MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae P1031

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012467	TAAGGA	2	12	16895	16906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012467	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012467	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012467	AGTTGA	2	12	21912	21923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012467	AAATAA	2	12	28271	28282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012467	GTAAAC	2	12	34880	34891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012467	AAAACA	2	12	36732	36743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012467	CAGGCT	2	12	58824	58835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012467	TAAAAA	2	12	59034	59045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012467	TAAAAA	2	12	75366	75377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012467	AAAAAT	2	12	91515	91526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012467	TTCTAT	2	12	99092	99103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012467	TCCCAT	2	12	104946	104957	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012467	TAAAAT	2	12	107323	107334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012467	TAAAAA	2	12	123884	123895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012467	GCTTAT	2	12	144561	144572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012467	TTTGCT	2	12	161667	161678	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012467	ATAAAA	2	12	162046	162057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012467	TTTTAC	2	12	214066	214077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012467	AGATAA	2	12	240437	240448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012467	CATAAT	2	12	242491	242502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012467	TCTTAA	2	12	258253	258264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012467	GGTTGC	2	12	275187	275198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012467	TCTTTT	2	12	294586	294597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012467	GAAAAA	2	12	325839	325850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012467	ACAAGA	2	12	333078	333089	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012467	AGTTGA	2	12	334157	334168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012467	AGTTGA	2	12	348940	348951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012467	GCCAAA	2	12	352901	352912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012467	GCAGTT	2	12	371162	371173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012467	AGAAAT	2	12	418129	418140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012467	ATGAAG	2	12	428801	428812	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012467	GCTTGC	2	12	459658	459669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012467	AAATCA	2	12	484569	484580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012467	CATCCA	2	12	485482	485493	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012467	TAAAAA	2	12	504136	504147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012467	TCTATT	2	12	505787	505798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012467	TGCTTT	2	12	510495	510506	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012467	AAAACA	2	12	529742	529753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012467	GCAATT	2	12	530182	530193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012467	GAAAGA	2	12	530392	530403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012467	TCTTTT	2	12	542379	542390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012467	AAGATT	2	12	547940	547951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012467	CTGTAA	2	12	588219	588230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012467	AAAGTT	2	12	593247	593258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012467	ACTTCT	2	12	611608	611619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012467	GAGATG	2	12	614064	614075	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012467	TGAAAA	2	12	614123	614134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012467	ATGGAA	2	12	632524	632535	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012467	GATATT	2	12	659463	659474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012467	AGAGGA	2	12	682716	682727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012467	AGATTG	2	12	695081	695092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012467	TTTTCA	2	12	736879	736890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012467	AGTTGA	2	12	748055	748066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012467	GAACAA	2	12	752799	752810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012467	TTTGTT	2	12	752811	752822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012467	TAAAAA	2	12	766247	766258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012467	TTCGGG	2	12	789518	789529	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012467	TTAAAA	2	12	823021	823032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012467	TATAAA	2	12	826545	826556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012467	AAAAAG	2	12	877356	877367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012467	ACCAAG	2	12	878219	878230	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012467	ACAAAC	3	18	884739	884756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012467	TTTTTA	2	12	897511	897522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012467	CTATTT	2	12	908987	908998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012467	AAAAAG	2	12	909036	909047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012467	TTTTCT	2	12	919301	919312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012467	TAAAAA	2	12	949412	949423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012467	TGTCAA	2	12	955029	955040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012467	AAGAAA	2	12	956335	956346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012467	ATTCGA	2	12	961335	961346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012467	AGCCTT	2	12	962607	962618	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012467	CCAGAT	2	12	962683	962694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012467	AATGGA	2	12	966967	966978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012467	TATCGT	2	12	967789	967800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012467	CAAAAG	2	12	968987	968998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012467	CATTAT	2	12	971024	971035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012467	CATCTC	2	12	1013714	1013725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012467	AGTTGA	2	12	1013833	1013844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012467	ATTTTT	2	12	1064378	1064389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012467	AATTTT	2	12	1135844	1135855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012467	ACCAAT	2	12	1136417	1136428	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012467	TTTTTG	2	12	1148312	1148323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012467	GTTTGT	2	12	1157490	1157501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012467	TGAAAA	2	12	1173109	1173120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012467	GTTGAA	2	12	1178641	1178652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012467	AGAAAA	2	12	1210951	1210962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012467	CTGGTG	2	12	1211124	1211135	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012467	ATACTA	2	12	1237540	1237551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012467	TAAAAA	2	12	1251259	1251270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012467	GAGTAA	2	12	1253409	1253420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012467	AAGAAA	2	12	1277298	1277309	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012467	TAGGTA	2	12	1295283	1295294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012467	TTGAAA	2	12	1306259	1306270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012467	GATGGT	2	12	1335083	1335094	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012467	TTTTAT	2	12	1346591	1346602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012467	AAAAAG	2	12	1351567	1351578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012467	TGCTTC	2	12	1402642	1402653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012467	ACTAAA	2	12	1403983	1403994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012467	AAATTT	2	12	1418743	1418754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012467	CTTTCT	2	12	1516915	1516926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012467	CCGTTT	2	12	1523490	1523501	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012467	TTAAAA	2	12	1578304	1578315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012467	AACTTG	2	12	1614198	1614209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012467	TATAAA	2	12	1639282	1639293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012467	TAATCA	2	12	1647432	1647443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012467	AAAAAG	2	12	1653608	1653619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012467	CACTTC	2	12	1663815	1663826	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012467	AAAAAT	2	12	1674746	1674757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012467	GAACAT	2	12	1693919	1693930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012467	CTTTCT	2	12	1713034	1713045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012467	TAGGCT	2	12	1713961	1713972	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012467	ATATCA	2	12	1718698	1718709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012467	TCATTA	2	12	1725708	1725719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012467	TAATCA	2	12	1746174	1746185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012467	TAAAAA	2	12	1772028	1772039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012467	TATTAG	2	12	1773780	1773791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012467	CACTTC	2	12	1773811	1773822	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012467	TCCTTA	2	12	1776899	1776910	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012467	TGGGCT	2	12	1782980	1782991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012467	TTCATC	2	12	1793257	1793268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012467	TTTTTC	2	12	1801426	1801437	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012467	CCAGAA	2	12	1804267	1804278	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012467	AAAAGA	2	12	1843494	1843505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012467	ATACCA	2	12	1849502	1849513	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012467	AAAAAT	2	12	1853539	1853550	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012467	TATTAG	2	12	1865760	1865771	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012467	CACTTC	2	12	1865791	1865802	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012467	TCCTTA	2	12	1868879	1868890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012467	ATGATT	2	12	1881871	1881882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012467	CCCGAA	2	12	1927008	1927019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012467	TATTAG	2	12	1927885	1927896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012467	CACTTC	2	12	1927916	1927927	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012467	TCCTTA	2	12	1931004	1931015	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012467	TAATTT	2	12	1957927	1957938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012467	ATAGAT	2	12	1976919	1976930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012467	TCTTTT	2	12	1988955	1988966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_012467	TAAATT	2	12	2008973	2008984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012467	TCCACT	2	12	2051212	2051223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012467	ACCTTG	2	12	2069327	2069338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.