MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012470	TTACGT	2	12	20627	20638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012470	ACTAAT	2	12	22879	22890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012470	GCAAAG	2	12	71127	71138	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012470	AAAACA	2	12	75787	75798	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012470	TAAGGT	2	12	79769	79780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012470	TTACGT	2	12	86224	86235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012470	ACTAAT	2	12	88476	88487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012470	TTCGGG	2	12	89405	89416	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012470	AAAAAG	2	12	104390	104401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012470	AAGATA	2	12	122852	122863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012470	TTTAAT	2	12	140712	140723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012470	GAAAAA	2	12	148888	148899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012470	ATAAAA	2	12	161118	161129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012470	CTCTTT	2	12	171457	171468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012470	CAAAAG	2	12	194016	194027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012470	AAAAAG	2	12	235420	235431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012470	AAGAGC	2	12	270612	270623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012470	TTACGT	2	12	289255	289266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012470	ACTAAT	2	12	291507	291518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012470	TAAAAA	2	12	302648	302659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012470	TTACGT	2	12	340714	340725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012470	ACTAAT	2	12	342966	342977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012470	GGAATG	2	12	393846	393857	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012470	GGAATG	2	12	394467	394478	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012470	AAAAGA	2	12	397113	397124	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012470	TTACCT	2	12	420764	420775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012470	ATCAAG	2	12	431381	431392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012470	TTTTTA	2	12	461325	461336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012470	TTACGT	2	12	483497	483508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012470	ACTAAT	2	12	485749	485760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012470	TTAGTT	2	12	502695	502706	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012470	CTCAAA	2	12	547324	547335	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012470	CTTTTT	2	12	583304	583315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012470	CTTGTA	2	12	596875	596886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012470	ATTAGG	2	12	627594	627605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012470	TTGCAC	2	12	646002	646013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012470	TGATGG	2	12	647348	647359	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012470	GAATTA	2	12	702030	702041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012470	ATTTTA	2	12	723189	723200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012470	GCTTGT	2	12	740421	740432	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012470	ATTGAG	2	12	754100	754111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012470	GGCTTG	2	12	792791	792802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012470	CTTTTT	2	12	831807	831818	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012470	GTATTG	2	12	837386	837397	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012470	GATAAG	2	12	860178	860189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012470	TTTAAA	2	12	866607	866618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012470	ATTTTT	2	12	872121	872132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012470	CAAGAA	2	12	874709	874720	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012470	TAATTT	2	12	877485	877496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012470	GAAGCT	2	12	897385	897396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012470	ATTCCG	2	12	898184	898195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012470	AGAAAA	2	12	902177	902188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012470	ATACAA	2	12	942062	942073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012470	TTGAAT	2	12	966335	966346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012470	AAATAG	2	12	988388	988399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012470	ACTGAG	2	12	996485	996496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012470	TTGGGC	2	12	1009140	1009151	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012470	ATTAAA	2	12	1025370	1025381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012470	ATGTTG	2	12	1056259	1056270	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012470	ATTGAA	2	12	1056978	1056989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012470	CAACTC	2	12	1112007	1112018	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012470	ATTTTT	2	12	1112326	1112337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012470	ATTCCT	2	12	1156038	1156049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012470	AAGCTT	2	12	1159802	1159813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012470	CTATTC	2	12	1167904	1167915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012470	ATCACC	2	12	1179969	1179980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012470	TTCATG	2	12	1246940	1246951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012470	ACGTCT	2	12	1255281	1255292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012470	GTAACA	2	12	1358725	1358736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012470	TGCCTA	2	12	1363378	1363389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012470	TGATTC	2	12	1381703	1381714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012470	CCCTTA	2	12	1390186	1390197	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012470	GTTAAT	2	12	1396559	1396570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012470	TTTTAT	2	12	1396663	1396674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012470	TATTTC	2	12	1400868	1400879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012470	ATCTCC	2	12	1403910	1403921	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012470	AAAGAA	2	12	1404414	1404425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012470	ACTTTC	2	12	1405247	1405258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012470	CATTGA	2	12	1406301	1406312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012470	CCTACA	2	12	1407833	1407844	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012470	ATTTTC	2	12	1411177	1411188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012470	TATCAT	2	12	1411449	1411460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012470	TATCAA	2	12	1439570	1439581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012470	TCAAAT	2	12	1443116	1443127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012470	TCTCCC	2	12	1444233	1444244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012470	CATAAA	2	12	1478480	1478491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012470	TCAATG	2	12	1492362	1492373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012470	CCAAAA	2	12	1511240	1511251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012470	CTTAAT	2	12	1517941	1517952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012470	TTCCTT	2	12	1546279	1546290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012470	AAAAAG	2	12	1571143	1571154	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012470	TAAAAA	2	12	1586285	1586296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012470	TAAAAG	2	12	1586322	1586333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012470	ATGTTT	2	12	1593268	1593279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012470	TTAACC	2	12	1616438	1616449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012470	AGCTAA	2	12	1659192	1659203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012470	CACCTA	2	12	1687940	1687951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012470	GCACTG	2	12	1705438	1705449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012470	ATGTGT	2	12	1774513	1774524	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012470	AACCTC	2	12	1833394	1833405	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012470	TATCTG	2	12	1838717	1838728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012470	TAACCC	2	12	1847669	1847680	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012470	TTTTTC	2	12	1866827	1866838	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012470	AGCACA	2	12	1884810	1884821	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012470	CTTTTT	2	12	1939544	1939555	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012470	ATTAAC	2	12	1950019	1950030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012470	CTAAGC	2	12	1983235	1983246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012470	CATAGC	2	12	1983861	1983872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012470	TGAAAC	2	12	1984850	1984861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012470	AATGGC	2	12	1990058	1990069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012470	TCATTC	2	12	1994948	1994959	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012470	TAAAAA	2	12	1996564	1996575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012470	TGACAT	2	12	2041457	2041468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012470	TTTATT	2	12	2077768	2077779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012470	GTTTTG	2	12	2088979	2088990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012470	GAAAAA	2	12	2101323	2101334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012470	AATCAC	2	12	2145934	2145945	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012470	GCTCTT	2	12	2148787	2148798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.