MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 29811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012470	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
2	NC_012470	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
3	NC_012470	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
4	NC_012470	TGA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
5	NC_012470	CAG	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
6	NC_012470	CAG	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
7	NC_012470	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
8	NC_012470	AAC	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
9	NC_012470	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867618
10	NC_012470	TGT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867618
11	NC_012470	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867618
12	NC_012470	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867618
13	NC_012470	AAC	3	9	718	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867618
14	NC_012470	AGA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867618
15	NC_012470	AGC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867618
16	NC_012470	ATA	2	6	1208	1213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867618
17	NC_012470	GGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867618
18	NC_012470	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012470	CAG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867619
20	NC_012470	TTG	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867619
21	NC_012470	GGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867619
22	NC_012470	TGC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867619
23	NC_012470	GTC	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867619
24	NC_012470	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
25	NC_012470	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
26	NC_012470	CTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867619
27	NC_012470	GTG	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867619
28	NC_012470	GAT	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867619
29	NC_012470	GTC	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867620
30	NC_012470	GAA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867620
31	NC_012470	ATT	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012470	GGT	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012470	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867621
34	NC_012470	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867621
35	NC_012470	TTA	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867621
36	NC_012470	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867621
37	NC_012470	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867621
38	NC_012470	TTG	2	6	3369	3374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867621
39	NC_012470	TCT	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012470	CAG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
41	NC_012470	GCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867622
42	NC_012470	TGT	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867622
43	NC_012470	TGA	3	9	3811	3819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
44	NC_012470	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867622
45	NC_012470	GAT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
46	NC_012470	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867622
47	NC_012470	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
48	NC_012470	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
49	NC_012470	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867622
50	NC_012470	AGA	3	9	4234	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867622
51	NC_012470	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
52	NC_012470	CAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867622
53	NC_012470	AGC	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867622
54	NC_012470	ATG	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867622
55	NC_012470	GTC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867622
56	NC_012470	GAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012470	TAA	2	6	4714	4719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012470	GCT	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012470	TAG	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
60	NC_012470	AGA	2	6	4880	4885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867623
61	NC_012470	TTG	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867623
62	NC_012470	AAT	2	6	4965	4970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867623
63	NC_012470	TTG	2	6	4978	4983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867623
64	NC_012470	TAT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
65	NC_012470	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
66	NC_012470	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
67	NC_012470	TTA	2	6	5194	5199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
68	NC_012470	GAT	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867623
69	NC_012470	TAT	2	6	5280	5285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867623
70	NC_012470	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867623
71	NC_012470	ATT	2	6	5350	5355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
72	NC_012470	AGC	3	9	5443	5451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
73	NC_012470	GTG	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867624
74	NC_012470	GAT	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
75	NC_012470	CTG	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
76	NC_012470	CAG	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
77	NC_012470	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
78	NC_012470	TGA	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
79	NC_012470	GGA	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867624
80	NC_012470	AGC	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
81	NC_012470	GGA	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867624
82	NC_012470	AAG	2	6	6129	6134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
83	NC_012470	GAT	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
84	NC_012470	TTG	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867624
85	NC_012470	GAT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
86	NC_012470	ATT	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
87	NC_012470	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867624
88	NC_012470	TGA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
89	NC_012470	TCA	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867624
90	NC_012470	CTG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
91	NC_012470	ATT	2	6	6650	6655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
92	NC_012470	TGA	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
93	NC_012470	CGT	2	6	6740	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
94	NC_012470	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
95	NC_012470	CAG	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
96	NC_012470	CAG	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
97	NC_012470	GAT	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
98	NC_012470	GAG	2	6	7148	7153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867624
99	NC_012470	TGA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
100	NC_012470	GCT	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
101	NC_012470	CAG	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
102	NC_012470	ATT	3	9	7484	7492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
103	NC_012470	TGA	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
104	NC_012470	AGC	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
105	NC_012470	CCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867624
106	NC_012470	TAT	2	6	7771	7776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
