MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 1190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012488	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222644
3	NC_012488	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222645
4	NC_012488	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222645
5	NC_012488	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222645
6	NC_012488	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222646
7	NC_012488	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222647
8	NC_012488	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222650
9	NC_012488	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222650
10	NC_012488	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	226222652
11	NC_012488	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222652
12	NC_012488	ATTTTC	2	12	21959	21970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226222655
13	NC_012488	CTTCAT	2	12	22975	22986	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	226222657
14	NC_012488	TTTTGG	2	12	23339	23350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222657
15	NC_012488	ATTGAA	2	12	26988	26999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222660
16	NC_012488	CCAAAA	2	12	37138	37149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222672
17	NC_012488	AATTAT	2	12	37752	37763	50 %	50 %	0 %	0 %	226222673
18	NC_012488	TCACCA	2	12	38899	38910	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	226222675
19	NC_012488	CGATTA	2	12	44329	44340	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222679
20	NC_012488	TTATGT	2	12	48818	48829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222682
21	NC_012488	AAAGAT	2	12	52470	52481	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222685
22	NC_012488	TGAAAT	2	12	53307	53318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226222686
23	NC_012488	TGGCGG	2	12	56440	56451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226222690
24	NC_012488	TCAAAA	2	12	56560	56571	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222690
25	NC_012488	AAAAAT	2	12	59007	59018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222695
26	NC_012488	GCAGAA	2	12	62931	62942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226222697
27	NC_012488	AGGTAA	2	12	63022	63033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222698
28	NC_012488	TGATTG	2	12	64410	64421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226222699
29	NC_012488	TGATTT	2	12	69741	69752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222702
30	NC_012488	TTTTGC	2	12	70346	70357	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222703
31	NC_012488	AAAATA	2	12	79378	79389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222712
32	NC_012488	CTTTTT	2	12	87538	87549	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222721
33	NC_012488	ATCACT	2	12	90598	90609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222724
34	NC_012488	GATATT	2	12	90657	90668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222724
35	NC_012488	CAGATT	2	12	94174	94185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222724
36	NC_012488	AACTAT	2	12	96950	96961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222725
37	NC_012488	AACCAG	2	12	102188	102199	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222730
38	NC_012488	TATTAG	2	12	106481	106492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222735
39	NC_012488	TAGCAG	2	12	106544	106555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226222735
40	NC_012488	TTATTT	2	12	110007	110018	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222739
41	NC_012488	ATTACA	2	12	114201	114212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222744
42	NC_012488	TAAAAT	2	12	117925	117936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222747
43	NC_012488	CAAAAT	2	12	118066	118077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222747
44	NC_012488	CAAGCG	2	12	119067	119078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222747
45	NC_012488	GTTTTA	2	12	124833	124844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222755
46	NC_012488	TGATTT	2	12	126849	126860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226222759
47	NC_012488	AAGTAA	2	12	130820	130831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222762
48	NC_012488	CCGTTA	2	12	134327	134338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222769
49	NC_012488	CAGGTT	2	12	141652	141663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012488	CAACTG	2	12	144074	144085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226222778
51	NC_012488	TCTGAA	2	12	147056	147067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222783
52	NC_012488	GAATAA	2	12	148871	148882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222785
53	NC_012488	GTTGCA	2	12	153130	153141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222789
54	NC_012488	GATTGC	2	12	153192	153203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222789
55	NC_012488	AGGCGG	2	12	158840	158851	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	226222793
56	NC_012488	CGTAAC	2	12	161690	161701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012488	AGTACC	2	12	161735	161746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012488	GTTTTC	2	12	162729	162740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222794
59	NC_012488	GTTGAT	2	12	164345	164356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226222796
60	NC_012488	GTAAAA	2	12	164708	164719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222796
61	NC_012488	TTTTAC	2	12	166752	166763	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226222800
62	NC_012488	TTTTTA	2	12	167789	167800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222802
63	NC_012488	GCATTA	2	12	168019	168030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222802
64	NC_012488	AAAGTA	2	12	169001	169012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222803
65	NC_012488	ACACTT	2	12	169918	169929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012488	TTGCAC	2	12	171895	171906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222805
