MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 1703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012470	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225867620
2	NC_012470	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225867622
3	NC_012470	TTAGC	2	10	5691	5700	20 %	40 %	20 %	20 %	225867624
4	NC_012470	CAAAG	2	10	7026	7035	60 %	0 %	20 %	20 %	225867624
5	NC_012470	GCTTC	2	10	8630	8639	0 %	40 %	20 %	40 %	225867624
6	NC_012470	TTTTA	2	10	9756	9765	20 %	80 %	0 %	0 %	225867625
7	NC_012470	TGCTG	2	10	10064	10073	0 %	40 %	40 %	20 %	225867625
8	NC_012470	TTATC	2	10	12317	12326	20 %	60 %	0 %	20 %	225867629
9	NC_012470	TGACT	2	10	13385	13394	20 %	40 %	20 %	20 %	225867630
10	NC_012470	GATTA	2	10	14153	14162	40 %	40 %	20 %	0 %	225867631
11	NC_012470	GTATG	2	10	15864	15873	20 %	40 %	40 %	0 %	225867632
12	NC_012470	GATTT	2	10	16449	16458	20 %	60 %	20 %	0 %	225867633
13	NC_012470	GTATT	2	10	17146	17155	20 %	60 %	20 %	0 %	225867633
14	NC_012470	TCGTG	2	10	19117	19126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012470	CGGTT	2	10	19737	19746	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012470	GTTAA	2	10	20011	20020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012470	GGGAG	2	10	20530	20539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012470	AGGGA	2	10	22738	22747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012470	TAAGT	2	10	22990	22999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012470	GCTTA	2	10	23103	23112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012470	GCATA	2	10	23699	23708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012470	CTTTT	2	10	25513	25522	0 %	80 %	0 %	20 %	225867635
23	NC_012470	CTTGC	2	10	25722	25731	0 %	40 %	20 %	40 %	225867635
24	NC_012470	TTTTG	2	10	25939	25948	0 %	80 %	20 %	0 %	225867635
25	NC_012470	AATCA	2	10	26613	26622	60 %	20 %	0 %	20 %	225867636
26	NC_012470	TTGAT	2	10	30446	30455	20 %	60 %	20 %	0 %	225867639
27	NC_012470	TTTAT	2	10	32282	32291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012470	GCTTG	2	10	35578	35587	0 %	40 %	40 %	20 %	225867643
29	NC_012470	CAGCT	2	10	35940	35949	20 %	20 %	20 %	40 %	225867643
30	NC_012470	ATCTG	2	10	37303	37312	20 %	40 %	20 %	20 %	225867644
31	NC_012470	AAATG	2	10	38029	38038	60 %	20 %	20 %	0 %	225867644
32	NC_012470	ACAAG	2	10	40907	40916	60 %	0 %	20 %	20 %	225867647
33	NC_012470	AAGCA	2	10	40961	40970	60 %	0 %	20 %	20 %	225867647
34	NC_012470	GTGGA	2	10	42435	42444	20 %	20 %	60 %	0 %	225867648
35	NC_012470	AGCAG	2	10	46440	46449	40 %	0 %	40 %	20 %	225867651
36	NC_012470	TAGCC	2	10	48966	48975	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012470	TGAGG	2	10	51463	51472	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012470	CTTGT	2	10	52700	52709	0 %	60 %	20 %	20 %	225867658
39	NC_012470	TTGGT	2	10	52919	52928	0 %	60 %	40 %	0 %	225867658
40	NC_012470	CTTTC	2	10	53083	53092	0 %	60 %	0 %	40 %	225867658
41	NC_012470	TTTTC	2	10	53469	53478	0 %	80 %	0 %	20 %	225867658
42	NC_012470	ATCCA	2	10	53885	53894	40 %	20 %	0 %	40 %	225867658
43	NC_012470	TGGTA	2	10	54140	54149	20 %	40 %	40 %	0 %	225867658
44	NC_012470	ATGGT	2	10	55423	55432	20 %	40 %	40 %	0 %	225867659
45	NC_012470	ATTCA	2	10	56107	56116	40 %	40 %	0 %	20 %	225867659
46	NC_012470	TACAA	2	10	58970	58979	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012470	AACCA	2	10	59053	59062	60 %	0 %	0 %	40 %	225867661
