MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodococcus opacus B4

Total Repeats: 7011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012522	TCGCT	2	10	114	123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012522	GTTCG	2	10	2872	2881	0 %	40 %	40 %	20 %	226359419
3	NC_012522	CGACC	2	10	3405	3414	20 %	0 %	20 %	60 %	226359420
4	NC_012522	GGTGG	2	10	3831	3840	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012522	CCCCT	2	10	3944	3953	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_012522	GACGG	2	10	6137	6146	20 %	0 %	60 %	20 %	226359421
7	NC_012522	CGGCG	2	10	7390	7399	0 %	0 %	60 %	40 %	226359422
8	NC_012522	CCGAC	2	10	8007	8016	20 %	0 %	20 %	60 %	226359423
9	NC_012522	TCGAG	2	10	8809	8818	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012522	CGCGG	2	10	8930	8939	0 %	0 %	60 %	40 %	226359424
11	NC_012522	GACCC	3	15	9278	9292	20 %	0 %	20 %	60 %	226359424
12	NC_012522	ACCGA	2	10	9993	10002	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012522	CGGTG	2	10	11539	11548	0 %	20 %	60 %	20 %	226359427
14	NC_012522	GCCGC	2	10	12255	12264	0 %	0 %	40 %	60 %	226359428
15	NC_012522	CTGGC	2	10	13906	13915	0 %	20 %	40 %	40 %	226359431
16	NC_012522	TCCGC	2	10	15545	15554	0 %	20 %	20 %	60 %	226359433
17	NC_012522	GAGAC	2	10	15859	15868	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012522	CGCCC	2	10	16761	16770	0 %	0 %	20 %	80 %	226359436
19	NC_012522	GCTCG	2	10	18968	18977	0 %	20 %	40 %	40 %	226359437
20	NC_012522	GTGTG	2	10	20139	20148	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012522	GCACC	2	10	25217	25226	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_012522	GCCAC	2	10	26516	26525	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_012522	GCGCC	3	15	26567	26581	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012522	GGCGC	2	10	27806	27815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012522	CCCGA	2	10	28620	28629	20 %	0 %	20 %	60 %	226359448
26	NC_012522	GGTCG	2	10	29359	29368	0 %	20 %	60 %	20 %	226359450
27	NC_012522	GTGGA	2	10	29465	29474	20 %	20 %	60 %	0 %	226359450
28	NC_012522	CGTTG	2	10	29512	29521	0 %	40 %	40 %	20 %	226359450
29	NC_012522	TGAGA	2	10	30917	30926	40 %	20 %	40 %	0 %	226359451
30	NC_012522	CATCG	2	10	31665	31674	20 %	20 %	20 %	40 %	226359452
31	NC_012522	GCACC	2	10	31679	31688	20 %	0 %	20 %	60 %	226359452
32	NC_012522	TTTCC	2	10	32576	32585	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012522	ACCCG	2	10	32894	32903	20 %	0 %	20 %	60 %	226359455
34	NC_012522	CCGCG	2	10	34969	34978	0 %	0 %	40 %	60 %	226359456
35	NC_012522	ACCGC	2	10	35295	35304	20 %	0 %	20 %	60 %	226359456
36	NC_012522	ACCGG	2	10	35440	35449	20 %	0 %	40 %	40 %	226359457
37	NC_012522	CGGCC	2	10	35604	35613	0 %	0 %	40 %	60 %	226359457
38	NC_012522	CCGGA	2	10	35832	35841	20 %	0 %	40 %	40 %	226359457
39	NC_012522	GGCCG	2	10	37188	37197	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012522	GGACG	2	10	38583	38592	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012522	CGCAC	2	10	39788	39797	20 %	0 %	20 %	60 %	226359463
42	NC_012522	CTCCC	2	10	40527	40536	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_012522	TTTCT	2	10	41804	41813	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012522	GACGA	2	10	42673	42682	40 %	0 %	40 %	20 %	226359465
45	NC_012522	CTCGG	2	10	43973	43982	0 %	20 %	40 %	40 %	226359467
46	NC_012522	ACTCG	2	10	44361	44370	20 %	20 %	20 %	40 %	226359468
47	NC_012522	GCGCC	2	10	45063	45072	0 %	0 %	40 %	60 %	226359469
48	NC_012522	CGCGG	2	10	45216	45225	0 %	0 %	60 %	40 %	226359470
49	NC_012522	GGCAT	2	10	46753	46762	20 %	20 %	40 %	20 %	226359471
50	NC_012522	TCACT	2	10	47830	47839	20 %	40 %	0 %	40 %	226359472
51	NC_012522	ACTCA	2	10	48613	48622	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012522	TCCGC	2	10	49534	49543	0 %	20 %	20 %	60 %	226359473
53	NC_012522	CGTCT	2	10	49878	49887	0 %	40 %	20 %	40 %	226359473
