MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 2118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012488	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	226222641
3	NC_012488	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	226222641
4	NC_012488	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	226222642
5	NC_012488	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	226222645
6	NC_012488	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	226222647
7	NC_012488	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	226222648
8	NC_012488	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	226222649
9	NC_012488	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	226222650
10	NC_012488	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	226222652
11	NC_012488	ATTGT	2	10	17720	17729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012488	ATGAA	2	10	19330	19339	60 %	20 %	20 %	0 %	226222653
13	NC_012488	GAATG	2	10	21072	21081	40 %	20 %	40 %	0 %	226222654
14	NC_012488	TAATT	2	10	22449	22458	40 %	60 %	0 %	0 %	226222657
15	NC_012488	ATTAA	2	10	23966	23975	60 %	40 %	0 %	0 %	226222658
16	NC_012488	AAATC	2	10	24427	24436	60 %	20 %	0 %	20 %	226222658
17	NC_012488	ATTTT	2	10	25204	25213	20 %	80 %	0 %	0 %	226222659
18	NC_012488	GGATT	2	10	25549	25558	20 %	40 %	40 %	0 %	226222659
19	NC_012488	AAATG	2	10	26104	26113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012488	ATGGA	2	10	30907	30916	40 %	20 %	40 %	0 %	226222666
21	NC_012488	AATAA	2	10	33745	33754	80 %	20 %	0 %	0 %	226222668
22	NC_012488	GGTTT	2	10	34290	34299	0 %	60 %	40 %	0 %	226222669
23	NC_012488	CATAT	2	10	34622	34631	40 %	40 %	0 %	20 %	226222669
24	NC_012488	TTTCT	2	10	34905	34914	0 %	80 %	0 %	20 %	226222670
25	NC_012488	CCATA	2	10	35590	35599	40 %	20 %	0 %	40 %	226222671
26	NC_012488	GAAAA	2	10	36435	36444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012488	AGATA	2	10	36691	36700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012488	AATTG	2	10	37002	37011	40 %	40 %	20 %	0 %	226222672
29	NC_012488	TAAAA	2	10	37254	37263	80 %	20 %	0 %	0 %	226222672
30	NC_012488	AAAGG	2	10	37662	37671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012488	CTATT	2	10	38158	38167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012488	GAAAA	2	10	39244	39253	80 %	0 %	20 %	0 %	226222675
33	NC_012488	TGAAA	2	10	40399	40408	60 %	20 %	20 %	0 %	226222676
34	NC_012488	GAATG	2	10	42270	42279	40 %	20 %	40 %	0 %	226222678
35	NC_012488	AAATT	2	10	42397	42406	60 %	40 %	0 %	0 %	226222678
36	NC_012488	ATTTT	2	10	43003	43012	20 %	80 %	0 %	0 %	226222678
37	NC_012488	AAAAC	2	10	46630	46639	80 %	0 %	0 %	20 %	226222680
38	NC_012488	TTATT	2	10	48116	48125	20 %	80 %	0 %	0 %	226222682
39	NC_012488	GAAAA	2	10	49329	49338	80 %	0 %	20 %	0 %	226222682
40	NC_012488	ATAAA	2	10	50154	50163	80 %	20 %	0 %	0 %	226222683
41	NC_012488	ATTTT	2	10	51958	51967	20 %	80 %	0 %	0 %	226222685
42	NC_012488	GACAT	2	10	53171	53180	40 %	20 %	20 %	20 %	226222686
43	NC_012488	GACTT	2	10	53455	53464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012488	ATTTT	2	10	53541	53550	20 %	80 %	0 %	0 %	226222687
45	NC_012488	AAATG	2	10	54670	54679	60 %	20 %	20 %	0 %	226222688
46	NC_012488	ATGGT	2	10	55707	55716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012488	GTAGA	2	10	55756	55765	40 %	20 %	40 %	0 %	226222689
48	NC_012488	TTACT	2	10	56738	56747	20 %	60 %	0 %	20 %	226222691
