MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	AAAGG	2	10	3023	3032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012471	TCGTG	2	10	19115	19124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012471	GTTAA	2	10	20190	20199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012471	GGGAG	2	10	20709	20718	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012471	AGGGA	2	10	22917	22926	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012471	TAAGT	2	10	23169	23178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012471	GCTTA	2	10	23282	23291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012471	GCATA	2	10	23878	23887	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012471	TTTAT	2	10	31054	31063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012471	TGCTA	2	10	48879	48888	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012471	TGAGG	2	10	50293	50302	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012471	TACAA	2	10	57833	57842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012471	TGACT	2	10	59274	59283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012471	AAATG	2	10	59320	59329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012471	ACATA	2	10	59454	59463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012471	GATAC	2	10	59578	59587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012471	AGGAT	2	10	61413	61422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012471	TTTTG	2	10	62155	62164	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012471	GATTT	2	10	62383	62392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012471	AGTCA	2	10	64716	64725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012471	TTTAG	2	10	64781	64790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012471	AAGGA	2	10	74515	74524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012471	ACTAG	2	10	80832	80841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012471	GTTTC	2	10	82076	82085	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012471	TAGAT	2	10	83900	83909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012471	TCGTG	2	10	88701	88710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012471	GTTAA	2	10	89776	89785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012471	GGGAG	2	10	90295	90304	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012471	AGGGA	2	10	92503	92512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012471	TAAGT	2	10	92755	92764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012471	GCTTA	2	10	92868	92877	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012471	AGTTT	2	10	93846	93855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012471	GACTA	2	10	108854	108863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012471	AATTT	2	10	112936	112945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012471	TAAGG	2	10	116232	116241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012471	TACCT	2	10	123682	123691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012471	AAAGC	2	10	124076	124085	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012471	TTTCA	2	10	124183	124192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012471	TGATA	2	10	124202	124211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012471	TTTAA	2	10	126616	126625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012471	ATTAT	2	10	128937	128946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012471	TTTAA	2	10	135352	135361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012471	AATAA	2	10	143740	143749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012471	TAATA	2	10	155030	155039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012471	ATTAT	2	10	179529	179538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012471	TTTTA	2	10	195372	195381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012471	CAGCT	2	10	209228	209237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012471	GTGTT	2	10	210952	210961	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012471	GCAAA	2	10	213515	213524	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012471	TGCAA	2	10	214090	214099	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012471	AGACT	2	10	214229	214238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012471	TAAAA	2	10	216901	216910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012471	TTAAT	2	10	217562	217571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	TAAGC	2	10	222663	222672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012471	CTAAA	2	10	245873	245882	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012471	GCCAT	2	10	251772	251781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012471	AGCTA	2	10	255652	255661	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012471	GCTTT	2	10	260515	260524	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012471	AGGTA	2	10	260909	260918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012471	CTTGA	2	10	261221	261230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012471	CAGTT	2	10	261858	261867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012471	AAAAG	2	10	263674	263683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012471	TAAGG	2	10	286280	286289	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012471	TTCTT	2	10	292700	292709	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012471	AAAAG	2	10	301484	301493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012471	ATTTT	2	10	301526	301535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	CCTTT	2	10	305803	305812	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_012471	ATCTT	2	10	314562	314571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012471	GTTAT	2	10	319076	319085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012471	AACAT	2	10	331336	331345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012471	AAAAT	2	10	333284	333293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012471	TAATT	2	10	333345	333354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012471	TAAAA	2	10	339372	339381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012471	TTTAT	2	10	341943	341952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012471	TTTGC	2	10	345381	345390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012471	CATAA	2	10	350013	350022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012471	CAGTA	2	10	352753	352762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012471	CTCTG	2	10	355587	355596	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012471	ATGAG	2	10	356279	356288	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012471	TAGGG	2	10	358459	358468	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012471	TATCA	2	10	359395	359404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012471	TGATA	2	10	359420	359429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012471	GCTTG	2	10	359534	359543	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012471	TTTTC	2	10	359887	359896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012471	GACTT	2	10	359996	360005	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012471	CAAAG	2	10	369128	369137	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012471	GCTTA	2	10	369398	369407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012471	ATGTT	2	10	373960	373969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012471	ACCTG	2	10	385304	385313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012471	GCTTT	2	10	388225	388234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012471	GTAGG	2	10	406847	406856	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012471	TTTTA	2	10	408906	408915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012471	AGAAA	2	10	414560	414569	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012471	