523	GC	3	6	44198	44203	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
78	NC_012523	CG	3	6	44908	44913	0 %	0 %	50 %	50 %	226334813
79	NC_012523	CG	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	226334815
80	NC_012523	GT	4	8	45962	45969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012523	GC	3	6	46571	46576	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
82	NC_012523	CG	5	10	46636	46645	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
83	NC_012523	CA	3	6	46690	46695	50 %	0 %	0 %	50 %	226334817
84	NC_012523	GC	3	6	46879	46884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012523	GA	3	6	47952	47957	50 %	0 %	50 %	0 %	226334818
86	NC_012523	GC	3	6	48404	48409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012523	CT	3	6	48791	48796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012523	CA	3	6	48820	48825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012523	GC	3	6	50597	50602	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
90	NC_012523	GT	4	8	51131	51138	0 %	50 %	50 %	0 %	226334820
91	NC_012523	CG	3	6	52042	52047	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
92	NC_012523	GC	3	6	54727	54732	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
93	NC_012523	GC	3	6	57293	57298	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
94	NC_012523	CG	3	6	57807	57812	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
95	NC_012523	GC	3	6	58793	58798	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
96	NC_012523	CG	3	6	59844	59849	0 %	0 %	50 %	50 %	226334821
97	NC_012523	GA	4	8	60738	60745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012523	GT	3	6	61124	61129	0 %	50 %	50 %	0 %	226334823
99	NC_012523	GC	3	6	61601	61606	0 %	0 %	50 %	50 %	226334824
100	NC_012523	CG	3	6	61843	61848	0 %	0 %	50 %	50 %	226334825
101	NC_012523	TG	3	6	61939	61944	0 %	50 %	50 %	0 %	226334825
102	NC_012523	GC	3	6	62284	62289	0 %	0 %	50 %	50 %	226334826
103	NC_012523	AG	3	6	62396	62401	50 %	0 %	50 %	0 %	226334826
104	NC_012523	GC	3	6	63533	63538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012523	GC	3	6	64065	64070	0 %	0 %	50 %	50 %	226334830
106	NC_012523	GC	3	6	64178	64183	0 %	0 %	50 %	50 %	226334830
107	NC_012523	TG	3	6	64461	64466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012523	GA	3	6	65099	65104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012523	GC	3	6	65141	65146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012523	GC	4	8	65550	65557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012523	GT	3	6	65608	65613	0 %	50 %	50 %	0 %	226334833
112	NC_012523	AC	3	6	66244	66249	50 %	0 %	0 %	50 %	226334833
113	NC_012523	GA	3	6	66616	66621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012523	CG	3	6	67026	67031	0 %	0 %	50 %	50 %	226334834
115	NC_012523	GC	3	6	67967	67972	0 %	0 %	50 %	50 %	226334835
116	NC_012523	CG	3	6	68672	68677	0 %	0 %	50 %	50 %	226334836
117	NC_012523	GT	3	6	70477	70482	0 %	50 %	50 %	0 %	226334839
118	NC_012523	GC	3	6	71779	71784	0 %	0 %	50 %	50 %	226334840
119	NC_012523	GC	3	6	71800	71805	0 %	0 %	50 %	50 %	226334840
120	NC_012523	CG	3	6	72480	72485	0 %	0 %	50 %	50 %	226334841
121	NC_012523	GC	3	6	73424	73429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012523	GC	3	6	73972	73977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012523	AC	3	6	75707	75712	50 %	0 %	0 %	50 %	226334845
124	NC_012523	CA	3	6	76726	76731	50 %	0 %	0 %	50 %	226334846
125	NC_012523	GC	3	6	76966	76971	0 %	0 %	50 %	50 %	226334846
126	NC_012523	AT	3	6	77149	77154	50 %	50 %	0 %	0 %	226334847
127	NC_012523	TC	3	6	78367	78372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012523	GC	3	6	78796	78801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012523	GC	3	6	78993	78998	0 %	0 %	50 %	50 %	226334848
130	NC_012523	GT	3	6	79014	79019	0 %	50 %	50 %	0 %	226334848
131	NC_012523	AC	3	6	79192	79197	50 %	0 %	0 %	50 %	226334848
132	NC_012523	AC	3	6	79301	79306	50 %	0 %	0 %	50 %	226334848
133	NC_012523	GC	4	8	80896	80903	0 %	0 %	50 %	50 %	226334850
134	NC_012523	CG	4	8	81037	81044	0 %	0 %	50 %	50 %	226334850
135	NC_012523	GA	3	6	81596	81601	50 %	0 %	50 %	0 %	226334850
136	NC_012523	CT	3	6	82858	82863	0 %	50 %	0 %	50 %	226334851
137	NC_012523	AG	3	6	82974	82979	50 %	0 %	50 %	0 %	226334851
138	NC_012523	TG	3	6	83748	83753	0 %	50 %	50 %	0 %	226334852
139	NC_012523	CG	3	6	84039	84044	0 %	0 %	50 %	50 %	226334852
140	NC_012523	AG	3	6	85329	85334	50 %	0 %	50 %	0 %	226334854
141	NC_012523	GC	3	6	85931	85936	0 %	0 %	50 %	50 %	226334854
142	NC_012523	TG	3	6	86569	86574	0 %	50 %	50 %	0 %	226334854
143	NC_012523	CG	3	6	86810	86815	0 %	0 %	50 %	50 %	226334855
144	NC_012523	GC	3	6	89224	89229	0 %	0 %	50 %	50 %	226334857
145	NC_012523	TC	3	6	89482	89487	0 %	50 %	0 %	50 %	226334857
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.