MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pROB02

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012521	TCGCT	2	10	44	53	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012521	TCGCT	2	10	114	123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012521	GCCCG	2	10	223	232	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_012521	GCTCC	2	10	916	925	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_012521	GCATC	2	10	1435	1444	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012521	AATAA	2	10	5157	5166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012521	AGACC	2	10	5595	5604	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012521	TAGGT	2	10	6263	6272	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012521	ACCGG	2	10	9582	9591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012521	GCGCC	2	10	22088	22097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012521	GGCGA	2	10	23355	23364	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012521	CGCGG	2	10	27509	27518	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012521	CGGTG	2	10	35474	35483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012521	GCCGC	3	15	36306	36320	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_012521	CTAGC	2	10	62403	62412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012521	GCCTG	2	10	62501	62510	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012521	GGAAG	2	10	62673	62682	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012521	ACGGA	2	10	63345	63354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012521	ATCCA	2	10	67670	67679	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012521	CGGGT	2	10	73683	73692	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012521	TGCGC	2	10	76740	76749	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012521	TCAGA	2	10	77848	77857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012521	CCATC	2	10	89917	89926	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012521	GCCGG	2	10	106752	106761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012521	CGGCT	2	10	107390	107399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012521	ACCTC	2	10	111037	111046	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012521	CGGTG	2	10	113790	113799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012521	GTGGG	2	10	114814	114823	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012521	GACGC	2	10	128528	128537	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012521	ACCAC	2	10	152268	152277	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_012521	CGTGG	2	10	152780	152789	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012521	AGGTC	2	10	153887	153896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012521	CCGAT	2	10	156804	156813	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_012521	GAAAG	2	10	170126	170135	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012521	TCCGC	2	10	173788	173797	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_012521	CTGCT	2	10	173837	173846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012521	CGAAC	2	10	175016	175025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012521	CCACA	2	10	184444	184453	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_012521	GGCCG	2	10	187334	187343	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012521	TCGGT	2	10	195341	195350	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012521	TCGGC	2	10	200507	200516	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012521	GCTCG	2	10	203939	203948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012521	CTCGG	2	10	207996	208005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012521	TCAAG	2	10	235199	235208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012521	GGGGT	2	10	236375	236384	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012521	TCGGC	2	10	243710	243719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_012521	TGGTG	2	10	244448	244457	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012521	AGCGA	2	10	244875	244884	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.