MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae P1031

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012467	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012467	TCGTG	2	10	16422	16431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012467	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012467	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012467	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012467	CTTTT	2	10	24208	24217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012467	TTTTA	2	10	27987	27996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012467	TTTTA	2	10	29648	29657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012467	CTTAT	2	10	32375	32384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012467	GAAGA	2	10	33890	33899	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012467	CAGAA	2	10	36574	36583	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012467	TTTTG	2	10	36825	36834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012467	TTTTG	2	10	59414	59423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012467	ATTAT	2	10	59555	59564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012467	TTTTA	2	10	59693	59702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012467	AGAGG	2	10	78492	78501	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012467	TTTAT	2	10	98953	98962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012467	ATTCA	2	10	104875	104884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012467	TTATC	2	10	107397	107406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012467	TATCA	2	10	110671	110680	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012467	GAAAG	2	10	112482	112491	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012467	GCGGT	2	10	113767	113776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012467	ATAAA	2	10	121762	121771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012467	TAACC	2	10	121860	121869	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012467	GGCTT	2	10	137718	137727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012467	GCTTT	2	10	145862	145871	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012467	TATTG	2	10	145899	145908	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012467	TAAAA	2	10	151721	151730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012467	ATTAA	2	10	155046	155055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012467	GAAAA	2	10	162560	162569	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012467	TGAAA	2	10	191952	191961	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012467	CCCTG	2	10	200578	200587	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_012467	AAGGA	2	10	228038	228047	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012467	GTTCA	2	10	229672	229681	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012467	AAAAT	2	10	233479	233488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012467	ATCGA	2	10	234227	234236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012467	TTTTA	2	10	238851	238860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012467	AAGAT	2	10	239897	239906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012467	ATACC	2	10	240377	240386	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012467	ATTCT	2	10	243608	243617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012467	CTATC	2	10	244927	244936	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012467	CTTTT	2	10	257888	257897	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012467	CTTAA	2	10	260245	260254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012467	AAGCC	2	10	273971	273980	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012467	AATAG	2	10	275517	275526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012467	TGATA	2	10	284649	284658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012467	CTTTT	2	10	304219	304228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012467	AAATA	2	10	319244	319253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012467	AAGCT	2	10	333246	333255	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012467	TATAT	2	10	335418	335427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012467	ATTTC	2	10	347955	347964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012467	GGAAC	2	10	352164	352173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012467	CTATC	2	10	354103	354112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_012467	ATAAA	2	10	368997	369006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012467	TTTTC	2	10	381908	381917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012467	TTCTG	2	10	388240	388249	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012467	GACTG	2	10	427018	427027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012467	ATATA	2	10	435678	435687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012467	AAATA	2	10	438012	438021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012467	AGAAA	2	10	438033	438042	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012467	ATTTC	3	15	440777	440791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012467	TTTGC	2	10	441162	441171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012467	TTTAT	2	10	444517	444526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012467	ATTTA	2	10	444631	444640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012467	AAGAG	2	10	456372	456381	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012467	CAGGG	2	10	459700	459709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012467	TGAAA	2	10	465033	465042	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012467	TATTT	2	10	467104	467113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012467	AATAA	2	10	472360	472369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012467	CTTTT	2	10	473628	473637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012467	TAAAA	2	10	473641	473650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012467	CTAAG	2	10	477964	477973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012467	TGTTT	2	10	478215	478224	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012467	CTTTC	2	10	484260	484269	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_012467	TGGAT	2	10	485053	485062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012467	TTGCT	2	10	485331	485340	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012467	AATTT	2	10	485821	485830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012467	ATAAA	2	10	486640	486649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012467	AGCGA	2	10	489776	489785	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012467	TTGCC	2	10	493515	493524	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012467	ATTCA	2	10	494285	494294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012467	TACTG	2	10	495058	495067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012467	ATATA	2	10	495075	495084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012467	TTCTT	2	10	497640	497649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012467	GATAA	2	10	500316	500325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012467	ATTGG	2	10	517620	517629	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012467	TATAA	2	10	517716	517725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012467	CTTTT	2	10	520532	520541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012467	TTTTA	2	10	520613	520622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012467	ATTTT	2	10	528380	528389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012467	TTGCC	2	10	529155	529164	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012467	GATTG	2	10	530261	530270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012467	TAATT	2	10	530587	530596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012467	AGATG	2	10	531061	531070	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012467	ATAAA	2	10	531256	531265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012467	TTTTA	2	10	531408	531417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012467	TTTAT	2	10	535649	535658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012467	AGGAA	2	10	537728	537737	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012467	ATAAA	2	10	545763	545772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012467	TGTCT	2	10	546124	546133	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012467	TGGTT	2	10	548089	548098	