MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	TATACA	2	12	19779	19790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012471	ACTAAT	2	12	23058	23069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012471	GCAAAG	2	12	75429	75440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012471	AAAACA	2	12	80089	80100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012471	TAAGGT	2	12	84071	84082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012471	TATACA	2	12	89365	89376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012471	ACTAAT	2	12	92644	92655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012471	TTCGGG	2	12	93573	93584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012471	AAAAAG	2	12	105237	105248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012471	AAGACA	2	12	126567	126578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012471	GATAAG	2	12	128157	128168	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012471	AGCTTT	2	12	129126	129137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012471	AAATTA	2	12	150261	150272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012471	CAGGAA	2	12	150273	150284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012471	TTTTTA	2	12	165283	165294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012471	TTTAAT	2	12	185873	185884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012471	GAAAAA	2	12	194816	194827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012471	AAGCAG	2	12	212979	212990	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012471	TGCTAA	2	12	213121	213132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012471	CTCTTT	2	12	222732	222743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012471	AAAGCA	2	12	232608	232619	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012471	CAAAAG	2	12	245615	245626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012471	TTGACG	2	12	339743	339754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012471	GGCTGT	2	12	341915	341926	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012471	GAAAAA	2	12	348514	348525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012471	ATCTGA	2	12	351236	351247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012471	GCAGGT	2	12	354474	354485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012471	TCCATT	2	12	355442	355453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012471	TAGGGT	2	12	369320	369331	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012471	AATGAT	2	12	369545	369556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012471	TAGCTT	2	12	376652	376663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012471	TGAGGT	2	12	381908	381919	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012471	GCAAGT	2	12	402292	402303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012471	GATCTT	2	12	426520	426531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012471	TTAGAT	2	12	477318	477329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012471	CTGCAG	2	12	492748	492759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012471	GGCCTT	2	12	508941	508952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012471	TGATGT	2	12	509231	509242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012471	CAGTGC	2	12	512630	512641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012471	TAGGTG	2	12	520929	520940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012471	TTTAGC	2	12	549386	549397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012471	GCAGAA	2	12	550209	550220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012471	AATGAT	2	12	569507	569518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012471	GGTAGA	2	12	569651	569662	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012471	GGAGAT	2	12	592722	592733	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012471	AAAAGG	2	12	621537	621548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012471	TATGGT	2	12	639287	639298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012471	ATTAAG	2	12	649986	649997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012471	GGTCTT	2	12	658068	658079	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012471	TTTATG	2	12	689827	689838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012471	CAGGCC	2	12	706207	706218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012471	ATCCGA	2	12	740311	740322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012471	GAAGGA	2	12	742141	742152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	GAAAAA	2	12	759089	759100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012471	AAATAA	2	12	759164	759175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012471	TAAGGG	2	12	765704	765715	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012471	GGCTGC	2	12	767724	767735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012471	GGACAA	2	12	774857	774868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012471	TTGATA	2	12	796566	796577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012471	CAATAG	2	12	797480	797491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012471	ATAACA	2	12	854513	854524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012471	TTTTAG	2	12	873833	873844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012471	GGTGAT	2	12	1016455	1016466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012471	GAATAG	2	12	1030388	1030399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012471	TCAGAG	2	12	1038368	1038379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012471	AAGCTT	2	12	1038490	1038501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012471	AAAGCA	2	12	1078328	1078339	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012471	TATAGC	2	12	1079264	1079275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012471	ACTGAG	2	12	1095581	1095592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012471	TTGGGC	2	12	1108230	1108241	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012471	TGATTG	2	12	1137874	1137885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012471	GATATT	2	12	1138200	1138211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012471	TTAGTC	2	12	1143286	1143297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012471	AAAGAG	2	12	1172132	1172143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012471	GCTTTT	2	12	1189602	1189613	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012471	GATCAA	2	12	1189786	1189797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012471	GCAAGA	2	12	1204418	1204429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012471	AAAATA	2	12	1204748	1204759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	AATTAT	2	12	1208657	1208668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012471	AAGTCC	2	12	1268857	1268868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012471	ATTCAA	2	12	1299309	1299320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012471	TTGTAT	2	12	1318147	1318158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012471	CAATAC	2	12	1408534	1408545	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012471	ACAAAA	2	12	1439091	1439102	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012471	CAAGCC	2	12	1454558	1454569	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012471	CTCAAT	2	12	1492598	1492609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012471	GCAAGT	2	12	1499616	1499627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012471	ACAAGC	2	12	1506274	1506285	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012471	GCACCA	2	12	1532135	1532146	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012471	AAATAA	2	12	1593055	1593066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012471	GAACCA	2	12	1614792	1614803	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012471	CCTAAG	2	12	1614807	1614818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012471	TTTATT	2	12	1628202	1628213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012471	TACAAG	2	12	1641240	1641251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012471	TTTGAG	2	12	1680313	1680324	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012471	AGTACC	2	12	1715647	1715658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012471	AACTAA	2	12	1726761	1726772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012471	GGAAAT	2	12	1732345	1732356	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012471	TATTAG	2	12	1735284	1735295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012471	TGTATA	2	12	1738564	1738575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012471	TGGTAT	2	12	1742262	1742273	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012471	ATAAAA	2	12	1790714	1790725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012471	ATGATA	2	12	1808736	1808747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012471	CTTGAT	2	12	1823508	1823519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012471	CATTAT	2	12	1831464	1831475	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012471	AAGGTA	2	12	1834147	1834158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012471	TCTTTT	2	12	1857874	1857885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012471	TGGTGA	2	12	1858077	1858088	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012471	TATTAG	2	12	1915441	1915452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012471	TGTATA	2	12	1918721	1918732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012471	TTTTTA	2	12	1954255	1954266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	TATTAG	2	12	1965446	1965457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012471	TGTATA	2	12	1968726	1968737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012471	TATTAG	2	12	1971572	1971583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012471	TGTATA	2	12	1974852	1974863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012471	GCTCTT	2	12	1991080	1991091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012471	TAAAAA	2	12	2007998	2008009	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012471	CTTTTT	2	12	2036068	2036079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012471	TTGATA	2	12	2064458	2064469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012471	ATATTT	2	12	2093491	2093502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012471	AATTTG	2	12	2108535	2108546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012471	TCCCTT	2	12	2114026	2114037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012471	TGACAT	2	12	2138294	2138305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012471	CTACCA	2	12	2150422	2150433	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012471	CTGAGT	4	24	2150994	2151017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012471	GTTTTG	2	12	2190101	2190112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012471	TGCTAA	2	12	2202846	2202857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012471	TGAGTC	2	12	2239787	2239798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012471	AATCAC	2	12	2249860	2249871	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012471	GCTCTT	2	12	2252714	2252725	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.