49	NC_012488	CAAAA	2	10	57245	57254	80 %	0 %	0 %	20 %	226222692
50	NC_012488	GAAAT	2	10	57395	57404	60 %	20 %	20 %	0 %	226222692
51	NC_012488	CTTAG	2	10	57494	57503	20 %	40 %	20 %	20 %	226222692
52	NC_012488	AAATA	2	10	57763	57772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012488	TAAAA	2	10	58745	58754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012488	TGCTA	2	10	58919	58928	20 %	40 %	20 %	20 %	226222695
55	NC_012488	TTTTA	2	10	59087	59096	20 %	80 %	0 %	0 %	226222695
56	NC_012488	AGTTA	2	10	60403	60412	40 %	40 %	20 %	0 %	226222696
57	NC_012488	TTATG	2	10	60951	60960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012488	AGTCT	2	10	61867	61876	20 %	40 %	20 %	20 %	226222697
59	NC_012488	TTTTA	2	10	64863	64872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012488	AAACG	2	10	69232	69241	60 %	0 %	20 %	20 %	226222702
61	NC_012488	CAAAA	2	10	70732	70741	80 %	0 %	0 %	20 %	226222703
62	NC_012488	AACAA	2	10	72151	72160	80 %	0 %	0 %	20 %	226222705
63	NC_012488	ATGGA	2	10	78851	78860	40 %	20 %	40 %	0 %	226222711
64	NC_012488	AAAAT	2	10	78879	78888	80 %	20 %	0 %	0 %	226222712
65	NC_012488	ATATC	2	10	79218	79227	40 %	40 %	0 %	20 %	226222712
66	NC_012488	GTATA	2	10	80266	80275	40 %	40 %	20 %	0 %	226222713
67	NC_012488	TATTT	2	10	80406	80415	20 %	80 %	0 %	0 %	226222714
68	NC_012488	ATATA	2	10	80661	80670	60 %	40 %	0 %	0 %	226222714
69	NC_012488	TTTTA	2	10	82178	82187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012488	TTTTA	2	10	82283	82292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012488	GCTTG	2	10	84253	84262	0 %	40 %	40 %	20 %	226222717
72	NC_012488	GCGCT	2	10	86307	86316	0 %	20 %	40 %	40 %	226222719
73	NC_012488	AACAA	2	10	86756	86765	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012488	TTTGT	2	10	88000	88009	0 %	80 %	20 %	0 %	226222722
75	NC_012488	TTTCT	2	10	88738	88747	0 %	80 %	0 %	20 %	226222722
76	NC_012488	ATTTT	2	10	88987	88996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012488	CTAAA	2	10	91099	91108	60 %	20 %	0 %	20 %	226222724
78	NC_012488	GAAAA	2	10	92442	92451	80 %	0 %	20 %	0 %	226222724
79	NC_012488	TGAAA	2	10	92684	92693	60 %	20 %	20 %	0 %	226222724
80	NC_012488	AAATT	2	10	93028	93037	60 %	40 %	0 %	0 %	226222724
81	NC_012488	AGCGG	2	10	93612	93621	20 %	0 %	60 %	20 %	226222724
82	NC_012488	GGAAA	2	10	94791	94800	60 %	0 %	40 %	0 %	226222724
83	NC_012488	CGAAA	2	10	96107	96116	60 %	0 %	20 %	20 %	226222725
84	NC_012488	AAAAG	2	10	96420	96429	80 %	0 %	20 %	0 %	226222725
85	NC_012488	TGCAT	2	10	100080	100089	20 %	40 %	20 %	20 %	226222728
86	NC_012488	TTACT	2	10	100326	100335	20 %	60 %	0 %	20 %	226222728
87	NC_012488	GTTTT	2	10	101924	101933	0 %	80 %	20 %	0 %	226222730
88	NC_012488	TGGCT	2	10	102075	102084	0 %	40 %	40 %	20 %	226222730
89	NC_012488	ATATC	2	10	110936	110945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012488	AAAAG	2	10	113624	113633	80 %	0 %	20 %	0 %	226222744
91	NC_012488	ACGGT	2	10	115168	115177	20 %	20 %	40 %	20 %	226222745
92	NC_012488	GAAAT	2	10	116407	116416	60 %	20 %	20 %	0 %	226222746
93	NC_012488	GAATT	2	10	117048	117057	40 %	40 %	20 %	0 %	226222746
94	NC_012488	CTTTA	2	10	121252	121261	20 %	60 %	0 %	20 %	226222749
95	NC_012488	AGAGA	2	10	121762	121771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012488	CTCGA	2	10	122603	122612	20 %	20 %	20 %	40 %	226222751
97	NC_012488	TTCCA	2	10	122937	122946	20 %	40 %	0 %	40 %	226222751