54	NC_012522	ATCGA	2	10	50198	50207	40 %	20 %	20 %	20 %	226359473
55	NC_012522	GCACC	2	10	50230	50239	20 %	0 %	20 %	60 %	226359473
56	NC_012522	GGAAA	2	10	51661	51670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012522	CTCCG	2	10	51835	51844	0 %	20 %	20 %	60 %	226359475
58	NC_012522	GCAGT	2	10	52244	52253	20 %	20 %	40 %	20 %	226359476
59	NC_012522	GTCGT	2	10	52357	52366	0 %	40 %	40 %	20 %	226359476
60	NC_012522	GCCGA	2	10	53147	53156	20 %	0 %	40 %	40 %	226359477
61	NC_012522	ACCGA	2	10	53791	53800	40 %	0 %	20 %	40 %	226359478
62	NC_012522	GTGCC	2	10	54848	54857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_012522	GATCG	2	10	54886	54895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012522	CAGAC	2	10	55422	55431	40 %	0 %	20 %	40 %	226359481
65	NC_012522	CGATC	2	10	56626	56635	20 %	20 %	20 %	40 %	226359481
66	NC_012522	CGGGC	2	10	56930	56939	0 %	0 %	60 %	40 %	226359481
67	NC_012522	CCGCG	2	10	58239	58248	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_012522	ATCCG	2	10	58885	58894	20 %	20 %	20 %	40 %	226359482
69	NC_012522	CGTGG	2	10	59366	59375	0 %	20 %	60 %	20 %	226359483
70	NC_012522	GCCGT	2	10	59919	59928	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012522	CACCC	2	10	60637	60646	20 %	0 %	0 %	80 %	226359485
72	NC_012522	ACGTC	2	10	61166	61175	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012522	AGCAC	2	10	61300	61309	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012522	CCCCG	2	10	66205	66214	0 %	0 %	20 %	80 %	226359489
75	NC_012522	TCTGC	2	10	66654	66663	0 %	40 %	20 %	40 %	226359489
76	NC_012522	CATGT	2	10	66670	66679	20 %	40 %	20 %	20 %	226359489
77	NC_012522	TCGGG	2	10	66784	66793	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012522	AGGCG	2	10	67205	67214	20 %	0 %	60 %	20 %	226359490
79	NC_012522	CCGGC	2	10	68386	68395	0 %	0 %	40 %	60 %	226359491
80	NC_012522	GCCTC	2	10	68946	68955	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_012522	CCACA	2	10	70360	70369	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_012522	GCCGA	2	10	71079	71088	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012522	GCCGC	2	10	71334	71343	0 %	0 %	40 %	60 %	226359495
84	NC_012522	CCTCC	2	10	74262	74271	0 %	20 %	0 %	80 %	226359498
85	NC_012522	CAGAC	2	10	75835	75844	40 %	0 %	20 %	40 %	226359501
86	NC_012522	GGCCG	2	10	76028	76037	0 %	0 %	60 %	40 %	226359502
87	NC_012522	CTGCG	2	10	77478	77487	0 %	20 %	40 %	40 %	226359504
88	NC_012522	AGCGC	2	10	78166	78175	20 %	0 %	40 %	40 %	226359505
89	NC_012522	CTCAC	2	10	79023	79032	20 %	20 %	0 %	60 %	226359506
90	NC_012522	GCCGC	2	10	79435	79444	0 %	0 %	40 %	60 %	226359506
91	NC_012522	CGCGG	2	10	79670	79679	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012522	CGTTC	2	10	80206	80215	0 %	40 %	20 %	40 %	226359507
93	NC_012522	CCGAA	2	10	80719	80728	40 %	0 %	20 %	40 %	226359508
94	NC_012522	CGCCT	2	10	81151	81160	0 %	20 %	20 %	60 %	226359509
95	NC_012522	CGGCG	2	10	81550	81559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012522	CGAAA	2	10	81580	81589	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012522	GAGCA	2	10	83739	83748	40 %	0 %	40 %	20 %	226359514
98	NC_012522	GCACG	2	10	85736	85745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012522	TCGAG	3	15	88183	88197	20 %	20 %	40 %	20 %	226359517
100	NC_012522	GCCGA	2	10	88286	88295	20 %	0 %	40 %	40 %	226359518
101	NC_012522	CGAGA	2	10	89810	89819	40 %	0 %	40 %	20 %	226359520
102	NC_012522	TCGAC	2	10	89937	89946	20 %	20 %	20 %	40 %	226359520
103	NC_012522	CCGAT	2	10	91583	91592	20 %	20 %	20 %	40 %	226359521
104	NC_012522	ACCGA	2	10	92419	92428	40 %	0 %	20 %	40 %	226359522
105	NC_012522	TTCGT	2	10	93735	93744	0 %	60 %	20 %	20 %	226359523
106	NC_012522	GCACC	2	10	96165	96174	20 %	0 %	20 %	60 %	226359526
107	NC_012522	ACCGC	2	10	97069	97078	20 %	0 %	20 %	60 %	226359527
