MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 6026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	AGCT	2	8	41	48	25 %	25 %	25 %	25 %	225869488
2	NC_012471	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	225869488
3	NC_012471	TGCT	2	8	1163	1170	0 %	50 %	25 %	25 %	225869488
4	NC_012471	TTCA	2	8	1540	1547	25 %	50 %	0 %	25 %	225869489
5	NC_012471	ATAA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012471	TGAG	2	8	2706	2713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012471	AATT	2	8	3894	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	225869492
8	NC_012471	AATC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	225869492
9	NC_012471	GTGC	2	8	4382	4389	0 %	25 %	50 %	25 %	225869492
10	NC_012471	AGGA	2	8	4545	4552	50 %	0 %	50 %	0 %	225869492
11	NC_012471	CAAA	2	8	4813	4820	75 %	0 %	0 %	25 %	225869493
12	NC_012471	ATCA	2	8	4921	4928	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
13	NC_012471	ATTT	2	8	4936	4943	25 %	75 %	0 %	0 %	225869493
14	NC_012471	CAAT	2	8	5240	5247	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
15	NC_012471	CTTG	2	8	5546	5553	0 %	50 %	25 %	25 %	225869494
16	NC_012471	AATG	2	8	6183	6190	50 %	25 %	25 %	0 %	225869494
17	NC_012471	AGTT	2	8	6247	6254	25 %	50 %	25 %	0 %	225869494
18	NC_012471	TCAA	2	8	6472	6479	50 %	25 %	0 %	25 %	225869494
19	NC_012471	ACTG	2	8	7628	7635	25 %	25 %	25 %	25 %	225869494
20	NC_012471	TTAT	2	8	8016	8023	25 %	75 %	0 %	0 %	225869494
21	NC_012471	GCAA	3	12	8319	8330	50 %	0 %	25 %	25 %	225869494
22	NC_012471	TTGG	2	8	9323	9330	0 %	50 %	50 %	0 %	225869495
23	NC_012471	TTTA	2	8	9335	9342	25 %	75 %	0 %	0 %	225869495
24	NC_012471	ACTG	2	8	9774	9781	25 %	25 %	25 %	25 %	225869495
25	NC_012471	GCTG	2	8	9839	9846	0 %	25 %	50 %	25 %	225869495
26	NC_012471	GCTT	2	8	10116	10123	0 %	50 %	25 %	25 %	225869495
27	NC_012471	TTGC	2	8	10161	10168	0 %	50 %	25 %	25 %	225869495
28	NC_012471	GATT	2	8	10373	10380	25 %	50 %	25 %	0 %	225869496
29	NC_012471	TTAT	2	8	10938	10945	25 %	75 %	0 %	0 %	225869497
30	NC_012471	AGGA	2	8	11100	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	225869498
31	NC_012471	GCTT	2	8	12120	12127	0 %	50 %	25 %	25 %	225869499
32	NC_012471	CTAT	2	8	12159	12166	25 %	50 %	0 %	25 %	225869499
33	NC_012471	CTAT	2	8	12635	12642	25 %	50 %	0 %	25 %	225869500
34	NC_012471	TGAT	2	8	13016	13023	25 %	50 %	25 %	0 %	225869500
35	NC_012471	AGGC	2	8	13456	13463	25 %	0 %	50 %	25 %	225869500
36	NC_012471	TGGT	2	8	13592	13599	0 %	50 %	50 %	0 %	225869500
37	NC_012471	ATTA	2	8	14383	14390	50 %	50 %	0 %	0 %	225869502
38	NC_012471	TTGC	2	8	14948	14955	0 %	50 %	25 %	25 %	225869502
39	NC_012471	TGTT	2	8	15021	15028	0 %	75 %	25 %	0 %	225869502
40	NC_012471	GAGC	2	8	15080	15087	25 %	0 %	50 %	25 %	225869502
41	NC_012471	GATG	2	8	15193	15200	25 %	25 %	50 %	0 %	225869502
42	NC_012471	AACC	2	8	15238	15245	50 %	0 %	0 %	50 %	225869502
43	NC_012471	TGAT	2	8	15969	15976	25 %	50 %	25 %	0 %	225869502
44	NC_012471	AATA	2	8	16215	16222	75 %	25 %	0 %	0 %	225869502
45	NC_012471	ATGC	2	8	17729	17736	25 %	25 %	25 %	25 %	225869503
46	NC_012471	AAGA	2	8	17756	17763	75 %	0 %	25 %	0 %	225869503
