MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225860013
2	NC_012469	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225860013
3	NC_012469	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225860013
4	NC_012469	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225860014
5	NC_012469	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225860015
6	NC_012469	ACCAG	2	10	3576	3585	40 %	0 %	20 %	40 %	225860016
7	NC_012469	CCTAT	2	10	4734	4743	20 %	40 %	0 %	40 %	225860018
8	NC_012469	CCTAA	2	10	6693	6702	40 %	20 %	0 %	40 %	225860023
9	NC_012469	CCGTT	2	10	6798	6807	0 %	40 %	20 %	40 %	225860023
10	NC_012469	CTATG	2	10	8746	8755	20 %	40 %	20 %	20 %	225860024
11	NC_012469	AAATC	2	10	8857	8866	60 %	20 %	0 %	20 %	225860024
12	NC_012469	TCTTT	2	10	10307	10316	0 %	80 %	0 %	20 %	225860029
13	NC_012469	CATTG	2	10	10592	10601	20 %	40 %	20 %	20 %	225860030
14	NC_012469	AAGAA	2	10	10787	10796	80 %	0 %	20 %	0 %	225860031
15	NC_012469	TTCGT	2	10	11518	11527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012469	TACCG	2	10	12007	12016	20 %	20 %	20 %	40 %	225860034
17	NC_012469	TTGTT	2	10	12071	12080	0 %	80 %	20 %	0 %	225860034
18	NC_012469	TTATT	2	10	12650	12659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012469	CTTAG	2	10	14125	14134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012469	ATTTT	2	10	16118	16127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012469	AATTA	2	10	16171	16180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012469	ATCCA	2	10	16446	16455	40 %	20 %	0 %	40 %	225860041
23	NC_012469	AAAAG	2	10	17445	17454	80 %	0 %	20 %	0 %	225860042
24	NC_012469	CTGAA	2	10	18492	18501	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012469	CTTCT	2	10	19081	19090	0 %	60 %	0 %	40 %	225860044
26	NC_012469	CTTTT	2	10	19412	19421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012469	GTTTT	2	10	20458	20467	0 %	80 %	20 %	0 %	225860046
28	NC_012469	TGAAA	2	10	23451	23460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012469	AAACA	2	10	24712	24721	80 %	0 %	0 %	20 %	225860051
30	NC_012469	TCAAT	2	10	26339	26348	40 %	40 %	0 %	20 %	225860052
31	NC_012469	TTTTC	2	10	26379	26388	0 %	80 %	0 %	20 %	225860052
32	NC_012469	TAAAT	2	10	26897	26906	60 %	40 %	0 %	0 %	225860052
33	NC_012469	ACTCT	2	10	26978	26987	20 %	40 %	0 %	40 %	225860052
34	NC_012469	AAACG	2	10	28221	28230	60 %	0 %	20 %	20 %	225860052
35	NC_012469	TTGGT	2	10	28450	28459	0 %	60 %	40 %	0 %	225860052
36	NC_012469	CAATT	2	10	28519	28528	40 %	40 %	0 %	20 %	225860052
37	NC_012469	AGGAA	2	10	29535	29544	60 %	0 %	40 %	0 %	225860055
38	NC_012469	ATTGA	2	10	30953	30962	40 %	40 %	20 %	0 %	225860057
39	NC_012469	ATTCT	2	10	33086	33095	20 %	60 %	0 %	20 %	225860059
40	NC_012469	ATGCT	2	10	34314	34323	20 %	40 %	20 %	20 %	225860059
41	NC_012469	TCGTG	2	10	36702	36711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012469	GTTAA	2	10	37423	37432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012469	GGGAG	2	10	37941	37950	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012469	AGGGA	2	10	40152	40161	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012469	TTGAA	2	10	40356	40365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012469	ATGGT	2	10	42742	42751	20 %	40 %	40 %	0 %	225860062