98	NC_012488	TTACT	2	10	123201	123210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012488	TTTTA	2	10	124135	124144	20 %	80 %	0 %	0 %	226222753
100	NC_012488	AAAAG	2	10	124404	124413	80 %	0 %	20 %	0 %	226222754
101	NC_012488	AAAGT	2	10	125442	125451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012488	TTAGT	2	10	126564	126573	20 %	60 %	20 %	0 %	226222758
103	NC_012488	TGAAC	2	10	127246	127255	40 %	20 %	20 %	20 %	226222760
104	NC_012488	AGATG	2	10	127288	127297	40 %	20 %	40 %	0 %	226222760
105	NC_012488	TTTAT	2	10	129564	129573	20 %	80 %	0 %	0 %	226222761
106	NC_012488	AAGTG	2	10	131586	131595	40 %	20 %	40 %	0 %	226222764
107	NC_012488	AGTCT	2	10	131866	131875	20 %	40 %	20 %	20 %	226222764
108	NC_012488	TGTAA	2	10	132946	132955	40 %	40 %	20 %	0 %	226222766
109	NC_012488	AATTT	2	10	133328	133337	40 %	60 %	0 %	0 %	226222767
110	NC_012488	TTGTT	2	10	135694	135703	0 %	80 %	20 %	0 %	226222769
111	NC_012488	ATTTT	2	10	137496	137505	20 %	80 %	0 %	0 %	226222771
112	NC_012488	AAAAT	2	10	138998	139007	80 %	20 %	0 %	0 %	226222771
113	NC_012488	AACTT	2	10	140307	140316	40 %	40 %	0 %	20 %	226222774
114	NC_012488	ACAAA	2	10	140409	140418	80 %	0 %	0 %	20 %	226222774
115	NC_012488	ACTTG	2	10	141203	141212	20 %	40 %	20 %	20 %	226222774
116	NC_012488	CCACA	2	10	141544	141553	40 %	0 %	0 %	60 %	226222774
117	NC_012488	TTGGT	2	10	141999	142008	0 %	60 %	40 %	0 %	226222775
118	NC_012488	TGTTT	2	10	142342	142351	0 %	80 %	20 %	0 %	226222775
119	NC_012488	TATGA	2	10	144979	144988	40 %	40 %	20 %	0 %	226222779
120	NC_012488	TAACG	2	10	146828	146837	40 %	20 %	20 %	20 %	226222782
121	NC_012488	AGTAG	2	10	147150	147159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012488	TAAAA	2	10	148205	148214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012488	ATCCG	2	10	149820	149829	20 %	20 %	20 %	40 %	226222786
124	NC_012488	TTTAA	2	10	150513	150522	40 %	60 %	0 %	0 %	226222786
125	NC_012488	AATTT	2	10	150699	150708	40 %	60 %	0 %	0 %	226222786
126	NC_012488	GATAA	2	10	150866	150875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012488	AAACG	2	10	151849	151858	60 %	0 %	20 %	20 %	226222787
128	NC_012488	AATAA	2	10	151972	151981	80 %	20 %	0 %	0 %	226222787
129	NC_012488	GAATA	2	10	153933	153942	60 %	20 %	20 %	0 %	226222790
130	NC_012488	TTACT	2	10	155131	155140	20 %	60 %	0 %	20 %	226222791
131	NC_012488	AGATG	2	10	155179	155188	40 %	20 %	40 %	0 %	226222791
132	NC_012488	ATATG	2	10	157846	157855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012488	GCCAA	2	10	158159	158168	40 %	0 %	20 %	40 %	226222793
134	NC_012488	TCTAA	2	10	160210	160219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012488	AAACA	2	10	160821	160830	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012488	GGAAT	2	10	163359	163368	40 %	20 %	40 %	0 %	226222795
137	NC_012488	AAGAT	2	10	163780	163789	60 %	20 %	20 %	0 %	226222795
138	NC_012488	GAATT	2	10	164151	164160	40 %	40 %	20 %	0 %	226222796
139	NC_012488	AAATA	2	10	167203	167212	80 %	20 %	0 %	0 %	226222800
140	NC_012488	TTGTA	2	10	169931	169940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012488	ACTTT	2	10	170866	170875	20 %	60 %	0 %	20 %	226222804
142	NC_012488	AAAAG	2	10	172295	172304	80 %	0 %	20 %	0 %	226222805
143	NC_012488	ATGAA	2	10	174069	174078	60 %	20 %	20 %	0 %	226222806
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146	NC_012488	TTGTT	2	10	180433	180442	0 %	80 %	20 %	0 %	226222811
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148	NC_012488	TCAGT	2	10	182403	182412	20 %	40 %	20 %	20 %	226222812
