MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 1653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225857810
2	NC_012468	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225857810
3	NC_012468	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225857810
4	NC_012468	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225857811
5	NC_012468	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225857812
6	NC_012468	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012468	TGAAT	2	10	3954	3963	40 %	40 %	20 %	0 %	225857813
8	NC_012468	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	225857814
9	NC_012468	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	225857815
10	NC_012468	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	225857815
11	NC_012468	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	225857815
12	NC_012468	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	225857815
13	NC_012468	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	225857815
14	NC_012468	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	225857815
15	NC_012468	CAATT	2	10	8238	8247	40 %	40 %	0 %	20 %	225857815
16	NC_012468	AGGAA	2	10	9254	9263	60 %	0 %	40 %	0 %	225857818
17	NC_012468	ATTGA	2	10	10672	10681	40 %	40 %	20 %	0 %	225857820
18	NC_012468	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	225857822
19	NC_012468	TCGTG	2	10	17843	17852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012468	GTTAA	2	10	18564	18573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012468	GGGAG	2	10	19082	19091	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012468	AGGGA	2	10	21293	21302	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012468	ATGGT	2	10	23576	23585	20 %	40 %	40 %	0 %	225857829
24	NC_012468	CTTTT	2	10	24744	24753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012468	TAAGT	2	10	26256	26265	40 %	40 %	20 %	0 %	225857831
26	NC_012468	CCCAT	2	10	27007	27016	20 %	20 %	0 %	60 %	225857831
27	NC_012468	AATTA	2	10	27939	27948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012468	TTGCA	2	10	30743	30752	20 %	40 %	20 %	20 %	225857841
29	NC_012468	CTTAT	2	10	31325	31334	20 %	60 %	0 %	20 %	225857843
30	NC_012468	GAAGA	2	10	32840	32849	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012468	TTTAG	2	10	33679	33688	20 %	60 %	20 %	0 %	225857848
32	NC_012468	GATTG	2	10	34058	34067	20 %	40 %	40 %	0 %	225857849
33	NC_012468	GAAGA	2	10	34611	34620	60 %	0 %	40 %	0 %	225857851
34	NC_012468	ATTAC	2	10	34798	34807	40 %	40 %	0 %	20 %	225857852
35	NC_012468	TAAAT	2	10	35475	35484	60 %	40 %	0 %	0 %	225857854
36	NC_012468	AAGGA	2	10	35530	35539	60 %	0 %	40 %	0 %	225857854
37	NC_012468	ATGGT	2	10	35725	35734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012468	GAAAA	2	10	35800	35809	80 %	0 %	20 %	0 %	225857855
39	NC_012468	TCAGC	2	10	35971	35980	20 %	20 %	20 %	40 %	225857855
40	NC_012468	TCAAG	2	10	36628	36637	40 %	20 %	20 %	20 %	225857856
41	NC_012468	AGAAA	2	10	36716	36725	80 %	0 %	20 %	0 %	225857856
42	NC_012468	GCAAT	2	10	37515	37524	40 %	20 %	20 %	20 %	225857858
43	NC_012468	TATGC	2	10	37849	37858	20 %	40 %	20 %	20 %	225857859
44	NC_012468	TGACT	2	10	38970	38979	20 %	40 %	20 %	20 %	225857859
45	NC_012468	GCTAG	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	225857860
46	NC_012468	GCAAG	2	10	39138	39147	40 %	0 %	40 %	20 %	225857860
47	NC_012468	TGAAT	2	10	39379	39388	40 %	40 %	20 %	0 %	225857860
48	NC_012468	AGTCT	2	10	40733	40742	20 %	40 %	20 %	20 %	225857862
