MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 6206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012466	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
3	NC_012466	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
4	NC_012466	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225853612
5	NC_012466	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225853612
6	NC_012466	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225853612
7	NC_012466	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225853612
8	NC_012466	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012466	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225853613
10	NC_012466	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225853613
11	NC_012466	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225853613
12	NC_012466	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225853613
13	NC_012466	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012466	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	225853615
15	NC_012466	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	225853615
16	NC_012466	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	225853615
17	NC_012466	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	225853615
18	NC_012466	AAAT	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	225853616
19	NC_012466	TTGA	2	8	4458	4465	25 %	50 %	25 %	0 %	225853616
20	NC_012466	ATGA	2	8	4581	4588	50 %	25 %	25 %	0 %	225853616
21	NC_012466	TATC	2	8	5158	5165	25 %	50 %	0 %	25 %	225853617
22	NC_012466	GATT	2	8	5326	5333	25 %	50 %	25 %	0 %	225853617
23	NC_012466	GAAA	2	8	5591	5598	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
24	NC_012466	TTTA	2	8	7634	7641	25 %	75 %	0 %	0 %	225853617
25	NC_012466	GTCG	2	8	7695	7702	0 %	25 %	50 %	25 %	225853617
26	NC_012466	ATCA	2	8	7748	7755	50 %	25 %	0 %	25 %	225853617
27	NC_012466	GAAA	2	8	8217	8224	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
28	NC_012466	AAGA	2	8	8373	8380	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
29	NC_012466	GAAA	2	8	9356	9363	75 %	0 %	25 %	0 %	225853621
30	NC_012466	TATT	2	8	9392	9399	25 %	75 %	0 %	0 %	225853621
31	NC_012466	TAAA	2	8	9523	9530	75 %	25 %	0 %	0 %	225853621
32	NC_012466	ATCA	2	8	9598	9605	50 %	25 %	0 %	25 %	225853621
33	NC_012466	GAAG	2	8	9741	9748	50 %	0 %	50 %	0 %	225853621
34	NC_012466	TTCT	2	8	9860	9867	0 %	75 %	0 %	25 %	225853621
35	NC_012466	ATCA	2	8	9909	9916	50 %	25 %	0 %	25 %	225853621
36	NC_012466	CAGC	2	8	9934	9941	25 %	0 %	25 %	50 %	225853621
37	NC_012466	TTCT	2	8	10456	10463	0 %	75 %	0 %	25 %	225853621
38	NC_012466	CTAT	2	8	10948	10955	25 %	50 %	0 %	25 %	225853622
39	NC_012466	CTTA	2	8	11103	11110	25 %	50 %	0 %	25 %	225853622
40	NC_012466	ATTT	2	8	11502	11509	25 %	75 %	0 %	0 %	225853622
41	NC_012466	AATT	2	8	11535	11542	50 %	50 %	0 %	0 %	225853622
42	NC_012466	TTTA	2	8	11641	11648	25 %	75 %	0 %	0 %	225853622
43	NC_012466	AAAG	2	8	12158	12165	75 %	0 %	25 %	0 %	225853623
44	NC_012466	AGAA	2	8	12354	12361	75 %	0 %	25 %	0 %	225853623
45	NC_012466	TTAA	2	8	12392	12399	50 %	50 %	0 %	0 %	225853624
46	NC_012466	ACCA	2	8	12549	12556	50 %	0 %	0 %	50 %	225853624
47	NC_012466	TGCT	2	8	13074	13081	0 %	50 %	25 %	25 %	225853624