149	NC_012488	TACAT	2	10	183152	183161	40 %	40 %	0 %	20 %	226222812
150	NC_012488	GCGTT	2	10	183776	183785	0 %	40 %	40 %	20 %	226222812
151	NC_012488	ATCAA	2	10	186215	186224	60 %	20 %	0 %	20 %	226222813
152	NC_012488	TAAAA	2	10	187083	187092	80 %	20 %	0 %	0 %	226222814
153	NC_012488	AGAAA	2	10	188034	188043	80 %	0 %	20 %	0 %	226222815
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156	NC_012488	AATTT	2	10	190872	190881	40 %	60 %	0 %	0 %	226222819
157	NC_012488	ATTTG	2	10	191699	191708	20 %	60 %	20 %	0 %	226222820
158	NC_012488	TTGTC	2	10	196161	196170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_012488	ACAAA	2	10	196523	196532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_012488	AAAGT	2	10	198851	198860	60 %	20 %	20 %	0 %	226222827
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166	NC_012488	AATTT	2	10	202607	202616	40 %	60 %	0 %	0 %	226222831
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168	NC_012488	ATATA	2	10	204269	204278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_012488	AAGTG	2	10	205283	205292	40 %	20 %	40 %	0 %	226222832
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177	NC_012488	AAAAT	2	10	213580	213589	80 %	20 %	0 %	0 %	226222841
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179	NC_012488	TAGAA	2	10	214964	214973	60 %	20 %	20 %	0 %	226222843
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183	NC_012488	AGCCG	2	10	220471	220480	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_012488	GAATA	2	10	232109	232118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012488	AAATT	2	10	233794	233803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_012488	TAATT	2	10	240014	240023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012488	TCGTG	2	10	241173	241182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_012488	AAGGT	2	10	242641	242650	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_012488	GAACA	2	10	247507	247516	60 %	0 %	20 %	20 %	226222861
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218	NC_012488	GGCTG	2	10	283145	283154	0 %	20 %	60 %	20 %	226222892
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242	NC_012488	AGGTA	2	10	301516	301525	40 %	20 %	40 %	0 %	226222906
243	NC_012488	AAAGA	2	10	304179	304188	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_012488	ATTGT	2	10	305346	305355	20 %	60 %	20 %	0 %	226222910
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254	NC_012488	GACAA	2	10	321547	321556	60 %	0 %	20 %	20 %	226222925
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258	NC_012488	GTTAT	2	10	328296	328305	20 %	60 %	20 %	0 %	226222931
259	NC_012488	TAGAT	2	10	329162	329171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012488	GTTTT	2	10	330292	330301	0 %	80 %	20 %	0 %	226222933
261	NC_012488	AATCG	2	10	330337	330346	40 %	20 %	20 %	20 %	226222933
262	NC_012488	ACTTT	2	10	333936	333945	20 %	60 %	0 %	20 %	226222936
263	NC_012488	TGCTT	2	10	340346	340355	0 %	60 %	20 %	20 %	226222944
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267	NC_012488	TTCTT	2	10	345291	345300	0 %	80 %	0 %	20 %	226222948
268	NC_012488	AATAA	2	10	345602	345611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_012488	ATTGT	2	10	346960	346969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_012488	CAAAA	2	10	535463	535472	80 %	0 %	0 %	20 %	226223127
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