MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 1291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	ATAA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012471	TGAG	2	8	2706	2713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012471	GTGA	2	8	18448	18455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012471	TAAC	2	8	18531	18538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012471	AGCG	2	8	18619	18626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012471	TGGT	2	8	19284	19291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012471	AGCC	2	8	19501	19508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012471	GTAA	2	8	20276	20283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012471	GAAG	2	8	20358	20365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012471	ATTC	2	8	21296	21303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012471	CTAA	2	8	21651	21658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012471	CTGA	2	8	21924	21931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012471	TAGG	2	8	22306	22313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012471	TTGG	2	8	22489	22496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012471	AATC	2	8	22498	22505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012471	ATAG	2	8	23624	23631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012471	GCGT	2	8	24293	24300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012471	ATTG	2	8	27489	27496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012471	ATAG	2	8	28589	28596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012471	TAAA	2	8	31072	31079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012471	AAAG	2	8	31126	31133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012471	AAAT	2	8	31916	31923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012471	ATCA	2	8	40930	40937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012471	AAGA	2	8	42239	42246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012471	AGGC	2	8	42413	42420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012471	TAAT	2	8	42426	42433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012471	CTTT	2	8	42520	42527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012471	TTAT	2	8	42537	42544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012471	ATAG	2	8	46163	46170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012471	TTAA	2	8	48015	48022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012471	GAAA	2	8	48038	48045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012471	TTGC	2	8	48431	48438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012471	AACA	2	8	48508	48515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012471	GAAT	2	8	48589	48596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012471	ATTG	2	8	53390	53397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012471	CAAA	2	8	56509	56516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012471	AATT	2	8	58982	58989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012471	ATTT	2	8	59600	59607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012471	TTAT	2	8	62099	62106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012471	ATTG	2	8	62193	62200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012471	GTGG	2	8	62315	62322	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012471	TTTA	2	8	65030	65037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012471	TGAG	2	8	68684	68691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012471	AAAC	2	8	74132	74139	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012471	GCTT	2	8	76059	76066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012471	CAAA	2	8	76068	76075	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012471	GCTT	2	8	76890	76897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012471	TAGC	2	8	84207	84214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012471	TAAC	2	8	84717	84724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012471	ATTA	2	8	86294	86301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012471	TAAA	2	8	87314	87321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012471	GTGA	2	8	88034	88041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012471	TAAC	2	8	88117	88124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012471	AGCG	2	8	88205	88212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012471	TGGT	2	8	88870	88877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012471	AGCC	2	8	89087	89094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012471	GTAA	2	8	89862	89869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012471	GAAG	2	8	89944	89951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012471	ATTC	2	8	90882	90889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012471	CTAA	2	8	91237	91244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012471	CTGA	2	8	91510	91517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012471	TAGG	2	8	91892	91899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012471	TTGG	2	8	92075	92082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012471	AATC	2	8	92084	92091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012471	GCGT	2	8	93294	93301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012471	GATT	2	8	97233	97240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	TGCT	2	8	98221	98228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012471	TATT	2	8	98345	98352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012471	CTGT	2	8	101327	101334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012471	AGAA	2	8	105074	105081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012471	AGCA	2	8	112692	112699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012471	TGTA	2	8	112838	112845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012471	TTGT	2	8	113084	113091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012471	AATT	2	8	113709	113716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012471	CAGG	2	8	113832	113839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012471	ATTA	2	8	113873	113880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012471	GAAA	2	8	113969	113976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012471	GTGG	2	8	114022	114029	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	TCTT	2	8	115308	115315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012471	CTAT	2	8	123703	123710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012471	TCCA	2	8	123907	123914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012471	CATT	2	8	126633	126640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012471	GAAT	2	8	129324	129331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012471	TGAT	2	8	134959	134966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012471	CTAT	2	8	135215	135222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012471	CTTA	2	8	138585	138592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012471	ATGC	2	8	139642	139649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012471	CTAA	2	8	147161	147168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012471	TAAA	2	8	147182	147189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012471	AACA	2	8	147211	147218	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012471	CGAG	2	8	150123	150130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012471	TAGA	2	8	150297	150304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012471	AAGA	2	8	150497	150504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012471	CTTA	2	8	181900	181907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012471	CAGA	2	8	185860	185867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012471	TTGT	2	8	186402	186409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012471	AGAC	2	8	186988	186995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012471	TCAA	2	8	189573	189580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012471	TACC	2	8	189581	189588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012471	GACA	2	8	191194	191201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012471	ATAA	2	8	195471	195478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012471	TATC	2	8	196241	196248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012471	CAGG	2	8	196702	196709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012471	CTAT	2	8	200403	200410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012471	CTTT	2	8	200505	200512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012471	GATT	2	8	200616	200623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012471	AAGG	2	8	200895	200902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012471	TGTC	2	8	203901	203908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012471	GCTT	2	8	205780	205787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012471	GAAA	2	8	205837	205844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012471	ATTG	2	8	210196	210203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	CAAC	2	8	210282	210289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012471	TGGC	2	8	210552	210559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012471	AAAC	2	8	212689	212696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012471	ACTT	2	8	212875	212882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012471	AGCC	2	8	213534	213541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012471	AGCA	2	8	213796	213803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012471	TGCA	2	8	214125	214132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012471	TTGC	2	8	214185	214192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012471	CCTT	2	8	216779	216786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012471	AAAG	2	8	217650	217657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012471	GGTA	2	8	219760	219767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012471	TTGA	2	8	219896	219903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012471	AATG	2	8	220129	220136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012471	AGTA	2	8	220359	220366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012471	AAAC	2	8	220444	220451	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012471	ATTG	2	8	220505	220512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012471	AGCT	2	8	220629	220636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012471	TTCA	2	8	222276	222283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012471	TCGT	2	8	225823	225830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012471	CGCT	2	8	232329	232336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012471	CTTC	2	8	232629	232636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012471	ACTC	2	8	236667	236674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012471	TAAT	2	8	238804	238811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012471	TGGT	2	8	238856	238863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012471	AAGC	2	8	242914	242921	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012471	CTTT	2	8	244119	244126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012471	CTTA	2	8	247602	247609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012471	GAAG	2	8	250415	250422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012471	TGTC	2	8	251795	251802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012471	ATCT	2	8	254251	254258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012471	TGCT	2	8	254289	254296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012471	AACC	2	8	259613	259620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012471	CAAG	2	8	260257	260264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012471	TGGC	2	8	260269	260276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012471	ATGG	2	8	260685	260692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012471	GATA	2	8	260889	260896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012471	CAGT	2	8	261948	261955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012471	AGAT	2	8	262322	262329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012471	ATCA	2	8	262490	262497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012471	ATTT	2	8	263927	263934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012471	TTAT	2	8	264729	264736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012471	ATTA	2	8	264757	264764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012471	CAAG	2	8	266973	266980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012471	CTGC	2	8	266995	267002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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166	NC_012471	AAAT	2	8	286217	286224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_012471	TGAT	2	8	290174	290181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_012471	GCTG	2	8	298293	298300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_012471	TGCT	2	8	779767	779774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_012471	ATAG	2	8	781051	781058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012471	TTTA	2	8	783550	783557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_012471	TATT	2	8	799480	799487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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