MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pROB01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012520	TCCGGG	2	12	34303	34314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012520	TCAGGA	2	12	35488	35499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012520	CTGTGG	2	12	54434	54445	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012520	TGGCCG	2	12	65868	65879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012520	CAAGAA	2	12	75117	75128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012520	GTGATT	2	12	87940	87951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012520	TCGCGC	2	12	110360	110371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012520	CGTCGA	2	12	130099	130110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012520	AACACG	2	12	132351	132362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012520	CTGGTC	2	12	137316	137327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012520	CGTCGA	2	12	156894	156905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012520	GGGCTG	2	12	186032	186043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012520	CGGTGT	2	12	187787	187798	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012520	TACGCC	2	12	188240	188251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012520	GGACTC	3	18	188278	188295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012520	TCGATG	2	12	190410	190421	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012520	TCTCCG	2	12	206759	206770	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012520	GTCGAG	2	12	210836	210847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012520	AGCTGG	2	12	220867	220878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012520	CGGGTA	2	12	232536	232547	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012520	GAATGG	2	12	239627	239638	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012520	CCACCC	2	12	257956	257967	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_012520	GGTGCG	2	12	273043	273054	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012520	CTCGGC	2	12	273376	273387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012520	GGGGGC	2	12	320992	321003	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012520	CAGCGG	2	12	326517	326528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012520	TGTGGT	2	12	340836	340847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012520	TGGTCG	2	12	351677	351688	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012520	GGGAGC	2	12	366156	366167	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012520	GCACGC	2	12	391588	391599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012520	GCCCGC	2	12	409561	409572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_012520	TGGCGA	2	12	410575	410586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012520	GATCAC	2	12	412807	412818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012520	ACCGGT	2	12	450449	450460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012520	CGGTCG	2	12	468732	468743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012520	CGCGAC	2	12	468874	468885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012520	TGCTCG	2	12	479030	479041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012520	TCGACT	2	12	508387	508398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012520	GCCTGG	2	12	520872	520883	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012520	GTGGGG	2	12	557898	557909	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.