107	NC_012470	GTG	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867624
108	NC_012470	AAG	2	6	7838	7843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
109	NC_012470	ATG	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867624
110	NC_012470	CAA	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867624
111	NC_012470	TAT	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
112	NC_012470	GCT	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867624
113	NC_012470	AGC	2	6	8464	8469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867624
114	NC_012470	ATT	2	6	8658	8663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867624
115	NC_012470	AGA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867624
116	NC_012470	TCT	2	6	8846	8851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867625
117	NC_012470	TTA	2	6	8857	8862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867625
118	NC_012470	ATT	2	6	8879	8884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867625
119	NC_012470	AGC	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867625
120	NC_012470	CAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867625
121	NC_012470	TAT	2	6	8969	8974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867625
122	NC_012470	CTT	2	6	9080	9085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867625
123	NC_012470	CAG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867625
124	NC_012470	TGC	3	9	9296	9304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867625
125	NC_012470	TGC	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867625
126	NC_012470	TGC	2	6	9631	9636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867625
127	NC_012470	TTA	2	6	9787	9792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867625
128	NC_012470	TGA	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867625
129	NC_012470	TGA	2	6	9862	9867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867625
130	NC_012470	TCA	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867625
131	NC_012470	TTA	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867625
132	NC_012470	CTA	2	6	9995	10000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867625
133	NC_012470	TTG	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867625
134	NC_012470	CTG	2	6	10213	10218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867625
135	NC_012470	AAG	2	6	10399	10404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867626
136	NC_012470	TGC	2	6	10553	10558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867626
137	NC_012470	GAA	2	6	10602	10607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867626
138	NC_012470	GAA	2	6	10645	10650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867627
139	NC_012470	ATG	2	6	10723	10728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867627
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141	NC_012470	ATT	2	6	10798	10803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867627
142	NC_012470	AGC	2	6	10865	10870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867627
143	NC_012470	TGA	2	6	10878	10883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867627
144	NC_012470	ATT	2	6	10956	10961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867627
145	NC_012470	ATA	2	6	10985	10990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867628
146	NC_012470	TGA	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867628
147	NC_012470	GAA	2	6	11067	11072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867628
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150	NC_012470	TAT	2	6	11248	11253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
151	NC_012470	GAG	2	6	11284	11289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867629
152	NC_012470	GAT	2	6	11331	11336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867629
153	NC_012470	GTC	2	6	11432	11437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867629
154	NC_012470	ATT	2	6	11455	11460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
155	NC_012470	TAT	2	6	11617	11622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
156	NC_012470	ATA	2	6	11714	11719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867629
157	NC_012470	ATT	2	6	11726	11731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867629
158	NC_012470	AGC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867629
159	NC_012470	TGA	2	6	11889	11894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867629
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161	NC_012470	CTA	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867629
162	NC_012470	CTA	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867629
163	NC_012470	TCT	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867629
164	NC_012470	GCA	3	9	12136	12144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867629
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198	NC_012470	ATA	2	6	14255	14260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867632
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241	NC_012470	TAA	2	6	16412	16417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867633
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249	NC_012470	GCA	2	6	17283	17288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867633
250	NC_012470	TTG	2	6	17302	17307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867633
251	NC_012470	GTT	2	6	17451	17456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867633
252	NC_012470	TCA	2	6	17542	17547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867633
253	NC_012470	TAT	3	9	17642	17650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867633
254	NC_012470	GAC	2	6	17948	17953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_012470	GGC	2	6	18073	18078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_012470	GAT	2	6	18108	18113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012470	CGA	2	6	18323	18328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_012470	GCA	2	6	18397	18402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_012470	CGC	2	6	18444	18449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_012470	TGT	2	6	18483	18488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_012470	AGA	2	6	18492	18497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012470	CAT	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_012470	CAG	2	6	18566	18571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_012470	GGA	2	6	18756	18761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012470	GAA	2	6	19020	19025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_012470	TAA	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_012470	ATC	2	6	19244	19249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_012470	ATC	3	9	19888	19896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_012470	AGA	2	6	19943	19948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_012470	GAA	2	6	20057	20062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_012470	ACG	2	6	20074	20079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_012470	GCG	2	6	20250	20255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_012470	AGG	2	6	20267	20272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_012470	GAC	2	6	20319	20324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_012470	AGA	2	6	20333	20338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_012470	TCG	2	6	20436	20441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_012470	GGA	2	6	20449	20454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012470	AAG	2	6	20569	20574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_012470	GGA	2	6	20765	20770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_012470	GAT	2	6	21820	21825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_012470	TAC	2	6	22181	22186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_012470	GTA	2	6	29747	29752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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