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012467	GCTAA	2	10	552849	552858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012467	ATATA	2	10	557603	557612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012467	TAGTA	2	10	560833	560842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012467	AGTAA	2	10	561544	561553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012467	CATTT	2	10	562285	562294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012467	TAAAA	2	10	570659	570668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012467	TTTAC	3	15	599831	599845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012467	TTTCC	2	10	601595	601604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_012467	CTATC	2	10	601657	601666	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012467	AAACA	2	10	602006	602015	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012467	ATATA	2	10	604700	604709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012467	GAAAA	2	10	642819	642828	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012467	GTTAT	2	10	642858	642867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012467	TAAAA	2	10	645216	645225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012467	GTTTG	2	10	658339	658348	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012467	GCAAA	3	15	658629	658643	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012467	AGCCA	2	10	659484	659493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012467	CTATC	2	10	683723	683732	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012467	AGGGG	2	10	683830	683839	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012467	ATGGA	2	10	705502	705511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012467	TTATT	2	10	707797	707806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012467	ATAAA	2	10	715401	715410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012467	AAAAG	2	10	718683	718692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012467	AGAAA	2	10	720962	720971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012467	GGAAA	2	10	724323	724332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012467	TAAAA	2	10	734372	734381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012467	TCTTT	2	10	747326	747335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012467	GACTC	2	10	749157	749166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_012467	ATTTT	2	10	752436	752445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012467	CAAGA	2	10	758384	758393	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012467	CAAAT	2	10	760513	760522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012467	AAAAT	2	10	760558	760567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012467	TCTGA	2	10	764086	764095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012467	CTGAA	2	10	766284	766293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012467	ATAAA	2	10	766458	766467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012467	TTTGA	2	10	766486	766495	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012467	AAATA	2	10	774122	774131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012467	TATTT	2	10	789675	789684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012467	TTTTG	2	10	814118	814127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012467	TATAT	2	10	826509	826518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012467	ATCTA	2	10	833001	833010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012467	TATGA	2	10	835066	835075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012467	AAATC	2	10	842624	842633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012467	AGGTT	2	10	842703	842712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012467	CATTT	2	10	842860	842869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012467	AGAAC	2	10	847519	847528	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012467	ATATA	2	10	850450	850459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012467	CTTTT	2	10	855852	855861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012467	TAATA	2	10	856864	856873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012467	ATAGA	2	10	865727	865736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012467	TAAAA	2	10	870920	870929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012467	CTTTT	2	10	877661	877670	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_012467	CATCT	2	10	878030	878039	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_012467	GAAGA	2	10	878516	878525	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012467	ACCAA	2	10	884726	884735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_012467	TCTTT	2	10	886782	886791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_012467	AATAA	2	10	888641	888650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012467	AGGCT	2	10	907015	907024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_012467	AGCTC	2	10	916981	916990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_012467	GGCTG	2	10	917238	917247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_012467	AAAAG	2	10	917771	917780	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012467	TCCTT	2	10	928124	928133	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_012467	GCGAA	2	10	929391	929400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_012467	ATAAA	2	10	931481	931490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012467	AGACG	2	10	932340	932349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_012467	AAATT	2	10	954061	954070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012467	CAAGA	2	10	954783	954792	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_012467	TTAAA	2	10	955295	955304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012467	GGTAT	2	10	961671	961680	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012467	AAATC	2	10	962822	962831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012467	TGGAA	2	10	962846	962855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012467	GAATT	2	10	967833	967842	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012467	TTGAA	2	10	968705	968714	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012467	AAAGC	2	10	968770	968779	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_012467	ATTTA	2	10	977502	977511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012467	TCTAA	2	10	978759	978768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_012467	AAATT	2	10	995274	995283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012467	AGTAA	2	10	1000362	1000371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012467	AAGCT	2	10	1013151	1013160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_012467	TTTAT	2	10	1021541	1021550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_012467	ATTTC	2	10	1032343	1032352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
186	NC_012467	TAATA	2	10	1042691	1042700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012467	TAATA	2	10	1052211	1052220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012467	TAAAA	2	10	1064223	1064232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_012467	GAAAT	2	10	1086641	1086650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012467	GAAAG	2	10	1090783	1090792	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
193	NC_012467	AAGAA	2	10	1103954	1103963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012467	TGTGA	2	10	1104901	1104910	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012467	GATGG	2	10	1115474	1115483	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012467	AACCC	2	10	1115557	1115566	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
197	NC_012467	TAAAA	2	10	1117262	1117271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012467	TATGT	2	10	1120515	1120524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012467	TGAAA	2	10	1120745	1120754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_012467	TTTAT	2	10	1126161	1126170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_012467	CTTAT	2	10	1126179	1126188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_012467	AATTG	2	10	1372325	1372334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_012467	ATATA	2	10	1372483	1372492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012467	CAGAA	2	10	1381034	1381043	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_012467	TTTTC	2	10	1608739	1608748	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.