MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 1226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225860013
2	NC_012469	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225860013
3	NC_012469	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225860013
4	NC_012469	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225860014
5	NC_012469	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225860015
6	NC_012469	ACCAG	2	10	3576	3585	40 %	0 %	20 %	40 %	225860016
7	NC_012469	CCTAT	2	10	4734	4743	20 %	40 %	0 %	40 %	225860018
8	NC_012469	CCTAA	2	10	6693	6702	40 %	20 %	0 %	40 %	225860023
9	NC_012469	CCGTT	2	10	6798	6807	0 %	40 %	20 %	40 %	225860023
10	NC_012469	CTATG	2	10	8746	8755	20 %	40 %	20 %	20 %	225860024
11	NC_012469	AAATC	2	10	8857	8866	60 %	20 %	0 %	20 %	225860024
12	NC_012469	TCTTT	2	10	10307	10316	0 %	80 %	0 %	20 %	225860029
13	NC_012469	CATTG	2	10	10592	10601	20 %	40 %	20 %	20 %	225860030
14	NC_012469	AAGAA	2	10	10787	10796	80 %	0 %	20 %	0 %	225860031
15	NC_012469	TACCG	2	10	12007	12016	20 %	20 %	20 %	40 %	225860034
16	NC_012469	TTGTT	2	10	12071	12080	0 %	80 %	20 %	0 %	225860034
17	NC_012469	ATCCA	2	10	16446	16455	40 %	20 %	0 %	40 %	225860041
18	NC_012469	AAAAG	2	10	17445	17454	80 %	0 %	20 %	0 %	225860042
19	NC_012469	CTTCT	2	10	19081	19090	0 %	60 %	0 %	40 %	225860044
20	NC_012469	GTTTT	2	10	20458	20467	0 %	80 %	20 %	0 %	225860046
21	NC_012469	AAACA	2	10	24712	24721	80 %	0 %	0 %	20 %	225860051
22	NC_012469	TCAAT	2	10	26339	26348	40 %	40 %	0 %	20 %	225860052
23	NC_012469	TTTTC	2	10	26379	26388	0 %	80 %	0 %	20 %	225860052
24	NC_012469	TAAAT	2	10	26897	26906	60 %	40 %	0 %	0 %	225860052
25	NC_012469	ACTCT	2	10	26978	26987	20 %	40 %	0 %	40 %	225860052
26	NC_012469	AAACG	2	10	28221	28230	60 %	0 %	20 %	20 %	225860052
27	NC_012469	TTGGT	2	10	28450	28459	0 %	60 %	40 %	0 %	225860052
28	NC_012469	CAATT	2	10	28519	28528	40 %	40 %	0 %	20 %	225860052
29	NC_012469	AGGAA	2	10	29535	29544	60 %	0 %	40 %	0 %	225860055
30	NC_012469	ATTGA	2	10	30953	30962	40 %	40 %	20 %	0 %	225860057
31	NC_012469	ATTCT	2	10	33086	33095	20 %	60 %	0 %	20 %	225860059
32	NC_012469	ATGCT	2	10	34314	34323	20 %	40 %	20 %	20 %	225860059
33	NC_012469	ATGGT	2	10	42742	42751	20 %	40 %	40 %	0 %	225860062
34	NC_012469	TATTT	2	10	47619	47628	20 %	80 %	0 %	0 %	225860068
35	NC_012469	TTTTA	2	10	47631	47640	20 %	80 %	0 %	0 %	225860068
36	NC_012469	AATCA	2	10	50943	50952	60 %	20 %	0 %	20 %	225860072
37	NC_012469	AGCAG	2	10	51614	51623	40 %	0 %	40 %	20 %	225860073
38	NC_012469	TGAAG	2	10	54817	54826	40 %	20 %	40 %	0 %	225860075
39	NC_012469	CAGAT	2	10	60977	60986	40 %	20 %	20 %	20 %	225860083
40	NC_012469	TTTAC	2	10	61679	61688	20 %	60 %	0 %	20 %	225860083
41	NC_012469	GAAAA	2	10	61792	61801	80 %	0 %	20 %	0 %	225860083
42	NC_012469	GTGAC	2	10	65310	65319	20 %	20 %	40 %	20 %	225860087
43	NC_012469	GTGAT	2	10	66300	66309	20 %	40 %	40 %	0 %	225860087
44	NC_012469	GCTTG	2	10	67294	67303	0 %	40 %	40 %	20 %	225860087
45	NC_012469	TGGCT	2	10	69120	69129	0 %	40 %	40 %	20 %	225860088
46	NC_012469	AAATG	2	10	69726	69735	60 %	20 %	20 %	0 %	225860088
47	NC_012469	AGCTA	2	10	70620	70629	40 %	20 %	20 %	20 %	225860089
48	NC_012469	CCTTG	2	10	73510	73519	0 %	40 %	20 %	40 %	225860092
