MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brevibacillus brevis NBRC 100599

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012491	TGTTTT	2	12	162	173	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012491	CATCTT	2	12	8375	8386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012491	TCCCTC	2	12	8744	8755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012491	GGTTTG	2	12	19936	19947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012491	ATTCTA	2	12	72696	72707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012491	TGTTTA	2	12	73026	73037	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012491	AATAAA	2	12	81705	81716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012491	CCTTTT	2	12	104850	104861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012491	ACAAAA	2	12	171783	171794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012491	GTTCCT	2	12	185876	185887	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012491	AGTCAA	2	12	199161	199172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012491	ATTTTT	2	12	221394	221405	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012491	TTATTT	2	12	283251	283262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012491	AGAGGA	2	12	305331	305342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012491	TAGAAG	2	12	323481	323492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012491	CTGCGG	2	12	332480	332491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012491	CGGGGA	2	12	376779	376790	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012491	TACATC	2	12	377259	377270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012491	AATCAC	2	12	384078	384089	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012491	AGAAAA	2	12	451768	451779	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012491	GAAAAG	2	12	457683	457694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012491	ATGAAA	2	12	575172	575183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012491	CGGATT	2	12	613811	613822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012491	GGAGGG	3	18	681333	681350	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012491	GGTGGG	3	18	681351	681368	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012491	GTACAA	2	12	707296	707307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012491	AATAGC	2	12	748857	748868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012491	CGAAAA	2	12	748916	748927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012491	TGAAAT	2	12	755353	755364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012491	CAAGAA	2	12	769145	769156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012491	TATAGT	2	12	769265	769276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012491	AAAAGA	2	12	790576	790587	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012491	CTTTTT	2	12	800697	800708	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012491	GATAAT	2	12	828567	828578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012491	GATAAT	2	12	834521	834532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012491	CAAGCA	2	12	837731	837742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012491	TAAAAA	2	12	849852	849863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012491	ATTTCG	2	12	938077	938088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012491	TGAAAA	2	12	950913	950924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012491	GGAATC	2	12	974696	974707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012491	ATGAAC	2	12	980825	980836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012491	GGTAAT	2	12	995663	995674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012491	CTTTCA	2	12	1018975	1018986	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012491	AAAGCA	2	12	1058621	1058632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012491	GAATGA	2	12	1058971	1058982	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012491	GAAGAC	2	12	1166861	1166872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012491	CGGCTT	2	12	1201880	1201891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012491	ACTATG	2	12	1202412	1202423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012491	AGGAAG	2	12	1203796	1203807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012491	TCACGA	2	12	1319258	1319269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012491	TCCTTT	2	12	1319310	1319321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012491	GTTTTT	2	12	1347481	1347492	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012491	AGAAAG	2	12	1393937	1393948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012491	GCGCTG	2	12	1420433	1420444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012491	TAATTG	2	12	1447849	1447860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012491	CGTTAC	2	12	1509051	1509062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012491	AAGCTG	2	12	1522311	1522322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012491	GCACGG	2	12	1532982	1532993	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012491	CGATTT	2	12	1663417	1663428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012491	TTTCTA	2	12	1666565	1666576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012491	GAAAAG	2	12	1679425	1679436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012491	TTTTTC	2	12	1695430	1695441	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012491	GAGAGG	2	12	1729551	1729562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012491	CTCCCT	2	12	1740194	1740205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_012491	TCTTCC	2	12	1756640	1756651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012491	ATATCC	2	12	1757538	1757549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012491	CCTAGA	2	12	1777617	1777628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012491	TTTTGC	2	12	1784803	1784814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012491	AGGTGG	2	12	1806193	1806204	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012491	CAAAAA	2	12	1978377	1978388	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012491	AGAAAA	2	12	2014331	2014342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012491	GTTCAG	2	12	2019285	2019296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012491	TGAAGC	2	12	2019734	2019745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012491	CTCAAT	2	12	2028679	2028690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012491	CGGCTT	2	12	2033603	2033614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012491	TTTTCC	2	12	2034829	2034840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012491	TGCATT	2	12	2041314	2041325	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012491	TTCTCT	2	12	2041358	2041369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012491	GAATAG	2	12	2054009	2054020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012491	AGGGAA	2	12	2090707	2090718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012491	AAAGTC	2	12	2119421	2119432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012491	TGACTT	2	12	2119442	2119453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012491	AGAAAA	2	12	2128505	2128516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012491	CGCATA	2	12	2145388	2145399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012491	GTGTTT	2	12	2177455	2177466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012491	GATAGA	2	12	2183765	2183776	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012491	AGAATC	2	12	2267340	2267351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012491	TTTAGT	2	12	2282964	2282975	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012491	AAGTGC	2	12	2282994	2283005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012491	TGATTA	2	12	2313566	2313577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012491	TTTACG	2	12	2315500	2315511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012491	TGATAA	2	12	2318605	2318616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012491	TAGAGA	2	12	2325844	2325855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012491	TTTTCA	2	12	2354691	2354702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012491	CCTATT	2	12	2382558	2382569	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012491	TGGTCG	2	12	2394746	2394757	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012491	TATCGT	2	12	2397103	2397114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012491	CCCTGT	2	12	2406637	2406648	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012491	GTAGGT	2	12	2431288	2431299	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012491	ATATTC	2	12	2448183	2448194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012491	TTTCTT	2	12	2462301	2462312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012491	GGAAGG	2	12	2478836	2478847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012491	TGCTGT	2	12	2513440	2513451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012491	TTATTT	2	12	2619283	2619294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012491	AGATGA	2	12	2621585	2621596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012491	CTTGTT	2	12	2666306	2666317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012491	GACGTA	2	12	2688021	2688032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012491	GAGGAA	2	12	2772593	2772604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012491	CCCCAA	2	12	2812792	2812803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012491	CAAGCA	2	12	2841412	2841423	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012491	TATGCA	2	12	2845666	2845677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012491	CAAAGA	2	12	2916618	2916629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012491	AGAAAA	2	12	2940440	2940451	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012491	CAAAAA	2	12	3001116	3001127	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012491	AATTTT	2	12	3013246	3013257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012491	AGAACC	2	12	3171732	3171743	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012491	AAATTT	2	12	3175459	3175470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012491	TTCCTG	2	12	3189414	3189425	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012491	TTTTTG	2	12	3194520	3194531	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012491	AACTGA	2	12	3208144	3208155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012491	GAAAAA	2	12	3215508	3215519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012491	TTGTAT	2	12	3228272	3228283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012491	CAAACC	2	12	3245146	3245157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012491	AATCCG	2	12	3258761	3258772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012491	TCTTTT	2	12	3351171	3351182	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012491	TTTATC	2	12	3404620	3404631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012491	ATATTA	2	12	3438766	3438777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012491	GTTATC	2	12	3456131	3456142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012491	TTTATT	2	12	3495493	3495504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012491	CCTTTC	2	12	3531580	3531591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012491	GGAATT	2	12	3539235	3539246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012491	CTTCTA	2	12	3539574	3539585	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012491	TTTTGC	2	12	3543277	3543288	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_012491	AGAGTC	2	12	3550369	3550380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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137	NC_012491	CCTTTC	2	12	3708947	3708958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012491	GATTGA	2	12	3749726	3749737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_012491	GATATT	2	12	4314457	4314468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_012491	ATTCGA	2	12	4350162	4350173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.