MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 5467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012471	ATT	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012471	TCT	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012471	GCT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012471	ATT	2	6	14238	14243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012471	ATT	2	6	16230	16235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012471	GAC	2	6	17947	17952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012471	GGC	2	6	18071	18076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012471	GAT	2	6	18106	18111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012471	CGA	2	6	18321	18326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012471	GCA	2	6	18395	18400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012471	CGC	2	6	18442	18447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012471	TGT	2	6	18481	18486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012471	AGA	2	6	18490	18495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012471	CAT	2	6	18518	18523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012471	CAG	2	6	18564	18569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012471	GGA	2	6	18754	18759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012471	GAA	2	6	19018	19023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012471	AAG	2	6	19064	19069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012471	GGT	2	6	19092	19097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012471	GTC	2	6	19106	19111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012471	CAT	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012471	TAA	2	6	19209	19214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012471	GGA	2	6	19218	19223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012471	ATC	2	6	19242	19247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012471	CGC	2	6	19408	19413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012471	CAC	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012471	GAT	2	6	19524	19529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012471	CCT	2	6	19580	19585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012471	AGG	2	6	19849	19854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012471	TCG	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012471	CAA	2	6	20049	20054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012471	GAA	2	6	20236	20241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012471	ACG	2	6	20253	20258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012471	GCG	2	6	20429	20434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012471	AGG	2	6	20446	20451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012471	GAC	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012471	AGA	2	6	20512	20517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012471	TCG	2	6	20615	20620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012471	GGA	2	6	20628	20633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012471	AAG	2	6	20748	20753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012471	GGA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012471	ACC	2	6	21209	21214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012471	AGC	2	6	21289	21294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012471	ACA	2	6	21596	21601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012471	GAC	2	6	21663	21668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012471	GAT	2	6	21999	22004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012471	CGG	2	6	22090	22095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012471	TAC	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012471	CCT	2	6	22448	22453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012471	GGT	2	6	22584	22589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012471	TCG	2	6	22699	22704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012471	CGT	2	6	22779	22784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012471	CTC	2	6	22957	22962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012471	GTG	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012471	AGT	2	6	23220	23225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012471	AGT	2	6	23245	23250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012471	ACC	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012471	CGT	2	6	23777	23782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012471	CTC	2	6	23954	23959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012471	CGC	2	6	24125	24130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012471	TGG	2	6	24230	24235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012471	TCC	2	6	24317	24322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012471	TCG	2	6	24359	24364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012471	CGG	2	6	24480	24485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012471	TGT	2	6	24550	24555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012471	GGT	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012471	GGT	2	6	24660	24665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012471	CAT	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012471	GTA	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012471	TAT	2	6	28626	28631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012471	CTT	2	6	28709	28714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012471	GTT	2	6	28724	28729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012471	ATT	2	6	28826	28831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012471	TGT	2	6	31870	31875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012471	GCT	2	6	31941	31946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012471	GCT	2	6	35807	35812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012471	ATT	2	6	35813	35818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012471	AGG	2	6	37397	37402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012471	TAA	2	6	38996	39001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012471	AGC	2	6	39035	39040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012471	TGG	2	6	39049	39054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012471	AGA	2	6	39067	39072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012471	TGA	2	6	39079	39084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012471	TTA	2	6	40740	40745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012471	TGG	2	6	40824	40829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012471	GCT	2	6	40997	41002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012471	CCT	2	6	42217	42222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012471	AAT	2	6	42437	42442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012471	CAG	2	6	42456	42461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012471	ATG	2	6	42479	42484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012471	ATG	2	6	43896	43901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012471	TTA	2	6	43910	43915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012471	TGG	2	6	44031	44036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012471	ATG	2	6	45953	45958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012471	TGT	2	6	45966	45971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012471	GTG	2	6	46106	46111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012471	CAT	2	6	46198	46203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012471	ATT	2	6	46295	46300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012471	GAA	2	6	47770	47775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012471	GAA	2	6	47862	47867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012471	CTT	2	6	47956	47961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012471	TTA	2	6	47984	47989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012471	TAA	2	6	48009	48014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012471	GGT	2	6	48213	48218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012471	ATT	2	6	48388	48393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012471	GAA	2	6	48411	48416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012471	TGG	2	6	48424	48429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012471	TTA	2	6	48456	48461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012471	TTA	2	6	48489	48494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012471	ATT	2	6	48677	48682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012471	GAA	2	6	48848	48853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012471	AAT	2	6	49010	49015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012471	AAT	2	6	49035	49040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012471	GCT	2	6	49096	49101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012471	TGG	2	6	49144	49149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012471	ATC	2	6	49168	49173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012471	AAC	2	6	53094	53099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012471	TAA	2	6	53114	53119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012471	ATG	2	6	53156	53161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012471	ATT	2	6	53224	53229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012471	AAT	2	6	53275	53280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012471	ATT	2	6	53334	53339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012471	CCA	2	6	53351	53356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012471	ATA	2	6	53451	53456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012471	GCT	2	6	56176	56181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012471	GAA	2	6	56404	56409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012471	TGA	2	6	56430	56435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012471	TAA	2	6	56447	56452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012471	ATG	2	6	56476	56481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012471	AAT	2	6	56523	56528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012471	TTA	2	6	56560	56565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012471	ACA	2	6	57724	57729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012471	CAG	2	6	58934	58939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012471	ATG	2	6	58962	58967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012471	TTA	2	6	59063	59068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012471	CTC	2	6	59198	59203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012471	AGT	2	6	59255	59260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012471	AGA	2	6	59338	59343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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