49	NC_012469	TCAAA	2	10	73704	73713	60 %	20 %	0 %	20 %	225860092
50	NC_012469	AGTGG	2	10	76071	76080	20 %	20 %	60 %	0 %	225860094
51	NC_012469	GGGTG	2	10	76109	76118	0 %	20 %	80 %	0 %	225860094
52	NC_012469	CTATT	2	10	77076	77085	20 %	60 %	0 %	20 %	225860095
53	NC_012469	GAAGC	2	10	77266	77275	40 %	0 %	40 %	20 %	225860095
54	NC_012469	GCTTG	2	10	77721	77730	0 %	40 %	40 %	20 %	225860097
55	NC_012469	GCTTT	2	10	79150	79159	0 %	60 %	20 %	20 %	225860098
56	NC_012469	TCTGG	2	10	79756	79765	0 %	40 %	40 %	20 %	225860098
57	NC_012469	AGCAT	2	10	80710	80719	40 %	20 %	20 %	20 %	225860098
58	NC_012469	TACCA	2	10	81408	81417	40 %	20 %	0 %	40 %	225860098
59	NC_012469	TTCCT	2	10	82425	82434	0 %	60 %	0 %	40 %	225860098
60	NC_012469	TGAAA	2	10	83775	83784	60 %	20 %	20 %	0 %	225860099
61	NC_012469	GCTCG	2	10	85194	85203	0 %	20 %	40 %	40 %	225860100
62	NC_012469	TTGGT	2	10	86381	86390	0 %	60 %	40 %	0 %	225860101
63	NC_012469	CTTCA	2	10	87436	87445	20 %	40 %	0 %	40 %	225860102
64	NC_012469	AATCA	2	10	87548	87557	60 %	20 %	0 %	20 %	225860103
65	NC_012469	AGCTC	2	10	89766	89775	20 %	20 %	20 %	40 %	225860105
66	NC_012469	GCTCC	2	10	94047	94056	0 %	20 %	20 %	60 %	225860112
67	NC_012469	GCTGT	2	10	94365	94374	0 %	40 %	40 %	20 %	225860112
68	NC_012469	TCTAT	2	10	95568	95577	20 %	60 %	0 %	20 %	225860114
69	NC_012469	AGAAA	2	10	96493	96502	80 %	0 %	20 %	0 %	225860114
70	NC_012469	TGACT	2	10	99540	99549	20 %	40 %	20 %	20 %	225860117
71	NC_012469	ATTCT	2	10	106054	106063	20 %	60 %	0 %	20 %	225860123
72	NC_012469	TTACT	2	10	109871	109880	20 %	60 %	0 %	20 %	225860126
73	NC_012469	TGGGA	2	10	110525	110534	20 %	20 %	60 %	0 %	225860126
74	NC_012469	CAACC	2	10	110581	110590	40 %	0 %	0 %	60 %	225860126
75	NC_012469	TGCTT	2	10	111398	111407	0 %	60 %	20 %	20 %	225860127
76	NC_012469	TGGCT	2	10	111581	111590	0 %	40 %	40 %	20 %	225860127
77	NC_012469	CTCTT	2	10	117350	117359	0 %	60 %	0 %	40 %	225860133
78	NC_012469	AGATA	2	10	119605	119614	60 %	20 %	20 %	0 %	225860136
79	NC_012469	GTTTG	2	10	119772	119781	0 %	60 %	40 %	0 %	225860136
80	NC_012469	TATTT	2	10	121721	121730	20 %	80 %	0 %	0 %	225860138
81	NC_012469	AAAGC	2	10	124631	124640	60 %	0 %	20 %	20 %	225860140
82	NC_012469	CACAA	2	10	126394	126403	60 %	0 %	0 %	40 %	225860142
83	NC_012469	GGAAT	2	10	127880	127889	40 %	20 %	40 %	0 %	225860144
84	NC_012469	AGGAT	2	10	128445	128454	40 %	20 %	40 %	0 %	225860145
85	NC_012469	CTTTG	2	10	129754	129763	0 %	60 %	20 %	20 %	225860145
86	NC_012469	TCCTC	2	10	129880	129889	0 %	40 %	0 %	60 %	225860145
87	NC_012469	ATTTT	2	10	138017	138026	20 %	80 %	0 %	0 %	225860156
88	NC_012469	CAAAG	2	10	143268	143277	60 %	0 %	20 %	20 %	225860162
89	NC_012469	ACGCA	2	10	145615	145624	40 %	0 %	20 %	40 %	225860164
90	NC_012469	CGTGG	2	10	148235	148244	0 %	20 %	60 %	20 %	225860166
91	NC_012469	GTGAA	2	10	149237	149246	40 %	20 %	40 %	0 %	225860167
92	NC_012469	GTTTG	2	10	154173	154182	0 %	60 %	40 %	0 %	225860172
93	NC_012469	TTGGA	2	10	155195	155204	20 %	40 %	40 %	0 %	225860175
94	NC_012469	GAAAT	2	10	168361	168370	60 %	20 %	20 %	0 %	225860185
95	NC_012469	TATTT	2	10	168539	168548	20 %	80 %	0 %	0 %	225860185
96	NC_012469	TTAGT	2	10	169233	169242	20 %	60 %	20 %	0 %	225860186