48	NC_012466	GATG	2	8	13318	13325	25 %	25 %	50 %	0 %	225853624
49	NC_012466	TTGG	2	8	13427	13434	0 %	50 %	50 %	0 %	225853624
50	NC_012466	TGAA	2	8	13569	13576	50 %	25 %	25 %	0 %	225853624
51	NC_012466	AAGA	2	8	13667	13674	75 %	0 %	25 %	0 %	225853624
52	NC_012466	TCTA	2	8	13843	13850	25 %	50 %	0 %	25 %	225853624
53	NC_012466	TGGC	2	8	13872	13879	0 %	25 %	50 %	25 %	225853624
54	NC_012466	AACA	2	8	14076	14083	75 %	0 %	0 %	25 %	225853624
55	NC_012466	GTTC	2	8	14105	14112	0 %	50 %	25 %	25 %	225853624
56	NC_012466	ATGA	2	8	14312	14319	50 %	25 %	25 %	0 %	225853624
57	NC_012466	AAAC	2	8	14801	14808	75 %	0 %	0 %	25 %	225853625
58	NC_012466	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012466	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012466	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012466	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012466	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012466	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012466	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012466	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012466	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012466	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012466	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012466	CTTT	2	8	21355	21362	0 %	75 %	0 %	25 %	225853628
70	NC_012466	ATGT	2	8	22791	22798	25 %	50 %	25 %	0 %	225853632
71	NC_012466	GATA	2	8	23432	23439	50 %	25 %	25 %	0 %	225853632
72	NC_012466	CAAG	2	8	23596	23603	50 %	0 %	25 %	25 %	225853632
73	NC_012466	GGTT	2	8	23751	23758	0 %	50 %	50 %	0 %	225853632
74	NC_012466	CTTT	2	8	23808	23815	0 %	75 %	0 %	25 %	225853632
75	NC_012466	CTAT	2	8	23935	23942	25 %	50 %	0 %	25 %	225853632
76	NC_012466	TTGG	2	8	24039	24046	0 %	50 %	50 %	0 %	225853632
77	NC_012466	AACA	2	8	24085	24092	75 %	0 %	0 %	25 %	225853632
78	NC_012466	GAGG	2	8	24355	24362	25 %	0 %	75 %	0 %	225853633
79	NC_012466	AGCG	2	8	24474	24481	25 %	0 %	50 %	25 %	225853633
80	NC_012466	ATGC	2	8	24485	24492	25 %	25 %	25 %	25 %	225853633
81	NC_012466	TGAG	2	8	24522	24529	25 %	25 %	50 %	0 %	225853633
82	NC_012466	TTTG	2	8	24951	24958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012466	ATGT	2	8	25163	25170	25 %	50 %	25 %	0 %	225853634
84	NC_012466	GTAT	2	8	25407	25414	25 %	50 %	25 %	0 %	225853634
85	NC_012466	TTTC	2	8	25614	25621	0 %	75 %	0 %	25 %	225853634
86	NC_012466	ATTC	2	8	25689	25696	25 %	50 %	0 %	25 %	225853634
87	NC_012466	CTTG	2	8	26019	26026	0 %	50 %	25 %	25 %	225853635
88	NC_012466	AGCA	2	8	26414	26421	50 %	0 %	25 %	25 %	225853636
89	NC_012466	TTTG	2	8	27171	27178	0 %	75 %	25 %	0 %	225853636
90	NC_012466	TTAT	2	8	27672	27679	25 %	75 %	0 %	0 %	225853638
91	NC_012466	GTTT	2	8	28108	28115	0 %	75 %	25 %	0 %	225853639
92	NC_012466	AAAT	2	8	28665	28672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012466	TGCT	2	8	29010	29017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012466	AGTT	2	8	29386	29393	25 %	50 %	25 %	0 %	225853643
95	NC_012466	GGAG	2	8	29717	29724	25 %	0 %	75 %	0 %	225853645
96	NC_012466	CGGA	2	8	30135	30142	25 %	0 %	50 %	25 %	225853646
97	NC_012466	TAAA	2	8	30226	30233	75 %	25 %	0 %	0 %	225853646