47	NC_012471	GTGA	2	8	18448	18455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012471	TAAC	2	8	18531	18538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012471	AGCG	2	8	18619	18626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012471	TGGT	2	8	19284	19291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012471	AGCC	2	8	19501	19508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012471	GTAA	2	8	20276	20283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012471	GAAG	2	8	20358	20365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	ATTC	2	8	21296	21303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012471	CTAA	2	8	21651	21658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012471	CTGA	2	8	21924	21931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012471	TAGG	2	8	22306	22313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012471	TTGG	2	8	22489	22496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012471	AATC	2	8	22498	22505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012471	ATAG	2	8	23624	23631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012471	GCGT	2	8	24293	24300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012471	TAAA	2	8	26378	26385	75 %	25 %	0 %	0 %	225869506
63	NC_012471	GCAG	2	8	26919	26926	25 %	0 %	50 %	25 %	225869506
64	NC_012471	AATC	2	8	27367	27374	50 %	25 %	0 %	25 %	225869506
65	NC_012471	TGGT	2	8	27390	27397	0 %	50 %	50 %	0 %	225869506
66	NC_012471	ATTG	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	TGAT	2	8	28204	28211	25 %	50 %	25 %	0 %	225869507
68	NC_012471	TGAT	2	8	28216	28223	25 %	50 %	25 %	0 %	225869507
69	NC_012471	ATTG	2	8	28355	28362	25 %	50 %	25 %	0 %	225869507
70	NC_012471	TGAT	2	8	28396	28403	25 %	50 %	25 %	0 %	225869507
71	NC_012471	ATAG	2	8	28589	28596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012471	GAAT	2	8	29298	29305	50 %	25 %	25 %	0 %	225869508
73	NC_012471	ATTT	2	8	29432	29439	25 %	75 %	0 %	0 %	225869508
74	NC_012471	ATCA	2	8	29863	29870	50 %	25 %	0 %	25 %	225869509
75	NC_012471	GTTT	2	8	30070	30077	0 %	75 %	25 %	0 %	225869509
76	NC_012471	GCTT	2	8	30268	30275	0 %	50 %	25 %	25 %	225869509
77	NC_012471	TAAA	2	8	31072	31079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012471	AAAG	2	8	31126	31133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	TAAA	2	8	31381	31388	75 %	25 %	0 %	0 %	225869511
80	NC_012471	AAAT	2	8	31916	31923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012471	TCAA	2	8	32402	32409	50 %	25 %	0 %	25 %	225869512
82	NC_012471	ACCT	2	8	32797	32804	25 %	25 %	0 %	50 %	225869512
83	NC_012471	GCAG	2	8	34287	34294	25 %	0 %	50 %	25 %	225869512
84	NC_012471	CTTG	2	8	34320	34327	0 %	50 %	25 %	25 %	225869512
85	NC_012471	TGAT	2	8	34532	34539	25 %	50 %	25 %	0 %	225869512
86	NC_012471	AACT	2	8	34992	34999	50 %	25 %	0 %	25 %	225869512
87	NC_012471	TGGC	2	8	35425	35432	0 %	25 %	50 %	25 %	225869512
88	NC_012471	TGGT	2	8	36528	36535	0 %	50 %	50 %	0 %	225869513
89	NC_012471	TGGT	2	8	36759	36766	0 %	50 %	50 %	0 %	225869513
90	NC_012471	CCAA	2	8	36871	36878	50 %	0 %	0 %	50 %	225869513
91	NC_012471	GTAT	2	8	37841	37848	25 %	50 %	25 %	0 %	225869514
92	NC_012471	TGAT	2	8	37907	37914	25 %	50 %	25 %	0 %	225869514
93	NC_012471	TTCA	2	8	37967	37974	25 %	50 %	0 %	25 %	225869514
94	NC_012471	ACCT	2	8	38168	38175	25 %	25 %	0 %	50 %	225869514
95	NC_012471	ATCA	2	8	38266	38273	50 %	25 %	0 %	25 %	225869514
96	NC_012471	TGCT	2	8	38315	38322	0 %	50 %	25 %	25 %	225869514