67	NC_012488	AGAAGT	2	12	174043	174054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226222806
68	NC_012488	CAATCC	2	12	175959	175970	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	226222808
69	NC_012488	AAAGAT	2	12	177970	177981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222810
70	NC_012488	TGAAGT	2	12	182215	182226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222811
71	NC_012488	CATTGA	2	12	190336	190347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222818
72	NC_012488	TGCAGC	2	12	190991	191002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226222819
73	NC_012488	TAAAAA	2	12	193229	193240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222821
74	NC_012488	AATAAA	2	12	196234	196245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012488	AAAGCA	2	12	206443	206454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222833
76	NC_012488	TTCTTT	2	12	211142	211153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222839
77	NC_012488	GAAAAA	2	12	213231	213242	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222841
78	NC_012488	GAAAAA	2	12	214455	214466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222843
79	NC_012488	GCAAGT	2	12	220282	220293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226222846
80	NC_012488	GAAAAC	2	12	223152	223163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012488	TGTCGG	2	12	224201	224212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226222849
82	NC_012488	AAAAAC	2	12	225698	225709	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	226222850
83	NC_012488	GCAGAA	2	12	227242	227253	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	226222851
84	NC_012488	TAAAAT	2	12	230556	230567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222855
85	NC_012488	CCAGAA	2	12	231769	231780	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	226222856
86	NC_012488	ATTCAA	2	12	234057	234068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012488	AAGGAA	2	12	235628	235639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012488	TAGGCG	2	12	237281	237292	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012488	ATTCAA	2	12	240076	240087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012488	AAGGAA	2	12	241647	241658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012488	TAGGCG	2	12	243300	243311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012488	AGTCAA	2	12	245114	245125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012488	AGTAAA	2	12	252800	252811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222864
94	NC_012488	GTACGT	2	12	253606	253617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222866
95	NC_012488	TTATAT	2	12	259899	259910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012488	ACAGTA	2	12	260228	260239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222873
97	NC_012488	AAAACA	2	12	260603	260614	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	226222874
98	NC_012488	GCATGG	2	12	260784	260795	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226222874
99	NC_012488	CTGTAG	2	12	263728	263739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226222879
100	NC_012488	GACAAT	2	12	265240	265251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222881
101	NC_012488	GTGAGC	2	12	265695	265706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226222881
102	NC_012488	ATTGAT	2	12	265889	265900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	226222881
103	NC_012488	TAAAAA	2	12	266959	266970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	226222882
104	NC_012488	TGAATC	2	12	267744	267755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222883
105	NC_012488	GCTACT	2	12	269436	269447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226222884
106	NC_012488	TTCTGA	2	12	272510	272521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226222886
107	NC_012488	AAGAAA	2	12	275726	275737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226222889
108	NC_012488	TTCGTG	2	12	281482	281493	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	226222890
109	NC_012488	TAACAA	2	12	284789	284800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	226222894
110	NC_012488	TTTAAC	2	12	285862	285873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226222895
111	NC_012488	GTTGAG	2	12	287716	287727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	226222896
112	NC_012488	ATTTTT	2	12	287989	288000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226222896
113	NC_012488	TTTATA	2	12	288533	288544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012488	CCAAAT	2	12	290522	290533	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	226222897
115	NC_012488	AGAACT	2	12	293136	293147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222899
116	NC_012488	AACTTT	2	12	295616	295627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012488	TACAAG	2	12	297380	297391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222903
118	NC_012488	CGAAAT	2	12	297434	297445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226222903
119	NC_012488	TAAAAA	2	12	300985	300996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012488	CATTAT	2	12	301164	301175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226222906
121	NC_012488	TCTTTT	2	12	301625	301636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226222906
122	NC_012488	ATCAAT	2	12	304032	304043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	226222908
123	NC_012488	ATGAAA	2	12	304390	304401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222909
124	NC_012488	AATACA	2	12	305434	305445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012488	GCTTTT	2	12	305733	305744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226222911
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127	NC_012488	TAGAAA	2	12	307208	307219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226222912
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129	NC_012488	GAAAAC	2	12	311044	311055	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226222915