98	NC_012466	TATC	2	8	30877	30884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012466	AATA	2	8	31175	31182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012466	TTAA	2	8	31455	31462	50 %	50 %	0 %	0 %	225853649
101	NC_012466	ATGT	2	8	32061	32068	25 %	50 %	25 %	0 %	225853650
102	NC_012466	GATT	2	8	32145	32152	25 %	50 %	25 %	0 %	225853650
103	NC_012466	CCAG	2	8	32686	32693	25 %	0 %	25 %	50 %	225853651
104	NC_012466	TCCA	2	8	32711	32718	25 %	25 %	0 %	50 %	225853651
105	NC_012466	TTCG	2	8	33840	33847	0 %	50 %	25 %	25 %	225853652
106	NC_012466	AGAA	2	8	34144	34151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012466	ACGG	2	8	34232	34239	25 %	0 %	50 %	25 %	225853653
108	NC_012466	GGGA	2	8	34381	34388	25 %	0 %	75 %	0 %	225853653
109	NC_012466	TTGA	2	8	34996	35003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012466	TGGT	2	8	35569	35576	0 %	50 %	50 %	0 %	225853655
111	NC_012466	TTGA	2	8	35748	35755	25 %	50 %	25 %	0 %	225853655
112	NC_012466	TGAT	2	8	35761	35768	25 %	50 %	25 %	0 %	225853655
113	NC_012466	TTCT	2	8	35851	35858	0 %	75 %	0 %	25 %	225853655
114	NC_012466	ATCT	2	8	35919	35926	25 %	50 %	0 %	25 %	225853655
115	NC_012466	TGAT	2	8	35941	35948	25 %	50 %	25 %	0 %	225853655
116	NC_012466	CGTA	2	8	35993	36000	25 %	25 %	25 %	25 %	225853655
117	NC_012466	TTCT	2	8	36473	36480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012466	GCTG	2	8	36636	36643	0 %	25 %	50 %	25 %	225853657
119	NC_012466	CTTC	2	8	36710	36717	0 %	50 %	0 %	50 %	225853657
120	NC_012466	TGAT	2	8	37228	37235	25 %	50 %	25 %	0 %	225853659
121	NC_012466	AATT	2	8	37566	37573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012466	CTAT	2	8	37670	37677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012466	TTGA	2	8	37779	37786	25 %	50 %	25 %	0 %	225853660
124	NC_012466	TTGG	2	8	38757	38764	0 %	50 %	50 %	0 %	225853660
125	NC_012466	ACTT	2	8	39012	39019	25 %	50 %	0 %	25 %	225853660
126	NC_012466	AAGA	2	8	39240	39247	75 %	0 %	25 %	0 %	225853660
127	NC_012466	CTTG	2	8	39251	39258	0 %	50 %	25 %	25 %	225853660
128	NC_012466	GCTG	2	8	39314	39321	0 %	25 %	50 %	25 %	225853660
129	NC_012466	AAAC	2	8	40305	40312	75 %	0 %	0 %	25 %	225853660
130	NC_012466	TAAA	2	8	40385	40392	75 %	25 %	0 %	0 %	225853660
131	NC_012466	TTGA	2	8	40896	40903	25 %	50 %	25 %	0 %	225853661
132	NC_012466	TAGA	2	8	41071	41078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012466	TAGA	2	8	41116	41123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012466	TAGA	2	8	41161	41168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012466	TAGA	2	8	41206	41213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012466	TAGA	2	8	41251	41258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012466	TAGA	2	8	41296	41303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012466	CCAA	2	8	42022	42029	50 %	0 %	0 %	50 %	225853662
139	NC_012466	CAAG	2	8	42167	42174	50 %	0 %	25 %	25 %	225853662
140	NC_012466	AGGC	2	8	42343	42350	25 %	0 %	50 %	25 %	225853662
141	NC_012466	AGCG	2	8	42692	42699	25 %	0 %	50 %	25 %	225853663
142	NC_012466	CAGC	2	8	43640	43647	25 %	0 %	25 %	50 %	225853663
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144	NC_012466	GCCT	2	8	44211	44218	0 %	25 %	25 %	50 %	225853664
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