48	NC_012470	TGCCA	2	10	60299	60308	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012470	AAGCT	2	10	63479	63488	40 %	20 %	20 %	20 %	225867663
50	NC_012470	GAAAA	2	10	67275	67284	80 %	0 %	20 %	0 %	225867669
51	NC_012470	TTTGG	2	10	67689	67698	0 %	60 %	40 %	0 %	225867670
52	NC_012470	TTCAC	2	10	68045	68054	20 %	40 %	0 %	40 %	225867671
53	NC_012470	TGAAA	2	10	69125	69134	60 %	20 %	20 %	0 %	225867673
54	NC_012470	AAGGA	2	10	70213	70222	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012470	AAATA	2	10	74438	74447	80 %	20 %	0 %	0 %	225867685
56	NC_012470	TTCCT	2	10	74542	74551	0 %	60 %	0 %	40 %	225867685
57	NC_012470	TCCAA	2	10	75119	75128	40 %	20 %	0 %	40 %	225867685
58	NC_012470	AGAAT	2	10	75689	75698	60 %	20 %	20 %	0 %	225867685
59	NC_012470	ACTAG	2	10	76530	76539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012470	GTTTC	2	10	77774	77783	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012470	TAGAT	2	10	79598	79607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012470	CGATT	2	10	81864	81873	20 %	40 %	20 %	20 %	225867693
63	NC_012470	TCGTG	2	10	84714	84723	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012470	CGGTT	2	10	85334	85343	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012470	GTTAA	2	10	85608	85617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012470	GGGAG	2	10	86127	86136	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012470	AGGGA	2	10	88335	88344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012470	TAAGT	2	10	88587	88596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012470	GCTTA	2	10	88700	88709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012470	AGTTT	2	10	89678	89687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012470	AAAAG	2	10	89793	89802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012470	TCTTT	2	10	89822	89831	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012470	ATTCT	2	10	90502	90511	20 %	60 %	0 %	20 %	225867696
74	NC_012470	CAACC	2	10	90719	90728	40 %	0 %	0 %	60 %	225867696
75	NC_012470	CTAAA	2	10	91625	91634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012470	GAAAA	2	10	93122	93131	80 %	0 %	20 %	0 %	225867697
77	NC_012470	GATAA	2	10	93255	93264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012470	GGTCT	2	10	93312	93321	0 %	40 %	40 %	20 %	225867698
79	NC_012470	AAGGA	2	10	94329	94338	60 %	0 %	40 %	0 %	225867698
80	NC_012470	TGTTT	2	10	98449	98458	0 %	80 %	20 %	0 %	225867703
81	NC_012470	GCTGG	2	10	103021	103030	0 %	20 %	60 %	20 %	225867706
82	NC_012470	CTTTT	2	10	103629	103638	0 %	80 %	0 %	20 %	225867706
83	NC_012470	CTTTC	2	10	103895	103904	0 %	60 %	0 %	40 %	225867706
84	NC_012470	TTCCT	2	10	106301	106310	0 %	60 %	0 %	40 %	225867707
85	NC_012470	GACTA	2	10	108007	108016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012470	ATTGA	2	10	111944	111953	40 %	40 %	20 %	0 %	225867709
87	NC_012470	TAAGG	2	10	113952	113961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012470	TTTGG	2	10	114017	114026	0 %	60 %	40 %	0 %	225867711
89	NC_012470	AACAC	2	10	115401	115410	60 %	0 %	0 %	40 %	225867711
90	NC_012470	ATCAA	2	10	118519	118528	60 %	20 %	0 %	20 %	225867714
91	NC_012470	ACAAA	2	10	119568	119577	80 %	0 %	0 %	20 %	225867717