108	NC_012522	CTGAA	2	10	100546	100555	40 %	20 %	20 %	20 %	226359528
109	NC_012522	TCATG	2	10	100837	100846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012522	CGCGG	2	10	101857	101866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012522	CGTGC	2	10	102015	102024	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_012522	GTCGC	2	10	102978	102987	0 %	20 %	40 %	40 %	226359530
113	NC_012522	TCGGC	2	10	107138	107147	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_012522	CGCAA	2	10	107620	107629	40 %	0 %	20 %	40 %	226359534
115	NC_012522	GATCG	2	10	108127	108136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012522	GCCCG	2	10	108863	108872	0 %	0 %	40 %	60 %	226359535
117	NC_012522	TCGGT	2	10	109617	109626	0 %	40 %	40 %	20 %	226359536
118	NC_012522	GGATC	2	10	110278	110287	20 %	20 %	40 %	20 %	226359536
119	NC_012522	TCGCG	2	10	110305	110314	0 %	20 %	40 %	40 %	226359536
120	NC_012522	CGTGC	2	10	110670	110679	0 %	20 %	40 %	40 %	226359536
121	NC_012522	CTTCG	2	10	111421	111430	0 %	40 %	20 %	40 %	226359536
122	NC_012522	CTTCT	2	10	113026	113035	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012522	CCGTC	2	10	115198	115207	0 %	20 %	20 %	60 %	226359541
124	NC_012522	CACCG	2	10	116762	116771	20 %	0 %	20 %	60 %	226359544
125	NC_012522	CGGCT	2	10	117424	117433	0 %	20 %	40 %	40 %	226359545
126	NC_012522	GTCGG	2	10	120377	120386	0 %	20 %	60 %	20 %	226359546
127	NC_012522	TCACC	2	10	120874	120883	20 %	20 %	0 %	60 %	226359546
128	NC_012522	CCCGG	2	10	121590	121599	0 %	0 %	40 %	60 %	226359546
129	NC_012522	TCGCC	2	10	121603	121612	0 %	20 %	20 %	60 %	226359546
130	NC_012522	ACACC	2	10	122108	122117	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_012522	TGCGG	2	10	122217	122226	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012522	GGAAC	2	10	122438	122447	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012522	CGCGC	2	10	122623	122632	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_012522	GGCCG	2	10	123190	123199	0 %	0 %	60 %	40 %	226359547
135	NC_012522	CGGCG	2	10	123300	123309	0 %	0 %	60 %	40 %	226359547
136	NC_012522	CGGCC	2	10	125329	125338	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_012522	GACCT	2	10	125403	125412	20 %	20 %	20 %	40 %	226359549
138	NC_012522	GGCGT	2	10	129357	129366	0 %	20 %	60 %	20 %	226359556
139	NC_012522	GCGGT	2	10	129713	129722	0 %	20 %	60 %	20 %	226359557
140	NC_012522	GCGGT	2	10	129741	129750	0 %	20 %	60 %	20 %	226359557
141	NC_012522	CGCCC	2	10	133581	133590	0 %	0 %	20 %	80 %	226359563
142	NC_012522	GATCC	2	10	133794	133803	20 %	20 %	20 %	40 %	226359563
143	NC_012522	CCGGG	2	10	134280	134289	0 %	0 %	60 %	40 %	226359564
144	NC_012522	CACGT	2	10	135531	135540	20 %	20 %	20 %	40 %	226359566
145	NC_012522	GGCCA	2	10	138679	138688	20 %	0 %	40 %	40 %	226359569
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147	NC_012522	GCACC	2	10	140444	140453	20 %	0 %	20 %	60 %	226359571
148	NC_012522	CGGTG	2	10	140964	140973	0 %	20 %	60 %	20 %	226359572
149	NC_012522	GCCAG	2	10	141979	141988	20 %	0 %	40 %	40 %	226359573
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151	NC_012522	TGACG	2	10	143850	143859	20 %	20 %	40 %	20 %	226359577
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154	NC_012522	CGCGG	2	10	145805	145814	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
155	NC_012522	GGTGG	2	10	146983	146992	0 %	20 %	80 %	0 %	226359582
156	NC_012522	GTGTG	2	10	147313	147322	0 %	40 %	60 %	0 %	226359582
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158	NC_012522	TCACG	2	10	147871	147880	20 %	20 %	20 %	40 %	226359582
159	NC_012522	CCGGG	2	10	148230	148239	0 %	0 %	60 %	40 %	226359583
160	NC_012522	CGGGC	2	10	148942	148951	0 %	0 %	60 %	40 %	226359584
161	NC_012522	CGCAC	2	10	150154	150163	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
162	NC_012522	GCCGT	2	10	152500	152509	0 %	20 %	40 %	40 %	226359587