97	NC_012471	AAGC	2	8	38598	38605	50 %	0 %	25 %	25 %	225869515
98	NC_012471	AGTC	2	8	38796	38803	25 %	25 %	25 %	25 %	225869515
99	NC_012471	GACG	2	8	39308	39315	25 %	0 %	50 %	25 %	225869516
100	NC_012471	TCAT	2	8	39336	39343	25 %	50 %	0 %	25 %	225869516
101	NC_012471	CAAA	2	8	40436	40443	75 %	0 %	0 %	25 %	225869516
102	NC_012471	GCAA	2	8	40474	40481	50 %	0 %	25 %	25 %	225869516
103	NC_012471	ATCA	2	8	40930	40937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012471	CACC	2	8	41178	41185	25 %	0 %	0 %	75 %	225869517
105	NC_012471	AGGC	2	8	41965	41972	25 %	0 %	50 %	25 %	225869517
106	NC_012471	ACTT	2	8	42066	42073	25 %	50 %	0 %	25 %	225869517
107	NC_012471	CTGA	2	8	42111	42118	25 %	25 %	25 %	25 %	225869517
108	NC_012471	ATTA	2	8	42209	42216	50 %	50 %	0 %	0 %	225869517
109	NC_012471	AAGA	2	8	42239	42246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012471	AGGC	2	8	42413	42420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012471	TAAT	2	8	42426	42433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	CTTT	2	8	42520	42527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012471	TTAT	2	8	42537	42544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012471	GCAG	2	8	43083	43090	25 %	0 %	50 %	25 %	225869518
115	NC_012471	TCCT	2	8	43490	43497	0 %	50 %	0 %	50 %	225869518
116	NC_012471	GCTT	2	8	43617	43624	0 %	50 %	25 %	25 %	225869518
117	NC_012471	AAAT	2	8	43858	43865	75 %	25 %	0 %	0 %	225869518
118	NC_012471	TGAG	2	8	44698	44705	25 %	25 %	50 %	0 %	225869520
119	NC_012471	AAGC	2	8	44902	44909	50 %	0 %	25 %	25 %	225869520
120	NC_012471	GCCA	2	8	45436	45443	25 %	0 %	25 %	50 %	225869520
121	NC_012471	CTAT	2	8	45795	45802	25 %	50 %	0 %	25 %	225869521
122	NC_012471	ATAG	2	8	46163	46170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012471	TTGG	2	8	46542	46549	0 %	50 %	50 %	0 %	225869522
124	NC_012471	TGCT	2	8	47150	47157	0 %	50 %	25 %	25 %	225869522
125	NC_012471	TTAA	2	8	48015	48022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012471	GAAA	2	8	48038	48045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012471	TTGC	2	8	48431	48438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012471	AACA	2	8	48508	48515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012471	GAAT	2	8	48589	48596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012471	TTTG	2	8	50458	50465	0 %	75 %	25 %	0 %	225869524
131	NC_012471	CTGG	2	8	50558	50565	0 %	25 %	50 %	25 %	225869524
132	NC_012471	AAGC	2	8	51028	51035	50 %	0 %	25 %	25 %	225869525
133	NC_012471	GAAT	2	8	51088	51095	50 %	25 %	25 %	0 %	225869525
134	NC_012471	AAAC	2	8	51470	51477	75 %	0 %	0 %	25 %	225869526
135	NC_012471	ATTC	2	8	51676	51683	25 %	50 %	0 %	25 %	225869526
136	NC_012471	TGGC	2	8	52026	52033	0 %	25 %	50 %	25 %	225869526
137	NC_012471	ATTT	2	8	52223	52230	25 %	75 %	0 %	0 %	225869526
138	NC_012471	CTGG	2	8	52276	52283	0 %	25 %	50 %	25 %	225869526
139	NC_012471	ATTG	2	8	52388	52395	25 %	50 %	25 %	0 %	225869526
140	NC_012471	GCTT	2	8	52423	52430	0 %	50 %	25 %	25 %	225869526
141	NC_012471	TGGT	2	8	52449	52456	0 %	50 %	50 %	0 %	225869526
142	NC_012471	TTTA	2	8	52799	52806	25 %	75 %	0 %	0 %	225869526
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144	NC_012471	GAGC	2	8	53057	53064	25 %	0 %	50 %	25 %	225869526
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