92	NC_012470	TTTCA	2	10	120470	120479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012470	TGATA	2	10	120489	120498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012470	AATCG	2	10	121342	121351	40 %	20 %	20 %	20 %	225867720
95	NC_012470	TGATT	2	10	121723	121732	20 %	60 %	20 %	0 %	225867721
96	NC_012470	TCACT	2	10	123606	123615	20 %	40 %	0 %	40 %	225867722
97	NC_012470	TTTAT	2	10	124885	124894	20 %	80 %	0 %	0 %	225867723
98	NC_012470	ATCAG	2	10	125163	125172	40 %	20 %	20 %	20 %	225867723
99	NC_012470	TGATT	2	10	125562	125571	20 %	60 %	20 %	0 %	225867723
100	NC_012470	ACGAT	2	10	125578	125587	40 %	20 %	20 %	20 %	225867723
101	NC_012470	GCTTT	2	10	125762	125771	0 %	60 %	20 %	20 %	225867723
102	NC_012470	GCCTT	2	10	127197	127206	0 %	40 %	20 %	40 %	225867725
103	NC_012470	ACATC	2	10	133621	133630	40 %	20 %	0 %	40 %	225867730
104	NC_012470	TTTCC	2	10	136656	136665	0 %	60 %	0 %	40 %	225867732
105	NC_012470	CATGT	2	10	136675	136684	20 %	40 %	20 %	20 %	225867732
106	NC_012470	GATTC	2	10	137981	137990	20 %	40 %	20 %	20 %	225867734
107	NC_012470	GCTTG	2	10	139290	139299	0 %	40 %	40 %	20 %	225867735
108	NC_012470	TTAAG	2	10	140604	140613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012470	CTTTT	2	10	142789	142798	0 %	80 %	0 %	20 %	225867737
110	NC_012470	ATGCT	2	10	143662	143671	20 %	40 %	20 %	20 %	225867738
111	NC_012470	TCTTT	2	10	145078	145087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012470	TTGAA	2	10	146478	146487	40 %	40 %	20 %	0 %	225867742
113	NC_012470	GCTTT	2	10	147370	147379	0 %	60 %	20 %	20 %	225867743
114	NC_012470	AGGTA	2	10	147764	147773	40 %	20 %	40 %	0 %	225867743
115	NC_012470	CTTGA	2	10	148076	148085	20 %	40 %	20 %	20 %	225867743
116	NC_012470	TGGAG	2	10	153601	153610	20 %	20 %	60 %	0 %	225867746
117	NC_012470	AAGAT	2	10	155025	155034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012470	AAAAT	2	10	157018	157027	80 %	20 %	0 %	0 %	225867750
119	NC_012470	AAAGG	2	10	157509	157518	60 %	0 %	40 %	0 %	225867751
120	NC_012470	GAGCA	2	10	158104	158113	40 %	0 %	40 %	20 %	225867751
121	NC_012470	CAGCT	2	10	158673	158682	20 %	20 %	20 %	40 %	225867751
122	NC_012470	CAAGC	2	10	158791	158800	40 %	0 %	20 %	40 %	225867751
123	NC_012470	CAGCT	2	10	160351	160360	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012470	GTGTT	2	10	162075	162084	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012470	ATTAT	2	10	162211	162220	40 %	60 %	0 %	0 %	225867755
126	NC_012470	CTTGT	2	10	162902	162911	0 %	60 %	20 %	20 %	225867755
127	NC_012470	GTATT	2	10	163053	163062	20 %	60 %	20 %	0 %	225867755
128	NC_012470	GCAAA	2	10	164903	164912	60 %	0 %	20 %	20 %	225867756
129	NC_012470	AGATC	2	10	165239	165248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012470	TGCAA	2	10	165476	165485	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012470	AGACT	2	10	165615	165624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012470	AAAGG	2	10	167982	167991	60 %	0 %	40 %	0 %	225867757
133	NC_012470	CTAAG	2	10	171387	171396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012470	TTGGA	2	10	172924	172933	20 %	40 %	40 %	0 %	225867763
135	NC_012470	CTGTG	2	10	175814	175823	0 %	40 %	40 %	20 %	225867765
136	NC_012470	TTACC	2	10	177079	177088	20 %	40 %	0 %	40 %	225867766
137	NC_012470	AAGAT	2	10	177307	177316	60 %	20 %	20 %	0 %	225867766
138	NC_012470	TTGGT	2	10	177753	177762	0 %	60 %	40 %	0 %	225867767