47	NC_012469	CTTTT	2	10	43910	43919	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012469	TATTT	2	10	47619	47628	20 %	80 %	0 %	0 %	225860068
49	NC_012469	TTTTA	2	10	47631	47640	20 %	80 %	0 %	0 %	225860068
50	NC_012469	AAAAG	2	10	49637	49646	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012469	AATCA	2	10	50943	50952	60 %	20 %	0 %	20 %	225860072
52	NC_012469	AGCAG	2	10	51614	51623	40 %	0 %	40 %	20 %	225860073
53	NC_012469	TGAAG	2	10	54817	54826	40 %	20 %	40 %	0 %	225860075
54	NC_012469	CAGAT	2	10	60977	60986	40 %	20 %	20 %	20 %	225860083
55	NC_012469	TTTAC	2	10	61679	61688	20 %	60 %	0 %	20 %	225860083
56	NC_012469	GAAAA	2	10	61792	61801	80 %	0 %	20 %	0 %	225860083
57	NC_012469	AGAGG	2	10	62541	62550	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012469	GTGAC	2	10	65310	65319	20 %	20 %	40 %	20 %	225860087
59	NC_012469	GTGAT	2	10	66300	66309	20 %	40 %	40 %	0 %	225860087
60	NC_012469	GCTTG	2	10	67294	67303	0 %	40 %	40 %	20 %	225860087
61	NC_012469	TGGCT	2	10	69120	69129	0 %	40 %	40 %	20 %	225860088
62	NC_012469	AAATG	2	10	69726	69735	60 %	20 %	20 %	0 %	225860088
63	NC_012469	AGCTA	2	10	70620	70629	40 %	20 %	20 %	20 %	225860089
64	NC_012469	CCTTG	2	10	73510	73519	0 %	40 %	20 %	40 %	225860092
65	NC_012469	TCAAA	2	10	73704	73713	60 %	20 %	0 %	20 %	225860092
66	NC_012469	AGTGG	2	10	76071	76080	20 %	20 %	60 %	0 %	225860094
67	NC_012469	GGGTG	2	10	76109	76118	0 %	20 %	80 %	0 %	225860094
68	NC_012469	CTATT	2	10	77076	77085	20 %	60 %	0 %	20 %	225860095
69	NC_012469	GAAGC	2	10	77266	77275	40 %	0 %	40 %	20 %	225860095
70	NC_012469	GCTTG	2	10	77721	77730	0 %	40 %	40 %	20 %	225860097
71	NC_012469	GCTTT	2	10	79150	79159	0 %	60 %	20 %	20 %	225860098
72	NC_012469	TCTGG	2	10	79756	79765	0 %	40 %	40 %	20 %	225860098
73	NC_012469	AGCAT	2	10	80710	80719	40 %	20 %	20 %	20 %	225860098
74	NC_012469	TACCA	2	10	81408	81417	40 %	20 %	0 %	40 %	225860098
75	NC_012469	TTCCT	2	10	82425	82434	0 %	60 %	0 %	40 %	225860098
76	NC_012469	TTATT	2	10	83006	83015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012469	TGAAA	2	10	83775	83784	60 %	20 %	20 %	0 %	225860099
78	NC_012469	GCTCG	2	10	85194	85203	0 %	20 %	40 %	40 %	225860100
79	NC_012469	TTGGT	2	10	86381	86390	0 %	60 %	40 %	0 %	225860101
80	NC_012469	CTTCA	2	10	87436	87445	20 %	40 %	0 %	40 %	225860102
81	NC_012469	AATCA	2	10	87548	87557	60 %	20 %	0 %	20 %	225860103
82	NC_012469	ATTCA	2	10	88922	88931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012469	AGCTC	2	10	89766	89775	20 %	20 %	20 %	40 %	225860105
84	NC_012469	TTATC	2	10	91444	91453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012469	GCTCC	2	10	94047	94056	0 %	20 %	20 %	60 %	225860112
86	NC_012469	GCTGT	2	10	94365	94374	0 %	40 %	40 %	20 %	225860112
87	NC_012469	TATCA	2	10	94689	94698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012469	TCTAT	2	10	95568	95577	20 %	60 %	0 %	20 %	225860114
89	NC_012469	AGAAA	2	10	96493	96502	80 %	0 %	20 %	0 %	225860114
90	NC_012469	GAAAG	2	10	96545	96554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012469	GCGGT	2	10	97786	97795	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012469	TGACT	2	10	99540	99549	20 %	40 %	20 %	20 %	225860117
93	NC_012469	ATAAA	2	10	105781	105790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012469	TAACC	2	10	105879	105888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_012469	ATTCT	2	10	106054	106063	20 %	60 %	0 %	20 %	225860123
