MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae P1031

Total Repeats: 853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012467	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855736
2	NC_012467	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855740
3	NC_012467	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225855741
4	NC_012467	TGCTTA	2	12	7714	7725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225855741
5	NC_012467	GCTAAC	2	12	7955	7966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225855741
6	NC_012467	TTGATT	2	12	8889	8900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225855743
7	NC_012467	TAAGGA	2	12	16895	16906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012467	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012467	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012467	GATAGA	2	12	20602	20613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855750
11	NC_012467	AGTTGA	2	12	21912	21923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012467	TTCTTG	2	12	25310	25321	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225855754
13	NC_012467	ACTTTT	2	12	25379	25390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225855754
14	NC_012467	TTCAGT	2	12	25901	25912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225855755
15	NC_012467	AAATAA	2	12	28271	28282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012467	ATTGAG	2	12	34735	34746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855776
17	NC_012467	GTAAAC	2	12	34880	34891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012467	AAAACA	2	12	36732	36743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012467	TCATCT	2	12	39525	39536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225855784
20	NC_012467	ATCCAG	2	12	41169	41180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225855786
21	NC_012467	TCCTGA	2	12	41773	41784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225855786
22	NC_012467	ATGGAA	2	12	46047	46058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855795
23	NC_012467	CGAAGT	2	12	46752	46763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225855796
24	NC_012467	ATTACT	2	12	49087	49098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225855796
25	NC_012467	ATTTGG	2	12	53028	53039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225855798
26	NC_012467	AGGTTG	2	12	54748	54759	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225855799
27	NC_012467	CGGTAG	2	12	56091	56102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225855800
28	NC_012467	CAGGCT	2	12	58824	58835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012467	TAAAAA	2	12	59034	59045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012467	AGGTTG	2	12	61544	61555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225855812
31	NC_012467	TTGTTT	2	12	63757	63768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225855815
32	NC_012467	CGATTG	2	12	67777	67788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855819
33	NC_012467	TTCCTT	2	12	71102	71113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855822
34	NC_012467	TAAAAA	2	12	75366	75377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012467	AGGATA	2	12	76643	76654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855831
36	NC_012467	TCAATC	2	12	77972	77983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855831
37	NC_012467	TTACTG	2	12	88355	88366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225855838
38	NC_012467	AAAAAT	2	12	91515	91526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012467	GTTTCT	2	12	98656	98667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225855846
40	NC_012467	TTCTAT	2	12	99092	99103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012467	TTCCTT	2	12	99734	99745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855847
42	NC_012467	TTGCAG	2	12	103887	103898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855851
43	NC_012467	TCCCAT	2	12	104946	104957	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012467	TCTTGC	2	12	105466	105477	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225855853
45	NC_012467	GACTTG	2	12	105870	105881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855853
46	NC_012467	TAAAAT	2	12	107323	107334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012467	ACATCA	2	12	115556	115567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225855865
48	NC_012467	GCTTGC	2	12	117660	117671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855865
49	NC_012467	TACAGG	2	12	119885	119896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225855868
50	NC_012467	AAAAAC	2	12	119986	119997	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	225855868
51	NC_012467	TAAAAA	2	12	123884	123895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012467	TTTTGA	2	12	127097	127108	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225855876
53	NC_012467	AAGCAG	2	12	127625	127636	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225855876
54	NC_012467	AAAGGA	2	12	132591	132602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855882
55	NC_012467	AGACTT	2	12	143513	143524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225855892
56	NC_012467	GCTTAT	2	12	144561	144572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012467	TTATCT	2	12	148207	148218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225855897
58	NC_012467	TTTTAT	2	12	149476	149487	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	225855900
59	NC_012467	TAACAA	2	12	149971	149982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225855900
60	NC_012467	ATAAAA	2	12	152781	152792	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225855904
61	NC_012467	CTCCAG	2	12	154155	154166	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225855905
62	NC_012467	TTTGCT	2	12	161667	161678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012467	ATAAAA	2	12	162046	162057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012467	ATAAAT	2	12	166959	166970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855918