163	NC_012522	TGGGC	2	10	153288	153297	0 %	20 %	60 %	20 %	226359587
164	NC_012522	TGACG	2	10	154392	154401	20 %	20 %	40 %	20 %	226359589
165	NC_012522	ATCGC	2	10	154621	154630	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
166	NC_012522	CCGGC	2	10	154694	154703	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167	NC_012522	CCGAA	2	10	155391	155400	40 %	0 %	20 %	40 %	226359590
168	NC_012522	GCCGG	2	10	156082	156091	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
169	NC_012522	CCGCA	2	10	158515	158524	20 %	0 %	20 %	60 %	226359596
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171	NC_012522	ACCGA	2	10	160352	160361	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_012522	GCACA	2	10	160966	160975	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_012522	ACCCG	2	10	161531	161540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_012522	CAGAC	2	10	161824	161833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
175	NC_012522	TCGCG	2	10	162174	162183	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
176	NC_012522	CGGGC	2	10	164321	164330	0 %	0 %	60 %	40 %	226359599
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179	NC_012522	CAGGG	2	10	165899	165908	20 %	0 %	60 %	20 %	226359602
180	NC_012522	GAGCC	2	10	166274	166283	20 %	0 %	40 %	40 %	226359603
181	NC_012522	TCGGA	2	10	168840	168849	20 %	20 %	40 %	20 %	226359607
182	NC_012522	TCGAC	2	10	169684	169693	20 %	20 %	20 %	40 %	226359607
183	NC_012522	TCAGC	2	10	169753	169762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_012522	GCGAT	2	10	169817	169826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
185	NC_012522	CCCGA	2	10	169975	169984	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
186	NC_012522	TTCGA	2	10	170159	170168	20 %	40 %	20 %	20 %	226359608
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202	NC_012522	GCACG	2	10	186036	186045	20 %	0 %	40 %	40 %	226359628
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252	NC_012522	CGGTG	2	10	247142	247151	0 %	20 %	60 %	20 %	226359672
253	NC_012522	CAAAC	2	10	252205	252214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_012522	GCGTC	2	10	252392	252401	0 %	20 %	40 %	40 %	226359675
255	NC_012522	GAGGT	2	10	253795	253804	20 %	20 %	60 %	0 %	226359675
256	NC_012522	GAACA	2	10	254077	254086	60 %	0 %	20 %	20 %	226359675
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262	NC_012522	CGGGT	2	10	264817	264826	0 %	20 %	60 %	20 %	226359675
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270	NC_012522	ATCCG	2	10	273722	273731	20 %	20 %	20 %	40 %	226359675
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272	NC_012522	CGACG	2	10	274731	274740	20 %	0 %	40 %	40 %	226359675
273	NC_012522	GAACA	2	10	276376	276385	60 %	0 %	20 %	20 %	226359675
274	NC_012522	TGCGT	2	10	277183	277192	0 %	40 %	40 %	20 %	226359675
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276	NC_012522	CGGTC	2	10	281087	281096	0 %	20 %	40 %	40 %	226359675
277	NC_012522	CGGTC	2	10	281270	281279	0 %	20 %	40 %	40 %	226359675
278	NC_012522	TCACC	2	10	281738	281747	20 %	20 %	0 %	60 %	226359675
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280	NC_012522	GCCGA	2	10	282959	282968	20 %	0 %	40 %	40 %	226359677
281	NC_012522	CGACG	2	10	283628	283637	20 %	0 %	40 %	40 %	226359677
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287	NC_012522	GAGTG	2	10	290952	290961	20 %	20 %	60 %	0 %	226359685
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290	NC_012522	TCGTG	2	10	293223	293232	0 %	40 %	40 %	20 %	226359687
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294	NC_012522	CGGGC	2	10	299030	299039	0 %	0 %	60 %	40 %	226359693
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399	NC_012522	GTGCG	2	10	397802	397811	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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