96	NC_012469	TTACT	2	10	109871	109880	20 %	60 %	0 %	20 %	225860126
97	NC_012469	TGGGA	2	10	110525	110534	20 %	20 %	60 %	0 %	225860126
98	NC_012469	CAACC	2	10	110581	110590	40 %	0 %	0 %	60 %	225860126
99	NC_012469	TGCTT	2	10	111398	111407	0 %	60 %	20 %	20 %	225860127
100	NC_012469	TGGCT	2	10	111581	111590	0 %	40 %	40 %	20 %	225860127
101	NC_012469	GGTAT	2	10	112163	112172	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012469	CTTAG	2	10	113128	113137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012469	ATTAT	2	10	115139	115148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012469	CTATT	2	10	115155	115164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012469	TTATT	2	10	115267	115276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012469	CTCTT	2	10	117350	117359	0 %	60 %	0 %	40 %	225860133
107	NC_012469	AGATA	2	10	119605	119614	60 %	20 %	20 %	0 %	225860136
108	NC_012469	GTTTG	2	10	119772	119781	0 %	60 %	40 %	0 %	225860136
109	NC_012469	TATTT	2	10	121721	121730	20 %	80 %	0 %	0 %	225860138
110	NC_012469	AAAGC	2	10	124631	124640	60 %	0 %	20 %	20 %	225860140
111	NC_012469	GGCTT	2	10	126055	126064	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012469	CACAA	2	10	126394	126403	60 %	0 %	0 %	40 %	225860142
113	NC_012469	AAATG	2	10	127524	127533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012469	GGAAT	2	10	127880	127889	40 %	20 %	40 %	0 %	225860144
115	NC_012469	AGGAT	2	10	128445	128454	40 %	20 %	40 %	0 %	225860145
116	NC_012469	CTTTG	2	10	129754	129763	0 %	60 %	20 %	20 %	225860145
117	NC_012469	TCCTC	2	10	129880	129889	0 %	40 %	0 %	60 %	225860145
118	NC_012469	AAACT	2	10	135529	135538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012469	AAATT	2	10	136538	136547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012469	AGGAT	2	10	136569	136578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012469	GCTTT	2	10	137882	137891	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012469	TATTG	2	10	137919	137928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012469	ATTTT	2	10	138017	138026	20 %	80 %	0 %	0 %	225860156
124	NC_012469	CAAAG	2	10	143268	143277	60 %	0 %	20 %	20 %	225860162
125	NC_012469	TAAAA	2	10	143744	143753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012469	ACGCA	2	10	145615	145624	40 %	0 %	20 %	40 %	225860164
127	NC_012469	ATTAA	2	10	147410	147419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012469	CGTGG	2	10	148235	148244	0 %	20 %	60 %	20 %	225860166
129	NC_012469	GTGAA	2	10	149237	149246	40 %	20 %	40 %	0 %	225860167
130	NC_012469	GTTTG	2	10	154173	154182	0 %	60 %	40 %	0 %	225860172
131	NC_012469	ACATG	2	10	154318	154327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012469	GAAAA	2	10	154910	154919	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012469	TTGGA	2	10	155195	155204	20 %	40 %	40 %	0 %	225860175
134	NC_012469	ATGTT	2	10	165625	165634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012469	ACAAA	2	10	166139	166148	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012469	TTTTC	2	10	167551	167560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012469	GAAAT	2	10	168361	168370	60 %	20 %	20 %	0 %	225860185
138	NC_012469	TATTT	2	10	168539	168548	20 %	80 %	0 %	0 %	225860185