139	NC_012470	AAGGA	2	10	178371	178380	60 %	0 %	40 %	0 %	225867768
140	NC_012470	TTGGC	2	10	178626	178635	0 %	40 %	40 %	20 %	225867768
141	NC_012470	GGTCA	2	10	178829	178838	20 %	20 %	40 %	20 %	225867768
142	NC_012470	TGGAT	2	10	179444	179453	20 %	40 %	40 %	0 %	225867769
143	NC_012470	ATTGG	2	10	182233	182242	20 %	40 %	40 %	0 %	225867770
144	NC_012470	AATTG	2	10	183426	183435	40 %	40 %	20 %	0 %	225867770
145	NC_012470	GCTTG	2	10	184655	184664	0 %	40 %	40 %	20 %	225867771
146	NC_012470	CAATC	2	10	189894	189903	40 %	20 %	0 %	40 %	225867774
147	NC_012470	AGATA	2	10	192418	192427	60 %	20 %	20 %	0 %	225867775
148	NC_012470	CTAAA	2	10	194281	194290	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012470	ACAAA	2	10	196431	196440	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012470	GCCAT	2	10	198770	198779	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012470	GGAAA	2	10	199656	199665	60 %	0 %	40 %	0 %	225867782
152	NC_012470	GCTAG	2	10	199785	199794	20 %	20 %	40 %	20 %	225867782
153	NC_012470	AGATT	2	10	200361	200370	40 %	40 %	20 %	0 %	225867783
154	NC_012470	TATTT	2	10	200677	200686	20 %	80 %	0 %	0 %	225867783
155	NC_012470	AAGGG	2	10	201536	201545	40 %	0 %	60 %	0 %	225867784
156	NC_012470	AGCTA	2	10	202644	202653	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_012470	ATCAA	2	10	203210	203219	60 %	20 %	0 %	20 %	225867785
158	NC_012470	ATTCA	2	10	204234	204243	40 %	40 %	0 %	20 %	225867786
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160	NC_012470	TATCA	2	10	205541	205550	40 %	40 %	0 %	20 %	225867787
161	NC_012470	ACGTC	2	10	208862	208871	20 %	20 %	20 %	40 %	225867789
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164	NC_012470	GCTTA	2	10	213920	213929	20 %	40 %	20 %	20 %	225867794
165	NC_012470	TAAGC	2	10	214007	214016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_012470	CTGAC	2	10	216326	216335	20 %	20 %	20 %	40 %	225867796
167	NC_012470	TTAAC	2	10	217135	217144	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_012470	GAAAG	2	10	217573	217582	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012470	CTAAG	2	10	218143	218152	40 %	20 %	20 %	20 %	225867797
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171	NC_012470	AGCGC	2	10	220546	220555	20 %	0 %	40 %	40 %	225867799
172	NC_012470	AAGCA	2	10	220645	220654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_012470	ACAAA	2	10	220776	220785	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_012470	TACCA	2	10	223561	223570	40 %	20 %	0 %	40 %	225867801
175	NC_012470	CTGTC	2	10	223696	223705	0 %	40 %	20 %	40 %	225867801
176	NC_012470	TAAAA	2	10	226316	226325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012470	TCAGA	2	10	226558	226567	40 %	20 %	20 %	20 %	225867803
178	NC_012470	AAAAG	2	10	227106	227115	80 %	0 %	20 %	0 %	225867803
179	NC_012470	TAAGC	2	10	227280	227289	40 %	20 %	20 %	20 %	225867803
180	NC_012470	AAATA	2	10	231422	231431	80 %	20 %	0 %	0 %	225867806
181	NC_012470	TGATT	2	10	233496	233505	20 %	60 %	20 %	0 %	225867807
182	NC_012470	TTTGG	2	10	233647	233656	0 %	60 %	40 %	0 %	225867807
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187	NC_012470	GCCTT	2	10	243977	243986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_012470	TCAGG	2	10	244534	244543	20 %	20 %	40 %	20 %	225867817