49	NC_012468	CAATC	2	10	41543	41552	40 %	20 %	0 %	40 %	225857863
50	NC_012468	GGAAA	2	10	41632	41641	60 %	0 %	40 %	0 %	225857863
51	NC_012468	GGAAT	2	10	41846	41855	40 %	20 %	40 %	0 %	225857863
52	NC_012468	TGGAG	2	10	43072	43081	20 %	20 %	60 %	0 %	225857865
53	NC_012468	AGCGG	2	10	43945	43954	20 %	0 %	60 %	20 %	225857866
54	NC_012468	AAAGC	2	10	45594	45603	60 %	0 %	20 %	20 %	225857871
55	NC_012468	GTCTT	2	10	45629	45638	0 %	60 %	20 %	20 %	225857871
56	NC_012468	GGTTT	2	10	47774	47783	0 %	60 %	40 %	0 %	225857874
57	NC_012468	AATGT	2	10	49114	49123	40 %	40 %	20 %	0 %	225857874
58	NC_012468	CCGTT	2	10	49477	49486	0 %	40 %	20 %	40 %	225857875
59	NC_012468	GGTTC	2	10	49768	49777	0 %	40 %	40 %	20 %	225857875
60	NC_012468	TCCAG	2	10	50773	50782	20 %	20 %	20 %	40 %	225857876
61	NC_012468	TTGCA	2	10	54523	54532	20 %	40 %	20 %	20 %	225857876
62	NC_012468	TTTTG	2	10	61592	61601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012468	ATTAT	2	10	61733	61742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012468	TTTTA	2	10	61871	61880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012468	TATTT	2	10	65564	65573	20 %	80 %	0 %	0 %	225857888
66	NC_012468	TTTTA	2	10	65576	65585	20 %	80 %	0 %	0 %	225857888
67	NC_012468	AATCA	2	10	68886	68895	60 %	20 %	0 %	20 %	225857893
68	NC_012468	AGCAG	2	10	69557	69566	40 %	0 %	40 %	20 %	225857894
69	NC_012468	TGAAG	2	10	72815	72824	40 %	20 %	40 %	0 %	225857896
70	NC_012468	TCATA	2	10	78065	78074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012468	AATTA	2	10	81761	81770	60 %	40 %	0 %	0 %	225857908
72	NC_012468	CAGAT	2	10	83810	83819	40 %	20 %	20 %	20 %	225857911
73	NC_012468	TTTAC	2	10	84512	84521	20 %	60 %	0 %	20 %	225857911
74	NC_012468	AGAGG	2	10	85374	85383	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012468	GTGAC	2	10	88144	88153	20 %	20 %	40 %	20 %	225857914
76	NC_012468	GTGAT	2	10	89134	89143	20 %	40 %	40 %	0 %	225857914
77	NC_012468	GCTTG	2	10	90128	90137	0 %	40 %	40 %	20 %	225857914
78	NC_012468	TGGCT	2	10	91954	91963	0 %	40 %	40 %	20 %	225857915
79	NC_012468	AAATG	2	10	92560	92569	60 %	20 %	20 %	0 %	225857915
80	NC_012468	AGCTA	2	10	93454	93463	40 %	20 %	20 %	20 %	225857916
81	NC_012468	CCTTG	2	10	96344	96353	0 %	40 %	20 %	40 %	225857919
82	NC_012468	TCAAA	2	10	96538	96547	60 %	20 %	0 %	20 %	225857919
83	NC_012468	AGTGG	2	10	98905	98914	20 %	20 %	60 %	0 %	225857922
84	NC_012468	GGGTG	2	10	98943	98952	0 %	20 %	80 %	0 %	225857922
85	NC_012468	CTATT	2	10	99910	99919	20 %	60 %	0 %	20 %	225857923
86	NC_012468	AAGCA	2	10	100101	100110	60 %	0 %	20 %	20 %	225857923
87	NC_012468	GCTTG	2	10	100555	100564	0 %	40 %	40 %	20 %	225857925
88	NC_012468	GCTTT	2	10	101984	101993	0 %	60 %	20 %	20 %	225857926
89	NC_012468	TCTGG	2	10	102590	102599	0 %	40 %	40 %	20 %	225857926
90	NC_012468	AGCAT	2	10	103544	103553	40 %	20 %	20 %	20 %	225857926
91	NC_012468	TACCA	2	10	104242	104251	40 %	20 %	0 %	40 %	225857926
92	NC_012468	TTCCT	2	10	105259	105268	0 %	60 %	0 %	40 %	225857926
93	NC_012468	TTTAT	2	10	105863	105872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012468	TTGGT	2	10	109238	109247	0 %	60 %	40 %	0 %	225857929
95	NC_012468	CTTCA	2	10	110293	110302	20 %	40 %	0 %	40 %	225857930
96	NC_012468	AATCA	2	10	110405	110414	60 %	20 %	0 %	20 %	225857931
97	NC_012468	ATTCA	2	10	111738	111747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012468	AGCTC	2	10	112582	112591	20 %	20 %	20 %	40 %	225857933