65	NC_012467	GAAGCA	2	12	174996	175007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225855924
66	NC_012467	GTTTTA	2	12	178146	178157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225855928
67	NC_012467	TCAGGT	2	12	188313	188324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855938
68	NC_012467	ATTGAG	2	12	194793	194804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855945
69	NC_012467	TTCGGA	2	12	194923	194934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855945
70	NC_012467	AACAAG	2	12	198546	198557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225855947
71	NC_012467	GGATTG	2	12	200275	200286	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225855949
72	NC_012467	TGCACT	2	12	204040	204051	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225855954
73	NC_012467	CAATAT	2	12	205520	205531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225855955
74	NC_012467	TTCCAT	2	12	206849	206860	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225855956
75	NC_012467	ACTTGG	2	12	207108	207119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855956
76	NC_012467	ACCACG	2	12	211645	211656	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	225855962
77	NC_012467	GCAGAC	2	12	212504	212515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855963
78	NC_012467	TTTTAC	2	12	214066	214077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012467	ACAAGA	2	12	219963	219974	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225855969
80	NC_012467	CAGGAA	2	12	220167	220178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225855970
81	NC_012467	TAAAGG	2	12	222844	222855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855974
82	NC_012467	GCAATC	2	12	225432	225443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225855979
83	NC_012467	ACATCA	2	12	225979	225990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225855980
84	NC_012467	TAAAGG	2	12	230230	230241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855989
85	NC_012467	AAATTA	2	12	231269	231280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855992
86	NC_012467	ACTTGG	2	12	231336	231347	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855992
87	NC_012467	TTGAAG	2	12	234277	234288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855996
88	NC_012467	GTAAAG	2	12	234960	234971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855998
89	NC_012467	AAACTC	2	12	236335	236346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225856000
90	NC_012467	AGATAA	2	12	240437	240448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012467	CATAAT	2	12	242491	242502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012467	TATCTG	2	12	247966	247977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225856010
93	NC_012467	ACAATT	2	12	250086	250097	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225856011
94	NC_012467	CCAATC	2	12	255066	255077	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225856014
95	NC_012467	CGAAAT	2	12	256097	256108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225856014
96	NC_012467	TCTTAA	2	12	258253	258264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012467	TGTCAA	2	12	264870	264881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225856022
98	NC_012467	GATGGT	2	12	265629	265640	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225856023
99	NC_012467	TGCCTT	2	12	267281	267292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225856024
100	NC_012467	GTTGCT	2	12	271873	271884	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225856027
101	NC_012467	GGTTGC	2	12	275187	275198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012467	GCAAGA	2	12	275719	275730	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225856030
103	NC_012467	AAAATA	2	12	282937	282948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225856034
104	NC_012467	CGATAC	2	12	290813	290824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856042
105	NC_012467	TCTTTT	2	12	294586	294597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012467	CTCGGC	2	12	294819	294830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	225856047
107	NC_012467	TTTTGG	2	12	295114	295125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225856047
108	NC_012467	TAGATA	2	12	300728	300739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225856055
109	NC_012467	GATAAA	2	12	306077	306088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225856058
110	NC_012467	AAAATG	2	12	310021	310032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225856060
111	NC_012467	AGAGGA	2	12	312594	312605	50 %	0 %	50 %	0 %	225856063
112	NC_012467	ATGGAG	2	12	313027	313038	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225856064
113	NC_012467	GGACAA	2	12	313894	313905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225856065
114	NC_012467	CCATAG	2	12	317357	317368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856069
115	NC_012467	TTGATT	2	12	317800	317811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225856069
116	NC_012467	AGGAGT	2	12	319546	319557	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225856071
117	NC_012467	AGCGTG	2	12	321180	321191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225856075
118	NC_012467	AACTGT	2	12	323724	323735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225856077
119	NC_012467	GAAAAA	2	12	325839	325850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012467	CAACCT	2	12	330777	330788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225856083
121	NC_012467	ACAAGA	2	12	333078	333089	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012467	AGTTGA	2	12	334157	334168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012467	TCTATC	2	12	335201	335212	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225856087
124	NC_012467	GACCGT	2	12	336755	336766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225856088
125	NC_012467	AAAATA	2	12	341243	341254	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225856094
