MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012468	TCGTG	2	10	17843	17852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012468	GTTAA	2	10	18564	18573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012468	GGGAG	2	10	19082	19091	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012468	AGGGA	2	10	21293	21302	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012468	CTTTT	2	10	24744	24753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012468	AATTA	2	10	27939	27948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012468	GAAGA	2	10	32840	32849	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012468	ATGGT	2	10	35725	35734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012468	TTTTG	2	10	61592	61601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012468	ATTAT	2	10	61733	61742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012468	TTTTA	2	10	61871	61880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012468	TCATA	2	10	78065	78074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012468	AGAGG	2	10	85374	85383	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012468	TTTAT	2	10	105863	105872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012468	ATTCA	2	10	111738	111747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012468	TTATC	2	10	114260	114269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012468	TATCA	2	10	117566	117575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012468	GAAAG	2	10	119377	119386	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012468	ATAAA	2	10	128837	128846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012468	TAACC	2	10	128935	128944	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012468	GGCTT	2	10	145618	145627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012468	AAATG	2	10	147087	147096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012468	CTTTA	2	10	163075	163084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012468	TATTG	2	10	163111	163120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012468	TAAAA	2	10	168935	168944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012468	ATTAA	2	10	172335	172344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012468	GTTTG	2	10	179124	179133	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012468	GAAAA	2	10	179861	179870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012468	ATGTT	2	10	189175	189184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012468	ACAAA	2	10	189690	189699	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012468	TTTTC	2	10	191102	191111	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012468	GGCCT	2	10	194139	194148	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_012468	CTGTT	2	10	194706	194715	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012468	TGAAA	2	10	205923	205932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012468	ATTTC	2	10	207449	207458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012468	CCCTG	2	10	212860	212869	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_012468	ATGAT	2	10	228012	228021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012468	AAGGA	2	10	240264	240273	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012468	GTTCA	2	10	241898	241907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012468	AAAAT	2	10	245705	245714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012468	ATCGA	2	10	246453	246462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012468	TTTTA	2	10	251077	251086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012468	AAGAT	2	10	252123	252132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012468	ATACC	2	10	252593	252602	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012468	GATAG	2	10	253490	253499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012468	ATTCT	2	10	255837	255846	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012468	GATAA	2	10	256496	256505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012468	CTATC	2	10	258258	258267	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_012468	CTTTT	2	10	271219	271228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012468	CTTAA	2	10	273576	273585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012468	AAGCC	2	10	287221	287230	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012468	AATAG	2	10	288767	288776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012468	TGATA	2	10	297944	297953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012468	CTATT	2	10	316711	316720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012468	TTTAT	2	10	323579	323588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012468	TAAAG	2	10	328552	328561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012468	CTTTT	2	10	333108	333117	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012468	AAATA	2	10	348134	348143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012468	GAACT	2	10	367697	367706	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012468	CTTTT	2	10	375470	375479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012468	AAGCT	2	10	380500	380509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012468	AGTAA	2	10	380674	380683	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012468	CTATC	2	10	382638	382647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012468	ATAAA	2	10	399236	399245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012468	TTTTC	2	10	412147	412156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012468	TTAAA	2	10	413811	413820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012468	TGAAA	2	10	422608	422617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012468	TTCTG	2	10	426655	426664	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012468	ATATA	2	10	472877	472886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012468	AAATA	2	10	475210	475219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012468	AGAAA	2	10	475231	475240	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012468	TTTAT	2	10	481553	481562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012468	ATTTA	2	10	481667	481676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012468	AAGAG	2	10	493454	493463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012468	CAGGG	2	10	496782	496791	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012468	TGAAA	2	10	502114	502123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012468	CTATT	2	10	504184	504193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012468	AATAA	2	10	509441	509450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012468	CTTTT	2	10	510709	510718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012468	TAAAA	2	10	510722	510731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012468	TGTTT	2	10	513588	513597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012468	AACTA	2	10	515068	515077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012468	CTTTC	2	10	518178	518187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_012468	ATAAA	2	10	520558	520567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012468	AGCGA	2	10	523682	523691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012468	ATTCA	2	10	528229	528238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012468	TACTG	2	10	529002	529011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012468	ATATA	2	10	529019	529028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012468	TTCTT	2	10	531583	531592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012468	GATAA	2	10	534257	534266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012468	GTTTG	2	10	536479	536488	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012468	AAAAG	2	10	536846	536855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012468	ATTAT	2	10	538422	538431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012468	ATAGT	2	10	538544	538553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012468	ATTCT	2	10	539062	539071	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012468	AAAAG	2	10	540338	540347	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012468	GTATA	3	15	541280	541294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012468	CAATA	2	10	543563	543572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012468	TTTTA	2	10	555329	555338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012468	CTTTT	2	10	560263	560272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012468	TTTTA	2	10	560344	560353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012468	AGATG	2	10	568096	568105	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012468	ATAAA	2	10	568291	568300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012468	TTTTA	2	10	568443	568452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012468	AGGAA	2	10	574763	574772	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012468	ATAAA	2	10	582799	582808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012468	TGTCT	2	10	583160	583169	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012468	TTAGT	2	10	587051	587060	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012468	ATATA	2	10	594644	594653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012468	TAGTA	2	10	597873	597882	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012468	ATAAC	2	10	597939	597948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012468	CATTT	2	10	599326	599335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012468	TAAAA	2	10	607745	607754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012468	AAACA	2	10	636515	636524	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012468	ATATA	2	10	639209	639218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012468	GAAAA	2	10	677324	677333	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012468	GTTAT	2	10	677363	677372	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012468	TAAAA	2	10	679719	679728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012468	GTTTG	2	10	692829	692838	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012468	ACGAA	2	10	716984	716993	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012468	CTATC	2	10	718357	718366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012468	AGGGG	2	10	718464	718473	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012468	ATGGA	2	10	740203	740212	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012468	TTATT	2	10	742498	742507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012468	ATAAA	2	10	750094	750103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012468	GGAAA	2	10	759016	759025	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012468	TAAAA	2	10	769618	769627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012468	TAAAA	2	10	782506	782515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012468	ATTTT	2	10	783758	783767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012468	CAAGA	2	10	789807	789816	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012468	CAAAT	2	10	791936	791945	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012468	GAAAA	2	10	791980	791989	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012468	TCTGA	2	10	795495	795504	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012468	ATAAC	2	10	795987	795996	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012468	CTGAA	2	10	797693	797702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012468	ATAAA	2	10	797867	797876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012468	TTTGA	2	10	797895	797904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012468	TTTTA	2	10	800771	800780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012468	AAATA	2	10	805486	805495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012468	TATTT	2	10	820971	820980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012468	TTTTG	2	10	847571	847580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012468	TATAT	2	10	860392	860401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012468	ATCTA	2	10	866937	866946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012468	AAATC	2	10	877802	877811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012468	AGGTT	2	10	877881	877890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012468	CATTT	2	10	878038	878047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012468	AGAAC	2	10	882697	882706	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012468	ATATA	2	10	885627	885636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_012468	TAATA	2	10	892041	892050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_012468	CTTTT	2	10	912701	912710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_012468	CATCT	2	10	913070	913079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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157	NC_012468	TCTTT	2	10	921809	921818	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_012468	TAGTT	2	10	1117621	1117630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.