99	NC_012468	TTATC	2	10	114260	114269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012468	GCTCC	2	10	116924	116933	0 %	20 %	20 %	60 %	225857940
101	NC_012468	GCTGT	2	10	117242	117251	0 %	40 %	40 %	20 %	225857940
102	NC_012468	TATCA	2	10	117566	117575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012468	TCTAT	2	10	118400	118409	20 %	60 %	0 %	20 %	225857942
104	NC_012468	AGAAA	2	10	119325	119334	80 %	0 %	20 %	0 %	225857942
105	NC_012468	GAAAG	2	10	119377	119386	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012468	GCGGT	2	10	120618	120627	0 %	20 %	60 %	20 %	225857945
107	NC_012468	TGACT	2	10	122372	122381	20 %	40 %	20 %	20 %	225857947
108	NC_012468	AGGGC	2	10	126719	126728	20 %	0 %	60 %	20 %	225857949
109	NC_012468	ATAAA	2	10	128837	128846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012468	TAACC	2	10	128935	128944	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012468	ATTCT	2	10	129110	129119	20 %	60 %	0 %	20 %	225857953
112	NC_012468	TTACT	2	10	132879	132888	20 %	60 %	0 %	20 %	225857956
113	NC_012468	TGGGA	2	10	133533	133542	20 %	20 %	60 %	0 %	225857956
114	NC_012468	TGCTT	2	10	134253	134262	0 %	60 %	20 %	20 %	225857957
115	NC_012468	TGGCT	2	10	134436	134445	0 %	40 %	40 %	20 %	225857957
116	NC_012468	AGATA	2	10	138509	138518	60 %	20 %	20 %	0 %	225857962
117	NC_012468	GTTTG	2	10	138676	138685	0 %	60 %	40 %	0 %	225857962
118	NC_012468	TATTT	2	10	141330	141339	20 %	80 %	0 %	0 %	225857967
119	NC_012468	AAAGC	2	10	144194	144203	60 %	0 %	20 %	20 %	225857970
120	NC_012468	GGCTT	2	10	145618	145627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012468	CACAA	2	10	145957	145966	60 %	0 %	0 %	40 %	225857972
122	NC_012468	AAATG	2	10	147087	147096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012468	GGAAT	2	10	147453	147462	40 %	20 %	40 %	0 %	225857974
124	NC_012468	AGGAT	2	10	148018	148027	40 %	20 %	40 %	0 %	225857975
125	NC_012468	CTTTG	2	10	149327	149336	0 %	60 %	20 %	20 %	225857975
126	NC_012468	TCCTC	2	10	149453	149462	0 %	40 %	0 %	60 %	225857975
127	NC_012468	TGACT	2	10	150894	150903	20 %	40 %	20 %	20 %	225857977
128	NC_012468	ACAGT	2	10	157999	158008	40 %	20 %	20 %	20 %	225857981
129	NC_012468	AATAA	2	10	158743	158752	80 %	20 %	0 %	0 %	225857982
130	NC_012468	CTTTA	2	10	163075	163084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012468	TATTG	2	10	163111	163120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012468	ATTTT	2	10	163209	163218	20 %	80 %	0 %	0 %	225857989
133	NC_012468	TTGGA	2	10	163656	163665	20 %	40 %	40 %	0 %	225857989
134	NC_012468	TAAAA	2	10	168935	168944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012468	ATTAA	2	10	172335	172344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012468	CGTGG	2	10	173160	173169	0 %	20 %	60 %	20 %	225857998
137	NC_012468	GTGAA	2	10	174162	174171	40 %	20 %	40 %	0 %	225857999
138	NC_012468	GTTTG	2	10	179124	179133	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012468	GAAAA	2	10	179861	179870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_012468	TTTAT	2	10	323579	323588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_012468	CTTTT	2	10	333108	333117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_012468	ATGGA	2	10	334492	334501	40 %	20 %	40 %	0 %	225858169
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269	NC_012468	CTTTG	2	10	343937	343946	0 %	60 %	20 %	20 %	225858178
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400	NC_012468	AAGGT	2	10	510623	510632	40 %	20 %	40 %	0 %	225858339
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