139	NC_012469	TTAGT	2	10	169233	169242	20 %	60 %	20 %	0 %	225860186
140	NC_012469	CTTGC	2	10	169589	169598	0 %	40 %	20 %	40 %	225860186
141	NC_012469	GGCCT	2	10	170588	170597	0 %	20 %	40 %	40 %	225860188
142	NC_012469	CTGTT	2	10	171156	171165	0 %	60 %	20 %	20 %	225860188
143	NC_012469	AGAAA	2	10	172692	172701	80 %	0 %	20 %	0 %	225860191
144	NC_012469	TATAC	2	10	174653	174662	40 %	40 %	0 %	20 %	225860192
145	NC_012469	AGATC	2	10	174958	174967	40 %	20 %	20 %	20 %	225860193
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148	NC_012469	CTAAG	2	10	183880	183889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012469	TGAAA	2	10	184082	184091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012469	TTGAG	2	10	185261	185270	20 %	40 %	40 %	0 %	225860202
151	NC_012469	ATTTC	2	10	185608	185617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012469	GCCTT	2	10	187235	187244	0 %	40 %	20 %	40 %	225860206
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176	NC_012469	ATGAT	2	10	220973	220982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012469	GTAGA	2	10	221144	221153	40 %	20 %	40 %	0 %	225860243
178	NC_012469	TTTAG	2	10	221629	221638	20 %	60 %	20 %	0 %	225860243
179	NC_012469	CTTTT	2	10	222103	222112	0 %	80 %	0 %	20 %	225860243
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199	NC_012469	TGGAT	2	10	243744	243753	20 %	40 %	40 %	0 %	225860280
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202	NC_012469	ATTCT	2	10	248971	248980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
203	NC_012469	CTATC	2	10	250193	250202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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251	NC_012469	AGAAT	2	10	309289	309298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_012469	ATTTC	2	10	309696	309705	20 %	60 %	0 %	20 %	225860336
253	NC_012469	TTGAA	2	10	310260	310269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_012469	TTTAA	2	10	314889	314898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012469	TGAAA	2	10	317411	317420	60 %	20 %	20 %	0 %	225860344
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259	NC_012469	TTTAT	2	10	317900	317909	20 %	80 %	0 %	0 %	225860345
260	NC_012469	TTTAT	2	10	317977	317986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_012469	CTTTA	2	10	320146	320155	20 %	60 %	0 %	20 %	225860347
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269	NC_012469	ATGGA	2	10	328017	328026	40 %	20 %	40 %	0 %	225860354
270	NC_012469	AAAAG	2	10	329903	329912	80 %	0 %	20 %	0 %	225860354
271	NC_012469	AGAAC	2	10	330856	330865	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_012469	GCGTT	2	10	333000	333009	0 %	40 %	40 %	20 %	225860357
273	NC_012469	GTCAC	2	10	334077	334086	20 %	20 %	20 %	40 %	225860358
274	NC_012469	GATTT	2	10	335882	335891	20 %	60 %	20 %	0 %	225860360
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280	NC_012469	ATTTG	2	10	342108	342117	20 %	60 %	20 %	0 %	225860368
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282	NC_012469	TAAGT	2	10	342603	342612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_012469	GAAGA	2	10	504268	504277	60 %	0 %	40 %	0 %	225860516
402	NC_012469	AATAA	2	10	505081	505090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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