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129	NC_012467	GCCAAA	2	12	352901	352912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012467	GCTAAA	2	12	355666	355677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225856105
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232	NC_012467	CTAATT	2	12	602935	602946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225856341
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234	NC_012467	GGTCAA	2	12	607460	607471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225856344
235	NC_012467	CAAAGC	2	12	610624	610635	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	225856344
236	NC_012467	ACTTCT	2	12	611608	611619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
237	NC_012467	GAGATG	2	12	614064	614075	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
238	NC_012467	TGAAAA	2	12	614123	614134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_012467	GGAAAG	2	12	641664	641675	50 %	0 %	50 %	0 %	225856371
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265	NC_012467	ATTGCG	2	12	697623	697634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225856432
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331	NC_012467	ATGGGA	2	12	827569	827580	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225856560
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349	NC_012467	ATGAAA	2	12	860948	860959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225856593
350	NC_012467	AATTCC	2	12	860998	861009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225856593
351	NC_012467	TTTGGA	2	12	866233	866244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225856597
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353	NC_012467	AAAAAG	2	12	877356	877367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
354	NC_012467	ACCAAG	2	12	878219	878230	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
355	NC_012467	TGACCA	2	12	881254	881265	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856614
356	NC_012467	AATGAA	2	12	883647	883658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225856616
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363	NC_012467	TGGCTT	2	12	897810	897821	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225856633
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377	NC_012467	TCACTA	2	12	925356	925367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225856662
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388	NC_012467	GTTAAT	2	12	951239	951250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225856686
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422	NC_012467	GGAAGA	2	12	1051131	1051142	50 %	0 %	50 %	0 %	225856773
423	NC_012467	TTTGAA	2	12	1051909	1051920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225856773
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454	NC_012467	AAGAAA	2	12	1121418	1121429	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	225856836
455	NC_012467	TTCTGA	2	12	1126339	1126350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225856840
456	NC_012467	TTGTTT	2	12	1127172	1127183	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225856840
457	NC_012467	ATAGCC	2	12	1128791	1128802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856842
458	NC_012467	ACCAGC	2	12	1129096	1129107	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	225856842
459	NC_012467	GGTCGA	2	12	1133858	1133869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225856847
460	NC_012467	AATTTT	2	12	1135844	1135855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_012467	ACCAAT	2	12	1136417	1136428	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_012467	GTAATG	2	12	1138752	1138763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225856849
463	NC_012467	TTCTGC	2	12	1139614	1139625	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225856850
464	NC_012467	GTAATG	2	12	1141360	1141371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225856850
465	NC_012467	AGAGAT	2	12	1142889	1142900	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225856852
466	NC_012467	CAATCA	2	12	1143506	1143517	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225856852
467	NC_012467	TGCAAC	2	12	1143939	1143950	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856852
468	NC_012467	CATCTG	2	12	1144045	1144056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225856853
469	NC_012467	GATATG	2	12	1146801	1146812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225856855
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471	NC_012467	TTTTTG	2	12	1148312	1148323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012467	CTTTAT	2	12	1150529	1150540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225856859
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476	NC_012467	ACTTGA	2	12	1159312	1159323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225856871
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481	NC_012467	TGGATG	2	12	1178090	1178101	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225856888
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489	NC_012467	CTCCAA	2	12	1190890	1190901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225856904
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493	NC_012467	GTCCAA	2	12	1201117	1201128	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856911
494	NC_012467	ATCATG	2	12	1206787	1206798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225856915
495	NC_012467	AGAAAA	2	12	1210951	1210962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
496	NC_012467	CTGGTG	2	12	1211124	1211135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
497	NC_012467	TTGCGC	2	12	1217805	1217816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225856924
498	NC_012467	AAATTC	2	12	1220680	1220691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225856927
499	NC_012467	TGCCAA	2	12	1226801	1226812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225856933
500	NC_012467	AAGGAA	2	12	1228257	1228268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225856934

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