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191	NC_012470	GCAGG	2	10	248637	248646	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
192	NC_012470	AAGGC	2	10	249352	249361	40 %	0 %	40 %	20 %	225867819
193	NC_012470	ATCTA	2	10	250793	250802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_012470	TGCTA	2	10	252338	252347	20 %	40 %	20 %	20 %	225867821
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198	NC_012470	CTGTC	2	10	255068	255077	0 %	40 %	20 %	40 %	225867825
199	NC_012470	CTTGA	2	10	256336	256345	20 %	40 %	20 %	20 %	225867825
200	NC_012470	GCTCT	2	10	257103	257112	0 %	40 %	20 %	40 %	225867826
201	NC_012470	AAATA	2	10	260174	260183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012470	ACAGA	2	10	260685	260694	60 %	0 %	20 %	20 %	225867830
203	NC_012470	AAAGG	2	10	263402	263411	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
204	NC_012470	AACAG	2	10	263568	263577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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220	NC_012470	CGGTT	2	10	288365	288374	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_012470	GGGAG	2	10	289158	289167	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_012470	TTTTC	2	10	292944	292953	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_012470	AATCA	2	10	322100	322109	60 %	20 %	0 %	20 %	225867881
253	NC_012470	CCTTG	2	10	322881	322890	0 %	40 %	20 %	40 %	225867881
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255	NC_012470	TTGAA	2	10	325147	325156	40 %	40 %	20 %	0 %	225867883
256	NC_012470	TGCTG	2	10	325522	325531	0 %	40 %	40 %	20 %	225867884
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258	NC_012470	CTTTG	2	10	326907	326916	0 %	60 %	20 %	20 %	225867885
259	NC_012470	AGAGA	2	10	329487	329496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012470	GAAAA	2	10	331643	331652	80 %	0 %	20 %	0 %	225867887
261	NC_012470	GTCTT	2	10	333156	333165	0 %	60 %	20 %	20 %	225867888
262	NC_012470	TTGGT	2	10	333528	333537	0 %	60 %	40 %	0 %	225867889
263	NC_012470	ATTCG	2	10	333821	333830	20 %	40 %	20 %	20 %	225867889
264	NC_012470	TTAGT	2	10	336566	336575	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012470	TGAGC	2	10	337465	337474	20 %	20 %	40 %	20 %	225867892
266	NC_012470	TCGTG	2	10	339204	339213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_012470	CGGTT	2	10	339824	339833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_012470	GTTAA	2	10	340098	340107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_012470	GGGAG	2	10	340617	340626	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
270	NC_012470	AGGGA	2	10	342825	342834	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
271	NC_012470	TAAGT	2	10	343077	343086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012470	GCTTA	2	10	343190	343199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_012470	TAAAA	2	10	344210	344219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_012470	AAAAT	2	10	510544	510553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012470	ATATG	2	10	511298	511307	40 %	40 %	20 %	0 %	225868051
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406	NC_012470	AGCTT	2	10	516256	516265	20 %	40 %	20 %	20 %	225868056
407	NC_012470	GACTG	2	10	516828	516837	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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