MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pROB02

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012521	CCCA	2	8	608	615	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_012521	TCGC	2	8	671	678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012521	CACC	2	8	770	777	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_012521	GCCC	2	8	806	813	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_012521	CTAC	2	8	1335	1342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012521	GAAG	2	8	1495	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012521	TCCA	2	8	1636	1643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012521	GGCC	2	8	1688	1695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012521	TTGA	2	8	4989	4996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012521	CAGG	2	8	5144	5151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012521	CTCA	2	8	5834	5841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012521	AAAT	2	8	6244	6251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012521	GCAC	2	8	11412	11419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012521	CAAT	2	8	21862	21869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012521	GTGC	2	8	22110	22117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012521	CCTG	2	8	22364	22371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012521	ACGT	2	8	22412	22419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012521	GGTC	2	8	23303	23310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012521	CGGT	2	8	26088	26095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012521	GCCG	2	8	26427	26434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012521	CGCA	2	8	27287	27294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012521	CGGG	2	8	27333	27340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012521	TCGG	2	8	28461	28468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012521	CTGG	2	8	30568	30575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012521	CGCT	2	8	36088	36095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012521	CGGT	2	8	36170	36177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012521	ATCG	2	8	36235	36242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012521	GTCT	2	8	46497	46504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012521	GATG	2	8	46771	46778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012521	AGGT	2	8	46806	46813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012521	GCAC	2	8	48772	48779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012521	GGGT	2	8	49602	49609	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012521	GACT	2	8	53772	53779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012521	GGGT	2	8	56789	56796	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012521	ACCG	2	8	60603	60610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012521	CCGG	2	8	60668	60675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012521	CGCC	2	8	62297	62304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_012521	CTGG	2	8	62552	62559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012521	TTGC	2	8	62946	62953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012521	TGCT	2	8	62988	62995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012521	ATCG	2	8	63010	63017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012521	AGCT	2	8	63249	63256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012521	GCTA	2	8	64528	64535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012521	GGAA	2	8	64654	64661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012521	GTCA	2	8	66725	66732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012521	ACCA	2	8	76717	76724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012521	CGGC	2	8	77178	77185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012521	CGAC	2	8	77581	77588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012521	TCAC	2	8	77731	77738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012521	GCCG	2	8	78182	78189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012521	AGCG	2	8	87409	87416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012521	CGGT	2	8	89578	89585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012521	GCCC	2	8	89859	89866	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_012521	CCCG	2	8	89975	89982	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_012521	TGGA	2	8	90008	90015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012521	ACGC	2	8	90075	90082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012521	CGGC	2	8	99047	99054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012521	GGCG	2	8	106901	106908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012521	GCGG	2	8	107019	107026	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012521	GGTG	2	8	107155	107162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012521	GGCC	2	8	107225	107232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012521	CCGT	2	8	107662	107669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012521	CCGC	2	8	111057	111064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_012521	GGGA	2	8	111220	111227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012521	TGTA	2	8	111365	111372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012521	CTAC	2	8	111492	111499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012521	GGAG	2	8	111500	111507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012521	AATC	2	8	111643	111650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012521	TGTC	2	8	113778	113785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012521	AGCA	2	8	114833	114840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012521	GACT	2	8	116418	116425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012521	CGAC	2	8	116502	116509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012521	CTGC	2	8	121505	121512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012521	GGGC	2	8	128575	128582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012521	CCTT	2	8	130858	130865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012521	ACTT	2	8	131992	131999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012521	CGGT	2	8	137479	137486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012521	CACG	2	8	137539	137546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012521	ATAA	2	8	137614	137621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012521	CGAC	2	8	138813	138820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012521	CACC	2	8	139007	139014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_012521	CGGC	2	8	140096	140103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012521	ATTG	2	8	140381	140388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012521	AGGC	2	8	143882	143889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012521	CGTG	2	8	144098	144105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012521	CTAC	2	8	144154	144161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012521	GTTG	2	8	144322	144329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012521	TCGA	2	8	148673	148680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012521	GCCA	2	8	148813	148820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012521	GGAC	2	8	148860	148867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012521	GTGG	2	8	153853	153860	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012521	ATGA	2	8	154113	154120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012521	ACGG	2	8	154398	154405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012521	CAAC	2	8	165512	165519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012521	AAGG	2	8	165717	165724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012521	GGAA	2	8	168016	168023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012521	CTGC	2	8	182850	182857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012521	GCAC	2	8	184558	184565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012521	CCGA	2	8	186060	186067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012521	CCGC	2	8	186088	186095	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_012521	ACCC	2	8	186145	186152	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_012521	TCGG	2	8	187025	187032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012521	GGCG	2	8	189302	189309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012521	GGCT	2	8	189636	189643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012521	GACT	2	8	189751	189758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012521	TCGG	2	8	189843	189850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012521	GATC	2	8	194794	194801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012521	TGCC	2	8	194876	194883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012521	GCTG	2	8	194898	194905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012521	TCCT	2	8	200477	200484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012521	GCCG	2	8	200544	200551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012521	CTGA	2	8	200570	200577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012521	CTCG	2	8	201822	201829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012521	ATGA	2	8	203757	203764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012521	GCCG	2	8	203799	203806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012521	CGCC	2	8	205155	205162	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_012521	GGTT	2	8	205261	205268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012521	TGGC	2	8	205624	205631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012521	GGCA	2	8	207885	207892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012521	TGCT	2	8	207921	207928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012521	TGCG	2	8	209636	209643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012521	ACGA	2	8	209736	209743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012521	CCGC	2	8	209795	209802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_012521	CCGT	2	8	209899	209906	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012521	GTCA	2	8	210568	210575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012521	GGGC	2	8	213761	213768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012521	GCGA	2	8	215214	215221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012521	CCGC	2	8	219087	219094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_012521	CTGG	2	8	220041	220048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012521	GTCG	2	8	229150	229157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012521	CGGC	2	8	230264	230271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012521	TCCG	2	8	232892	232899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012521	CGTG	2	8	234555	234562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012521	GTGA	2	8	235277	235284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012521	ACAG	2	8	236315	236322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012521	CGTG	2	8	236407	236414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012521	GGGC	2	8	236507	236514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012521	TTCC	2	8	238724	238731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012521	GGCC	2	8	238742	238749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012521	GTGA	2	8	239192	239199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012521	TCTA	2	8	240054	240061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012521	CAGC	2	8	243359	243366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012521	GCGG	2	8	243512	243519	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012521	GAGG	2	8	243911	243918	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012521	GCGG	2	8	244406	244413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012521	TCGA	2	8	244886	244893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.