ATTTT	2	10	419078	419087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012471	ATTTT	2	10	422513	422522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012471	GTGCT	2	10	425567	425576	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012471	TCACT	2	10	442890	442899	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_012471	TAGAC	2	10	442925	442934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012471	TGAGG	2	10	443657	443666	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012471	GAAAA	2	10	445202	445211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012471	CTATA	2	10	446421	446430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012471	CATGG	2	10	451049	451058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012471	ATTAT	2	10	453722	453731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012471	TCCCC	2	10	461973	461982	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_012471	ATAGC	2	10	461996	462005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012471	AAATC	2	10	476195	476204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012471	TATCA	2	10	479972	479981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012471	ATTAT	2	10	488350	488359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012471	CAATA	2	10	488368	488377	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012471	TAGAT	2	10	488805	488814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012471	GTTGA	2	10	492119	492128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	CAAAC	2	10	492644	492653	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012471	ATTTT	2	10	493208	493217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012471	TCTCC	2	10	493276	493285	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_012471	TAAGA	2	10	494014	494023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012471	AAACA	2	10	503323	503332	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012471	TGCTT	2	10	505914	505923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012471	CAAAA	2	10	506928	506937	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012471	CTTTT	2	10	509686	509695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012471	AGCCT	2	10	510731	510740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_012471	AGCTG	2	10	512398	512407	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012471	TGCTT	2	10	518753	518762	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012471	TAATA	2	10	525516	525525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012471	GTTTT	2	10	525655	525664	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012471	GCAAA	2	10	538247	538256	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012471	TGAGA	2	10	539373	539382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012471	TAGCA	2	10	539443	539452	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012471	ACCAA	2	10	549531	549540	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_012471	TTATC	2	10	549697	549706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012471	AAACT	2	10	550410	550419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012471	GAAGA	2	10	550790	550799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012471	AGCTT	2	10	551240	551249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012471	ATTTG	2	10	561873	561882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012471	ATGAC	2	10	577601	577610	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012471	GCTAA	2	10	578724	578733	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012471	TAAAA	2	10	579340	579349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012471	TCATT	2	10	583061	583070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012471	CTTTT	2	10	587101	587110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012471	AAGGA	2	10	590974	590983	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012471	TGATT	2	10	592708	592717	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012471	ATAAA	2	10	615850	615859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012471	TTGCT	2	10	617770	617779	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012471	GCTTT	2	10	619705	619714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012471	GCTTT	2	10	630127	630136	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012471	ATAAA	2	10	630152	630161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012471	TGATA	2	10	638570	638579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012471	TATAA	2	10	648510	648519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012471	TATCA	2	10	650784	650793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012471	GTTTT	2	10	658047	658056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012471	CTACT	2	10	660177	660186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_012471	TGAAA	2	10	726607	726616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_012471	CCAAG	2	10	1281320	1281329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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272	NC_012471	TTTGC	2	10	1304775	1304784	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_012471	TCTTT	2	10	1305795	1305804	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_012471	TACTT	2	10	1305857	1305866	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_012471	CTATC	2	10	1348931	1348940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_012471	CTTAT	2	10	1357670	1357679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_012471	TTCTT	2	10	1358072	1358081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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424	NC_012471	CTTTC	2	10	2053973	2053982	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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428	NC_012471	TAGTA	2	10	2104320	2104329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012471	TATAA	2	10	2112371	2112380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_012471	GTTTT	2	10	2117053	2117062	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
431	NC_012471	AGCTA	2	10	2118989	2118998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
432	NC_012471	AAATT	2	10	2123649	2123658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012471	TACCT	2	10	2133671	2133680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
434	NC_012471	AAAGC	2	10	2134065	2134074	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
435	NC_012471	TTATT	2	10	2134814	2134823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_012471	TAAGC	2	10	2141199	2141208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
437	NC_012471	TACCA	2	10	2143501	2143510	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
438	NC_012471	ATAGA	2	10	2146793	2146802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
439	NC_012471	ATAGT	2	10	2150840	2150849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_012471	CTACA	2	10	2179110	2179119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
442	NC_012471	ACTTT	2	10	2189532	2189541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
443	NC_012471	TATGA	2	10	2189552	2189561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012471	CACTG	2	10	2202725	2202734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
445	NC_012471	ATATC	2	10	2214676	2214685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
446	NC_012471	TACCT	2	10	2239300	2239309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
447	NC_012471	AAAGC	2	10	2239694	2239703	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
448	NC_012471	TTTAA	2	10	2240959	2240968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_012471	TATCA	2	10	2242806	2242815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
450	NC_012471	CTTTT	2	10	2251368	2251377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.