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134	NC_012488	GCAATT	2	12	325479	325490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226222928
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154	NC_012488	AAATTT	2	12	370729	370740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012488	GCCATC	2	12	372811	372822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226222968
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161	NC_012488	ATGATA	2	12	393510	393521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012488	GATTTC	2	12	400391	400402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226222999
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183	NC_012488	TAATTA	2	12	458991	459002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012488	GCAAAA	2	12	459247	459258	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	226223059
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221	NC_012488	GGAAAA	2	12	569763	569774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226223158
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224	NC_012488	AGATTT	2	12	574499	574510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
225	NC_012488	GACGGC	2	12	574944	574955	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226223163
226	NC_012488	CGCACT	2	12	575756	575767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226223163
227	NC_012488	TTGCTT	2	12	584149	584160	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226223170
228	NC_012488	TTTTTC	2	12	584192	584203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	226223170
229	NC_012488	GCAACC	2	12	587389	587400	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226223175
230	NC_012488	AATCAC	2	12	588692	588703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	226223176
231	NC_012488	TACAGT	2	12	591063	591074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226223178
232	NC_012488	ATCCAG	2	12	593221	593232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	226223180
233	NC_012488	AGAATT	2	12	594533	594544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	226223181
234	NC_012488	TTTGGC	2	12	599051	599062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	226223185
235	NC_012488	TTTGGT	2	12	599756	599767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226223186
236	NC_012488	TACGTT	2	12	603087	603098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	226223189
237	NC_012488	CGCAAC	2	12	613778	613789	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226223202
238	NC_012488	AAATAA	2	12	614794	614805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_012488	AGAATG	2	12	620632	620643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	226223209
240	NC_012488	ACTTTT	2	12	622487	622498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226223210
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242	NC_012488	TGTTAG	2	12	623199	623210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226223211
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244	NC_012488	ACTTGA	2	12	626746	626757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226223212
245	NC_012488	CTGGAA	2	12	628533	628544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226223214
246	NC_012488	GCAACC	2	12	628697	628708	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226223214
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252	NC_012488	AATTTC	2	12	643724	643735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	226223227
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263	NC_012488	GGTTGC	2	12	667917	667928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226223256
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270	NC_012488	TTATTT	2	12	679697	679708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	226223265
271	NC_012488	ATCGTC	2	12	682031	682042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226223266
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333	NC_012488	GAAAAA	2	12	850492	850503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	226223441
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335	NC_012488	CGATGG	2	12	853173	853184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226223445
336	NC_012488	TTTCTG	2	12	853296	853307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	226223445
337	NC_012488	TTACTT	2	12	854360	854371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
338	NC_012488	AAAACC	2	12	857364	857375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226223447
339	NC_012488	AAATGA	2	12	867173	867184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	226223454
340	NC_012488	ATTTTA	2	12	868979	868990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226223455
341	NC_012488	CGCTAG	2	12	871199	871210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226223457
342	NC_012488	GGAGAA	2	12	878782	878793	50 %	0 %	50 %	0 %	226223460
343	NC_012488	TGTAAC	2	12	881607	881618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	226223460
344	NC_012488	TTATCT	2	12	889203	889214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226223467
345	NC_012488	AAATAG	2	12	890777	890788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
346	NC_012488	GCGGAA	2	12	894971	894982	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	226223474
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348	NC_012488	GTAATC	2	12	897581	897592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
349	NC_012488	TTACAA	2	12	897599	897610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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448	NC_012488	CATTTT	2	12	1135869	1135880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	226223718
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455	NC_012488	TTTAGT	2	12	1144307	1144318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_012488	TTGGTA	2	12	1145290	1145301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	226223730
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459	NC_012488	TAAAGC	2	12	1145555	1145566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226223730
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