97	NC_012469	CTTGC	2	10	169589	169598	0 %	40 %	20 %	40 %	225860186
98	NC_012469	GGCCT	2	10	170588	170597	0 %	20 %	40 %	40 %	225860188
99	NC_012469	CTGTT	2	10	171156	171165	0 %	60 %	20 %	20 %	225860188
100	NC_012469	AGAAA	2	10	172692	172701	80 %	0 %	20 %	0 %	225860191
101	NC_012469	TATAC	2	10	174653	174662	40 %	40 %	0 %	20 %	225860192
102	NC_012469	AGATC	2	10	174958	174967	40 %	20 %	20 %	20 %	225860193
103	NC_012469	TTTGT	2	10	176967	176976	0 %	80 %	20 %	0 %	225860195
104	NC_012469	ACTAT	2	10	180973	180982	40 %	40 %	0 %	20 %	225860198
105	NC_012469	TTGAG	2	10	185261	185270	20 %	40 %	40 %	0 %	225860202
106	NC_012469	GCCTT	2	10	187235	187244	0 %	40 %	20 %	40 %	225860206
107	NC_012469	AAGTA	2	10	190017	190026	60 %	20 %	20 %	0 %	225860208
108	NC_012469	TTGAT	2	10	191176	191185	20 %	60 %	20 %	0 %	225860209
109	NC_012469	TCACT	2	10	191551	191560	20 %	40 %	0 %	40 %	225860210
110	NC_012469	ATTTT	2	10	191874	191883	20 %	80 %	0 %	0 %	225860210
111	NC_012469	TTAAG	2	10	192226	192235	40 %	40 %	20 %	0 %	225860210
112	NC_012469	TCAGG	2	10	193141	193150	20 %	20 %	40 %	20 %	225860211
113	NC_012469	GCCTT	2	10	194755	194764	0 %	40 %	20 %	40 %	225860213
114	NC_012469	AAATG	2	10	194868	194877	60 %	20 %	20 %	0 %	225860213
115	NC_012469	TTCCC	2	10	195311	195320	0 %	40 %	0 %	60 %	225860214
116	NC_012469	GCTTT	2	10	198728	198737	0 %	60 %	20 %	20 %	225860217
117	NC_012469	TTTAT	2	10	200218	200227	20 %	80 %	0 %	0 %	225860218
118	NC_012469	TGAAT	2	10	203296	203305	40 %	40 %	20 %	0 %	225860222
119	NC_012469	GCAAT	2	10	203573	203582	40 %	20 %	20 %	20 %	225860222
120	NC_012469	GATTT	2	10	204967	204976	20 %	60 %	20 %	0 %	225860227
121	NC_012469	GTTCT	2	10	210323	210332	0 %	60 %	20 %	20 %	225860232
122	NC_012469	TCTCT	2	10	211742	211751	0 %	60 %	0 %	40 %	225860233
123	NC_012469	GAAAG	2	10	213758	213767	60 %	0 %	40 %	0 %	225860233
124	NC_012469	AGTTA	2	10	215038	215047	40 %	40 %	20 %	0 %	225860235
125	NC_012469	AAATC	2	10	216270	216279	60 %	20 %	0 %	20 %	225860237
126	NC_012469	GCAGA	2	10	217937	217946	40 %	0 %	40 %	20 %	225860240
127	NC_012469	AAGGA	2	10	218199	218208	60 %	0 %	40 %	0 %	225860240
128	NC_012469	GTAGA	2	10	221144	221153	40 %	20 %	40 %	0 %	225860243
129	NC_012469	TTTAG	2	10	221629	221638	20 %	60 %	20 %	0 %	225860243
130	NC_012469	CTTTT	2	10	222103	222112	0 %	80 %	0 %	20 %	225860243
131	NC_012469	GTCTG	2	10	222580	222589	0 %	40 %	40 %	20 %	225860243
132	NC_012469	AGCAG	2	10	225781	225790	40 %	0 %	40 %	20 %	225860247
133	NC_012469	GGGAG	2	10	226120	226129	20 %	0 %	80 %	0 %	225860248
134	NC_012469	ACGAT	2	10	226294	226303	40 %	20 %	20 %	20 %	225860248
135	NC_012469	CCTTG	2	10	226722	226731	0 %	40 %	20 %	40 %	225860249
136	NC_012469	ACTTA	2	10	227062	227071	40 %	40 %	0 %	20 %	225860249
137	NC_012469	TACAC	2	10	229726	229735	40 %	20 %	0 %	40 %	225860254
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261	NC_012469	GATGT	2	10	425415	425424	20 %	40 %	40 %	0 %	225860445
262	NC_012469	GGCAA	2	10	427179	427188	40 %	0 %	40 %	20 %	225860448
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264	NC_012469	TATCT	2	10	430881	430890	20 %	60 %	0 %	20 %	225860453
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